测试标识符 :SCCNP

重元和元元元基因板解剖

实用性
推荐临床失序或设置

向有个人或家庭历史显示重先天性中分量和/或循环性中分量的病人提供遗传评价

建立先天性神经元诊断并在某些情况下允许对基于基因的疾病特征进行适当管理和监测

遗传测试信息
提供信息帮助选择正确基因测试或正确提交测试请求

使用下一代排序检测30个基因单核素和拷贝变异AK2,AP3B1,AP3D1,CD40LG,CEPE,CLB,CSF3RCR2,CXCR4DGJC21,EFLIP1ELANE,G6PC3,GATA2GFI1GINS1HX1JAGN1LYST,RAC2SBDSSSSLC37A4SMARCD2SRP54TAZSB1VPS13BVPS45WIPF1.看吧目标基因方法细节 重元元元元元元元元元元元元元金板方法描述补充细节

识别致病变异物可能有助于诊断、预测、临床管理、复发风险评估、家庭筛选和遗传咨询重先天性中子和循环中子

反射测试
列表测试可加或不可加荷,视初始测试结果和解释而定

测试i 报表名称 单独可用 一贯性能
CULFB Fibrolat基因测试文化

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

皮肤切片或培养纤维标本纤维爆文化将附加电荷如果不能获取可行单元格,客户端会得到通知

特殊指令
PDF库,包括有关测试的信息和表格

方法名称
简单描述测试使用法

顺序抓取和定向下级定序后继聚合数链响应和Sanger定序

纽约州可用
表示纽约州批准状态和测试对纽约州客户可排序性

报表名称
列表短或缩写版本

遗传神经元Gene

异类
列表附加常用名测试辅助搜索

遗传性中子

CSF3R

循环中子

ELANE语言

HAX1

神经元弹性

下一Gene语义测试

SBDS系统

重先天性中子

原型

WIPF1

X-联通重先天性中子

X链路多步调

extGen定序测试

巴特综合症

切迪亚克-希加希综合症

科恩综合症

Dursun综合症

ELANE缺陷

安贝格综合症

GATA2缺陷

液态存储疾病Ia

液态存储器ib

液态存储疾病i

HAX1缺陷

Hermansky-Pudlak综合症10

赫曼斯基普德拉克综合症2

缺陷神经元化疗

免疫缺陷X-联通超IgM

Kostmann综合症

Poikiloderma带中子

轮廓生成

Shwachman-Diamond综合症

特定粒子缺陷

WHIM综合症

wiskot-aldrich综合症

X链路 myodislasia

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

皮肤切片或培养纤维标本纤维爆文化将附加电荷如果不能获取可行单元格,客户端会得到通知

特征类型
描述样本类型验证测试

变迁

排序指南

面向家庭变异测试(也称网站专用或已知变异测试)可供本板基因使用FMTT/Familical变异、定向测试、Varies获取更多测试选项信息,电话800-533-1710

发运指令

Specimen宁可在96小时内赶到

特征需求
定义执行测试所需的最优试样和完成测试首选卷

病人准备:原骨髓移植自配方会干扰测试电话800-533-1710测试接受骨髓移植的病人指令

仅提交下列标本中的 1

特征类型 :全血

容器/图贝:

首选 :淡顶部或黄顶

可接受性:任何抗coaplan

样本量 :3mL

集合指令 :

开工多次反转混合血液

二叉发送全血液标本原型管非liquot

特征稳定信息Ambient4天/冷冻

特征类型:皮肤活检

用品类Fibroblast生物感知传输介质

容器/管子静态容器使用标准细胞培养介质(例如最小基本介质,RPMI1640)。配有1%青霉素和复方素

样本卷4毫米重击

特征稳定信息:冷冻式/Ambient

附加信息 :CULFB/Fiblast文化生物化学测试或分子测试3至4周后才能进行基因测试

样板类型:cultidFiblasts

容器/管道T-25瓶

样板卷积二叉

集合式指令发布:从另一个实验室的皮肤活检中提交可分解分解分解分解细胞从产前标本培养出细胞不被接受

特征稳定信息ient/refricate (<24小时)

