探测和识别密码子替换的丙型肝炎病毒(HCV) NS3, NS5A,和NS5B基因组区域当前直接的抗病毒(DAA)产生耐药性的药物用于治疗慢性丙型肝炎感染由于HCV基因型1 a、1 b,或3(任何子类型)
引导启动或改变的抗病毒药物组合治疗慢性丙肝病毒感染
这个试验不被用作丙肝病毒感染的筛检试验。
这个测试应该不责令丙肝病毒感染由于基因型2、4、5、6。
本试验使用下一代测序检测和识别丙型肝炎病毒(HCV)抗病毒耐药在慢性丙型肝炎患者和那些被认为是直接的抗病毒药物联合治疗(DAA)。
这个测试可以用来预测治疗反应的可能性目前fda批准的DAA用于治疗慢性丙型肝炎的药物组合。
测试Id | 报告名称 | 可单独购买 | 总是表现 |
---|---|---|---|
HCVQN | 丙肝病毒RNA检测/定量,S | 是的 | 没有 |
只有有足够的测试是成功的丙型肝炎病毒(HCV) RNA存在于血清标本(即50000国际单位/毫升以上)前30天。如果丙肝病毒RNA水平在过去的30天内是未知的或不提供,然后HCVQN /丙型肝炎病毒(HCV) RNA检测和量化的实时一(rt - pcr)、血清将额外的费用。必要的信息。
聚合酶链反应(PCR)其次是下一代测序
丙肝病毒
HCVDR
丙肝病毒DAA阻力
丙肝病毒基因型
丙肝病毒基因分型
丙肝病毒耐药
抗丙肝病毒
丙肝病毒挥动
只有有足够的测试是成功的丙型肝炎病毒(HCV) RNA存在于血清标本(即50000国际单位/毫升以上)前30天。如果丙肝病毒RNA水平在过去的30天内是未知的或不提供,然后HCVQN /丙型肝炎病毒(HCV) RNA检测和量化的实时一(rt - pcr)、血清将额外的费用。必要的信息。
血清SST
这个测试的目的是检测现有抗病毒药物resistance-associated替换在个人已知感染丙型肝炎病毒(HCV)基因型1 a、1 b,或3(亚型)和正在考虑对HCV NS3、NS5A, NS5B抑制剂联合治疗。
请求这个测试之前,病人必须证实血清或血浆丙型肝炎病毒(丙肝病毒RNA水平的50000国际单位/毫升前30天内或更高版本和一个已知的HCV基因型1的结果,1 b或3(任何子类型)。下面的测试可以提供这些先决条件的结果:
-HCVQG /丙型肝炎病毒(HCV) RNA量化反射HCV基因型,血清
-HCVQN /丙型肝炎病毒(HCV) RNA检测和量化的实时一(rt - pcr)、血清
-HCVG /丙型肝炎病毒基因型,血清
1。立刻冻结血清,船在干冰冷冻标本。
2。如果货物将推迟24小时,冻结血清在-20到-80度C(60天)装运前在干冰。
必须回答以下两个问题的测试点(如果不订购电子,注意答案的测试要求):
1。什么是国际单位/毫升的丙肝病毒RNA水平在过去的30天内?(选择答案选项)
——< 50000
- 50000 - 1000000
- 1000001 - 10000000
- 10000001 - 100000000
- > 100000000
注意:如果这个问题的答案是不回答或者是“未知”,HCVQN /丙型肝炎病毒(HCV) RNA检测和量化的实时一(rt - pcr)、血清将被添加和执行一个额外的费用来确定是否适合这个测试血清标本。
2。病人有知道丙型肝炎基因型1,1 b,或3(亚型)吗?回答“是”或“不是”。
注意:测试订单提交标本用“不”回答这个问题将被取消。
供应:能整除的管5毫升(T465)
收集容器/管:血清凝胶
提交集装箱/管:塑料碗
样品数量:2.5毫升
收集产品说明:
1。离心机的血液每收集管收集管制造商的指令(如离心机和整除2小时内收集BD真空采血管管)。
2。整除血清成塑胶瓶。
1.6毫升
严重溶血 | 好吧 |
总脂血 | 好吧 |
总值黄疸 | 好吧 |
标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
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血清SST | 冷冻(首选) | 60天 | 能整除的管 |
冷藏 | 7天 | 能整除的管 |
探测和识别密码子替换的丙型肝炎病毒(HCV) NS3, NS5A,和NS5B基因组区域当前直接的抗病毒(DAA)产生耐药性的药物用于治疗慢性丙型肝炎感染由于HCV基因型1 a、1 b,或3(任何子类型)
引导启动或改变的抗病毒药物组合治疗慢性丙肝病毒感染
这个试验不被用作丙肝病毒感染的筛检试验。
