测试标识符 :CRCGP

遗传肠癌板变换

实用性
推荐临床失序或设置

评估个人或家庭历史显示遗传肠癌或遗传多子综合症

建立遗传肠癌综合症或遗传多子综合症诊断,允许基于相关风险目标癌症监控

识别与胃肠癌和多子体风险增加相联的遗传变异性,允许预测测试和适当筛选有风险家庭成员

遗传测试信息
提供信息帮助选择正确基因测试或正确提交测试请求

本测试使用下一代排序检测26个基因单核素和拷贝变异物,这些基因与遗传直肠癌、胃癌或聚子体风险相关PARP运维包括推广者1A和1BATMAXIN2BMPR1ACDH1CHEK2CTNNA1EPCAM数位变异GREM1上流增强区域复制KIT、MLH1、MLH3、MSH2、MSH3、MSH6、MUTYH、NTHL1、PDGFRA、PMS2、PLD1、PETEN内含推介RNF43SMAD4STK11TP53.详情见方法描述目标基因方法细节.

识别致病变异物可能有助于诊断、预测、临床管理、家庭筛选和遗传咨询遗传肠癌综合症和遗传多子综合症

优先授权可用此解析 。

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

一级测试可考虑/推荐更多信息见ynch综合症测试算法.

方法名称
简单描述测试使用法

序列抓取和下一序量计算,聚合数链响应,Sanger定序和/或多路取用

纽约州可用
表示纽约州批准状态和测试对纽约州客户可排序性

报表名称
列表短或缩写版本

遗传GI癌症板

异类
列表附加常用名测试辅助搜索

减代多功能性

CMMRD

Coron癌症板

染色癌症板

立体错配补缺

考登综合症

family异常多波斯

FAP系统

胃癌

GI面板

遗传剖析癌症

ONCC

少年多功能综合症

LiFrameni综合症

IMAP大全

MYH关联多边邮箱

extGen定序测试

eutz-Jeghers综合症

复用词

PTEN-Hamartoma肿瘤综合症

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

一级测试可考虑/推荐更多信息见ynch综合症测试算法.

特征类型
描述样本类型验证测试

变迁

排序指南

自定义面板和单基因分析更多资料见CGPH/自定义Gene面板、推理学、下一序号、Varies

面向家庭变异测试(也称网站专用或已知变异测试)可供本板基因使用更多信息见FMTT/Familical变换、定向测试、Varies获取更多测试选项信息,电话800-533-1710

发运指令

Specimen宁可在96小时内赶到

必要信息

优先授权可用性不需要......如果继续事前授权过程,则随试样提交所需表格

特征需求
定义执行测试所需的最优试样和完成测试首选卷

病人准备:原骨髓移植自配方会干扰测试电话800-533-1710测试接受骨髓移植的病人指令

特征类型 :全血

容器/图贝:

首选 :淡顶部或黄顶

可接受性:任何抗coaplan

样本量 :3mL

集合指令 :

开工多次反转混合血液

二叉发送全血液标本原型管不解析.

特征稳定信息Ambient4天/冷冻

特殊指令
PDF库,包括有关测试的信息和表格

表单

开工纽约客户端非格式化协议文档请求表或电子命令副本存档

-知情录用基因测试576

-知情基因测试(西班牙语)T826

二叉分子遗传学:继承癌症综合症患者信息表519

3级遗传肠癌板前授权指令指令

4级非电子排序完整打印发送肿瘤测试请求729带标本

样本最小量
定义样本量以提供测试实验室确定的临床相关结果最小量足以一次测试

1 ml

拒绝到期
识别样本类型和条件可能导致样本被拒绝

yabo208所有样本都将在maio诊所实验室评估测试适配性

特征稳定信息
提供向执行实验室运输标本所需温度描述,并包括替代可接受温度

特征类型 温度学 时间轴 专用容器
变迁 变迁

实用性
推荐临床失序或设置

评估个人或家庭历史显示遗传肠癌或遗传多子综合症

建立遗传肠癌综合症或遗传多子综合症诊断,允许基于相关风险目标癌症监控

识别与胃肠癌和多子体风险增加相联的遗传变异性,允许预测测试和适当筛选有风险家庭成员

遗传测试信息
提供信息帮助选择正确基因测试或正确提交测试请求

本测试使用下一代排序检测26个基因单核素和拷贝变异物,这些基因与遗传直肠癌、胃癌或聚子体风险相关PARP运维包括推广者1A和1BATMAXIN2BMPR1ACDH1CHEK2CTNNA1EPCAM数位变异GREM1上流增强区域复制KIT、MLH1、MLH3、MSH2、MSH3、MSH6、MUTYH、NTHL1、PDGFRA、PMS2、PLD1、PETEN内含推介RNF43SMAD4STK11TP53.详情见方法描述目标基因方法细节.

