测试标识符 :TPNUQ

Thioprine甲基转移酶和NudixHydle

实用性
推荐临床失序或设置

预测对thiopurine药毒的潜在作用(6-mercapurine,6-thioguaine和athioprine)

亮点

本测试包括基因组化TPMTNUDT15都影响thioprine药新陈代谢

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

方法名称
简单描述测试使用法

实时聚合链反射

纽约州可用
表示纽约州批准状态和测试对纽约州客户可排序性

报表名称
列表短或缩写版本

TPMT和NUDT15Genoi

异类
列表附加常用名测试辅助搜索

6-Mercaptopurine

6-Thioguaine

急性淋巴白血病

阿扎卓

Crohn疾病

炎波病

NUDT15

风波关节炎

锡欧浦林

TPMT

Ulceticle

mercaptoprine

二叉九

tmpt语言

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

特征类型
描述样本类型验证测试

变迁

排序指南

TPMT3/Thiopurine甲基转移物活动简介Erythrocytes但也应当排序测试,因为TPMT酶活动测试检测无法检测变异NUDT15并影响thioprine新陈代谢

特征需求
定义执行测试所需的最优试样和完成测试首选卷

单采样后可进行多基因型测试看吧多基因测试列表列表测试可同时排序

仅提交下列标本中的 1

特征类型 :全血

容器/图贝:稀疏顶部

样本量 :3mL

集合指令 :

开工多次反转混合血液

二叉发送全血液标本原型管非liquot

特征稳定信息环境9天/冷冻30天

特征类型 :萨利瓦

病人准备:病人在收集前30分钟不应吃、喝、吸或嚼口香糖

用品:Saliva Swab集合包(T786)

样本量 :1 Swab

集合指令 :收集并发送样本按装箱指令

特征稳定信息环形30天

特征类型提取脱氧核糖核酸

容器/管道2ml螺丝顶管

样板卷积:100mc

集合指令:

开工优先量为100mcl,浓度为50ng/mcl

二叉提供脱氧核糖核酸浓度和管体积

特征稳定信息:冻结/Ambient/Refricate

特殊指令
PDF库,包括有关测试的信息和表格

表单

开工纽约客户端非格式化协议文档请求表或电子命令副本存档下列文件可用性:

-知情录用基因测试576

-知情基因测试-西班牙文T826

二叉非电子排序完整打印并寄送下列表一标本

-神经学特殊测试客户端测试请求732

-气文学和肝学客户端测试请求728

-治疗测试请求831

样本最小量
定义样本量以提供测试实验室确定的临床相关结果最小量足以一次测试

血迹:0.4毫升

萨利瓦提取脱氧核糖核酸:见Specimen必备

拒绝到期
识别样本类型和条件可能导致样本被拒绝

yabo208所有样本都将在maio诊所实验室评估测试适配性

特征稳定信息
提供向执行实验室运输标本所需温度描述,并包括替代可接受温度

特征类型 温度学 时间轴 专用容器
变迁 变迁

实用性
推荐临床失序或设置

预测对thiopurine药毒的潜在作用(6-mercapurine,6-thioguaine和athioprine)

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

诊断信息
讨论生理学、病理学和泛临床方面,因为它们与实验室测试相关

thioprine药是净化非定时药,可用于处理急性淋巴性白血病、自动机失常(如克罗氏病、风波关节炎)和器官移植接收者thiopurine药、6-mercaptoprine药、6-thioguaine药和athioprine药类需要6-TGN倍增酶催化thioprine药的细胞毒理作用主要通过将6-TGN输入DNA和RNA实现。通向活性细胞毒性6-TGN路径与thioprine甲基转移酶催化的非激活路径竞争评估这条路径很重要,因为红细胞测量的6-TGN水平与thioprine疗效和毒效相关联,如Myelosuprition

TPM活动继承为单生同位特征,可变TPM活动与TPMT遗传变异TPM活动在红细胞中的分布是白人的三角模式,约0.3%的人有缺陷(不可解析)TPM活动,11%低(中间)活动,89%正常TPM活动正常TPM活动 Altele(Wild类型)已被指定TPMT*1.四TPMT由三种不同的单核变异物组合成的单核变异物占部分种族中大多数非激活变异物,包括白种TPMT*2,TPMT*3ATPMT*3C.少发生TPMT方位数TPMT*4,TPMT*5,TPMT*8TPMT*12并被指为缺缺算法万一TPMT变异方位通过此解析检测 最可能的基因型TPMT*1/*,不可排除其他稀有异同

