测试Id:SMN1Z

SMN1基因,基因分析,各不相同

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

证实诊断为脊髓性肌肉萎缩症由于核苷酸变异SMN1基因

二线载体筛查时脊髓性肌肉萎缩症家族史,但影响个人不是用于测试,或者当致病变种是未知的

二线载体筛查的生殖伙伴SMA携带者

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

测试包括的全部基因测序SMN1基因。

反射测试
列出测试,可能会或可能不会被执行,在一个额外的费用,根据初始测试的结果和解释。

测试Id 报告名称 可单独购买 总是表现
CULFB 纤维母细胞文化基因测试 是的 没有

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

皮肤活检或培养的成纤维细胞标本,成纤维细胞培养测试将执行一个额外的费用。如果没有获得可行的细胞中,客户端会通知。

更多信息见继承了运动神经元病和痴呆测试算法

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法名称
一个简短的描述方法用于执行测试

聚合酶链反应(PCR) DNA测序紧随其后

纽约的状态
表明纽约国家批准的状态,如果测试是公开为纽约州立客户定货。

是的

报告名称
列出了短或缩写为一个测试版本的发布名称

满SMN1基因分析

别名
列表附加测试常见的名字,作为一个帮助搜索

I型脊髓性肌萎缩症

SMA1

SMAI

SMA小儿急性形式

肌肉萎缩,幼稚的

严重的小儿急性脊髓性肌肉萎缩症

脊髓性肌Atrophy-1

脊髓性肌肉萎缩症,II型

SMA2

SMAII

肌萎缩症、脊髓中间类型

肌萎缩症、脊柱、小儿慢性形式

小儿慢性脊髓性肌萎缩

脊髓性肌Atrophy-2

脊髓性肌萎缩、类型III

SMA3

SMAIII

肌肉萎缩,青少年

Kugelberg-Welander综合症

KWS

脊髓性肌肉萎缩症,轻微的童年和青少年的形式

脊髓性肌Atrophy-3

脊髓性肌肉萎缩症,IV型

SMA4

SMAIV

脊髓性肌肉萎缩症,成人的形式

脊髓性肌萎缩、近端、成人,常染色体隐性

成人SMA

脊髓性肌Atrophy-4

SMN1Z

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

皮肤活检或培养的成纤维细胞标本,成纤维细胞培养测试将执行一个额外的费用。如果没有获得可行的细胞中,客户端会通知。

更多信息见继承了运动神经元病和痴呆测试算法

标本类型
描述了标本类型验证测试

不同

订购指南

这是载体筛查或诊断的首选基因测试在个人涉嫌脊髓性肌萎缩(SMA)。对于这些情况,订单SMNCS /载波脊髓性肌萎缩症筛查、删除/复制分析、不同或SMNDX /脊髓性肌肉萎缩症的诊断分析,删除/复制分析,各不相同。

这个测试适合二线载体筛选后SMNCS /载波脊髓性肌萎缩症筛查、删除/复制分析,不同时间:

——是一种SMA的家族史,但受影响的个人不能用于测试

——致病变种是未知的

测试一个已知的SMA的生殖伙伴航空公司

装船指示

首选标本收集的96小时内到达。

标本要求
定义了执行测试所需的最佳标本和首选的体积来完成测试

病人准备:先前的骨髓移植同种异体的捐赠会干扰测试。电话800-533-1710说明测试的病人接受了骨髓移植手术。

提交以下标本:只有1

样品类型:全血

容器/管:

首选:薰衣草(EDTA)或黄色大(ACD)

可以接受的:任何抗凝剂

样品数量:3毫升

收集产品说明:

1。反几次混合血。

2。在原始管发送全血标本。不整除。

样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏

样品类型:培养的成纤维细胞

容器/管:t - 75或T-25烧瓶

样品数量:1全t - 75或2全T-25烧瓶

样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏< 24小时

附加信息:一个单独的文化电荷将评估在CULFB /纤维母细胞生化和分子检测。需要额外的3到4周文化成纤维细胞在基因检测可以发生。

供应:纤维母细胞活检传输媒体(T115)

样品类型:皮肤活组织检查

容器/管:无菌容器与任何标准细胞培养媒体(例如,最小的重要媒体,RPMI 1640)。解决方案应补充1%青霉素和链霉素)。

样品数量:4毫米穿孔

样品稳定性信息:冷藏(首选)/环境

附加信息:一个单独的文化电荷将评估在CULFB /纤维母细胞生化和分子检测。需要额外的3到4周文化成纤维细胞在基因检测可以发生。

供应:卡-血液点收集(滤纸)(T493)

样品类型:血现货

容器/管:

首选:采集卡(绘画纸蛋白质节省903纸)

可以接受的:PerkinElmer 226(原seppo 226)滤纸或血液收集卡片

样品数量:5点血

收集产品说明:

