敏感和快速诊断肺炎所致军团菌物种
分析是不推荐作为测试的成功治疗后治愈,因为细菌核酸可能持续。
快速聚合酶链反应(PCR)
Fluoribacter bozemanae
Fluoribacter dumoffii
军团菌
军团菌sp
军团菌spp
军团菌bozemanae
军团菌dumoffii
军团菌gormanii
军团菌hackeliae
军团菌jordanis
军团菌longbeachae
军团菌micdadei
军团菌oakridgensis
嗜肺性军团菌
军团菌wadsworthii
军团病
军团病
不同
标本来源是必需的。
| 问题ID | 描述 | 答案 |
|---|---|---|
| SRC57 | 标本来源 |
放大的高灵敏度聚合酶链反应需要的标本处理在一个环境污染的标本军团菌DNA是不可能的。
样品类型:下呼吸道
来源:支气管肺泡灌洗、支气管送气音/刷/灌洗/洗涤,气管、气管分泌物、送气音,痰容器/管:无菌容器
样品数量:1毫升
样品类型:新鲜组织或活组织检查
来源:肺、胸膜、心包,心脏瓣膜
容器/管:无菌容器
样品数量:整个集合或5毫米(3)——大约大小的铅笔橡皮擦
收集产品说明:无菌收集一块1到2厘米(3)的组织
样品类型:流体
来源:心包、胸腔、胸、胸管引流,胸腔穿刺术,积脓症
容器/管:无菌容器
样品数量:1毫升
如果不是电子订购,完成,打印和发送微生物测试请求(T244)标本。
| 组织在福尔马林、甲醛、丙酮 Formalin-fixed石蜡包埋块(FFPE) |
拒绝 |
| 标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
|---|---|---|---|
| 不同 | 冷藏(首选) | 7天 | |
| 冻 | 7天 |
敏感和快速诊断肺炎所致军团菌物种
分析是不推荐作为测试的成功治疗后治愈,因为细菌核酸可能持续。
军团病肺炎疫情期间首次承认在1976年在费城退伍军人大会。调查人员与CDC孤立的一部小说,革兰氏阴性杆菌,后来命名嗜肺性军团菌。现在普遍认识到我瞭解(和其他属的成员军团菌军团病的原因。
不适用
积极的聚合酶链反应(PCR)结果的一个特定的序列中找到军团菌5 s rRNA基因表示的存在军团菌可能是由于物种的DNA军团菌感染或环境/水军团菌DNA标本。
- PCR结果表明没有检测到军团菌标本的DNA,但不排除军团病可能出现假阴性结果由于抑制PCR,序列变异性的引物和探针,或存在的军团菌物种数量小于试验的检测极限。
这个试验不区分军团菌物种。假阳性结果理论上如果病人污染的标本军团菌DNA,这可能发生军团菌环境生物物种存在于水生环境。
下面的非同寻常的遇到的物种军团菌没有检测到这个试验:军团菌anisa,军团菌feeleii,军团菌maceachernii,军团菌parisiensis,军团菌sainthelensi。
在梅奥诊所的一项研究中,153年之前存档的呼吸道标本检测军团菌物种通过直接荧光抗体(DFA)提取测试和测试使用这种聚合酶链反应(PCR)方法。PCR分析特定的敏感和99.3%,100%相比,DFA。此外,30肺组织和30胸膜液体上升了3最常见的孤立军团菌物种。飙升的研究显示类似的分析灵敏度PCR和DFA方法。分析灵敏度小于50的目标/ 20微升的反应。没有观察到大当测试面板的呼吸道病原体或上呼吸道正常菌群的细菌。十三种嗜肺性军团菌(我瞭解血清型1 - 12,15/16)和9附加军团菌物种(Fluoribacter bozemanae军团菌,Fluoribacter(军团菌)dumoffii,军团菌gormanii,军团菌jordanis,军团菌longbeachae,军团菌micdadei,军团菌oakridgensis,军团菌hackeliae,军团菌wadsworthii)包含在面板与PCR检测方法。
1。海登RT, Uhl JR,钱其琛X, et al:直接检测军团菌物种从支气管肺泡灌洗和开放肺活检标本:比较LightCycler PCR、原位杂交、直接荧光抗原检测,和文化。中国Microbiol。2001;39(7):2618 - 2626。doi: 10.1128 / jcm.39.7.2618 - 2626.2001
2。Diederen BM、Kluytmans JA Vandenbroucke-Grauls厘米,此人MF:实用的实时PCR诊断军团病的常规临床实践。中国Microbiol。2008;46(2):671 - 677。doi: 10.1128 / JCM.01196-07。
3所示。MacDonell太Colwell RR: 5 s rRNA的核苷酸序列嗜肺性军团菌。核酸研究》1987年;15(3):1335。doi: 10.1093 / nar / 15.3.1335。
4所示。Rucinski SL,墨菲MP,黄铁矿KD,坎宁安SA Schuetz, Patel R: 8年临床军团菌的PCR测试演示了一个季节性模式。J感染说。2018年7月13日,218 (4):669 - 670。doi: 10.1093 / infdis / jiy201。
该方法采用有针对性的检测系统使用荧光共振能量转移(FRET)杂交探针设计为一个特定的序列中发现军团菌5 s核糖体rna基因。LightCycler仪器放大和监控目标核酸序列中被荧光聚合酶链支配(PCR)骑车。这是一个自动PCR系统能够迅速发现放大产品开发通过严格的空气缸温度循环和毛细管比色皿。放大产品的检测是基于为原则。担心产品的检测,与供体荧光团杂交探针,荧光素,3的结束是兴奋由外部光源,发光所吸收的第二个杂交探索受体荧光团,640年LC-Ted 5的结束。受体荧光团然后发出不同波长的光,可以测量信号正比于特定PCR产品的数量。检测过程完成后在一个小时内使用一个封闭的管道系统。坎宁安SA斯隆LM, Uhl JA等:验证一个实时PCR检测分析军团菌物种在呼吸道样本。摘要分子病理学协会的年度会议上,2009年大会,11月19日至22日,2009;Rucinski SL,墨菲MP,黄铁矿KD,坎宁安SA Schuetz, Patel r . 8年临床军团菌的PCR测试演示了一个季节性模式。J感染说。2018年7月13日,218 (4):669 - 670。doi: 10.1093 / infdis / jiy201)
周一到周日
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
87801年
| 测试Id | 测试顺序的名字 | 订单LOINC价值 |
|---|---|---|
| LEGRP | 军团菌PCR | 5020 - 3 |
| 结果Id | 测试结果的名字 | 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
|
|---|---|---|
| SRC57 | 标本来源 | 31208 - 2 |
| 29515年 | 军团菌PCR,结果 | 5020 - 3 |