首选诊断试验的检测百日咳博德特氏菌或博代氏杆菌属parapertussis
聚合酶链反应(PCR) / DNA探针杂交
包括DNA制备标本、PCR扩增和杂交
百日咳博德特氏菌和parapertussis
Parapertussis
PCR(聚合酶链反应)
百日咳
聚合酶链反应(PCR)
百日咳
博代氏杆菌属parapertussis聚合酶链反应
博代氏杆菌属parapertussis快速PCR
百日咳博德特氏菌通过聚合酶链反应(PCR)检测
不同
标本来源是必需的。
扩增的PCR的灵敏度高要求要处理的标本在一个环境污染的标本博代氏杆菌属百日咳或博代氏杆菌属parapertussisDNA是不可能的。
提交以下标本:只有1
首选:
供应:
鼻咽拭子(人造丝Mini-Tip棍)(T515)
样品类型:鼻咽拭子
容器/管:人造丝拭子和一个铝轴放置在运输中如绿色在鼻咽拭子(人造丝mini-tip)和斯图尔特的媒体(无木炭)(T515),或斯图尔特用木炭,或定制有或没有木炭(Transwab鼻咽癌与木炭系统)。
附加信息:
1。拭子运输容器没有木炭必须包含一个脱脂棉饱和与斯图尔特的或定制的液体介质。清晰的半固态/固体媒体是凝胶,将被拒绝。
2。其他拭子或媒体类型可能抑制PCR检测和将被拒绝。
可以接受的:
样品类型:鼻咽癌(不是喉咙)吸入/洗鼻吸入/洗
容器/管:无菌容器与螺杆顶罩(没有传输媒体)
样品数量:整个集合
如果不是电子订购,完成,打印和发送微生物测试请求(T244)标本。
0.5毫升
其他 | 鼻子、鼻腔或咽喉拭子;藻酸钙或cotton-tipped拭子;拭子送检凝胶运输中,病毒/最普遍的交通工具,或里根劳媒体;ESwab;拭子和固体塑料轴;干拭子 |
标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
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不同 | 冷藏(首选) | 7天 | |
环境 | 7天 | ||
冻 | 7天 |
首选诊断试验的检测百日咳博德特氏菌或博代氏杆菌属parapertussis
博代氏杆菌属百日咳是百日咳的高度传染性病因代理人或百日咳。博代氏杆菌属parapertussis导致一个类似的,但一般不太严重的疾病。尽管疫苗接种工作,B百日咳在美国仍然很常见”,强调有效的诊断测试的必要性。在美国,百日咳是最常见的夏季末。百日咳疫苗并不能阻止Bparapertussis感染,通常发生在一个年轻的年龄比疾病所致B百日咳。百日咳的诊断是基于高临床指数对感染的嫌疑,连同确认实验室的测试。实验室检测方法包括核酸扩增检测(如PCR)、血清学、文化、直接荧光抗体测试。文化和直接荧光抗体试验受限于低敏感性,使核酸扩增试验和血清学测试的选择。
美国疾病控制和预防中心建议PCR检测患者疑似急性百日咳。B百日咳PCR检测大约两倍多的情况下,文化。B百日咳DNA可以检测到4周,或更长的时间在我们的经验(8周),(1)症状出现后。然而,随着时间的推移,的数量B百日咳和B parapertussisDNA将会减弱,使试验的敏感度降低。血清学的回应B百日咳通常由感染后2周内安装,因此,检测IgG-class百日咳毒素抗体(PT),仅仅是由哪一个B百日咳,可以是一个有用的辅助诊断在疾病的后期时的数量B百日咳可能会低于PCR检测的检测极限。
不适用
一个积极的结果表明DNA的存在百日咳博德特氏菌或B parapertussis。在某些情况下,病人可能同时测试呈阳性B百日咳和Bparapertussis。大与B holmesii和B bronchiseptica可能发生的B百日咳试验(见注意事项)。