识别致病变异物可能有助于诊断、预测、临床管理、家庭筛选和遗传咨询遗传肠癌综合症和遗传多子综合症

优先授权可用此解析 。

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

一级测试可考虑/推荐更多信息见ynch综合症测试算法.

诊断信息
讨论生理学、病理学和泛临床方面,因为它们与实验室测试相关

大约4%至6%的普通人发生染色癌症。 (1) 在某些情况下,个人或家族有染色癌症、胃癌或多子因遗传癌症综合症而可能增加癌症风险.(2,3)评价板上的基因对有直肠癌历史的家庭、胃癌家庭、多波斯或胃肠癌家庭有用,以确定癌症风险、监视建议和定向处理

最常见的遗传结核综合症Lynch综合症,约占所有结核癌症例的2%至4%Lynch综合症与不匹配修复基因中的子系变异相关MLH1,MSH2,MSH6,PMS2删除EPCAM系统基因(2,3)主要特征是染色体和内生癌症风险大增。(2,3)染色体癌症终生风险高度变量并依赖相关基因。(2,3)肿瘤谱中的其他恶性包括胃癌、卵巢癌、肝癌和上角极生癌和小肠癌

富集性个人和家庭也可能面临遗传多聚性综合症的风险,如家庭多聚性综合症(FAP)。PARP运维外表表现多变,包括胃和二元聚变器、安眠聚变器、骨质瘤、牙性异常(无损牙)、视色上皮先天性超肥化

已知其他基因还会导致遗传直肠癌、胃癌和胃肠癌。 (2) 与这些综合症相联的致癌风险不一。

国家综合癌症网络和美国癌症协会提供遗传肠癌综合症个人医疗管理建议

引用值
描述参考间隔和额外信息解释测试结果可酌情包括基于年龄和性别的间隔区间衍生马约,除非另行指定如果提供解析报告,引用值字段将说明这一点。

提供解析报告

传译
提供信息帮助解释测试结果

美国医学遗传学和基因组学学院建议评价所有检测变异 (5)变异根据已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性评论报告,详细说明其潜在或已知意义

警告符
讨论可能造成诊断混淆的条件,包括不当标本采集处理、不适当测试选择和干扰物质

临床关联度 :
测试结果应结合临床发现、家庭历史和其他实验室数据理解信息不准确或不完整时,结果误解可能发生

如果测试是由于临床上意义重大的家族历史完成的,则通常宜先测试受影响的家庭成员检测受影响家庭成员中可报告变异可允许对风险个人作更多信息测试

yabo208讨论额外测试选项可用性或帮助解释这些结果时,联系maio诊所遗传咨询师800-533-1710

技术约束
下一代测序可能检测不到所有类型基因组变异稀有案例可能出现假阴性或假阳性结果深度覆盖对目标区域可变性分析性能低于最低可接受标准或失灵区域基于这些限制,负结果并不排除诊断遗传失序疑似特定临床失序时,可考虑替代方法评价

可能有些区域基因无法通过排序或删除和重复分析有效评价,这些区域包括同族学区域、高抗量子素内容区和重复序列选择可报告变异性确认工作将以内部实验室标准为基础用替代方法完成

测试验证95%删除至75基对并插入至47b卸载插入量40分或40分以上,包括移动元插入量,可能比小deins更难可靠检测

删除/重复分析 :

本分析目标单倍删除/重复然而,在某些情况下单前解法无法实现,原因是单次减少序列覆盖或固有基因组复杂性平衡结构重排列(如移位和反转等)可能检测不到

本测试设计不是为了检测低量马赛斯或区分声波变异和子波变异万一检测到的变异体可能有体性,可能需要额外测试以澄清结果意义

基因可基于更新临床关联性增删最新基因列表包含于测试中,见目标基因方法细节.有关基因特效和技术约束的详细信息见方法描述或联系实验室遗传咨询师

如果病人有异构干细胞移植或最近输血,结果可能不准确,因为有捐献式脱氧核糖核酸yabo208调用mao诊所实验室指令测试接受骨髓移植的病人

变换策略重新分类:
目前,实验室系统审查先前分类变异非标准做法实验室鼓励保健提供者随时联系实验室学习特定变异分类如何随时间变化

变换评价:
变异评价和分类使用已出版的美国医学遗传学和基因学学院和分子病理学建议协会作为指南。 (5) 可考虑其他基因指南变量根据已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性注释报告,详细说明其潜在或已知意义分类为良性或似良性变量不报告

多线程评价工具可用于帮助解释这些结果硅评价工具预测精度高度依赖特定基因可用数据,定期更新这些工具可能导致预测随时间变化silco评价工具结果应谨慎解读和专业临床判断

临床参考
深入阅读临床性质建议

开工Howlader N,NooneAM,KrapchoM等:SEER癌症统计审查1975-2018年国家癌症学院更新2021年4月访问2022年11月8日Available at: https://seer.cancer.gov/csr/1975_2018/

