测试Id:NCLGP

皮肤活检或培养的成纤维细胞标本,成纤维细胞培养测试将执行一个额外的费用。如果没有获得可行的细胞中,客户端会通知。

一线生化测试是用于2最常见类型的酶缺乏症与神经有关ceroid lipofuscinosis;订单TPPTL / Tripeptidyl肽酶1和Palmitoyl-Protein Thioesterase 1,白细胞。

定制的面板和单基因分析对任何基因出现在这个面板是可用的。更多信息见CGPH /自定义面板中,基因遗传,下一代测序,各不相同。

首选标本收集的96小时内到达。

病人准备:先前的骨髓移植同种异体的捐赠会干扰测试。电话800-533-1710说明测试的病人接受了骨髓移植手术。

提交以下标本:只有1

样品类型:全血

容器/管:

首选:薰衣草(EDTA)或黄色大(ACD)

可以接受的:任何抗凝剂

样品数量:3毫升

收集产品说明:

1。反几次混合血。

2。在原始管发送全血标本。不整除。

样品稳定性信息:环境(首选)4天/冷藏14天

标本类型:皮肤活组织检查

供应:成纤维细胞活检传输媒体(T115)

容器/管与任何标准细胞培养基:无菌容器(例如,最小的重要媒体,RPMI 1640)。解决方案应该补充青霉素和链霉素为1%。

试样体积:4毫米

样品稳定性信息:冷藏(首选)/环境

附加信息:一个单独的文化电荷将评估在CULFB /纤维母细胞的生化和分子检测。需要额外的3到4周文化成纤维细胞在基因检测可以发生。

标本类型:培养的成纤维细胞

容器/管:T-25瓶

标本体积:2烧瓶

集合指令:提交汇合的培养成纤维细胞从一个来自另一个实验室的皮肤活检。培养细胞的产前样品不会被接受。

样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏(< 24小时)

附加信息:一个单独的文化电荷将评估在CULFB /纤维母细胞的生化和分子检测。需要额外的3到4周文化成纤维细胞在基因检测可以发生。

标本类型:血液现货

供应:Card-Blood点收集(滤纸)(T493)

容器/管:

首选:采集卡(绘画纸蛋白质节省903纸)

可接受的:PerkinElmer 226(226年以前seppo)滤纸或血液收集卡片

试样体积:5点血

托收指示:

1。另一种血液收集选项1岁以上的病人的手指。看到干血现货教程集合如何收集血液通过手指针刺点。

2。让干血滤纸在水平位置的环境温度至少3小时。

3所示。不暴露标本高温或阳光直射。

4所示。不叠湿标本。

5。保持标本干燥

样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏

附加信息:

1。由于低浓度的DNA产生了从血液,可能可能需要额外的标本来完成测试。

2。托收指示,请参阅血的地方收集指令

3所示。托收指示在西班牙,看到的血现货Card-Spanish指令集合(T777)

4所示。托收指示,明白了血现货Card-Chinese指令集合(T800)

样品类型:唾液

病人准备:病人不能吃、喝、吸烟或嚼口香糖30分钟前集合。

供应:唾液拭子采集设备(T786)

样品数量:1拭子

收集产品说明:收集和发送样品每箱指令。

样品稳定性信息:周围30天

附加信息:由于低浓度的DNA产生唾液,这是可能的,可能需要额外的标本来完成测试。

• 分子遗传学:生化紊乱患者信息
• 基因检测的知情同意
• 血现货Card-Spanish指令集合
• 血现货Card-Chinese指令集合
• 知情同意的基因检测(西班牙语)
• 血的地方收集指令
• 目标基因和神经的方法细节Ceroid Lipofuscinosis(板条疾病)基因面板

1。纽约Clients-Informed同意是必需的。请求的文档形式或电子订单,一份文件。下列文件中可用的特别指示:

- - - - - -基因检测的知情同意(T576)

- - - - - -知情同意的基因检测(西班牙语)(T826)

2。分子遗传学:生化紊乱患者信息(T527)在特殊指令

看到标本要求

所有标本将评估在梅奥诊所实验室测试适用性。yabo208

跟进异常生化或电子显微镜结果可疑神经元ceroid lipofuscinoses (NCL)

