建立一个分子诊断患有脑常染色体显性遗传的特性与皮层下梗死和脑白质病动脉病(CADASIL)和NOTCH3有关的疾病
识别中的致病变种NOTCH3基因与CADASIL和NOTCH3有关的疾病,使预测高危家庭成员的测试
这个测试利用新一代测序检测单核苷酸和拷贝数变异NOTCH3脑常染色体显性基因与动脉病与皮层下梗死和白质脑病(CADASIL)和其他NOTCH3有关的疾病。查看更多细节描述方法。
鉴定致病变种可能协助诊断、预后、临床管理、家族性筛选,复发风险评估和遗传咨询NOTCH3有关的疾病。
测试Id | 报告名称 | 可单独购买 | 总是表现 |
---|---|---|---|
FIBR | 成纤维细胞培养 | 是的 | 没有 |
CRYOB | 生物化学研究同行 | 没有 | 没有 |
如果收到皮肤活检,纤维母细胞生化研究文化和低温贮藏将增加额外的费用。
序列捕获和有针对性的下一代测序随后聚合酶链反应(PCR)和Sanger测序
次世代测序检测
CADASIL
LMS
脑膜侧综合症
NOTCH3-related障碍
如果收到皮肤活检,纤维母细胞生化研究文化和低温贮藏将增加额外的费用。
不同
目标测试(也称为特定站点或已知的变异测试)可发现这种基因变体。看到FMTT /家族突变,有针对性的测试,各不相同。
病人准备:先前的骨髓移植同种异体的捐赠会干扰测试。电话800-533-1710说明测试的病人接受了骨髓移植手术。
提交以下标本:只有1
样品类型:全血
容器/管:
首选:薰衣草(EDTA)或黄色大(ACD)
可以接受的:任何抗凝剂
样品数量:3毫升
收集产品说明:
1。反几次混合血。
2。在原始管发送全血标本。不整除。
样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏
标本类型:皮肤活组织检查
供应:成纤维细胞活检传输媒体(T115)
容器/管与任何标准细胞培养基:无菌容器(例如,最小的重要媒体,RPMI 1640)。解决方案应该补充青霉素和链霉素为1%。
试样体积:4毫米
样品稳定性信息:冷藏(首选)/环境
附加信息:一个单独的文化电荷将评估在FIBR /纤维母细胞生化和分子检测,组织。需要一个额外的4周文化成纤维细胞在基因检测可以发生。
标本类型:培养的成纤维细胞
容器/管:T-25瓶
标本体积:2烧瓶
集合指令:提交汇合的培养成纤维细胞从一个来自另一个实验室的皮肤活检。培养细胞的产前样品不会被接受。
样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏(< 24小时)
附加信息:一个单独的文化电荷将评估在FIBR /纤维母细胞生化和分子检测,组织。需要一个额外的4周文化成纤维细胞在基因检测可以发生。
标本类型:血液现货
容器/管:
首选:采集卡(绘画纸蛋白质节省903纸)
可接受的:PerkinElmer 226(原seppo 226)滤纸,或血液点收集卡片(T493)
试样体积:5点血
托收指示:
1。另一个选择才是对病人采血1岁以上是一个手指针刺。1岁以下的婴儿,应该使用一个跟贴。看到干血现货教程集合如何收集血液通过手指针刺点。
2。让干血滤纸在水平位置的环境温度至少3小时。
3所示。不暴露标本高温或阳光直射。
4所示。不叠湿标本。
5。保持标本干燥
样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏
附加信息:
1。托收指示,请参阅血位置指令集合。
2。托收指示在西班牙,看到的血现货Card-Spanish指令集合(T777)。
3所示。托收指示,明白了血现货Card-Chinese指令集合(T800)。
4所示。由于低浓度的DNA产生了从血液,可能可能需要额外的标本来完成测试。
样品类型:唾液
病人准备:病人不能吃、喝、吸烟或嚼口香糖30分钟前集合。
供应:唾液拭子采集设备(T786)
样品数量:1拭子
收集产品说明:收集和发送样品每箱指令。
附加信息:由于低浓度的DNA产生唾液,这是可能的,可能需要额外的标本来完成测试。
样品稳定性信息:周围30天
1。纽约Clients-Informed同意是必需的。请求的文档形式或电子订单,一份文件。
