测试标识符 :MNDP

继承汽车神经元病基因板

实用性
推荐临床失序或设置

建立分子诊断运动神经元疾病

识别已知与运动神经元疾病关联的基因变量,允许预测性测试有风险家属

遗传测试信息
提供信息帮助选择正确基因测试或正确提交测试请求

本测试使用下一代排序检测与运动神经元疾病关联的33个基因单核素数变异ALS2、ANXA11、ASAH1、CCNF、CHD10、CHMP2B、DTN1、ERBB4FIG4FUS、HNRPA1、HNRNPA2B1、KIF5A、MATR3NEFH、OTPN、PFNIF1SETX、SIGMAR1SOD1SPG11、SQSTM1TAF15、TBBPTK1TIA1、TUBA4A、UBQLN2VAPB、VCPVRK.聚合酶链反射解析用于检测C9orf72GGGGCC六核循环重复扩展看吧目标基因方法细节继承汽车神经元疾病基因板方法描述补充细节

识别致病变异物可能有助于诊断、预测、临床管理、复发风险评估、家庭筛选和运动神经元疾病的遗传咨询

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

特殊指令
PDF库,包括有关测试的信息和表格

方法名称
简单描述测试使用法

序列抓取和定向下调序后继聚合物链响应和Sanger定序

纽约州可用
表示纽约州批准状态和测试对纽约州客户可排序性

报表名称
列表短或缩写版本

运动神经元疾病基因板

异类
列表附加常用名测试辅助搜索

extGen定序测试

子宫横向硬化

初级横向硬化

初级肌肉萎缩

ALS系统

NPAN网

C9ALS/FTD

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

特征类型
描述样本类型验证测试

变迁

排序指南

一级诊断痴呆症或亚度侧缩测试为C9ORF/C9orf72Hexanuleotide重复式,分子分析式变换式,它包含于本测试中,但也可以单独获取

对有ALS和痴呆证据的个人,考虑AFTDP/继承前沿迟疑症和缩微分解基因板块

面向家庭变异测试(也称网站专用或已知变异测试)可供本板基因使用FMTT/Familical变异、定向测试、Varies获取更多测试选项信息,电话800-533-1710

自定义面板和单基因分析更多信息见CGPH/自定义Gene面板、推理式、下生成顺序变换

发运指令

Specimen宁可在96小时内赶到

特征需求
定义执行测试所需的最优试样和完成测试首选卷

病人准备:原骨髓移植自配方会干扰测试电话800-533-1710测试接受骨髓移植的病人指令

特征类型 :全血

容器/图贝:淡顶部或黄顶

可接受性:任何抗coaplan

样本量 :3mL

集合指令 :

开工多次反转混合血液

二叉发送全血液标本原型管非liquot

特征稳定信息Ambient (preferred)/Refrigerated

特殊指令
PDF库,包括有关测试的信息和表格

表单

开工纽约客户端非格式化协议文档请求表或电子命令副本存档

下列文件可用性:

-知情录用基因测试576

-知情基因测试(西班牙语)T826

二叉 分子遗传学:神经科病人信息

3级非电子排序完整打印发送神经学特殊测试客户端测试请求732标本

样本最小量
定义样本量以提供测试实验室确定的临床相关结果最小量足以一次测试

1 ml

拒绝到期
识别样本类型和条件可能导致样本被拒绝

yabo208所有样本都将在maio诊所实验室评估测试适配性

特征稳定信息
提供向执行实验室运输标本所需温度描述,并包括替代可接受温度

特征类型 温度学 时间轴 专用容器
变迁 变迁

实用性
推荐临床失序或设置

建立分子诊断运动神经元疾病

识别已知与运动神经元疾病关联的基因变量,允许预测性测试有风险家属

遗传测试信息
提供信息帮助选择正确基因测试或正确提交测试请求

本测试使用下一代排序检测与运动神经元疾病关联的33个基因单核素数变异ALS2、ANXA11、ASAH1、CCNF、CHD10、CHMP2B、DTN1、ERBB4FIG4FUS、HNRPA1、HNRNPA2B1、KIF5A、MATR3NEFH、OTPN、PFNIF1SETX、SIGMAR1SOD1SPG11、SQSTM1TAF15、TBBPTK1TIA1、TUBA4A、UBQLN2VAPB、VCPVRK.聚合酶链反射解析用于检测C9orf72GGGGCC六核循环重复扩展看吧目标基因方法细节继承汽车神经元疾病基因板方法描述补充细节

