测试标识符 :FLFRN

CysticFibross Transmbrane行为管理器、FLFTR、全基因分析器、Varies

实用性
推荐临床失序或设置

后续测试识别个人变异并诊断囊性纤维化

识别非典型CF个人遗传变异

识别个人遗传变异,通过定向变异分析检测率低或因祖传背景未知

识别可能响应囊性纤维化转机调节器的病人FLFR强者理疗

遗传测试信息
提供信息帮助选择正确基因测试或正确提交测试请求

本测试使用下一代排序检测单核化物和拷贝数变异FLFR与囊性纤维化(CF)关联的基因

识别致病变异物可能有助于诊断、预测、临床管理、复发风险评估、家庭筛选和CF遗传咨询

反射测试
列表测试可加或不可加荷,视初始测试结果和解释而定

测试i 报表名称 单独可用 一贯性能
STR1 Comp分析使用STR 号单
STR2 添加'lcomp分析 w/STR 号单
CULFB Fibrolat基因测试文化
CULAF 亚虫流水文化/基因测试
MATTC 母细胞污染B

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

仅指产前标本:

-aminic流水(非容积培养细胞)接收后,aminic流水培养/遗传测试将附加电荷

接收chorionic villus标本(非容积培养细胞)后,基因测试的纤维化培养法将附加附加电荷

接收的任何产前样本,母细胞污染测试将附加电荷

皮肤生物切片或培养纤维标本
接收皮肤活检后,将附加电荷进行纤维放大培养测试如果不能获取可行单元格,客户端会得到通知

特殊指令
PDF库,包括有关测试的信息和表格

方法名称
简单描述测试使用法

顺序抓取和定向下级定序后继聚合数链响应和Sanger定序

纽约州可用
表示纽约州批准状态和测试对纽约州客户可排序性

报表名称
列表短或缩写版本

FFTRGene全基因分析

异类
列表附加常用名测试辅助搜索

extGen定序测试

CAVD自始自至终不见Vas Deferens

Vas Deferens先天缺失

CysticFibrosis

CysticFibross Transmembrane行为

脑膜炎

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

仅指产前标本:

-aminic流水(非容积培养细胞)接收后,aminic流水培养/遗传测试将附加电荷

接收chorionic villus标本(非容积培养细胞)后,基因测试的纤维化培养法将附加附加电荷

接收的任何产前样本,母细胞污染测试将附加电荷

皮肤生物切片或培养纤维标本
接收皮肤活检后,将附加电荷进行纤维放大培养测试如果不能获取可行单元格,客户端会得到通知

特征类型
描述样本类型验证测试

变迁

排序指南

测试不优选囊囊筛选CFMP/CysticFibrosisFLFRGene变换板Varies

家庭变异物定向测试(也称网站特异或已知变异测试)可供FFTR基因识别变异FMTT/Familical变异、定向测试、Varies获取更多测试选项信息,电话800-533-1710

附加测试需求

所有产前标本必须配有母血标本;mATCC/MDLC/MDLC样本定序数必须不同于产前标本.

线性血液标本:母细胞沾染研究提供有序性MATCC单序数下索血和母标本.验血测试不进行CCC研究,但如果CCC在场则结果失密

发运指令

Specimen宁可在96小时内赶到

特征需求
定义执行测试所需的最优试样和完成测试首选卷

病人准备:原骨髓移植自配方会干扰测试电话800-533-1710测试接受骨髓移植的病人指令

仅提交下列标本中的 1

特征类型 :全血

容器/图贝:

首选 :淡顶部或黄顶

可接受性:任何抗coaplan

样本量 :3mL

集合指令 :

开工多次反转混合血液

二叉发送全血液标本原型管非liquot

特征稳定信息Ambient4天/冷冻

特征类型:皮肤活检

用品类Fibroblast生物感知传输介质

容器/管子静态容器使用标准细胞培养介质(例如最小基本介质,RPMI1640)。配有1%青霉素和复方素

样本卷4毫米重击

特征稳定信息:冷冻式/Ambient

附加信息CULFB/Fiblast文化生物化学测试或分子测试3至4周后才能进行基因测试

样板类型:cultidFiblasts

容器/管道T-25瓶

样板卷积二叉

集合式指令发布:从另一个实验室的皮肤活检中提交可分解分解分解分解细胞

特征稳定信息ient/refricate (<24小时)

