优先测试检测肺孢子菌
实时聚合酶链反应(PCR)
不同
这个测试应该执行与真菌文化;订单FGEN /真菌文化,习惯。
收集的标本必须在7天内到达;超过7天的标本将被拒绝。
标本来源是必需的。
| 问题ID | 描述 | 答案 |
|---|---|---|
| SRC63 | 标本来源 |
放大的高灵敏度聚合酶链反应需要的标本处理在一个环境污染的标本肺孢子菌物种的DNA是不可能的。
首选标本:胸膜、呼吸(如支气管肺泡灌洗(BAL),支气管洗,痰),或新鲜组织
可接受的标本:如果没有可用新鲜标本,消化呼吸道标本处理N-acetyl-L-cysteine-sodium氢氧化物(支持/氢氧化钠)是可以接受的(例如,落下帷幕,支气管洗衣、呼吸道液体,痰,或气管分泌物)
提交以下标本:只有1
首选
样品类型:体液
来源:胸膜
容器/管:无菌容器
样品数量:1毫升
附加信息:只吃新鲜的、non-NALC / NaOH-digested体液是可以接受的。
样品类型:呼吸
来源:洗落下帷幕,支气管、气管分泌物或痰
容器/管:无菌容器
样品数量:1毫升要是PCR命令或3毫升如果PCR下令涂片和文化
样品类型:组织
来源:呼吸
容器/管:无菌容器
样品数量:5 - 10毫米
收集产品说明:
1。提交新的组织。
2。保持组织湿润与无菌水或无菌生理盐水
可接受的
样品类型:支持/ NaOH-digested呼吸道标本
来源:落下帷幕,支气管冲洗、呼吸道液、痰、或气管分泌物
容器/管:无菌容器
样品数量:2毫升
收集产品说明:
1。提交样品消化处理支持/氢氧化钠。
2。容器和订单上标明试样消化标本。
如果不是电子订购,完成,打印和发送微生物测试请求(T244)标本。
体液或nondigested呼吸道标本:0.5毫升;新鲜的组织:5毫米;NALC-NaOH-digested标本:1毫升
| 胸膜液体以外的体液 血 骨 非呼吸道组织 骨髓 肺以外的器官组织 石蜡包埋组织 在厌氧生物标本瓶或病毒传输介质 粪便 拭子 组织在福尔马林液 尿液 |
拒绝 |
| 标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
|---|---|---|---|
| 不同 | 冷藏(首选) | 7天 | |
| 冻 | 7天 |
优先测试检测肺孢子菌
肺孢子菌机会性感染的肺炎是一个重要的原因是免疫力低下的患者,特别是那些与艾滋病毒。病原体,耶氏肺孢子菌,不能在体外培养,因此,实验室检测历来依靠微观识别直接从病人标本使用荧光染色或抗体。污渍通常缺乏敏感性和需要专业知识的读者来区分耶氏肺孢子菌从染色工件和其他真菌。这个实时聚合酶链反应分析提供了一个敏感的和具体的检测肺孢子菌从支气管肺泡灌洗液和其他呼吸道标本。
不适用
一个积极的结果表明存在肺孢子菌DNA。
一个消极的结果表明没有检测到
测试结果应作为辅助诊断,不应被认为是诊断。文献表明,肺孢子菌会导致无症状的殖民的健康个体和免疫力低下的人。因此,测试结果应与病人症状和临床表现。
并不排除负面结果的存在肺孢子菌或活动性疾病,因为生物体可能出现在检测不到的水平。
1。Senecal J,史密斯E,德尔Corpo O, et al:非侵入性诊断卡式肺肺炎:系统回顾和荟萃分析。Microbiol感染。2022年1月,28 (1):23-30。doi: 10.1016 / j.cmi.2021.08.017
2。Apostolopoulou, Fishman JA:耶氏肺孢子菌肺炎的发病机制和诊断。J真菌(巴塞尔)。2022年11月5;8 (11):1167。doi: 10.3390 / jof8111167
3所示。Fishman农协。耶氏肺孢子菌。Semin和保健医疗。2020年2月,41 (1):141 - 157。doi: 10.1055 / s - 0039 - 3399559
核酸提取使用麦格纳纯LC仪器(罗氏)。然后使用LightCycler放大实时提取聚合酶链反应(PCR)平台(罗氏)。扩增子的检测是基于荧光共振能量转移(FRET),利用杂交探针。特定微生物核酸的存在证实了扩增子的执行一个融化曲线分析。(小Uhl Arcenas RC Buckwalter SP, et al:实时PCR试验检测肺孢子菌从支气管肺泡灌洗液。成岩作用Microbiol感染说。2006年3月,54 (3):169 - 175)
周一到周日
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
87798年
| 测试Id | 测试顺序的名字 | 订单LOINC价值 |
|---|---|---|
| PNRP | 肺孢子菌PCR | 89996 - 3 |
| 结果Id | 测试结果的名字 | 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
|
|---|---|---|
| SRC63 | 标本来源 | 31208 - 2 |
| 81698年 | 肺孢子菌PCR,结果 | 89996 - 3 |
| 24188年 | 特殊的信息 | 48767 - 8 |
| 24189年 | 报告状态 | 不需要LOINC |