测试Id:HIF2A

低氧诱导因子α(EPAS1 / HIF2A)基因外显子9和12测序、全血

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

评估HIF2A / EPAS1在个人的评价JAK2负红细胞增多与终身持续增加红细胞(RBC)质量,提高红细胞计数,血红蛋白或红细胞比容

方法名称
一个简短的描述方法用于执行测试

纽约的状态
表明纽约国家批准的状态,如果测试是公开为纽约州立客户定货。

是的

报告名称
列出了短或缩写为一个测试版本的发布名称

HIF2A基因突变分析,B

别名
列表附加测试常见的名字,作为一个帮助搜索

EPAS1

标本类型
描述了标本类型验证测试

全血

标本要求
定义了执行测试所需的最佳标本和首选的体积来完成测试

只有公开的定货。更多信息见麻/遗传性红细胞增多突变,全血。

容器/管:薰衣草(EDTA)

样品数量:3毫升

收集产品说明:在原始管发送全血标本。不整除。

试样体积最小
定义样本的数量必须提供一个临床相关的结果取决于测试实验室

0.5毫升

拒绝原因
识别标本类型和条件可能会导致样品被拒绝

严重溶血 拒绝
总脂血 拒绝
总值黄疸 拒绝
中等至严重凝结的 拒绝

样品稳定性信息
提供了一个描述运输所需的温度进行实验室的标本,替代还包括可接受的温度

标本类型 温度 时间 特种集装箱
全血 冷藏(首选) 30天
环境 14天

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

评估HIF2A / EPAS1在个人的评价JAK2负红细胞增多与终身持续增加红细胞(RBC)质量,提高红细胞计数,血红蛋白或红细胞比容

临床信息
讨论了生理学、病理生理学和一般临床方面,与实验室测试

红细胞增多(即增加红细胞(RBC)质量或红血球增多症)可能是主要的,由于骨髓干细胞的一种内在的缺陷(即真性红细胞增多:PV)或二次反应增加血清促红细胞生成素(EPO)水平。继发性红细胞增多与许多疾病包括慢性肺部疾病,慢性一氧化碳(由于吸烟),增加青紫的心脏病、高海拔生活,肾囊肿和肿瘤,肝癌和其他EPO-secreting肿瘤。当这些常见的原因排除继发性红细胞增多,涉及遗传原因血红蛋白或红细胞监管机制可能会怀疑。

与真性红细胞增多症、遗传性红细胞增多与克隆进化的风险无关,应该表现为孤立的红细胞增多,自出生以来一直存在。一小部分病例与嗜铬细胞瘤和副神经节瘤的形成有关。遗传性红细胞增多是由于几个基因发生了变异,可能在一个常染色体显性遗传、常染色体隐性遗传方式。红细胞增多的家族史预计将在这些情况下,虽然有可能出现在一个人的新变化。

血红蛋白的基因编码,β球蛋白,α球蛋白(high-oxygen-affinity血红蛋白变体),hemoglobin-stabilization蛋白(2、3 bisphosphoglycerate变位酶:BPGM),红细胞生成素受体,EPOR,和氧感受途径酶(低氧诱导因子:HIF2A / EPAS1prolyl羟化酶域:PHD2 / EGLN1von Hippel,林道市:VHL)会导致遗传性红细胞增多(见下表)。遗传的真正流行erythrocytosis-causing变体是未知的。血红蛋白基因,HBA1 / HBA2HBB不化验在这个概要文件。