识别致病变异物可能有助于诊断、预测、临床管理、复发风险评估、家庭筛选和运动神经元疾病的遗传咨询

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

诊断信息
讨论生理学、病理学和泛临床方面,因为它们与实验室测试相关

运动神经元疾病有选择地影响运动神经元变位MND包括初级横向硬化症(PLS)、初级肌肉萎缩症(PMA)和亚元横向硬化症(ALS)。PLS和PMA中马达神经元变换分别限于上马达神经元和下马达神经元PLS的临床pheno类型可包括逐步递增腿弱和抽音性软弱ALS最常见的MND变换形式包括上下马达神经元并导致累进性肌肉弱化、瘫痪和呼吸机能故障致死Onset通常发生晚中生,死亡通常发生3至5年

六核重复扩展C9orf72基因是继承ALS最常见的原因,由本测试评估

引用值
描述参考间隔和额外信息解释测试结果可酌情包括基于年龄和性别的间隔区间衍生马约,除非另行指定如果提供解析报告,引用值字段将说明这一点。

提供解析报告

C9orf72重复数 :

常序alles(引用):<20GGGGCC重复

不定词源数:20-100GGGGCC重复

发病词代数:*>100GGGGGCC重复

精确截取致病性目前尚未定义需要额外研究确认致病性截值为100复数C9orf72相关故障C9orf72六核复用数以万计复用

传译
提供信息帮助解释测试结果

检测到的变量都根据美国医学遗传学和基因组学院建议评价。 (1) 变量根据已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性评论报告,详细说明其潜在或已知意义

警告符
讨论可能造成诊断混淆的条件,包括不当标本采集处理、不适当测试选择和干扰物质

临床关联度 :

测试结果应结合临床发现、家庭历史和其他实验室数据理解信息不准确或不完整时,结果误解可能发生

如果测试是由于临床上意义重大的家族历史完成的,则通常宜先测试受影响的家庭成员检测受影响家庭成员中可报告变异可允许对风险个人作更多信息测试

&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;讨论额外测试选项可用性或帮助解释这些结果时,联系maio诊所遗传咨询师800-533-1710

技术约束

下一代测序可能检测不到所有类型基因组变异稀有案例可能出现假阴性或假阳性结果深度覆盖对目标区域可变性分析性能低于最低可接受标准或失灵区域基于这些限制,负结果并不排除诊断遗传失序疑似特定临床失序时,可考虑替代方法评价

可能有些区域基因无法通过排序或删除和重复分析有效评价,这些区域包括同族学区域、高抗量子素内容区和重复序列选择可报告变异性确认工作将以内部实验室标准为基础用替代方法完成

测试验证95%删除至75基对并插入至47b卸载插入量40分或40分以上,包括移动元插入量,可能比小deins更难可靠检测

删除/重复分析 :

本分析目标单倍删除/重复然而,在某些情况下单前解法无法实现,原因是单次减少序列覆盖或固有基因组复杂性平衡结构重排列(如移位和反转等)可能检测不到

本测试设计不是为了检测低层次马赛斯或区分声波变异和子波变异万一检测到的变异体可能有体性,可能需要额外测试以澄清结果意义

基因可基于更新临床关联性增删参考目标基因方法细节继承汽车神经元疾病基因板最新基因列表有关基因特效和技术约束的详细信息见方法描述或联系实验室遗传咨询师

如果病人有异构干细胞移植或最近输血,结果可能不准确,因为有捐献式脱氧核糖核酸&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;调用mao诊所实验室指令测试接受骨髓移植的病人

变式重新分类

此时,实验室系统审查先前分类变异非标准做法实验室鼓励保健提供者随时联系实验室学习特定变异分类如何随时间变化扩大遗传知识范围后,实验室有可能发现与病人相关联的新信息。万一发生,实验室可发布修正报告

变式评价

变异评价和分类使用已出版的美国医学遗传学和基因学学院和分子病理学建议协会指南来进行。变量根据已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性注释报告,详细说明其潜在或已知意义分类为良性或似良性变量不报告

多线程评价工具可用于帮助解释这些结果硅评价工具预测精度高度依赖特定基因可用数据,定期更新这些工具可能导致预测随时间变化silco评价工具结果应谨慎解读和专业临床判断

稀有偶发或二次发现可能隐含另一种偏态或主动性疾病的存在将仔细审查这些结果,以确定是否将报告这些结果。

临床参考
深入阅读临床性质建议

开工理查斯S、AzizN和BaleS等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会联合协商一致建议Genet Med20155月17(5):405-424