这个测试应该不责令丙肝病毒感染由于基因型2、4、5、6。
只有有足够的测试是成功的丙型肝炎病毒(HCV) RNA存在于血清标本(即50000国际单位/毫升以上)前30天。如果丙肝病毒RNA水平在过去的30天内是未知的或不提供,然后HCVQN /丙型肝炎病毒(HCV) RNA检测和量化的实时一(rt - pcr)、血清将额外的费用。必要的信息。
Interferon-free,直接抗病毒因子(DAA)药物联合治疗慢性患者的护理标准丙型肝炎病毒(丙肝病毒)感染。然而,治疗依从性较差和预处理抗病毒耐药的存在可能会影响这些药物治疗的效果。天然(现有)或treatment-induced突变病毒基因组序列中目标的抗病毒药物可以导致抗病毒阻力和治疗失败。DAA治疗的上市后临床试验和研究表明,既存,resistance-associated替换(RAS)有关HCV基因组区域的某些基因型或出现某些RAS DAA治疗期间可能导致治疗失败。每当前建议FDA和专业社会实践指南(见表和临床参考部分),使用某些FDA批准的DAA药物治疗慢性HCV基因型1,1 b和3(亚型)需要预处理测试RAS相关丙肝病毒基因组区域指导选择最佳的DAA联合治疗。
丙肝病毒基因组DAA药物的目标
|
丙肝病毒基因型
|
||
1
|
1 b
|
3(任何子类型)
|
|
NS3/4 |
Glecaprevir (a) Grazoprevir (b) Voxilaprevir (c) |
Glecaprevir (a) Grazoprevir (b) Voxilaprevir (c) |
Glecaprevir (a) Voxilaprevir (c) |
NS5A |
Daclatasvir (d) Elbasvir (b) Ledipasvir (e) Pibrentasvir (a) Velpatasvir (c、f) |
Daclatasvir (d) Elbasvir (b) Ledipasvir (e) Pibrentasvir (a) Velpatasvir (c, e) |
Daclatasvir (d)
Pibrentasvir (a)
Velpatasvir (c, e)
|
NS5B |
Sofosbuvir (c, e, f, g) |
Sofosbuvir (c, e, f, g) |
Sofosbuvir (c、f, g) |
贸易的DAA的名字:
(一)Mavyret = Glecaprevir + Pibrentasvir
(b) Zepatier = Elbasvir + Grazoprevir
(c) Vosevi = Sofosbuvir + Velpatasvir + Voxilaprevir
(d) Daklinza = Daclatasvir
(e) Harvoni = Ledipasvir + Sofosbuvir
(f) Epclusa = Sofosbuvir + Velpatasvir
(g) Sovaldi = Sofosbuvir
抗病毒药物RAS相关丙肝病毒基因组区域可以检测并确定遗传型的使用Sanger测序或下一代测序(上天)方法。氨基酸的变化视为RAS NS3预计,NS5A, NS5B病人的丙肝病毒株序列通过比较他们预期在相关氨基酸密码子的位置在一个野生型丙肝病毒参考序列。DAA每个药物耐药性可能预测基于相关的RAS中丙肝病毒序列中发现病人的血清。预测丙肝病毒的抗病毒药物的耐药性在这个门店分析是基于fda批准的药物处方信息和专业社会实践指南(见表上www.hcvguidelines.org/evaluate/resistance)。
解释报告
解释抗病毒药物耐药性的分析是基于一个检测阈值的10% resistance-associated丙型肝炎病毒(HCV)变异出现在患者的血清标本(即最低10%频率的变异)。
这个试验将确认病人的HCV基因型,与可能的基因型1结果生成;1 b;1,没有亚型;2个;2 b;2,没有亚型;3个;3,没有亚型;4;4,没有亚型; 5a; 6a; 6, no subtype. However, analysis of resistance-associated substitutions (RAS) and prediction of antiviral drug resistance are restricted only to HCV genotype test results of 1a, 1b, 3a, or 3 no subtype.