1。另一个选择才是对病人采血1年以上的年龄是手指针刺。看到干血现货教程集合如何收集血液通过手指针刺点。

2。让干血滤纸在水平位置的环境温度至少3小时。3所示。不暴露标本高温或阳光直射。

4所示。不叠湿标本。

5。保持标本干燥。

样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏

附加信息:

1。由于低浓度的DNA产生了从血液,可能可能需要额外的标本来完成测试。

2。托收指示,请参阅血的地方收集指令

3所示。托收指示在西班牙,看到的血现货Card-Spanish指令集合(T777)

4所示。托收指示,明白了血现货Card-Chinese指令集合(T800)

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

形式

1。纽约Clients-Informed同意是必需的。请求的文档形式或电子订单,一份文件。下列文件中可用的特别指示:

- - - - - -基因检测的知情同意(T576)

- - - - - -为遗传Testing-Spanish知情同意(T826)

2。分子遗传学:先天性遗传性疾病患者信息(T521)在特殊指令

试样体积最小
定义样本的数量必须提供一个临床相关的结果取决于测试实验室

血:1毫升

血液斑点:3拳3毫米直径

拒绝原因
识别标本类型和条件可能会导致样品被拒绝

所有标本将评估在梅奥诊所实验室测试适用性。yabo208

样品稳定性信息
提供了一个描述运输所需的温度进行实验室的标本,替代还包括可接受的温度

标本类型 温度 时间 特种集装箱
不同 不同

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

证实诊断为脊髓性肌肉萎缩症由于核苷酸变异SMN1基因

二线载体筛查时脊髓性肌肉萎缩症家族史,但影响个人不是用于测试,或者当致病变种是未知的

二线载体筛查的生殖伙伴SMA携带者

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

测试包括的全部基因测序SMN1基因。

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

皮肤活检或培养的成纤维细胞标本,成纤维细胞培养测试将执行一个额外的费用。如果没有获得可行的细胞中,客户端会通知。

更多信息见继承了运动神经元病和痴呆测试算法

临床信息
讨论了生理学、病理生理学和一般临床方面,与实验室测试

脊髓性肌萎缩(SMA)是一种常染色体隐性神经肌肉疾病的特点是运动神经元变性导致肌肉萎缩与进步的瘫痪。基因复杂条件,传统上分为5个亚型,根据症状出现的年龄和运动实现的里程碑。表示的范围可以从在子宫内胎儿运动关节挛缩和缺乏(0)型,失去移动在青春期或成年期(IV型)。所有患者SMA开发匀称的肌肉不受控制,最常见的是影响近端肌肉。美国大学医学遗传学和基因组学(ACMG)建议提供SMA载体筛选所有夫妇,无论种族,在怀孕前或在怀孕早期。

最常见的SMA与损失有关的运动神经元存活(SMN)蛋白质,由2个或更多的基因编码的染色体上5。大多数SMN蛋白表达的运动神经元生存1 (SMN1)基因,但SMN的一小部分也由运动神经元生存2 (SMN2)基因。的确,SMN1SMN蛋白产量超过90%,而SMN2只有不到10%的剩余SMN蛋白这是因为SMN2不同于SMN1由5核苷酸,导致替代的第1外显子7拼接,并减少SMN2表达式。大多数人有2份SMN1,但是个人多达5份SMN1检测到。此外,个人也有0到5份SMN2

SMA是最常见的由外显子7的纯合缺失造成的SMN1。然而,一些患有这种疾病可能是复合杂合的,删除1份SMN1和其他的核苷酸变异等位基因。病人的疾病的严重程度相关课程的副本的数量SMN2目前,3或更多SMN2副本与一个温和的SMA表型有关。

本试验旨在专门确定核苷酸变异SMN1通过直接测序和区分这些核苷酸变异和变化SMN2。然而,SMN1外显子1变种仍无法区别在变化SMN2外显子1。

参考价值
描述参考区间和附加信息的解释测试结果。可能包括在适当的时间间隔根据年龄和性别。间隔Mayo-derived,除非另有指定。如果一个提供解释报告,参考价值字段将这个状态。

一个将提供解释报告。

解释
提供信息,协助解释测试结果

所有检测到的变化评估根据美国大学医学遗传学和基因组学的建议。(1)变体进行分类的基础上,预测,或可能的致病性和报告详细注释解释他们的潜在的或已知的意义。

注意事项
讨论了条件,可能会导致诊断的混乱,包括样本收集和处理不当,不恰当的测试选择、干扰物质

变异检测SMN1外显子1不能区别变异SMN2外显子1。因此,需要额外的分子分析来确认结果在这个地区。

一小部分人运营商或诊断为脊髓性肌肉萎缩症可能的变体被这种方法(如大型基因组缺失,发起人改变)。没有一个变体,因此,并不能消除的可能性正载体状态或脊髓性肌肉萎缩症的诊断。对于运营商测试,是非常重要的第一个文档的存在SMN1基因变异在一个家庭成员的影响。