二叉Gupta S,ProvenzaleD,Llor X等:NCCN指南Insights:遗传/家庭高危险评估JNTL康普尔坎昆网20199117(9):1032-104

3级Idos G, ValleL:Lynch综合症Adam MP、EvermanDB、MirzaaGM等编辑Gene审查[Internets]华府西雅图2004年Updated February 2, 2021.访问2022年11月8日Available at www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1211/

4级Smith RA、Andrews KS、BrooksD等:美国癌症筛选,2019年:审查当前美国癌症协会指南和当前癌症筛选问题CA癌症Jclin2019年5月69(3):184-210

5级理查斯S、AzizN和BaleS等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会联合协商一致建议基因医疗2015年5月17(5):405-424

方法描述
描述测试执行方式并提供方法专用参考

下一代测序和/或Sanger测序测试变量在编码区和经分析基因异次/Exron/ex人类基因组参考GRCh37/hg19构建用于序列阅读对齐至少有99%的基底覆盖深度超过30X单核变异估计感知度99%以上,删除插入值94%以上小于40基对b测试基因分析中是否存在删除和重复,NGS、多目依赖探解放大法和/或聚合物链反射法PCR和gel电阻测试MSH2基因学

可能有些区域基因无法通过排序或删除和重复分析有效评价,这些区域包括同族学区域、高抗量子素内容区和重复序列目标基因分析细节和未例行覆盖的具体基因区域见目标基因方法细节.未公开maio方法

选择可报告变异可用基于内部实验室标准的替代方法验证

Genes分析PARP运维包括推广者1A和1BATMAXIN2BMPR1ACDH1CHEK2CTNNA1EPCAM数位变异GREM1上流增强区域复制KIT、MLH1、MLH3、MSH2、MSH3、MSH6、MUTYH、NTHL1、PDGFRA、PMS2、PLD1、PETEN内含推介RNF43SMAD4STK11TP53

PDF报表
表示报表中是否包含带图表、图像或其他丰富信息的额外文档

辅助性

天执行
轮廓测试执行现场显示样本必须在测试实验室开始测试过程,并包括测试前的任何样本准备和处理时间部分测试列为连续执行,这意味着日间多次执行解析

变迁

报表可用性
yabo208时间间隔(接收maio诊所实验室样本以获取结果),并计及标准搭建日与周末第一天通常需要时间提供结果最后一天可能需要时间 算出重复测试

21至28天

样本保留时间
轮廓测试标本在丢弃前存放在实验室

全血2周提取脱氧核糖核酸:3个月

性能实验室定位
表示执行测试的实验室位置

罗切斯特

收费
数项因素决定执行测试收费联系你的美国或国际区域管理员信息建立收费表或学习更多资源优化测试选择

测试分类
提供医学设备分类信息实验室测试包和试剂测试可归为美国食品药品管理局清理或核准并按制造商指令使用或归为未经过FDA全面审核和批准的产品,并贴上分析专用试剂标签

测试开发完成,性能特征由maioClinic以符合CLIA要求的方式确定测试未经美国食品药管局审核或批准

CPT代码信息
指导确定当前程序术语代码信息对每次测试或剖面yabo208列表CPT编码反映Mayo临床实验室对CPT编码要求的解释由每个实验室负责确定正确的CPT代码用于计费

CPT代码由演艺实验室提供

81435

优先授权
优先授权可能为您的保险公司所要求

保险预授权可供测试使用表格可用性

yabo208病人经济援助可提供给合格者,从Mayo诊所实验室接收帐单的病人将获取资格和申请方式信息

LOINCQQ信息
指导判定逻辑观察标识器名称代码值LOINC值由演艺实验室提供

测试i 测试顺序名 指令LOINC值
CRCGP 遗传GI癌症板 进程内
结果Id 测试结果名 结果LOINC值
仅适用于执行实验室最初报告的单位计量结果值并不适用于转换为其他度量单位的结果
614695 测试描述 62364-5
614696 样板 3208-2
614697 源码 3208-2
614698 结果汇总 50397-9
614699 结果 82939-0
614700 传译 69047-9
614701 资源类 99622-3
614702 附加信息 48767-8
614703 方法论 850693
614704 Genes解析 48018-6
614705 免责声明 62364-5
614706 发布方式 18771-6

测试搭建资源

搭建文件
yabo208测试搭建信息包含测试文件定义细节支持顺序并产生maio诊所实验室与实验室信息系统接口

Excel应用|Pdf

样本报表
正常异常样本报告作为报告外观参考

正常报表|异常报表

SI样本报表
单元报告国际系统提供数目有限的测试这些报告供国际账号使用,仅通过mayeLINK账号提供,这些账号已被定义接收

SI正常报表|SI异常报告