Nudix流星体(NUDT15)被认为去phosrylatethioprines、TGTP和TdGTP等主动代谢物,这些代谢物防止它们融入脱氧核糖核酸并减少它们的细胞毒效遗传变异NUDT15下降活动与thiopurine相关近距离抑制关系密切NUDT15缺陷在东亚(22.6%)、南亚(13.6%)和美洲原住民(12.5%-21.2)中最为常见对其他人群的研究正在进行中本测试评价关联变量NUDT15*2、NUDT15*3、NUDT15*4NUDT15*5.万一NUDT15变异方位通过此解析检测 最可能的基因型NUDT15*1/*,不可排除其他稀有异同个人变异都TPMTNUDT15被识别并远比个体异兹古斯对单基因变异敏感两者整合TPMTNUDT15测试可更精确预测thiopurine相关毒性风险以引导服药,特别是在来自不同人群的病人中

表1TPMT单星 Ale

TPMT阿莱尔

CDNA核变化

NM_000367.4)

氨酸变化

对酶新陈代谢

#1

无(虚型)

无(虚型)

正常函数

2

238G>C

P.Ala80Pro(p.A80P)

无活动

3A

C.460G>A和C.719A

P.Ala154THRp.A154T和p.Tyr240Cys

无活动

3B

460G>A

P.Ala154THR

无活动

3C

719A>G

yr240Cys

无活动

4

C.626-1G>A

不适用,复用网站

无活动

5

C.146T>C

e.L.L.49Ser

无活动

8

644G>A

p.ARG215His

减少活动

12

C.374C>T

ser125Leu (p.S125L)

减少活动

表2NUDT15单星异耗

NUDT15阿莱尔

CDNA核变化

NM_018283.3)

氨酸变化

对酶新陈代谢

#1

无(虚型)

无(虚型)

正常活动

23

415C>T

P.ARG139Cys

无活动

4

416G>A

P.ARG139Hs

无活动

5

.52G>A

Val18I

无活动

美国食品药管局、临床药效实现集团和一些专业协会建议考虑TPMTNUDT15基因型测试或TPMT酶活动测试NUDT15基因型测试启动前使用thiopurine药有大量证据连接TPMTNUDT15基因型变异多斯调整基础TPMTNUDT15基因类型减低Thiopurine诱发的不利影响,同时不损及若干临床环境所期望的抗试管和免疫抑制治疗效果

Genotyping不受已知抑制TPM活动的其他药物影响辅助临床测试可用以测量红细胞活性(TPMT3/Thiopurine甲基转移酶活动简介,Erythrocytes),如果临床医生想检查TPMT较低酶活性,不管原因如何。TPMT酶活动测试不受变量影响NUDT15.

引用值
描述参考间隔和额外信息解释测试结果可酌情包括基于年龄和性别的间隔区间衍生马约,除非另行指定如果提供解析报告,引用值字段将说明这一点。

提供解析报告

传译
提供信息帮助解释测试结果

提供解析报告

上头TPMT基因型配星使用TPM名词委员会发布的标准Allic命名法NUDT15基因类型和关联星代数与Moriyama等人(2)描述并编目于药效变换财团(www.pharmvar.org)。

有关药理学基因及其相关药的更多信息见药理学协会.资源中还包括有关酶抑制器和诱导器的信息,以及潜在的替代药选择

警告符
讨论可能造成诊断混淆的条件,包括不当标本采集处理、不适当测试选择和干扰物质

稀有变异可能导致假阴性或假阳性结果万一TPMT变异方位通过此解析检测 最可能的基因型TPMT*1/*,不可排除其他稀有异同此外,如果没有NUDT15变异方位通过此解析检测 最可能的基因型NUDT15*1/*,不可排除其他稀有异同

如果遗传型结果与临床结果不匹配,应考虑对thioprine甲基转移酶活动进行额外测试(TPMT3/Thiopurine甲基转移酶活动简介Erythrocytes)。NUDT15的相应活动解析目前不可用

样本中可能含有捐献式脱氧核糖核酸,如果取自接受非液化输血或异源异构干细胞移植的病人从这些环境下获取样本的结果可能无法准确反映接收者基因型个人接受输血时,基因型通常在6周内恢复为接收者类型。个人接受异形异构干细胞移植时建议测试前移植脱氧核糖核酸标本

结果并不排除病人存取别式的可能性TPMTNUDT15或另一基因可影响药响应或副作用基因配置程序不区分异步形TPMT*3A从稀有TPMT*3B/*3C估计频率为1:120890稀有基因型与低酶活动相关昆虫活动评价对确定稀有基因类型(TPMT3/Thiopurine甲基转移酶活动简介Erythrocytes)十分必要

