建立分子诊断
识别内部变量TTR已知与amyroidosi相关联,允许预测测试有风险家庭成员
本测试使用下一代排序检测单核素数变异TTR.方法描述补充细节
识别致病变异物可能有助于诊断、预测、临床管理、复发风险评估、家庭筛选和阿米洛多斯遗传咨询
序列抓取和定向下调序后继聚合物链响应和Sanger定序
extGen定序测试
AmyloidosisfilityAmyloidosi
transyretin Gene
TTR(过渡性)Gene
ATTRZ
TTRZ
变迁
定点测试(也称网站专用或已知变异测试)可供变异测试使用TTR基因学FMTT/Familical变异、定向测试、Varies获取更多测试选项信息,电话800-533-1710
测试TTR基因部分定制面板可用更多信息见CGPH/自定义Gene面板、推理式、下生成顺序变换
Specimen宁可在96小时内赶到
病人准备:原骨髓移植自配方会干扰测试电话800-533-1710测试接受骨髓移植的病人指令
特征类型 :全血
容器/图贝:
首选 :淡顶部或黄顶
可接受性:任何抗coaplan
样本量 :3mL
集合指令 :
开工多次反转混合血液
二叉发送全血液标本原型管非liquot
特征稳定信息Ambient (preferred)/Refrigerated
1 ml
| 特征类型 | 温度学 | 时间轴 | 专用容器 |
|---|---|---|---|
| 变迁 | 变迁 | ||
建立分子诊断
识别内部变量TTR已知与amyroidosi相关联,允许预测测试有风险家庭成员
本测试使用下一代排序检测单核素数变异TTR.方法描述补充细节
识别致病变异物可能有助于诊断、预测、临床管理、复发风险评估、家庭筛选和阿米洛多斯遗传咨询
系统单片机体包含数种异语学失序,特征为外细胞蛋白沉积最常用的形式是获取的单片寄生虫二维至多线性或单克隆语组相异意义,即amyroid由免疫球素光链组成除光链阿米多斯症外,还有多类蛋白误积和降水引起的多类阿米多斯症并存式amyroidosis由于后天形式和遗传形式之间的临床重叠,必须确定亚虫病的具体类型,以便提供精确预测并考虑适当的治疗干预
最常见遗传阿米多斯症是家庭瞬态阿米多斯症,由变异在转盘中引起自序支配性失序TTR基因学由此生成的氨基酸替换可产生相对不稳定性、异语源TTR蛋白多数人开始显示三到七十年的临床症状典型地说,TTR关联型ayroidosi进程分5至15年递增,最常见的死因是心科病受感染者可能出现各种症状,包括外围神经病、失明、心智病、肾病、自动机神经机能失常或肠道机能失常
必须指出,这项分析没有检测与非TTR形式家庭阿米洛多斯化相关变异
提供解析报告
检测到的变量都根据美国医学遗传学和基因组学院建议评价。 (1) 变量根据已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性评论报告,详细说明其潜在或已知意义
临床关联度 :
测试结果应结合临床发现、家庭历史和其他实验室数据理解信息不准确或不完整时,结果误解可能发生
如果测试是由于临床上意义重大的家族历史完成的,则通常宜先测试受影响的家庭成员检测受影响家庭成员中可报告变异可允许对风险个人作更多信息测试
yabo208讨论额外测试选项可用性或帮助解释这些结果时,联系maio诊所遗传咨询师800-533-1710
技术约束
下一代测序可能检测不到所有类型基因组变异稀有案例可能出现假阴性或假阳性结果深度覆盖对目标区域可变性分析性能低于最低可接受标准或失灵区域基于这些限制,负结果并不排除诊断遗传失序疑似特定临床失序时,可考虑替代方法评价
可能有些区域基因无法通过排序或删除和重复分析有效评价,这些区域包括同族学区域、高抗量子素内容区和重复序列选择可报告变异性确认工作将以内部实验室标准为基础用替代方法完成
测试验证95%删除至75基对并插入至47b卸载插入量40分或40分以上,包括移动元插入量,可能比小deins更难可靠检测
删除/重复分析 :
