提供预后信息新诊断患者b细胞慢性淋巴细胞白血病
这个测试是不适用为病人提供预后信息与其他b细胞肿瘤或造血肿瘤。
虽然变异状态的确定可以通过PCR Sanger测序,这种方法只允许用于分析单样本。下一代测序技术(上天)标志着一个重大的进步在现有桑格化验,允许批量样品分析和同时克隆的识别本肿瘤特异性重排序列重排,决心体细胞变异的百分比。
聚合酶链反应(PCR)和下一代测序
BCLL
IGVH
IGHV
接下来一代测序测试
体细胞突变(或Hypermutation)
慢性淋巴细胞白血病预后
不同
1。冷藏和环境标本必须在7天内到达的集合。
2。收集和包样品尽可能接近运输时间。
1。分子Hematopathology患者信息:b细胞慢性淋巴细胞白血病(CLL)IGVH和/或TP53体细胞突变测试(T711)是必需的,看到特殊指令。测试可能继续没有患者信息,然而,这有助于提供一个更全面的解释。要求供应商强烈建议填写表格并发送样品。
2。如果不提供形式,包括以下信息与测试要求:标本来源、相关病史(即CBC结果及相关临床讲义),和临床或形态学猜疑。
| 问题ID | 描述 | 答案 |
|---|---|---|
| MP005 | 标本类型 |
提交以下标本:只有1
样品类型:外周血
容器/管:
首选:薰衣草(EDTA)
可以接受的:黄色(ACD)
样品数量:4毫升
收集产品说明:
1。反几次混合血。
2。在原始管发送样品。
3。标签和血液标本。
样品的稳定性:冷藏/环境
样品类型:骨髓
容器/管:
首选:薰衣草(EDTA)
可以接受的:黄色(ACD)
样品数量:2毫升
收集产品说明:
1。反几次混合骨髓。
2。在原始管发送样品。
3。标签作为骨髓标本。
样品的稳定性:冷藏/环境
样品类型:从血液或骨髓中提取DNA
容器/管:1.5 - 2毫升有螺旋盖的管
试样体积:整个标本
托收指示:
1。标签样本中提取DNA,表明标本来源(血液或骨髓)。
2。所需的DNA量是50制程20 ng /制程的浓度
3所示。包括体积和浓度在管。
样品的稳定性:冷冻/冷藏(首选)
1。分子Hematopathology患者信息:b细胞慢性淋巴细胞白血病(CLL)IGVH和/或TP53体细胞突变测试(T711)是必需的,看的特别指示
2。如果不订购电子,完成,打印和发送Hematopathology /细胞遗传学测试要求(T726)标本。
血:1毫升
骨髓:1毫升
提取的DNA:看标本
| 严重溶血 | 拒绝 |
| 中等至严重凝结的 | 拒绝 |
| 标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
|---|---|---|---|
| 不同 | 不同 | 7天 |
提供预后信息新诊断患者b细胞慢性淋巴细胞白血病
这个测试是不适用为病人提供预后信息与其他b细胞肿瘤或造血肿瘤。
b细胞早期发育期间,本基因是由多个多态基因片段进行重组和选择,生成变量加入(VDJ)多样性组合是独一无二的每个B细胞的长度和序列。此外,新收购(体细胞)变化引入的变量(V)地区成熟的B细胞在淋巴结生发中心反应,这个过程被称为体细胞hypermutation (SHM)。因为慢性淋巴细胞白血病(CLL)来源于单个淋巴细胞的恶性转化,每个子细胞1或股票(有时)更为独特的“克隆”抗原受体基因重组,肿瘤细胞,因此,具体的(即肿瘤细胞“指纹”)。克隆IGHV基因hypermutation状态为慢性淋巴细胞白血病患者预后提供了重要信息和小淋巴细胞性淋巴瘤(SLL)。的存在本单孔位微吹气扰动被定义为超过2%的差异从生殖系VH基因序列的身份(变异),而小于或等于2%的差异被认为是没有SHM(不突变)。单孔位微吹气扰动的状态有明显的影响在慢性淋巴细胞白血病患者的中位生存。Hypermutation的本变量地区强烈预测预后良好,而缺乏变异预测预后差。