表。基因与遗传性红细胞增多有关

基因

继承

血清促红细胞生成素

JAK2V617F

收购了

减少

JAK2外显子12

收购了

减少

EPOR

占主导地位的

减少

PHD2/EGLN1

占主导地位的

正常水平

BPGM

隐性

正常水平

β球蛋白

占主导地位的

正常水平的增加

α球蛋白

占主导地位的

正常水平的增加

HIF2A/EPAS1

占主导地位的

正常水平的增加

VHL

隐性

正常水平的增加

通过酶氧感受通路功能,低氧诱导因子(HIF),调节红细胞质量。α和β亚基组成的异质二聚体蛋白,诱导功能的标记耗尽氧气浓度。当礼物,氧气变成了衬底调停HIF-alpha单元退化。在缺乏氧气的情况下,退化不发生和α蛋白组件可以与HIF-beta二聚单元。异质二聚体然后诱发许多包括缺氧反应基因的转录EPO(促红细胞生成素)VEGF和GLUT1。HIF-alpha是由冯Hippel-Lindau (VHL) protein-mediated泛素化和变幻虫的退化,这就需要prolyl HIF脯氨酸残基的羟基化。HIF-alpha亚基编码的HIF2A (EPAS1)基因。在羟基化酶重要HIF-alpha prolyl羟化酶域蛋白质,其中最重要的同种型PHD2,编码的PHD2(EGLN1)基因。基因改变导致改变HIF-alpha PHD2, VHL蛋白可能导致临床红细胞增多。变异的一个小子集PHD2/EGLN1HIF2A / EPAS1中也发现了红细胞的患者嗜铬细胞瘤和副神经节瘤。

删除的变体EPOR红细胞生成素受体的基因编码可以通过损失导致红细胞增多的负面监管细胞质SHP-1绑定域导致促红细胞生成素过敏症。目前已知的所有变体已本地化的外显子8和删除是杂合的变体。EPOR变异与下降到正常EPO水平(见表)。

参考价值
描述参考区间和附加信息的解释测试结果。可能包括在适当的时间间隔根据年龄和性别。间隔Mayo-derived,除非另有指定。如果一个提供解释报告,参考价值字段将这个状态。

只有公开的定货。更多信息见麻/遗传性红细胞增多突变,全血。

一个将提供解释报告。

解释
提供信息,协助解释测试结果

将提供一份解释报告的一部分麻/遗传性红细胞增多突变,全血和将包括标本信息,分析信息,标本是否积极的任何变异的基因。如果积极,变体将与临床意义,如果已知。

注意事项
讨论了条件,可能会导致诊断的混乱,包括样本收集和处理不当,不恰当的测试选择、干扰物质

真性红细胞增多和获得红细胞增多的原因应该排除在订购这个评估。

这个测试不会检测体细胞或性腺的镶嵌性。

某些序列改变没有临床表现,本质上,在临床上是良性的。相关性与所有相关临床信息必须提供适当的病人护理。

临床参考
对临床性质的深入阅读的建议

1。Patnaik MM, Tefferi答:红细胞增多的完整评估:先天性和获得。白血病。2009;23 (5):834 - 844。doi: 10.1038 / leu.2009.54

2。McMullin MF:红细胞增多的分类和诊断。Int J实验室内科杂志。2008;12月30 (6):447 - 459

3所示。珀西MJ,李FS:家族性红细胞增多:分子血红细胞控制的链接。Haematologica。2008年7月,93 (7):963 - 967。doi: 10.3324 / haematol.13250

4所示。黄LJ,沈YM, Bulut GB:理解的进步主要家族和先天性polycythaemia的发病机理。Br J Haematol。2010年3月,148 (6):844 - 852

5。马兰J, Prchal J:红血球增多症和氧气传感。Pathologie生物。2004年6月,52 (5):280 - 284

6。李F:红细胞增多,氧感受途径的遗传原因。血启2008;11月22 (6):321 - 332

7所示。霍耶JD,商人SH,奥利维拉JL Viswanatha DS:红细胞增多。:他的ED,艾德,Hematopathology。第二版。爱思唯尔桑德斯;2012:22 - 723

8。壮族Z,杨C,洛伦佐F, et al:体细胞HIF2A功能突变与红血球增多症副神经节瘤。郑传经地中海J。2012年9月6日,367 (10):922 - 930

9。Ladroue C, Carcenac R, Leporrier M, et al: PHD2突变和副神经节瘤先天性红细胞增多。郑传经地中海J。2008年12月18日,359 (25):2685 - 2692

10。洛伦佐FR,杨C, Ng唐优质黄麻M, et al:先天性红血球增多症体内/ HIF2A生殖细胞突变的EPAS1基因副神经节瘤。J摩尔。2013年4月,91 (4):507 - 512