建立一个分子诊断NCL患者

识别基因变异在已知NCL,允许预测高危家庭成员的测试

这个测试利用下一代测序检测单核苷酸和拷贝数变异在16个基因与神经有关ceroid lipofuscinosis (NCL /板条疾病):ATP13A2,CLN3,CLN5,CLN6,CLN8,CTSD,CTSF,CTSK,DNAJC5,入库单,KCTD7,MFSD8,PANK2,PPT1,SGSH,TPP1。看到目标基因和神经的方法细节Ceroid Lipofuscinosis(板条疾病)基因面板在特殊说明和方法描述额外的细节。

鉴定致病变种可能协助诊断、预后、临床管理、家族性筛选和遗传咨询NCL(板条疾病)。

额外的第一层测试可能被视为/推荐。更多信息见点指导。

皮肤活检或培养的成纤维细胞标本,成纤维细胞培养测试将执行一个额外的费用。如果没有获得可行的细胞中,客户端会通知。

神经元ceroid lipofuscinoses (NCL)的一个子集溶酶体储存疾病涉及缺陷细胞脂质处理。NCL由癫痫临床特点,知识和运动减少,和失明。电子显微镜通常显示了颗粒的特性积累osmophilic存款(GROD),曲线资料(CVB),或指纹档案(FP)。酶测试可能显示缺乏palmitoyl-protein thioesterase 1 (PPT1) tripeptidyl-peptidase 1 (TPP1),或组织蛋白酶D (CTSD)。目前至少有14个遗传学上截然不同的形式。

发病的年龄和临床特征变量,从先天性成人发病。NCL通常是在一个常染色体隐性遗传方式,尽管一个成人发病形式(ANCL;DNAJC5基因)已被证明是常染色体显性遗传。

一个将提供解释报告。

所有检测到的变化评估根据美国大学医学遗传学和基因组学(ACMG)建议。(1)变体进行分类的基础上,预测,或可能的致病性和报告详细注释解释他们的潜在的或已知的意义。

临床相关性:

测试结果应解释在临床中发现,家族史和其他实验室数据。误解的结果可能发生如果提供的信息不准确或不完整的。

如果测试执行,因为临床上重要的家族史,这第一个测试通常是很有用的一个家庭成员的影响。检测至少一个可报告的变体在受影响的家庭成员将允许更多的信息检测的高危个体。

讨论额外的可用性测试选项或协助解释这些结果,联系梅奥诊所实验室遗传顾问800-533-1710。

技术的局限性:

下一代测序可能无法检测所有类型的基因变异。在极少数情况下,可能出现假阴性或假阳性结果。的深度报道可能变量对于一些目标区域;分析性能低于最低可接受的标准或失败的地区将会指出。考虑到这些限制,负面结果不排除遗传性疾病的诊断。如果一个特定的临床障碍被怀疑,可以被认为是评价的替代方法。

可能存在不能有效地评价区域的基因测序或删除和重复分析由于技术的局限性分析,包括区域的同源性、高guanine-cytosine (GC)内容,和重复序列。确认选择可报告的变异将由替代方法基于内部实验室标准。

这个测试是验证检测95%的删除75个碱基对47英国石油(bp)和插入。插入/删除(indels) 40岁以上的英国石油公司,包括移动元素插入,可能不如小indels可靠地检测到。

删除/复制分析:

这种分析目标单一和multi-exon删除/复制;然而,在某些情况下单一外显子决议不能实现减少由于孤立序列覆盖或固有的基因组的复杂性。平衡结构重组(如易位和反演)可能不能被检测到。

这个测试不是为了检测低水平的镶嵌性或区分体细胞和生殖系变异。是否有可能检测到变异体细胞,额外的测试可能需要澄清的结果的意义。

基因可能是添加或删除基于更新的临床意义。指的是目标基因和神经的方法细节Ceroid Lipofuscinosis(板条疾病)基因面板特殊说明最新的基因列表包含在这个测试。关于基因的特定性能的详细信息和技术的局限性,看到方法描述或实验室基因顾问联系。