附加信息CULFB/Fiblast文化生物化学测试或分子测试3至4周后才能进行基因测试

由于产前检验的复杂性,所有产前检验均需咨询实验室产前标本周一至周四发送,下午5点前接收中心时间周五处理

特征类型 :防水流水

容器/图贝:防水流水容器

样本量 :20ml

特征稳定信息Refrigerated (preferred)/Ambient

附加信息

开工CULAF/Civil for遗传测试Amniotic Fluid下将评估单立文化收费基因测试前需要2至3周培养羊水

二叉所有产前标本必须配有母血标本;mATCC/MDLC/MDLC样本

特征类型:Chorionic villi

容器/图贝:15mL管装15mL运输媒体

样本量 :20毫克

特征稳定信息冷冻

附加信息 :

开工CULFB/Fiblast文化生物化学测试或分子测试基因测试前需要2至3周来培养chorionic villi

二叉所有产前标本必须配有母血标本;mATCC/MDLC/MDLC样本

特征类型 :松散培养单元

容器/图贝:T-25瓶

样本量 :2浮点

集合指令 :提交从另一个实验室培养的细胞

特征稳定信息Ambient (preferred)/Refrigerated

附加信息:所有产前标本必须配有母血标本;mATCC/MDLC/MDLC样本

特殊指令
PDF库,包括有关测试的信息和表格

表单

开工纽约客户端非格式化协议文档请求表或电子命令副本存档下列文件可用性:

-知情录用基因测试576

-知情基因测试(西班牙语)T826

二叉分子遗传学:遗传固有疾病患者信息521

拒绝到期
识别样本类型和条件可能导致样本被拒绝

&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;所有样本都将在maio诊所实验室评估测试适配性

特征稳定信息
提供向执行实验室运输标本所需温度描述,并包括替代可接受温度

特征类型 温度学 时间轴 专用容器
变迁 变迁

实用性
推荐临床失序或设置

后续测试识别个人变异并诊断囊性纤维化

识别非典型CF个人遗传变异

识别个人遗传变异,通过定向变异分析检测率低或因祖传背景未知

识别可能响应囊性纤维化转机调节器的病人FLFR强者理疗

遗传测试信息
提供信息帮助选择正确基因测试或正确提交测试请求

本测试使用下一代排序检测单核化物和拷贝数变异FLFR与囊性纤维化(CF)关联的基因

识别致病变异物可能有助于诊断、预测、临床管理、复发风险评估、家庭筛选和CF遗传咨询

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

仅指产前标本:

-aminic流水(非容积培养细胞)接收后,aminic流水培养/遗传测试将附加电荷

接收chorionic villus标本(非容积培养细胞)后,基因测试的纤维化培养法将附加附加电荷

接收的任何产前样本,母细胞污染测试将附加电荷

皮肤生物切片或培养纤维标本
接收皮肤活检后,将附加电荷进行纤维放大培养测试如果不能获取可行单元格,客户端会得到通知

诊断信息
讨论生理学、病理学和泛临床方面,因为它们与实验室测试相关

Cystic Fibross(CF)经典形式是一种严重的自闭症,特征为慢阻肺病和静脉不全等不同程度。 (1) 临床诊断通常是基于这些特征,并伴有阳性氯化物测试或正鼻辨别。(1)CF也可以有非典型描述方式(lclFLFR相关故障FLFR相关代谢综合症(CRMS),并可能仅表现为先天性疏漏或慢性异性囊炎。 (2) 数个州对CF进行了新生儿筛选,通过测量滤镜采集的干血原素识别潜在影响个人

迄今,2000年以上变异式已在囊性纤维化转导调节器内描述(Cystic Fibrosis Transmrane行为规范器内描述)(FLFR最常用变异tf508占全世界变异约67%,北美白人约70%至75%(4) 剩余变异多为稀有,尽管某些变异在某些ecries或CFRD或CRMS等非典型表达方式中相对高发率

