跟踪异常生化结果显示暴风波
建立分子诊断系统
识别已知与暴风病关联的基因变量,允许预测性测试有风险家属
本测试使用下一代排序检测四大基因单核素和拷贝数变异FAH,HGD,HPD系统,泰特.看吧目标基因方法细节Tyrosine故障基因板方法描述补充细节
致病变异物识别可能有助于诊断、预测、临床管理、家庭筛选和暴风病遗传咨询
可考虑/推荐附加一级测试更多信息见指令指南
测试i | 报表名称 | 单独可用 | 一贯性能 |
---|---|---|---|
CULFB | Fibrolat基因测试文化 | 对 | 号 |
皮肤生物切片或培养纤维标本将附加电荷测试如果不能获取可行单元格,客户端会得到通知
序列抓取和定向下一序次排序后继聚合物链响应和Sanger定序
extGen定序测试
暴风病
发泡链etacase缺乏
皮肤生物切片或培养纤维标本将附加电荷测试如果不能获取可行单元格,客户端会得到通知
变迁
推荐的第一级生化测试包括定量等离子酸(AAQP/Amino酸、量化、等离子体酸)、尿有机酸(OAP/Organeces屏幕、随机式、乌里安式)和缩微胶片测量(SUAC/succnylacetone、Bloodspote)
自定义面板和单基因分析详情见CGPH/自定义Gene面板、转义式、下序式、Varies
病人准备:原骨髓移植自配方会干扰测试电话800-533-1710测试接受骨髓移植的病人指令
仅提交下列标本中的 1
特征类型 :全血
容器/图贝:
首选 :淡顶部或黄顶
可接受性:任何抗coaplan
样本量 :3mL
集合指令 :
开工多次反转混合血液
二叉发送全血液标本原型管不复数标注.
特征稳定信息安倍4天/冷冻14天
特征类型:皮肤活检
用品类Fibroblast生物感知传输介质
容器/管子静态容器使用标准细胞培养介质(例如最小基本介质,RPMI1640)。配有1%青霉素和复方素
样本卷4毫米重击
特征稳定信息:冷冻式/Ambient
附加信息 :CULFB/Fiblast文化生物化学测试或分子测试3至4周后才能进行基因测试
样板类型:culatedfroblast
容器/管道T-25瓶
样板卷积二叉
集合式指令发布:从另一个实验室的皮肤活检中提交可分解分解分解分解细胞从产前标本培养出细胞不被接受
特征稳定信息ient/refricate (<24小时)
附加信息 :CULFB/Fiblast文化生物化学测试或分子测试3至4周后才能进行基因测试
特征类型:血迹
用品:Card-Blood点记收集器(Filter纸张)(T493)
容器/管道:
首选集合卡
可接受性Perkinelmer226(前Ahlstrom226)滤纸或血迹采集卡
样本卷5血点
集合指令:
开工指针为1岁以上的病人提供替代验血选择看吧如何收集干血迹样本通过指棒
二叉使滤镜上血液干燥环境温度 水平定位最少3小时
3级不暴露标本热或直接阳光
4级不栈湿标本
5级保持标本干
特征稳定信息环境/冷冻
附加信息 :
开工低浓度脱氧核糖核酸取自血点,可能要求更多样本完成测试
二叉集合指令见血迹收集指令
3级西班牙文集合指令见血迹收集卡-西班牙指令777
4级中文集合指令见血迹收集卡指令(T800)
特征类型 :萨利瓦
病人准备:病人在收集前30分钟不应吃、喝、吸或嚼口香糖
用品:Saliva Swab集合包(T786)
样本量 :1 swab
集合指令 :收集并发送样本按装箱指令
特征稳定信息环形30天
附加信息 :低浓度脱氧核糖核酸从唾液中产生,可能需要更多样本来完成测试
见Specimen必备
特征类型 | 温度学 | 时间轴 | 专用容器 |
---|---|---|---|
变迁 | 变迁 |
跟踪异常生化结果显示暴风波
建立分子诊断系统
识别已知与暴风病关联的基因变量,允许预测性测试有风险家属
本测试使用下一代排序检测四大基因单核素和拷贝数变异FAH,HGD,HPD系统,泰特.看吧目标基因方法细节Tyrosine故障基因板方法描述补充细节
致病变异物识别可能有助于诊断、预测、临床管理、家庭筛选和暴风病遗传咨询
可考虑/推荐附加一级测试更多信息见指令指南
皮肤生物切片或培养纤维标本将附加电荷测试如果不能获取可行单元格,客户端会得到通知
Tyrosimeia类型1(haporealtyrosinimaia:HT-1)是一种自休症,因抗逆转录病毒阻隔水解HT-1主要影响肝脏、肾脏和外围神经,造成严重肝病、内核管机能失灵和神经故障多数患者在生命头几年因肝衰竭死亡,HT-1发生率约为十万分之一
等离子氨酸分析中增加强效性的其他原因包括二类强效血症、三类强效血症和Hawkinsinuria,尽管诊断结果通常基于Hawkinsin在尿液中的存在Alkaptonuria是暴雨退化路径上的另一个条件,特征是等离子和小便同质酸增加尿液变暗站立和碱化
提供解析报告
检测到的所有变异都根据美国医学遗传学和基因学学院的建议评价。 (1) 变异按已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性评论报告,详细说明其潜在或已知意义