不确定的结果表明测试失败,可能由于存在抑制物质的血清标本提交。一个新的血清标本应收集和提交以重新测试,如果临床表示。
不确定的结果是由于非典型的存在丙肝病毒基因组序列,如丙肝病毒株重组由来自多个基因的基因组序列、预防丙肝病毒基因型的明确的决心。
无法表明基因型鉴定无法可靠确定抗病毒的阻力,因为较低的HCV病毒载量(即< 50000国际单位/毫升)或模糊或不完整的丙肝病毒与分析目标序列生成。
预测阻力意味着RAS检测报告与降低易感性有关具体直接的抗病毒药物(DAA)。
可能抵抗意味着RAS发现可能与降低易感性有关特定DAA药物由于可能的抗力移转在同一类药物。当前的同行评议,报道没有足够的数据来明确排除抗病毒药物的耐药性。
不预测意味着未发现RAS和没有特定的DAA耐药性预计患者的丙肝病毒毒株。
抗病毒治疗病人的反应取决于多个因素,包括病人的丙型肝炎病毒(HCV)基因型,感染病毒毒株的特点,病人遵守规定的药物治疗,患者获得适当的护理,药物药物动力学和药物之间的相互作用。耐药性测试结果应该解释只有在结合临床表现及其他实验室标记当治疗决策。
缺乏抵抗药物并不排除水库的存在直接的抗病毒(DAA)防丙肝病毒在受感染的病人。
丙肝病毒基因型耐药性测试不是一个直接衡量抗病毒药物的耐药性。尽管基因型的测试可以检测resistance-associated替换(RAS)在相关的丙肝病毒基因组区域,这些RAS需要仔细的临床意义解释预测药敏。这个试验的能力放大和检测丙肝病毒的目标序列RAS可能有限,当血清HCV病毒载量低于50000国际单位/毫升由于丙肝病毒菌株的多样性。血清标本提交这个测试应该包含至少50000国际单位/毫升的丙肝病毒RNA。
1。Pawlotsky JM:丙型肝炎病毒抵抗interferon-free方案直接的抗病毒药物。胃肠病学。2016年7月,151 (1):70 - 86。doi: 10.1053 / j.gastro.2016.04.003
2。威尔DL, Luetkemeyer房颤:了解丙型肝炎病毒耐药性:对当前和未来的治疗方案的临床意义。小红伞地中海。2017;25 (3):103 - 109
3所示。索伯MC,集句V, Di Maio VC等:丙型肝炎病毒耐药性相关的替换和他们的临床意义:2018年更新。药物抵抗Updat。2018年3月,37:17-39。doi: 10.1016 / j.drup.2018.01.004
4所示。威尔DL:抵抗DAAs:当看,当它很重要。咕咕叫艾滋病众议员2017;12月14 (6):229 - 237。doi: 10.1007 / s11904 - 017 - 0369 - 5
5。欧洲肝脏研究协会:EASL建议在2018年治疗丙型肝炎。J乙醇。2018年8月,69 (2):461 - 511。doi: 10.1016 / j.jhep.2018.03.026
6。美国肝病研究协会和美国传染病学会:丙肝病毒指导:建议测试、管理和治疗丙型肝炎丙肝病毒抵抗底漆。2021年10月5日更新。2022年1月10日通过。可从www.hcvguidelines.org/evaluate/resistance上读取。
这个测试利用商用圣淘沙岛平方丙肝病毒基因分型检测,2.0 v,这是新一代测序分析基于“合成测序”的方法。试验旨在专门放大4序列从600年的1100个碱基对长度,坐落在三种不同的非结构性(NS)地区的丙型肝炎病毒(HCV)基因组:NS3 (67 RAS在15码位置),NS5A (52 RAS 13密码子的位置),和NS5B (7 RAS在4密码子的位置)。临床血清标本进行自动化的丙肝病毒RNA提取和纯化,其次是逆转录聚合酶链反应(rt - pcr)的丙肝病毒的目标序列,与系统控制和积极控制包含在每个试验运行质量控制目的。自动化DNA库执行准备使用放大产品,包括酶的剪切、适配器结扎、净化、正常化,DNA模板前准备和测序。与离子个人基因组测序反应进行机器(PGM)音序器,分析了装配序列数据和使用专利分析和解释软件应用程序。丙肝病毒genotype-specific抗病毒药物耐药性的解释是基于fda批准的药物处方信息和专业社会实践指南使用10%的变异检测中断阈值。(说明书:圣淘沙岛平方丙肝病毒基因分型检测v2.0(4), 0.1版。贝拉操作;不。PS103375A, 06/2017)
