诊断胃肠道疾病(腹泻或呕吐)由诺瓦克病毒genogroups 1和2
这个测试应该不能使用test-of-cure。
实时聚合酶链反应(PCR) /核糖核酸探针杂交
诺沃克病毒
粪便
瓶放置在一个密封的塑料袋船周围。标本接收其他温度将被拒绝,和测试将被取消。
供应:文化和敏感性凳子运输瓶(T058)
容器/管:商用运输系统特定的肠道病原体的复苏从粪便标本(15毫升的少量的运输介质——要么Cary-Blair Para-Pak文化和敏感媒体)
样品数量:代表一部分腹泻粪便样本,1克或5毫升
收集产品说明:
1。采集新鲜粪便和防腐剂的1小时内收集。
2。明显形成粪便与诺瓦克病毒胃肠道疾病是不一致的,不应提交测试。
| Nonpreserved粪便 传输媒体除了Cary-Blair或C和S 修改Cary-Blair 粪便拭子 明显形成粪便 |
拒绝 |
| 标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
|---|---|---|---|
| 粪便 | 环境 | 7天 |
诊断胃肠道疾病(腹泻或呕吐)由诺瓦克病毒genogroups 1和2
这个测试应该不能使用test-of-cure。
诺瓦克诺瓦克病毒,以前被称为类病毒具有高度传染性RNA病毒引起急性胃肠炎(腹泻、呕吐)。尽管6 genogroups诺瓦克病毒已确定,只有3 genogroups (genogroup: G1、G2和G4)导致人类疾病。此外,大多数的疫情与G1和G2,与G2是最常见的。(1)
诺瓦克病毒通过关闭,传输个人接触受感染的个人或主要通过粪-口途径通过病毒变得摄入受污染的食物或水。这些病毒极易蔓延,不到20个病毒粒子能够引起疾病。(1)
一旦感染,潜伏期通常是短,24至72小时。突然出现症状,呕吐和腹泻水样nonbloody是常见的。病人也可能经历一个轻度发热、头痛和轻微的身体疼痛。(1)
诺瓦克病毒感染的诊断通常可以在临床理由和症状通常在24至48小时内解决。然而,在某些病人,尤其是那些免疫力低下或住院,实验室检测可能表示用于感染控制和限制抗生素的使用。由实时聚合酶链反应检测腹泻粪便允许快速和敏感的检测和区分诺瓦克病毒G1和G2临床粪便样本。
负
一个积极的结果表明,从诺瓦克病毒RNA genogroups 1和/或2存在于临床标本。
消极的结果表明,从诺瓦克病毒RNA genogroups 1和2没有在临床标本。
一个积极的结果表明,诺瓦克病毒是引起消化道疾病(腹泻或呕吐);然而,在某些病人(如免疫功能不全的主机),诺瓦克病毒可能摆脱数周,数月没有症状。(2)
这个测试不应该用作test-of-cure,因为诺瓦克病毒核酸可能在患者数周,数月后,发现解决症状。(2)
消极的结果表明,诺瓦克病毒不是胃肠道疾病的原因(腹泻或呕吐);然而,病毒核酸可能出席的水平低于这个测试的检测极限。的上下文中结果应该解释病人的临床表现和其他实验室的研究结果。
准确性:
共有100名临床粪便样本提交给梅奥在11/2015和03/2016测试由商业多元化胃肠面板(包括诺瓦克病毒)整除,盲法,并测试在24至48小时内收到使用诺瓦克病毒G1 / G2实时聚合酶链反应(PCR)检测。标本产生不和谐的多路传输面板和实时PCR结果提交给外部参考实验室和明尼苏达州卫生部门(MDH)诺瓦克病毒分子检测。
表1。比较后的结果不一致的分析实验室和MDH外部引用
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样品数量不一致的决议的结果:(a, b)
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诺瓦克病毒lab-developed测试(LDT)
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积极的
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负
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积极的
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63 (c)
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0
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负
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2 (d)
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35
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总
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65年
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35
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调整灵敏度(95%可信区间[CI]) = 96.9% (88.8, 99.8)
调整后的特异性(95%置信区间)= 100% (88.2,100)
调整协议(95% CI) = 98% (92.6, 99.9)
诺瓦克病毒之间的。样品表现出不和谐的结果实时PCR和FilmArray被分子检测方法在诊断和MDH焦点。
b。样品显示协议诺瓦克病毒实时PCR和FilmArray没有进一步的测试。
c。四个63样品被确认为G1 LDT;其余59人确认为诺瓦克病毒G2。
2 d。其中一个是诺瓦克病毒阳性样本集中诊断和MDH、和LDT重复测试一式三份,也是积极的。第二个示例是在MDH诺瓦克病毒阳性,但负面的关注和LDT重复测试。
临床粪便样本测试取得了59标本阳性LDT诺瓦克病毒G2的;然而,只有4个样品测定为诺瓦克病毒G1是积极的。为了补充临床数据和增加样品的数量为诺瓦克病毒阳性G1,进行强化研究。Analyte-negative粪便样本(n = 26)飙升了诺瓦克病毒G1 RNA(写明ATCC) 1稀释上面定义的检测极限(LOD)(表2)。
表2。粪便标本诺瓦克病毒GI的飙升的研究结果。
标本
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物种
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样品浓度的目标越来越多
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积极的/ |
%的积极
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意思是交叉点
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凳子
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诺瓦克病毒G1
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10张/制程
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26/26
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One hundred.
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33.2
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敏感性分析:
G1和G2的检测极限分析是确定为5份/制程(5000拷贝/毫升)的凳子上。
分析特异性:
全面特异性面板,包括细菌(n = 16)、寄生虫(n = 5),或病毒(n = 5)导致胃肠道疾病被诺瓦克病毒G1 / G2化验测试。此外,人类的DNA测试。特异性小组的所有成员被诺瓦克病毒G1和G2 -化验。此外,爆炸(基本局部比对搜索工具)分析引物和探针序列,没有显示显著的大生物体可能出现在粪便样本。
1。国家中心免疫和呼吸系统疾病,病毒性疾病分工:诺瓦克病毒。疾病控制和预防中心;2013年。2023年2月23日更新。2023年3月28日通过。可以在www.cdc.gov诺瓦克病毒/ index . html
2。Echenique IA, Stosor V,加仑L,考夫曼D,气C, Zembower TR:胰腺移植后长期诺瓦克病毒感染:慢性诺瓦克病毒的病例报告和审查。Transpl感染说。2016年2月,18 (1):98 - 104
本试验利用实时TaqMan-based聚合酶链反应(PCR)技术目标诺瓦克病毒的非结构化多蛋白基因G1和G2。从腹泻粪便样本中核酸提取Cary-Blair媒体。执行后提取病毒RNA,反转录转换诺瓦克病毒基因组RNA互补DNA。然后要进行实时放大和检测。两个独立的实时PCR反应执行对于每一个样品,一个特定的诺瓦克病毒G1和第二定位诺瓦克病毒G2。分析能够准确地检测并区分这些genogroups临床粪便样本。(未发表的梅奥法)
星期一到星期五
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
87798 x 2
| 测试Id | 测试顺序的名字 | 订单LOINC价值 |
|---|---|---|
| LNORO | 诺瓦克病毒PCR, F | 88701 - 8 |
| 结果Id | 测试结果的名字 | 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
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|---|---|---|
| 65170年 | 诺瓦克病毒G1 PCR | 54905 - 5 |
| 47553年 | 诺瓦克病毒G2 PCR | 54906 - 3 |