如果诊断或怀疑CF完全基因分析FLFR基因可转基因确认诊断完全基因删除/重复分析FLFR基因识别98%以上序列变异

值得注意的是FLFR强效疗法可改善对CF诊断的病人的临床结果并至少复制一份选择子类变异

引用值
描述参考间隔和额外信息解释测试结果可酌情包括基于年龄和性别的间隔区间衍生马约,除非另行指定如果提供解析报告,引用值字段将说明这一点。

提供解析报告

传译
提供信息帮助解释测试结果

美国医学遗传学和基因组学学院建议评价所有检测变异 (5)变异根据已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性评论报告,详细说明其潜在或已知意义

警告符
讨论可能造成诊断混淆的条件,包括不当标本采集处理、不适当测试选择和干扰物质

临床关联度 :
测试结果应结合临床发现、家庭历史和其他实验室数据理解信息不准确或不完整时,结果误解可能发生

如果测试是由于临床上意义重大的家族历史完成的,则通常宜先测试受影响的家庭成员检测受影响家庭成员中可报告变异可允许对风险个人作更多信息测试

&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;讨论额外测试选项可用性或帮助解释这些结果时,联系Mayo诊所遗传咨询师800-533-1710

技术约束:
下一代测序可能检测不到所有类型基因组变异稀有案例可能出现假阴性或假阳性结果深度覆盖对目标区域可变性分析性能低于最低可接受标准或失灵区域基于这些限制,负结果并不排除诊断遗传失序疑似特定临床失序时,可考虑替代方法评价

可能有些区域基因无法通过排序或删除和重复分析有效评价,这些区域包括同族学区域、高抗量子素内容区和重复序列选择可报告变异性确认工作将以内部实验室标准为基础用替代方法完成

测试验证95%删除至75基对并插入至47b卸载插入量40分或40分以上,包括移动元插入量,可能比小deins更难可靠检测

删除/重复分析 :

本分析目标单倍删除/重复然而,在某些情况下,单排解法无法实现,原因是单次减少序列覆盖或固有基因组复杂性平衡结构重排列(如移位和反转等)可能检测不到

本测试设计不是为了检测低层次马赛斯或区分声波变异和子波变异万一检测到的变异体可能有体性,可能需要额外测试以澄清结果意义

有关基因特效和技术约束的详细信息见方法描述或联系实验室遗传咨询师

如果病人有异构干细胞移植或最近非液化输血,结果可能不准确,因为有捐献者DNA&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;调用mao诊所实验室指令测试接受骨髓移植的病人

变式重新分类:
目前,实验室系统审查先前分类变异非标准做法实验室鼓励保健提供者随时联系实验室学习特定变异分类可能随时间变化扩大遗传知识范围后,实验室有可能发现与病人相关联的新信息。万一发生,实验室可发布修正报告

变换评价:
变异评价和分类使用已出版的美国医学遗传学和基因学学院和分子病理学建议协会作为指南。 (5) 可考虑其他基因指南变量根据已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性注释报告,详细说明其潜在或已知意义分类为良性或似良性变量不报告

多线程评价工具可用于帮助解释这些结果硅评价工具预测精度高度依赖特定基因可用数据,定期更新这些工具可能导致预测随时间变化silco评价工具结果应谨慎解读和专业临床判断

稀有偶发或二次发现可能隐含另一种偏态或主动性疾病的存在将仔细审查这些结果,以确定是否将报告这些结果。

临床参考
深入阅读临床性质建议

开工sczeskiBA etal:Cystic纤维化和先天缺位Adam MP、EvermanDB、MirzaaGM等编辑Gene审查[Internets]华府西雅图2001年更新2022年11月10日访问2023年1月20日Available at: www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1250/

二叉BombieriC公司,ClaustresM公司,de BoeckK公司等:建议把疾病分类为FFTR相关故障JCystFibros2011 Jun;10Suppl2S86-102

3级LinkSLNAKRP审查囊性纤维化快速发展美德市2020年11月至12月;117(6):548-554

4级BobadillaJL,McekM Jr,FineJP,Farrell PM:CystemFibross洪穆特Jun;19(6):575-606

5级理查斯SAzizNBALES等ACMG实验室质量保证委员会:序列变异解释标准和指南:美国医学遗传学和基因组学院和分子病理学协会联合协商一致建议基因医疗2015年5月17(5):405-424