星期一到星期五
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
87900年
87902年
87522(如果合适的话)
测试Id | 测试顺序的名字 | 订单LOINC价值 |
---|---|---|
HCVDR | 丙肝病毒基因型耐药性,S | 82525 - 7 |
结果Id | 测试结果的名字 | 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
|
---|---|---|
604410年 | 丙肝病毒基因型耐药性,S | 77202 - 0 |
604376年 | 丙肝病毒基因型 | 92731 - 9 |
604377年 | HCV NS3拉 | 73654 - 6 |
604378年 | 在密码子序列失败: | 92732 - 7 |
604379年 | Glecaprevir阻力 | 92733 - 5 |
604380年 | Grazoprevir阻力 | 82523 - 2 |
604382年 | Voxilaprevir阻力 | 92734 - 3 |
604383年 | 丙肝病毒NS5A拉 | 73655 - 3 |
604384年 | 在密码子序列失败: | 92732 - 7 |
604385年 | Daclatasvir阻力 | 82379 - 9 |
604386年 | Elbasvir阻力 | 82376 - 5 |
604387年 | Ledipasvir阻力 | 82377 - 3 |
604388年 | Pibrentasvir阻力 | 92735 - 0 |
604389年 | Velpatasvir阻力 | 82520 - 8 |
604390年 | 丙肝病毒NS5B拉 | 73655 - 3 |
604391年 | 在密码子序列失败: | 92732 - 7 |
604392年 | Sofosbuvir阻力 | 82382 - 3 |
604393年 | 丙肝病毒基因型 | 92731 - 9 |
604394年 | HCV NS3拉 | 73654 - 6 |
604395年 | 在密码子序列失败: | 92732 - 7 |
604396年 | Glecaprevir阻力 | 92733 - 5 |
604397年 | Grazoprevir阻力 | 82523 - 2 |
604399年 | Voxilaprevir阻力 | 92734 - 3 |
604400年 | 丙肝病毒NS5A拉 | 73655 - 3 |
604401年 | 在密码子序列失败: | 92732 - 7 |
604402年 | Daclatasvir阻力 | 82379 - 9 |
604403年 | Elbasvir阻力 | 82376 - 5 |
604404年 | Ledipasvir阻力 | 82377 - 3 |
604405年 | Pibrentasvir阻力 | 92735 - 0 |
604406年 | Velpatasvir阻力 | 82520 - 8 |
604407年 | 丙肝病毒NS5B拉 | 73655 - 3 |
604408年 | 在密码子序列失败: | 92732 - 7 |
604409年 | Sofosbuvir阻力 | 82382 - 3 |
HCVKG | 是已知的HCV基因型1 a、1 b,还是3 ? | 86955 - 2 |
HCVLR | 丙肝病毒RNA水平国际单位/毫升持续30天= | 86955 - 2 |