本分析目标单倍删除/重复然而,在某些情况下单前解法无法实现,原因是单次减少序列覆盖或固有基因组复杂性平衡结构重排列(如移位和反转等)可能检测不到
本测试设计不是为了检测低层次马赛斯或区分声波变异和子波变异万一检测到的变异体可能有体性,可能需要额外测试以澄清结果意义
有关基因特效和技术约束的详细信息见方法描述或联系实验室遗传咨询师
如果病人有异构干细胞移植或最近输血,结果可能不准确,因为有捐献式脱氧核糖核酸yabo208调用mao诊所实验室指令测试接受骨髓移植的病人
变式重新分类
此时,实验室系统审查先前分类变异非标准做法实验室鼓励保健提供者随时联系实验室学习特定变异分类如何随时间变化扩大遗传知识范围后,实验室有可能发现与病人相关联的新信息。万一发生,实验室可发布修正报告
变式评价
变异评价和分类使用已出版的美国医学遗传学和基因学学院和分子病理学建议协会指南来进行。变量根据已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性注释报告,详细说明其潜在或已知意义分类为良性或似良性变量不报告
多线程评价工具可用于帮助解释这些结果硅评价工具预测精度高度依赖特定基因可用数据,定期更新这些工具可能导致预测随时间变化silco评价工具结果应谨慎解读和专业临床判断
稀有偶发或二次发现可能隐含另一种偏态或主动性疾病的存在将仔细审查这些结果,以确定是否将报告这些结果。
开工理查斯S、AzizN和BaleS等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会联合协商一致建议Genet Med20155月17(5):405-424
二叉ManganelliF,FabriziGM,LuigettiM,MandichP,MazzeoA,PareysonD遗传跨交解析概述神经科学2020年11月14日doi: 10.1007/s10072-020-04889-2.Epub前打印
下一代排序和/或Sanger排序测试编码区和数子/exTTR和其他一些已知致病变异人类基因组参考GRCh37/hg19构建用于序列阅读对齐至少有99%的基底覆盖深度超过30X单核变异估计感知度99%以上,删除插件94%以上小于40基对bgs和/或聚合物链反射量化法测试删除和重复TTR
可能有区域TTR无法通过排序或删除和重复分析有效评价,因为技术限制解析,包括同族学区域、高抗量子素内容和重复序列
参考转录TTR基因NM_000371.3引用转录数可因转录复用而更新常参考最终病人报告基因笔录信息测试时引用
选择可报告变异可用基于内部实验室标准的替代方法验证
变迁
测试开发完成,性能特征由maioClinic以符合CLIA要求的方式确定测试未经美国食品药管局审核或批准
81404
| 测试i | 测试顺序名 | 指令LOINC值 |
|---|---|---|
| TTRZ | TTRGene全基因分析 | 94225-0 |
| 结果Id | 测试结果名 | 结果LOINC值
仅适用于执行实验室最初报告的单位计量结果值并不适用于转换为其他度量单位的结果
|
|---|---|---|
| 61754 | 测试描述 | 62364-5 |
| 61755 | 样板 | 3208-2 |
| 617756 | 源码 | 3208-2 |
| 61757 | 结果汇总 | 50397-9 |
| 61758 | 结果 | 82939-0 |
| 61759 | 传译 | 69047-9 |
| 618194 | 附加结果 | 进程内 |
| 617760 | 资源类 | 99622-3 |
| 61776 | 附加信息 | 48767-8 |
| 61762 | 方法论 | 850693 |
| 617763 | Genes解析 | 48018-6 |
| 61764 | 免责声明 | 62364-5 |
| 61765 | 发布方式 | 18771-6 |