下列文件是可用的:
- - - - - -基因检测的知情同意(T576)
- - - - - -知情同意的基因检测(西班牙语)(T826)
看到标本要求
标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
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不同 | 变化(首选) |
建立一个分子诊断患有脑常染色体显性遗传的特性与皮层下梗死和脑白质病动脉病(CADASIL)和NOTCH3有关的疾病
识别中的致病变种NOTCH3基因与CADASIL和NOTCH3有关的疾病,使预测高危家庭成员的测试
这个测试利用新一代测序检测单核苷酸和拷贝数变异NOTCH3脑常染色体显性基因与动脉病与皮层下梗死和白质脑病(CADASIL)和其他NOTCH3有关的疾病。查看更多细节描述方法。
鉴定致病变种可能协助诊断、预后、临床管理、家族性筛选,复发风险评估和遗传咨询NOTCH3有关的疾病。
如果收到皮肤活检,纤维母细胞生化研究文化和低温贮藏将增加额外的费用。
脑常染色体显性遗传与皮层下梗死和脑白质病动脉病(CADASIL)是一种遗传性小血管疾病和中风和痴呆的常见的遗传原因的成年人。出现临床症状通常发生在mid-adulthood和可能包括复发性缺血性卒中和短暂性脑缺血发作,认知能力下降,发展到痴呆、偏头痛先兆的患者和精神障碍。对称和进步白质hyperintensities,假定血管起源的陷窝,皮层下梗死是神经影像学特征的发现。粒状osmophilic材料(傻子)电子显微镜在探测到CADASIL皮肤成纤维细胞被认为是一个特殊的发现。
的致病变种NOTCH3基因导致CADASIL。大多数人与CADASIL继承父母的条件,但罕见新创变异的报告。家族史可能出现负由于变量表达性的条件和故障识别症状在其他家庭成员的影响。此外,NOTCH3像重复由重复的表皮生长因子(EGFr)域。报道致病性变异通常导致损失或获得EGFr域内的半胱氨酸残基;这些影响表皮生长因子受体域1 - 6完全渗透,而影响EGRr域7-34可能与温和的疾病或不完全外显率。
杂合的致病性变异在NOTCH3也导致常染色体显性的脑膜侧综合症(LMS)。LMS是一种罕见的条件与多个侧脑脊髓膜突出,听力损失,发育迟缓,肌张力减退、关节hyperlaxity和变量更多的先天畸形。LMS通常发生由于新创致病变种,但罕见的实例继承的父已报告的影响。
一个将提供解释报告。
所有检测到变异评估根据美国大学医学遗传学和基因组学(ACMG)建议。(1)基于已知变异进行分类,预测,或可能的致病性和报告详细注释解释他们的潜在的或已知的意义。
临床相关性:
测试结果应解释在临床中发现,家族史和其他实验室数据。误解的结果可能发生如果提供的信息不准确或不完整的。
如果测试执行,因为临床上重要的家族史,这第一个测试通常是很有用的一个家庭成员的影响。检测可报告的变体的影响家庭成员将允许更多的信息检测的高危个体。
讨论额外的可用性测试选项或协助解释这些结果,梅奥诊所实验室遗传顾问800-533-1710联系。yabo208
技术上的限制:
下一代测序可能无法检测所有类型的基因变异。在极少数情况下,可能出现假阴性或假阳性结果。的深度报道可能变量对于一些目标区域;分析性能低于最低可接受的标准或失败的地区将会指出。考虑到这些限制,负面结果不排除遗传性疾病的诊断。如果一个特定的临床障碍被怀疑,可以被认为是评价的替代方法。
可能存在不能有效地评价区域的基因测序或删除和重复分析由于技术的局限性分析,包括区域的同源性、高guanine-cytosine (GC)内容,和重复序列。确认选择可报告的变异将由替代方法基于内部实验室标准。
这个测试是验证检测95%的删除75个碱基对47英国石油(bp)和插入。缺失插入(利林)40岁以上的英国石油公司,包括移动元素插入,可能不如小利林可靠地检测到。
删除/复制分析:
这种分析目标单一和multi-exon删除/复制;然而,在某些情况下单一外显子决议不能实现减少由于孤立序列覆盖或固有的基因组的复杂性。平衡结构重组(如易位和反演)可能不能被检测到。