一个将提供解释报告。
体的存在与否hypermutation (SHM)免疫球蛋白重链基因(本)变量(V)地区的DNA将报道。大于2%的变异频率将报告为突变。百分比突变和V区等位基因重排中标识将被包含在报告中。
b细胞慢性淋巴细胞白血病(B-CLL)缺乏SHM的本V区域(不突变)与预后明显不如B-CLL包含的单孔位微吹气扰动本V地区(变异)。
这个测试是有用的为患者慢性淋巴细胞白血病(CLL),或小淋巴细胞性淋巴瘤(SLL)与血液或骨髓参与。体细胞的预后价值本V(本V)适用区域突变状态只有b细胞恶性肿瘤的亚型。
这个测试需要一个最低为了放大比例慢性淋巴细胞白血病单克隆b细胞克隆本基因重排。这个级别已经建立在5%的淋巴细胞(例如,由流仪immunophenotyping)。CLL人口低于5%将没有一个可靠的和可再生的克隆基因重排和测序下一代测序以确定体细胞突变状态通常会产生没有结果,或者可能是假阳性发现。因此,慢性淋巴细胞白血病样本提交必须有一个最低慢性淋巴细胞白血病单克隆b细胞淋巴细胞总数的5%的人口。
体细胞的预后意义hypermutation (SHM)状态时唯一已知的一个功能本重排标识(即在坐标系交界编码区没有过早预测蛋白质截断)。然而,各种各样的情况可能发生,临床意义不明。这些大致可以分为以下几点:
1。大于1的功能确定重排,与不和谐的突变状态
2。只确定非功能性重组
重组和突变状态达到或接近2%的截止进行解释时应特别谨慎,预后的目的,尤其是在整个本V无法测序序列由于使用框架区域1 (FR1) V区域引物。如果这样的结果确认,报告将提供一个适当的评论。
1。汉布林TJ,戴维斯Z,嘉丁纳Oscier DG,史蒂文森颗:不突变Ig V (H)基因与一个更激进的形式的慢性淋巴细胞白血病。血。1999年9月15日,94 (6):1848 - 1854
2。Damle RN, Wasil T,做F, et al:搞笑V基因突变状态和表达CD38小说在慢性淋巴细胞白血病预后指标。血。1999年9月15日,94 (6):1840 - 1847
3所示。Langerak啊,大卫F,图灵P, et al:免疫球蛋白序列分析和预测在慢性淋巴细胞白血病:ERIC审查委员会的指导方针可靠的解释有问题的情况。白血病。2011年6月,25 (6):979 - 984。doi: 10.1038 / leu.2011.49
DNA提取从全血或骨髓标本和本基因重组是放大了聚合酶链反应(聚合酶链反应)使用索引领袖和/或FR1向前引物。然后放大产品纯化DNA浓度测量。汇集患者样本(指数可识别的条形码)是下一代测序。随后FASTQC序列数据分析使用专有软件来识别本V重排和独特的序列。结果相比,生殖系IGHV序列数据库的软件计算百分比的身份肿瘤本V重排序列最接近的生殖系。重组包含一个变异的频率大于2%是解释为突变。重组包含变异频率小于或等于2%是解释为没有突变。(未发表的梅奥法)
周一,周三,周五
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
81263 -本(免疫球蛋白重链轨迹)(如白血病和淋巴瘤,b细胞),变量地区体细胞突变分析
| 测试Id | 测试顺序的名字 | 订单LOINC价值 |
|---|---|---|
| BCLL | 本体细胞Hypermutation B-CLL | 50627 - 9 |
| 结果Id | 测试结果的名字 | 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
|
|---|---|---|
| MP005 | 标本类型 | 31208 - 2 |
| 19674年 | 最后的诊断 | 50398 - 7 |
| 39465年 | BCLL结果 | 不需要LOINC |