本测试无法检测全部TPMTNUDT15遗传变异负结果不排除使用thioprines产生毒性的可能性,因为已知多重因素(例如其他遗传因素、药物-药物交互作用)oprinol的共同处方可能会抑制TPMT活动显示抑制TPM活动的其他药包括环球药、ibuprofen药、ketoprofen药、furosemide药、sulfasalazine药、misalazine药、olsalazine药、mefenica

临床参考
深入阅读临床性质建议

开工TPMT命名委员会:TPMT命名表连通大学更新2019年5月访问2022年10月6日Available at https://liu.se/en/research/tpmt-nomenclature-committee

二叉MoriyamaT,NishiR,Perez-AndreuVetal:NUDT15多态改变thioprine代谢和异构毒纳吉特2016Apr;48(4):367-373i:10.1038/ng.3508

3级AppellML、BergJ、DuleyJ等:Thiopurine甲基转移酶基因名词药效基因组学2013年4月23(4):242-248doi:1 0.1097/FPC.0b013e32835f1cc0

4级guyen CMMMMMMDMDMJDTiopurine甲型转基因PLOS库尔2011年5月3日RRN1236i: 10.1371/流水.RRRN1236

5级RellingMV、SchwabM、Whirl-CarrilloM等:临床药效实现财团基于TPMT和NUDT15基因型指南2018更新林药厂20195 105(5):1095-1105i:10102/cpt1304

6级温希布伦R:Thiopurine药效学:Thiopurine甲基转移酶临床和分子研究药元DESPS2001 Apr;294Pt2:601-605

7扎扎G,CheokM,KrynetskaiaN等:Thiopurine路径药效基因组学2010年9月20(9):573-574doi: 10.1097/FPC.0b013e328334338f

方法描述
描述测试执行方式并提供方法专用参考

基因组式脱氧核糖核酸取自全血或唾液格诺调用TPMTNUDT15Alles使用聚合物链反射法5'nuclease解析荧光标签检测针向目标脱氧核糖核酸PCR用于放大含有多态学的DNA段检测探针与目标脱氧核糖核酸完全匹配时,5'核聚合酶会降解探针,报告染色从quencher染色效果释放并检测荧光信号Geno类型分配基于所有ele专用荧光信号检测

PDF报表
表示报表中是否包含带图表、图像或其他丰富信息的额外文档

天执行
轮廓测试执行现场显示样本必须在测试实验室开始测试过程,并包括测试前的任何样本准备和处理时间部分测试列为连续执行,这意味着日间多次执行解析

星期一至星期五

报表可用性
yabo208时间间隔(接收maio诊所实验室样本以获取结果),并计及标准搭建日与周末第一天通常需要时间提供结果最后一天可能需要时间 算出重复测试

2至4天

样本保留时间
轮廓测试标本在丢弃前存放在实验室

全血/唾液2周提取脱氧核糖核酸2个月

性能实验室定位
表示执行测试的实验室位置

罗切斯特

收费
数项因素决定执行测试收费联系你的美国或国际区域管理员信息建立收费表或学习更多资源优化测试选择

测试分类
提供医学设备分类信息实验室测试包和试剂测试可归为美国食品药品管理局清理或核准并按制造商指令使用或归为未经过FDA全面审核和批准的产品,并贴上分析专用试剂标签

测试开发完成,性能特征由maioClinic以符合CLIA要求的方式确定测试未经美国食品药管局审核或批准

CPT代码信息
指导确定当前程序术语代码信息对每次测试或剖面yabo208列表CPT编码反映Mayo临床实验室对CPT编码要求的解释由每个实验室负责确定正确的CPT代码用于计费

CPT代码由演艺实验室提供

0034U

LOINCQQ信息
指导判定逻辑观察标识器名称代码值LOINC值由演艺实验室提供

测试i 测试顺序名 指令LOINC值
TPNUQ TPMT和NUDT15Genoi 93193-1
结果Id 测试结果名 结果LOINC值
仅适用于执行实验室最初报告的单位计量结果值并不适用于转换为其他度量单位的结果
610159 TPMT基因型 41048-0
610160 TPMT物理类型 79713-4
610161 NUDT15热核 93194-9
610162 NUDT15基因型 93195-6
610163 传译 69047-9
610164 附加信息 48767-8
610165 方法论 850693
610166 免责声明 62364-5
610167 评委 18771-6

测试搭建资源

搭建文件
yabo208测试搭建信息包含测试文件定义细节支持顺序并产生maio诊所实验室与实验室信息系统接口

Excel应用|Pdf

样本报表
正常异常样本报告作为报告外观参考

正常报表|异常报表

SI样本报表
单元报告国际系统提供数目有限的测试这些报告供国际账号使用,仅通过mayeLINK账号提供,这些账号已被定义接收

SI正常报表|SI异常报告