如果病人有同种异体造血干细胞移植或最近的异种输血,结果可能是不准确的,由于供体DNA的存在。叫梅奥诊所yabo208实验室说明测试的病人接受了骨髓移植手术。

变异的重新分类:

此时,它不是标准实践的实验室系统地回顾之前定期分类变量。实验室鼓励卫生保健提供者随时联系实验室学习特定的变体的分类可能已经改变了。

变体的评估:

执行评估和分类变量使用发表美国大学医学遗传学和基因组学和分子病理学协会建议作为指导原则。其他gene-specific指南也可以考虑。基于已知变异进行分类,预测,或可能的致病性和报告详细注释解释他们的潜在的或已知的意义。变异分为良性或可能良性不报道。

多在网上评估工具可以用来帮助解释这些结果。预测的准确性由在硅片评估工具是高度依赖于数据对于一个给定的基因,并定期更新这些工具可能导致预测随时间变化的。结果在网上评估工具进行解释时应特别谨慎和专业临床判断。

1。理查兹,阿齐兹N,贝尔,et al:标准和指导方针的序列变异的解释:一个联合一致推荐的美国大学医学遗传学和基因组学和分子病理学协会。地中海麝猫。2015年5月,17 (5):405 - 424

2。摩尔,柯特曼SL:遗传神经ceroid lipofuscinoses(板条疾病)。Biochim Biophys学报。2015;1852年有关肺结核(10):2237 - 2241

3所示。库珀JD、马Tarczyluk Nelvagal人力资源:向一个新的NCL发病机制的理解。Biochim Biophys学报。2015;1852年有关肺结核(10):2256 - 2261

4所示。威廉姆斯再保险,鼹鼠SE:新术语和分类方案神经元ceroid lipofuscinoses。神经学。2012;79 (2):183 - 191

5。摩尔,威廉姆斯RE:神经元ceroid-lipofuscinoses。:亚当MP, Ardinger HH,冰内生物RA, et al, eds。GeneReviews[网络]。华盛顿大学。西雅图;2001年。2013年8月1日更新。2020年10月28日通过。可以在www.ncbi.nlm.nih.gov /书/ NBK1428 /

• 分子遗传学:生化紊乱患者信息
• 基因检测的知情同意
• 血现货Card-Spanish指令集合
• 血现货Card-Chinese指令集合
• 知情同意的基因检测(西班牙语)
• 血的地方收集指令
• 目标基因和神经的方法细节Ceroid Lipofuscinosis(板条疾病)基因面板

下一代测序(上天)和/或执行Sanger测序检测中存在变异基因的编码区和内含子/外显子边界分析,以及一些其他地区已知致病变种。人类基因组参考GRCh37 / hg19构建用于序列读一致性。至少99%的基地覆盖在阅读的深度超过30 x。灵敏度是单核苷酸变异估计在99%以上,94%以上插入/删除(indels)不到40碱基对(bp), 95%以上为删除75基点和插入到47个基点。门店和/或聚合酶链反应(PCR)的定量方法来测试执行删除和复制的基因分析。看到目标基因和神经的方法细节Ceroid Lipofuscinosis(板条疾病)基因面板在特别说明细节对目标基因进行了分析。

可能存在不能有效地评价区域的基因测序或删除和重复分析由于技术的局限性分析,包括区域的同源性、高guanine-cytosine (GC)内容,和重复序列。看到目标基因和神经的方法细节Ceroid Lipofuscinosis(板条疾病)基因面板特别指示的细节对于特定的基因区域不经常覆盖。(未发表的梅奥法)

基因分析:ATP13A2,CLN3,CLN5,CLN6,CLN8,CTSD,CTSF,CTSK,DNAJC5,入库单,KCTD7,MFSD8,PANK2,PPT1,SGSH,TPP1

补充

不同

28日至42天

全血:2周(如果可用);提取的DNA: 3个月;血液斑点/唾液;1个月

罗彻斯特

• 授权用户可以登录测试价格费用的详细信息。
• 客户没有测试价格可以联系亚搏一天24小时,一周7天。
• 潜在客户应该联系他们的区域经理。寻求帮助,请联系亚搏。

这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。

81443年

88233 -组织培养、皮肤、固体组织活检(如果合适的话)

88240 -低温贮藏(如果合适的话)