一个消极的结果表明没有检测到B百日咳和BparapertussisDNA标本,但并不否定有机体的存在或积极或最近的疾病(抑制率< 1%)和可能发生由于抑制PCR、序列变化潜在的引物或探针,或存在的吗B百日咳或Bparapertussis量小于试验的检测极限。此外,患者出现症状后晚可能试验阴性;在这种情况下,测试B百日咳血清中抗体,免疫球蛋白,可以考虑。
大与博代氏杆菌属holmesii可能发生的B百日咳PCR分析。的患病率Bholmesii相对较低,积极性<鼻咽拭子的1%。(2)请注意,Bholmesii与pertussis-like有关症状。(2)
大的B百日咳与数量有限的试验已经证明博代氏杆菌属bronchiseptica隔离。插入序列的目标,是普遍的481年已报道,在1%和5%之间Bbronchiseptica隔离。
这个试验是不建议用于检查无症状的个体可能携带B百日咳或parapertussis。
这个试验的患者不建议跟进以前患百日咳(即作为测试治疗)。
一些B百日咳非细胞疫苗(即合一,Daptacel Adacel)包含PCR检测DNA。污染的标本与疫苗会导致假阳性B百日咳PCR结果。收集的标本不应暴露或加工领域B百日咳疫苗的材料。
分析目标multicopy插入基因序列,是481年,是1001年的,博代氏杆菌属百日咳和博代氏杆菌属parapertussis,分别。这个试验之前进行使用分析物特定试剂从罗氏诊断(3);这些试剂是不再可用。分析是使用探针和引物序列重新检验它,但提供的备用供应商。性能的新分析是与前面的试验相比,使用罗氏分析物的特定的试剂,使用374鼻咽拭子和洗液提交博代氏杆菌属测试。54个标本阳性(48博代氏杆菌属百日咳和6博代氏杆菌属parapertussis)和314年由化验标本呈阴性。五个鼻咽样本阳性博代氏杆菌属百日咳或博代氏杆菌属parapertussis新老分析化验和消极的。一个鼻咽样本呈阳性博代氏杆菌属百日咳由旧试验但负面的新的分析方法。总的来说,有98%(368/374)协议2化验。博代氏杆菌属holmesii不能区分开来博代氏杆菌属百日咳的测定。测定的灵敏度分析是1目标/制程/制程鼻咽癌洗鼻咽拭子和10个目标/吸入等。
1。Theofiles AG)坎宁安SA, Chia N, et al:百日咳疫情,明尼苏达州东南部,2012。梅奥Proc 2014年10月,89 (10):1378 - 1388
2。格思里杰,罗伯逊AV,唐P, et al:小说双实时PCR试验检测博代氏杆菌属holmesii标本pertussis-like患者症状在安大略省,加拿大。中国Microbiol 48:1435 2010; 1437年
3所示。斯隆LM,霍普金斯可,米切尔PS, et al:多路LightCycler PCR试验检测和分化百日咳博德特氏菌和博代氏杆菌属parapertussis在鼻咽样本。中国Microbiol 40:96 2002; 100年
LightCycler仪器平台放大和显示器的发展目标核酸序列后,荧光PCR的每个周期。放大产品的自动检测是基于荧光共振能量转移(FRET)原则。分析使用重复(50 - 100份)插入序列(481年)中发现的百日咳博德特氏菌和重复(35 -副本)插入序列(1001年)中发现的Bparapertussis作为目标。检测和分化博代氏杆菌属目标是通过熔化曲线分析。探针设计获得10度温度之间的转变B百日咳和Bparapertussis这是出现在融化曲线分析。分析PCR扩增和探针融化曲线是通过使用LightCycler软件来完成的。(斯隆LM,霍普金斯可,米切尔PS, et al:多路复用LightCycler PCR试验检测和分化百日咳博德特氏菌和博代氏杆菌属parapertussis在鼻咽样本。中国Microbiol 40:96 2002; 100)
星期一到星期五,星期天
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
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