这个测试不是为了检测低水平的镶嵌性或区分体细胞和生殖系变异。是否有可能检测到变异体细胞,额外的测试可能需要澄清的结果的意义。
关于基因的特定性能的详细信息和技术的局限性,看到方法描述或实验室基因顾问联系。
如果病人有同种异体造血干细胞移植或最近的异种输血,结果可能是不准确的,由于供体DNA的存在。叫梅奥诊所yabo208实验室说明测试的病人接受了骨髓移植手术。
变异的重新分类:
此时,它不是标准实践的实验室系统地回顾之前定期分类变量。实验室鼓励卫生保健提供者随时联系实验室学习特定的变体的分类可能已经改变了。
变体的评估:
执行评估和分类变量使用发表美国大学医学遗传学和基因组学和分子病理学协会作为指导原则建议。(1)其他gene-specific指南也可以考虑。基于已知变异进行分类,预测,或可能的致病性和报告详细注释解释他们的潜在的或已知的意义。变异分为良性或可能良性不报道。
多在网上评估工具可以用来帮助解释这些结果。预测的准确性由在硅片评估工具是高度依赖于数据对于一个给定的基因,并定期更新这些工具可能导致预测随时间变化的。结果在网上评估工具进行解释时应特别谨慎和专业临床判断。
1。理查兹,阿齐兹N,贝尔,et al:标准和指导方针的序列变异的解释:一个联合一致推荐的美国大学医学遗传学和基因组学和分子病理学协会。麝猫2015;17 (5):405 - 424
2。费E, Cudrici C, Boehm M: CADASIL:基础科学和临床方面的新进展。当今内科杂志。2019;26 (3):193 - 198
3所示。Rutten J,范Eijsden B, duer M等:NOTCH3致病性变异位置的影响CADASIL疾病严重程度:NOTCH3表皮生长因子受体1 - 6致病变种与更严重的表型相关和更低的生存与表皮生长因子受体7-34致病变种。地中海麝猫。2019年3月;21 (3):676 - 682
4所示。Canalis E:脑膜侧综合症的骨架。麝猫。2021年1月14日,11620334
下一代测序(上天)和/或执行Sanger测序检测中存在变异基因的编码区和内含子/外显子边界分析,以及一些其他地区已知致病变种。人类基因组参考GRCh37 / hg19构建用于序列读一致性。至少99%的基地覆盖在阅读的深度超过30 x。灵敏度是单核苷酸变异估计在99%以上,94%以上为删除/插入(利林)不到40碱基对(bp), 95%以上为删除75基点和插入到47个基点。门店和/或聚合酶链反应的量化方法执行测试的删减和复制的基因分析。
可能存在不能有效地评价区域的基因测序或删除和重复分析由于技术的局限性分析,包括区域的同源性、高guanine-cytosine (GC)内容,和重复序列。
的参考文本NOTCH3基因NM_000435.3。参考记录数字可能被更新由于成绩单版本控制。总是把最后一个病人报告基因转录时引用的测试信息。确认选择可报告的变异可能是由交替方法基于内部实验室标准。
基因分析:NOTCH3
不同
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
81479年
测试Id | 测试顺序的名字 | 订单LOINC价值 |
---|---|---|
NTC3Z | NOTCH3基因,基因分析 | 过程中 |
结果Id | 测试结果的名字 | 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
|
---|---|---|
616564年 | 测试描述 | 62364 - 5 |
616565年 | 标本 | 31208 - 2 |
616566年 | 源 | 31208 - 2 |
616567年 | 结果总结 | 50397 - 9 |
616568年 | 结果 | 82939 - 0 |
616569年 | 解释 | 69047 - 9 |
616570年 | 资源 | 过程中 |
616571年 | 额外的信息 | 48767 - 8 |
616572年 | 方法 | 85069 - 3 |
616573年 | 基因分析 | 82939 - 0 |
616574年 | 免责声明 | 62364 - 5 |
616575年 | 发布的 | 18771 - 6 |