检测和识别分枝杆菌物种,诺卡氏菌属物种和其他有氧放线菌
识别执行使用Hologic / GenProbe AccuProbes选择分枝杆菌物种,基质辅助激光解吸电离时间飞行质谱(MALDI-TOF),或500 -碱基对16 s rRNA基因测序
结核分枝杆菌复杂的物种鉴定可以要求使用快速聚合酶连锁反应(PCR)的目标差异的地区(RD)基因组区域
| 测试Id | 报告名称 | 可单独购买 | 总是表现 |
|---|---|---|---|
| 我 | 由16 s测序ID | 不,(仅法案) | 没有 |
| RMALM | Id MALDI-TOF质量规范空军基地 | 不,(仅法案) | 没有 |
| RTBSP | Id, Mtb物种形成,PCR | 不,(仅法案) | 没有 |
| TBMP | 分枝杆菌探测识别 | 不,(仅法案) | 没有 |
| TBPB | 分枝杆菌探针识别肉汤 | 不,(仅法案) | 没有 |
| 技术性贸易壁垒 | 浓度、分枝杆菌 | 不,(仅法案) | 没有 |
| TISSR | 组织处理 | 不,(仅法案) | 没有 |
| LCTB | Id, MTB复杂快速PCR | 不,(仅法案) | 没有 |
自动检测的积极文化其次是生物识别/核酸探针/ DNA测序/基质辅助激光解吸/电离飞行时间(MALDI-TOF)质谱
抗酸杆菌涂片(空军基地)
耐酸的诽谤
杆菌、抗酸的
文化对结核病(肺结核)
分枝杆菌
诺卡氏菌属
涂片,Bacilli-AFB酸快
5180 -施莱
结核病(肺结核)文化
不同
1。标本来源是必需的。
2。提醒实验室如果分枝杆菌genavense怀疑,因为这个物种需要添加mycobactin J培养基的最佳生长和恢复。
| 问题ID | 描述 | 答案 |
|---|---|---|
| Q00M0014 | 标本来源 |
提交以下标本:只有1
样品类型:体液
容器/管:无菌容器
样品数量:1毫升
样品类型:骨髓
容器/管:SPS /隔离器系统、无菌容器,或绿色最高(锂或肝素钠)
样品数量:整个集合
样品类型:洗胃
容器/管:无菌容器
样品数量:10毫升
收集产品说明:中和标本收集的4小时内100毫克的钠碳酸盐每5到10毫升的洗胃。
样品类型:呼吸
来源:支气管肺泡灌洗液、支气管冲洗痰
容器/管:无菌容器
样品数量:3毫升
收集产品说明:
1。收集3呼吸道样本进行抗酸的涂片和培养临床和患者的胸部x光发现兼容肺结核。
2。这三个应采集标本8 - 24小时间隔24小时(如果可能的话),应包括至少1第一个早晨标本。
样品类型:凳子
供应:粪便收集装备,随机(T635)
容器/管:无菌容器
样品数量:5到10 g
样品类型:组织
容器/管:无菌容器
样品数量:5到10毫米
收集产品说明:收集新鲜的组织标本。
样品类型:尿液
容器/管:无菌容器
样品数量:20到50毫升
收集产品说明:收集一个随机尿液标本。
新鲜组织或体液是首选标本类型而不是拭子标本。
样品类型:拭子
来源:伤口、组织或体液
容器/管:文化传输拭子(noncharcoal) culturette或Eswab
样品数量:足够的标本
收集产品说明:
1。在收集标本,擦去任何过多的分泌和排泄,如果合适。
2。获取分泌物或流体与无菌拭子从源代码。
3所示。如果涂片和文化要求或细菌培养和分枝杆菌培养要求,收集第二次抽汲测试灵敏度最大化。
看到标本要求
| 血液或固定的组织 标本的病毒传输介质(包括但不限于M4、M5 BD病毒传输媒体,thioglycolate汤) 唾液 拭子呼吸道液体的来源(如痰) 拭子鼻、鼻窦,耳朵,嘴巴,喉咙,或头皮 木轴或木炭拭子 培养皿中 |
拒绝 |
| 标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
|---|---|---|---|
| 不同 | 冷藏(首选) | 7天 | |
| 环境 | 7天 |
检测和识别分枝杆菌物种,诺卡氏菌属物种和其他有氧放线菌
识别执行使用Hologic / GenProbe AccuProbes选择分枝杆菌物种,基质辅助激光解吸电离时间飞行质谱(MALDI-TOF),或500 -碱基对16 s rRNA基因测序
结核分枝杆菌复杂的物种鉴定可以要求使用快速聚合酶连锁反应(PCR)的目标差异的地区(RD)基因组区域
分枝杆菌物种负责重要的发病率和死亡率在免疫力低下和免疫活性的主机。结核分枝杆菌结核病的病原体,每年世界上造成近200万人死亡。Nontuberculous分枝杆菌等鸟型分支杆菌复杂和脓肿分枝杆菌引起各种感染(如呼吸道、皮肤和软组织)是重要的检测和正确识别为了帮助临床决策。大约有200种公认的分枝杆菌和识别这些生物的物种水平往往是需要帮助指导适当的治疗。虽然有可用于直接检测方法M肺结核、生长的有机体在文化媒体仍然需要允许进行药敏检测。这时,直接复合菌群的分子检测方法缺乏非结核分枝杆菌和增长文化对鉴定和药敏测试至关重要。