特殊指令
PDF库,包括有关测试的信息和表格

方法描述
描述测试执行方式并提供方法专用参考

下一代测序和/或Sanger测序测试编码区和数子/exFLFR基因类 和其他一些区域 已知疾病传播变异人类基因组参考GRCh37/hg19构建用于序列阅读对齐至少有99%的基底覆盖深度超过30X单核变异估计感知度超过99%,删除/插入小于40基对估计感知度超过94%,删除/插入最大达47bgs和/或聚合物链反射量化法测试FLFR基因学

可能有区域FLFR无法通过排序或删除和重复分析有效评价,因为技术限制解析,包括同族学区域、高抗量子素内容和重复序列

选择可报告变异可用基于内部实验室标准的替代方法验证

引用转录数可因转录复用而更新常参考最终病人报告基因笔录信息测试时引用

Gene符号

参考转录

附加评价

技术约束

FLFR

NM_000492.4

PolyT线程
TG重复区
删除/重复分析
c.870-1113_870-1110del
1393-18G>A
C.1585-9T>A
C.1585-8G>A
C.1585-9412A>G
C.1680-886A>G
C.1680-883A>G
C.1680-877G>T
2909-15T>G
2989-313A>T
3140-26A>G
3140-16T>A
C.3469-1304C>G
C.3717+40A>G
C.3718-2477C>T
C.3874-4522A>G

exon 13复制数变异分析不执行

PDF报表
表示报表中是否包含带图表、图像或其他丰富信息的额外文档

辅助性

天执行
轮廓测试执行现场显示样本必须在测试实验室开始测试过程,并包括测试前的任何样本准备和处理时间部分测试列为连续执行,这意味着日间多次执行解析

变迁

报表可用性
&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;时间间隔(接收maio诊所实验室样本以获取结果),并计及标准搭建日与周末第一天通常需要时间提供结果最后一天可能需要时间 算出重复测试

28至42天

样本保留时间
轮廓测试标本在丢弃前存放在实验室

全血:2周提取脱氧核糖核酸3个月培养型纤维素、皮肤活性素、线性血液、羊膜流水、培养型羊膜细胞素、charionio villi、培养型charionio villi:1个月

性能实验室定位
表示执行测试的实验室位置

罗切斯特

收费
数项因素决定执行测试收费联系你的美国或国际区域管理员信息建立收费表或学习更多资源优化测试选择

测试分类
提供医学设备分类信息实验室测试包和试剂测试可归为美国食品药品管理局清理或核准并按制造商指令使用或归为未经过FDA全面审核和批准的产品,并贴上分析专用试剂标签

测试开发完成,性能特征由maioClinic以符合CLIA要求的方式确定测试未经美国食品药管局审核或批准

CPT代码信息
指导确定当前程序术语代码信息对每次测试或剖面&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;列表CPT编码反映Mayo临床实验室对CPT编码要求的解释由每个实验室负责确定正确的CPT代码用于计费

CPT代码由演艺实验室提供

81223

88233-组织培养、皮肤、固组织生物检测

88240-密码保护

LOINCQQ信息
指导判定逻辑观察标识器名称代码值LOINC值由演艺实验室提供

测试i 测试顺序名 指令LOINC值
FLFRN FFTRGene全基因分析 90256-9
结果Id 测试结果名 结果LOINC值
仅适用于执行实验室最初报告的单位计量结果值并不适用于转换为其他度量单位的结果
619775 测试描述 62364-5
619776 样板 3208-2
619777 源码 3208-2
619778 结果汇总 50397-9
619779 结果 82939-0
619780 传译 69047-9
619781 附加结果 进程内
619782 资源类 99622-3
619783 附加信息 48767-8
619784 方法论 850693
619785 Genes解析 82939-0
619786 免责声明 62364-5
619787 发布方式 18771-6

测试搭建资源

搭建文件
&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;测试搭建信息包含测试文件定义细节支持顺序并产生maio诊所实验室与实验室信息系统接口

Excel应用|Pdf

样本报表
正常异常样本报告作为报告外观参考

正常报表|异常报表

SI样本报表
单元报告国际系统提供数目有限的测试这些报告供国际账号使用,仅通过mayeLINK账号提供,这些账号已被定义接收

SI正常报表|SI异常报告

测试更新资源

更改类型 有效日期
新建测试 2023-03-23