11。Tarade D,罗宾逊厘米,李我,哦M: HIF-2alpha-pVHL复杂揭示广泛genotype-phenotype HIF-2aalpha-driven疾病的相关性。Nat Commun。2018年8月22日,9 (1):3359

12。奥利维拉杰:遗传算法评价红细胞增多:通路和警告。Int J实验室内科杂志。2019;41增刊1:89 - 94。doi: 10.1111 / ijlh.13019

方法描述
描述如何执行测试并提供method-specific参考

DNA从全血中提取和放大7单独聚合酶链反应(PCR)的反应EPOR外显子8,HIF2A外显子9和12,PHD2外显子1到5。然后PCR产物测序Sanger测序方法与测序和分析软件。病人结果与基因组参考序列和比较序列单核苷酸变异发生在基因。如果检测到变异,信使RNA参考序列将被用来确定氨基酸数量和产生的氨基酸的变化,如果有的话。(珀西MJ McMullin MF、槌球啊,等:红细胞增多由于红细胞生成素受体基因的突变。Br J Haematol。1998年2月,100 (2):407 - 410;马提尼,Teofili L,森西T, et al:小说杂合的HIF2a [M535I]突变强化氧传感的作用通路障碍发病机制的家族性红细胞增多。Haematologica。2008; 93 (7): 1068 - 1071;珀西MJ,赵问,弗洛雷斯,et al:一个家庭与红细胞增多建立prolyl羟化酶的作用域蛋白2氧体内平衡。《美国国家科学院刊a . 2006, 103 (3): 654 - 659;奥利维拉JL浣熊LM,弗雷德里克·拉等:Genotype-phenotype相关的遗传性红细胞增多突变,一个中心体验。 Am J Hematol. 2018 May 23. doi: 10.1002/ajh.25150)

PDF报告
表明报告包括一个额外的文档是否与图表、图像或其他丰富的信息

没有

报告可用
时间的间隔(收到样品在梅奥诊所实验室结果可用)考虑标准设置和周末。yabo208第一天的时间通常是结果可用。最后一天的时间可能需要,占任何必要的重复测试。

10 - 25天

样品保留时间
轮廓的时间在测试标本保存在实验室之前就会被丢弃

全血:2周;提取的DNA: 3个月

执行实验室的位置
表明实验室的位置执行测试

罗彻斯特

费用
几个因素决定执行一个测试的费用收取。联系你的美国或国际区域经理建立费用表的信息或了解更多关于资源优化测试的选择。

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  • 客户没有测试价格可以联系亚搏一天24小时,一周7天。
  • 潜在客户应该联系他们的账户代表。寻求帮助,请联系亚搏

测试的分类
提供信息关于医疗器械分类为实验室测试工具和试剂。测试可以分为清除或通过美国食品和药物管理局(FDA)和每个制造商使用说明,或产品,不接受FDA审查和批准,并贴上一个分析物特定试剂(ASR)产品。

这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。

CPT编码信息
提供指导在决定适当的当前程序的术语(CPT)代码(s)为每个测试或概要信息。梅奥诊所上市CPT编码反映实验室的解释CPT编码需求。yabo208每个实验室有责任来确定正确的CPT编码用于计费。

CPT编码由执行实验室提供。

81479 -未上市的分子病理过程

LOINC®信息
提供指导在确定逻辑观察标识符名称和代码(LOINC)值的顺序和结果代码的测试。LOINC表演实验室提供的值。

测试Id 测试顺序的名字 订单LOINC价值
HIF2A HIF2A基因突变分析,B 过程中
结果Id 测试结果的名字 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
34647年 HIF2A基因测序结果 82939 - 0

测试设置资源

设置文件
测试设置信息包含测试文件定义支持订单细节和结果之间的接口梅奥诊所实验室和实验室信息系统。yabo208

Excel|Pdf

样品报告
正常和异常样本报告作为参考提供报告的外观。

正常的报告|异常报告

如果样品报告
国际体系(SI)的单位报告提供有限数量的测试。这些报告仅用于国际帐户,只可以通过MayoLINK账户已定义接收他们。

如果正常的报告|如果异常报告