在某些情况下,DNA变化的不确定的意义可能是确定的。

罕见的病变存在,可能导致假阴性或假阳性结果。如果结果不匹配的临床研究结果,应考虑额外的测试。

测试结果应解释在临床中发现,家族史和其他实验室数据。错误的解释结果可能发生如果资料不准确或不完整的。

临床参考
对临床性质的深入阅读的建议

1。理查兹,阿齐兹N,贝尔,et al:标准和指导方针的序列变异的解释:一个联合一致推荐的美国大学医学遗传学和基因组学和分子病理学协会。地中海麝猫。2015年5月,17 (5):405 - 424

2。Wirth B:一个更新的运动神经元生存基因的突变谱(SMN1)常染色体隐性脊髓性肌萎缩(SMA)。哼Mutat。2000; 15:228 - 237

3所示。克莱蒙特O, Burlet P, Benit P, et al:分子分析SMA患者没有纯合子SMN1删除使用新的策略SMN1微妙的突变的识别。哼Mutat。2004; 24:417 - 427

4所示。久保Y,西H,齐藤K: SMN1和混合SMN基因分析的新方法在脊髓性肌肉萎缩症使用远程PCR测序紧随其后。J哼麝猫。2015;60:233 - 239

5。前T,浸出我,Finanger E:脊髓性肌萎缩。:亚当MP, Ardinger HH,冰内生物RA, et al, eds。评论(互联网)的基因。华盛顿大学西雅图分校的;2000年。2019年11月14日更新。2020年9月28日通过。可以在www.ncbi.nlm.nih.gov网站/书/ NBK1352 /

6。人类基因突变数据库(HGMD),专业从BIOBASE 2017.2版本。数据库系突变的基因与人类遗传疾病有关。2017年9月12日通过。可以在https://portal.biobase-international.com/hgmd/pro/start.php

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法描述
描述如何执行测试并提供method-specific参考

Long-range-PCR的SMN1外显子2 - 8,紧随其后的是双向桑格所有蛋白质编码区域的核苷酸序列分析变异和内含子/外显子的边界SMN1SMN1外显子1是扩增和双向Sanger-sequenced菌进行基因。(未发表的梅奥法)

PDF报告
表明报告包括一个额外的文档是否与图表、图像或其他丰富的信息

没有

天(s)
概述了天测试执行。这个领域反映了天,样品必须在测试实验室开始测试过程,包括任何样品制备和测试执行之前处理时间。列出了一些测试,不断进行,这意味着化验白天多次执行。

不同

报告可用
时间的间隔(收到样品在梅奥诊所实验室结果可用)考虑标准设置和周末。yabo208第一天的时间通常是结果可用。最后一天的时间可能需要,占任何必要的重复测试。

14到20天

样品保留时间
轮廓的时间在测试标本保存在实验室之前就会被丢弃

全血:2周(如果可用);提取的DNA: 3个月

执行实验室的位置
表明实验室的位置执行测试

罗彻斯特

费用
几个因素决定执行一个测试的费用收取。联系你的美国或国际区域经理建立费用表的信息或了解更多关于资源优化测试的选择。

  • 授权用户可以登录测试价格费用的详细信息。
  • 客户没有测试价格可以联系亚搏一天24小时,一周7天。
  • 潜在客户应该联系他们的区域经理。寻求帮助,请联系亚搏

测试的分类
提供信息关于医疗器械分类为实验室测试工具和试剂。测试可以分为清除或通过美国食品和药物管理局(FDA)和每个制造商使用说明,或产品,不接受FDA审查和批准,并贴上一个分析物特定试剂(ASR)产品。

这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。

CPT编码信息
提供指导在决定适当的当前程序的术语(CPT)代码(s)为每个测试或概要信息。梅奥诊所上市CPT编码反映实验室的解释CPT编码需求。yabo208每个实验室有责任来确定正确的CPT编码用于计费。

CPT编码由执行实验室提供。

81336年

88233年组织培养、皮肤或固体组织活检(如果合适的话)

88240 -低温贮藏(如果合适的话)

LOINC®信息
提供指导在确定逻辑观察标识符名称和代码(LOINC)值的顺序和结果代码的测试。LOINC表演实验室提供的值。

测试Id 测试顺序的名字 订单LOINC价值
SMN1Z 满SMN1基因分析 94221 - 9
结果Id 测试结果的名字 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
602754年 结果总结 50397 - 9
602755年 结果 82939 - 0
602756年 解释 69047 - 9
602757年 额外的信息 48767 - 8
602758年 标本 31208 - 2
602759年 31208 - 2
602760年 发布的 18771 - 6

测试设置资源

设置文件
测试设置信息包含测试文件定义支持订单细节和结果之间的接口梅奥诊所实验室和实验室信息系统。yabo208

Excel|Pdf

样品报告
正常和异常样本报告作为参考提供报告的外观。

正常的报告|异常报告

如果样品报告
国际体系(SI)的单位报告提供有限数量的测试。这些报告仅用于国际帐户,只可以通过MayoLINK账户已定义接收他们。

如果正常的报告|如果异常报告