二叉HardimanO, Al-ChalabiA,ChioA等Nat RevDS素数2017Oct53:17071

3级majziniR,FlynnLL,PitoutIL,FletcherS,WiltonSDAALS遗传学、机制学和治疗学:我们现在在哪里?前神经系统2019;13:1310

特殊指令
PDF库,包括有关测试的信息和表格

方法描述
描述测试执行方式并提供方法专用参考

下一代测序和/或Sanger测序测试变量在编码区和经分析基因异次/Exron/ex人类基因组参考GRCh37/hg19构建用于序列阅读对齐至少有99%的基底覆盖深度超过30X单核变异估计感知度99%以上,删除插件94%以上小于40基对bgs和/或聚合物链反射法测试所分析基因中是否存在删除和复制

可能有些区域基因无法通过排序或删除和重复分析有效评价,这些区域包括同族学区域、高抗量子素内容区和重复序列看吧目标基因方法细节继承汽车神经元疾病基因板目标基因分析细节和未例行覆盖的具体基因区域

选择可报告变异可用基于内部实验室标准的替代方法验证

复用复用复用求解法用于大小异耗约145次复用并检测GGGGCC六核复用C9orf72gene.(Ida CM、Lundquist PA、Bram E等:单管组合安普连长和重复优先访问PCR测试,用于临床检测和描述C9fs72六核列它重复扩展抽象7312017ACMG年度临床遗传学会议菲尼克斯AZ2017年3月23日)

Genes分析ALS2、ANXA11、ASAH1、CCNF、CHD10、CHMP2B、DTN1、ERBB4FIG4FUS、HNRPA1、HNRNPA2B1、KIF5A、MATR3NEFH、OTPN、PFNIF1SETX、SIGMAR1SOD1SPG11、SQSTM1TAF15、TBBPTK1TIA1、TUBA4A、UBQLN2VAPB、VCPVRK

PDF报表
表示报表中是否包含带图表、图像或其他丰富信息的额外文档

辅助性

天执行
轮廓测试执行现场显示样本必须在测试实验室开始测试过程,并包括测试前的任何样本准备和处理时间部分测试列为连续执行,这意味着日间多次执行解析

变迁

报表可用性
&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;时间间隔(接收maio诊所实验室样本以获取结果),并计及标准搭建日与周末第一天通常需要时间提供结果最后一天可能需要时间 算出重复测试

28至42天

样本保留时间
轮廓测试标本在丢弃前存放在实验室

全血:2周提取脱氧核糖核酸:3个月

性能实验室定位
表示执行测试的实验室位置

罗切斯特

收费
数项因素决定执行测试收费联系你的美国或国际区域管理员信息建立收费表或学习更多资源优化测试选择

测试分类
提供医学设备分类信息实验室测试包和试剂测试可归为美国食品药品管理局清理或核准并按制造商指令使用或归为未经过FDA全面审核和批准的产品,并贴上分析专用试剂标签

测试开发完成,性能特征由maioClinic以符合CLIA要求的方式确定测试未经美国食品药管局审核或批准

CPT代码信息
指导确定当前程序术语代码信息对每次测试或剖面&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;列表CPT编码反映Mayo临床实验室对CPT编码要求的解释由每个实验室负责确定正确的CPT代码用于计费

CPT代码由演艺实验室提供

81443

LOINCQQ信息
指导判定逻辑观察标识器名称代码值LOINC值由演艺实验室提供

测试i 测试顺序名 指令LOINC值
MNDP 运动神经元疾病基因板 进程内
结果Id 测试结果名 结果LOINC值
仅适用于执行实验室最初报告的单位计量结果值并不适用于转换为其他度量单位的结果
617650 测试描述 62364-5
617651 样板 3208-2
617652 源码 3208-2
617654 结果 82939-0
617655 传译 69047-9
617653 结果汇总 50397-9
61186 附加结果 进程内
617656 资源类 99622-3
617657 附加信息 48767-8
617658 方法论 850693
617659 Genes解析 48018-6
617660 免责声明 62364-5
617661 发布方式 18771-6

测试搭建资源

搭建文件
&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;测试搭建信息包含测试文件定义细节支持顺序并产生maio诊所实验室与实验室信息系统接口

Excel应用|Pdf

样本报表
正常异常样本报告作为报告外观参考

正常报表|异常报表

SI样本报表
单元报告国际系统提供数目有限的测试这些报告供国际账号使用,仅通过mayeLINK账号提供,这些账号已被定义接收

SI正常报表|SI异常报告

测试更新资源

更改类型 有效日期
新建测试 2022-12-06