临床关联度 :
测试结果应结合临床发现、家庭历史和其他实验室数据理解信息不准确或不完整时,结果误解可能发生
如果测试是由于临床上意义重大的家族历史完成的,则通常宜先测试受影响的家庭成员检测受影响家庭成员中至少一个可报告变异可允许对风险个人作更多信息测试
讨论额外测试选项的可用性或帮助解释这些结果时,联系Mayo实验室遗传咨询师800-533-1710
技术约束
下一代测序可能检测不到所有类型基因组变异稀有案例可能出现假阴性或假阳性结果深度覆盖对目标区域可变性分析性能低于最低可接受标准或失灵区域基于这些限制,负结果并不排除诊断遗传失序疑似特定临床失序时,可考虑替代方法评价
可能有些区域基因无法通过排序或删除和重复分析有效评价,这些区域包括同族学区域、高抗量子素内容区和重复序列选择可报告变异性确认工作将以内部实验室标准为基础用替代方法完成
测试验证95%删除至75基对并插入至47b插入/删除分量40或以上b
删除/重复分析 :
本分析目标单倍删除/重复然而,在某些情况下单前解法无法实现,原因是单次减少序列覆盖或固有基因组复杂性平衡结构重排列(如移位和反转等)可能检测不到
本测试设计不是为了检测低层次马赛斯或区分声波变异和子波变异万一检测到的变异体可能有体性,可能需要额外测试以澄清结果意义
基因可基于更新临床关联性增删参考目标基因方法细节Tyrosine故障基因板特殊指令最新基因列表有关基因特效和技术约束的详细信息见方法描述或联系实验室遗传咨询师
如果病人有异形异构干细胞移植或最近异式输血,结果可能不准确,因为有捐献式脱氧核糖核酸yabo208调用mao诊所实验室指令测试接受骨髓移植的病人
变式重新分类
此时,实验室系统审查先前分类变异非标准做法实验室鼓励保健提供者随时联系实验室学习特定变异分类可能随时间变化
变式评价
变量评价和分类使用出版的美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学建议协会指导也可考虑其他基因专用指南变量根据已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性注释报告,详细说明其潜在或已知意义分类为良性或似良性变量不报告
多线程评价工具可用于帮助解释这些结果硅评价工具预测精度高度依赖特定基因可用数据,定期更新这些工具可能导致预测随时间变化silco评价工具结果应谨慎解读和专业临床判断
开工理查斯S、AzizN和BaleS等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会联合协商一致建议基因医疗2015年5月17(5):405-424
二叉ChinskyJM Singh R和FiciolgluC等:诊断和处理tirosi基因医疗2017;1912doi:10.1038/gim.2017.10
3级OMIM203500 AlkaptonuriaAKU约翰霍普金斯大学更新时间:5月29日2019存取10月29日 2020https://omim.org/
下一代测序和/或Sanger测序测试变量在编码区和经分析基因异次/Exron/ex人类基因组参考GRCh37/hg19构建用于序列阅读对齐至少有99%的基底覆盖深度超过30X单核变异估计感知度99%以上,插入/删除小于40基对94%以上,删除最大达75bp和插入最大达47bgs和/或聚合物链反射法测试所分析基因中是否存在删除和复制
可能有些区域基因无法通过排序或删除和重复分析有效评价,这些区域包括同族学区域、高抗量子素内容区和重复序列看吧目标基因方法细节Tyrosine故障基因板目标基因分析细节和未例行覆盖的具体基因区域
Genes分析FAH,HGD,HPD系统,泰特
变迁
测试开发完成,性能特征由maioClinic以符合CLIA要求的方式确定测试未经美国食品药管局审核或批准
81406
81479
88233-Tisse培养、皮肤、固组织生物检测
88240-Cryop保留
81479(如果适合政府支付者)
测试i | 测试顺序名 | 指令LOINC值 |
---|---|---|
TyRGP系统 | 暴风病基因板 | 进程内 |
结果Id | 测试结果名 | 结果LOINC值
仅适用于执行实验室最初报告的单位计量结果值并不适用于转换为其他度量单位的结果
|
---|---|---|
608800 | 测试描述 | 62364-5 |
608801 | 样板 | 3208-2 |
608802 | 源码 | 3208-2 |
608803 | 结果汇总 | 50397-9 |
608804 | 结果 | 82939-0 |
608805 | 传译 | 69047-9 |
608806 | 资源类 | 99622-3 |
608807 | 附加信息 | 48767-8 |
608808 | 方法论 | 850693 |
608809 | Genes解析 | 48018-6 |
608810 | 免责声明 | 62364-5 |
608811 | 发布方式 | 18771-6 |