诺卡氏菌属物种和其他有氧放线菌(如Tsukamurella物种,Gordonia物种,红球菌属物种)也是很重要的病因以及隔离在文化媒体促进鉴定和药敏测试是很重要的。诺卡氏菌属和其他有氧放线菌在分枝杆菌生长介质,因此,建议订购一个分枝杆菌培养时感染这群有机体被怀疑。
负
最后一个负面报告发布后42天的孵化。
一旦检测到积极的文化。
复苏的分枝杆菌的数量取决于生物标本中,样本收集方法,方法的处理和病人等因素anti-mycobacteria疗法的使用。
附近潘塔抗生素使用洗液MGIT混合物,尽管所有未经消毒标本,分枝杆菌有抑制作用。
Bactec 460和Bactec MGIT 960系统进行了比较。共有1963名病人标本培养,其中包括1519呼吸道标本需要净化与氢氧化钠和444无菌标本不需要清除污染物。168文化增长抗酸的杆菌1或两个系统(积极性率8.5%)。积极的呼吸道标本的污染率为3.8%,Bactec MGIT 460和7.9%。污染无菌标本6.3% MGIT Bactec 460和10.1%。结合利率4.3% 460年Bactec MGIT和8.4%。分枝杆菌物种的整体复苏率,排除gordonae分枝杆菌,分别为82.8%、79.1%和78.4% Bactec 460 MGIT 960,分别和坚实的媒体。回收率460年Bactec MGIT 960被认为是等价的。
1。Pfyffer通用电气、Palicova F:分枝杆菌:一般特征;实验室检测和染色过程。卡罗尔:Versalovic J, KC,凡克G, eds。临床微生物学手册。10艾德,卷1。ASM出版社;2011:472 - 502
2。Tortoli E:微生物特性和临床意义的分枝杆菌属的新物种。中国Microbiol启2014年10月,27 (4):727 - 752。doi: 10.1128 / CMR.00035-14
3所示。威尔逊JW:诺卡氏菌病:更新和临床概述。梅奥Proc。2012年4月,87 (7):403 - 407
的BACTEC MGIT 960系统是专为分枝杆菌的快速检测在临床标本。该系统包括液体培养基(洗液MGIT分枝杆菌生长指示管),增长补充(洗液MGIT OADC浓缩),和一种抗生素的混合物(洗液MGIT附近潘塔)。洗液MGIT OADC富集提供了分枝杆菌的生长所必须的物质。洗液MGIT附近潘塔包含抗菌药物的混合物用于抑制污染细菌的生长。
荧光化合物是嵌入在硅胶上每个MGIT肉汤管的底部。这种化合物是敏感的存在氧气溶解在汤。最初,大量的溶解氧淬灭化合物的排放和小荧光可以被探测到。后,积极呼吸(增长)微生物消耗氧气,让荧光检测。
自动BACTEC MGIT 960系统监控的管每小时增加荧光。荧光分析是用来确定管instrument-positive,即测试包含可行的生物。文化管保持负至少42天,没有可见的迹象积极性和底片从仪器中删除。
除了MGIT管,麦德7 h10/7h10s琼脂双片接种和孵化在37度c .增长从正面MGIT管或琼脂板标识使用各种技术包括Hologic / GenProbe AccuProbes,基质辅助激光解吸电离时间飞行质谱(MALDI-TOF),或16 s rRNA基因测序。的结核分枝杆菌复杂将确定物种水平要求,使用快速聚合酶链反应。(马丁•我Pfyffer通用电气,帕里什N:分枝杆菌:一般特征、实验室检测和染色过程。:卡罗尔KC, Pfaller妈,兰德里ML, et al, eds。临床微生物学手册。12。卷1。ASM出版社;2019:558 - 575;穆瑟Halse助教,Escuyer VE、KA:评价一个管多路实时PCR的分化结核分枝杆菌复杂的临床标本。中国Microbiol。2011年7月,49 [7]:2562 - 2567。doi: 10.1128 / JCM.00467-11)
周一到周日
这个测试已经清除、批准或由美国食品和药物管理局是免税的,按照制造商的说明使用。性能特征验证了梅奥诊所的方式符合CLIA需求。
87116 -分枝杆菌培养
87015 -分枝杆菌文化、浓度(如果合适的话)
87118 - id MALDI-TOF质量规范空军基地(如果合适的话)
87150 -分枝杆菌探针识别、固体(如果合适的话)
87150 -分枝杆菌探测识别,肉汤(如果合适的话)
结核分枝杆菌87150 - id、物种形成、PCR(如果合适的话)
87153 -分枝杆菌测序鉴定(如果合适的话)
87176年组织处理(如果合适的话)
87150 -Id, MTB复杂快速PCR(如果合适的话)
| 测试Id | 测试顺序的名字 | 订单LOINC价值 |
|---|---|---|
| 施 | 分枝杆菌培养 | 50941 - 4 |
| 结果Id | 测试结果的名字 | 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
|
|---|---|---|
| 施 | 分枝杆菌培养 | 50941 - 4 |