附加信息 :CULFB/Fiblast文化生物化学测试或分子测试3至4周后才能进行基因测试

特殊指令
PDF库,包括有关测试的信息和表格

表单

开工纽约客户端非格式化协议文档请求表或电子命令副本存档下列文件可用性:

-知情录用基因测试576

-知情基因测试(西班牙语)T826

二叉分子遗传学:遗传固有疾病患者信息521

3级同源神经元化素、骨髓失灵、Telomere缺陷和脉冲Fibrosis

样本最小量
定义样本量以提供测试实验室确定的临床相关结果最小量足以一次测试

血迹:1m皮肤生物剖析或培养纤维块:见Specimen必备

拒绝到期
识别样本类型和条件可能导致样本被拒绝

&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;所有样本都将在maio诊所实验室评估测试适配性

特征稳定信息
提供向执行实验室运输标本所需温度描述,并包括替代可接受温度

特征类型 温度学 时间轴 专用容器
变迁 变迁

实用性
推荐临床失序或设置

向有个人或家庭历史显示重先天性中分量和/或循环性中分量的病人提供遗传评价

建立先天性神经元诊断并在某些情况下允许对基于基因的疾病特征进行适当管理和监测

遗传测试信息
提供信息帮助选择正确基因测试或正确提交测试请求

使用下一代排序检测30个基因单核素和拷贝变异AK2,AP3B1,AP3D1,CD40LG,CEPE,CLB,CSF3RCR2,CXCR4DGJC21,EFLIP1ELANE,G6PC3,GATA2GFI1GINS1HX1JAGN1LYST,RAC2SBDSSSSLC37A4SMARCD2SRP54TAZSB1VPS13BVPS45WIPF1.看吧目标基因方法细节 重元元元元元元元元元元元元元金板方法描述补充细节

识别致病变异物可能有助于诊断、预测、临床管理、复发风险评估、家庭筛选和遗传咨询重先天性中子和循环中子

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

皮肤切片或培养纤维标本纤维爆文化将附加电荷如果不能获取可行单元格,客户端会得到通知

诊断信息
讨论生理学、病理学和泛临床方面,因为它们与实验室测试相关

继承先天性神经元指初级免疫机能子集影响神经元成熟和功能临床特征严重程度反映中子素度多数中子案例归结于获取(非遗传性)原因重先天性中子素特征为慢性低核子计数和复发性,经常威胁生命感染从生命头几个月开始sclipsenia和受感染时间持续3至5天并定期复发。 scr/nc

遗传先天性子宫和循环性子宫的流行估计介于1:500 000至1:100 000活胎之间。 (1-5)继承先天性子宫的遗传学最常是由于基因中疾病诱因变异作用

偏僻先天性中小素最常见的成因是致病变异ELANE语言HAX1基因分解中微粒弹性和HCLS1(化学细胞专用Lyn基调)-相关蛋白X-1自动somal支配ELANE语言相关中子素是儿童先天性中子素最常见的原因,并可能出现口服/结肠溃素、常量上下呼吸道感染和各种软组织感染ELANE语言.自动休眠科斯特曼病 由变异引起HAX1基因是儿童先天性中小素第二大常见因子ELANE语言相关中子.(2,4,6)原型相关失序导致先天性神经元型谱类包括Wiskot-Aldrich综合症和X联通先天性神经元CSF3R,CXCR2,GFI1WIPF1.(1,6)

重中子还可能作为多系统失序的一部分出现。 (1)本面板评估多条件中子与超化学特征并发,包括但不限于:

斯华赫曼-戴安德综合症,自豆主因SBDS系统基因特征还表现为异构泛构机能失常、骨异常和染色异常

-GATA2deficieny(单细胞感染和局部感染综合症)GATA2基因展示广度临床演示从温慢单细胞寄存性到Emberger综合症和偏向急性类友恶性

Barth综合症-X相关条件TAZ基因特征为心科病理学、骨髓科病理学、生长延迟学和特征面部特征

Cohen综合症,自鸡休眠条件 因疾病诱因变异VSP13B基因特征还表现为虚度、发育延迟、微脑积分、婴儿发育不良、曲式肥胖症、眼科发现、联合超移动性、欢乐配置和特征面部特征

WHIM综合症(warts, segamluglobliemia, subjects, mylokathexis)CXCR4基因特征还包括缺膜球状血症和易染人皮洛马病毒

引用值
描述参考间隔和额外信息解释测试结果可酌情包括基于年龄和性别的间隔区间衍生马约,除非另行指定如果提供解析报告,引用值字段将说明这一点。

提供解析报告

传译
提供信息帮助解释测试结果

美国医学遗传学和基因组学学院建议评估所有检测变异 (7)变异根据已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性评论报告,详细说明其潜在或已知意义

警告符
讨论可能造成诊断混淆的条件,包括不当标本采集处理、不适当测试选择和干扰物质

临床关联度 :

测试结果应结合临床发现、家庭历史和其他实验室数据理解信息不准确或不完整时,结果误解可能发生

如果测试是由于临床上意义重大的家族历史完成的,则通常宜先测试受影响的家庭成员检测受影响家庭成员中可报告变异可允许对风险个人作更多信息测试

&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;讨论额外测试选项可用性或帮助解释这些结果时,联系Mayo诊所遗传咨询师800-533-1710

技术约束:

下一代测序可能检测不到所有类型基因组变异稀有案例可能出现假阴性或假阳性结果深度覆盖对目标区域可变性分析性能低于最低可接受标准或失灵区域基于这些限制,负结果并不排除诊断遗传失序疑似特定临床失序时,可考虑替代方法评价

可能有些区域基因无法通过排序或删除和重复分析有效评价,这些区域包括同族学区域、高抗量子素内容区和重复序列选择可报告变异性确认工作将以内部实验室标准为基础用替代方法完成

测试验证95%删除至75基对并插入至47b卸载插入量40分或40分以上,包括移动元插入量,可能比小deins更难可靠检测

删除/重复分析 :

本分析目标单倍删除/重复然而,在某些情况下,单排解法无法实现,原因是单次减少序列覆盖或固有基因组复杂性平衡结构重排列(如移位和反转等)可能检测不到

本测试设计不是为了检测低层次马赛斯或区分声波变异和子波变异万一检测到的变异体可能有体性,可能需要额外测试以澄清结果意义

基因可基于更新临床关联性增删参考目标基因方法细节 重元元元元元元元元元元元元元金板最新基因列表有关基因特效和技术约束的详细信息见方法描述或联系实验室遗传咨询师

如果病人有异构干细胞移植或最近非液化输血,结果可能不准确,因为有捐献者DNA&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;调用mao诊所实验室指令测试接受骨髓移植的病人

变式重新分类:

目前,实验室系统审查先前分类变异非标准做法实验室鼓励保健提供者随时联系实验室学习特定变异分类可能随时间变化扩大遗传知识范围后,实验室有可能发现与病人相关联的新信息。万一发生,实验室可发布修正报告

变换评价:

变异评价和分类使用已出版的美国医学遗传学和基因学学院和分子病理学建议协会指南来进行。 (7) 可考虑其他基因指南变量根据已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性注释报告,详细说明其潜在或已知意义分类为良性或似良性变量不报告

多线程评价工具可用于帮助解释这些结果硅评价工具预测精度高度依赖特定基因可用数据,定期更新这些工具可能导致预测随时间变化silco评价工具结果以谨慎和专业临床判断理解

稀有偶发或二次发现可能隐含另一种偏态或主动性疾病的存在将仔细审查这些结果,以确定是否将报告这些结果。

临床参考
深入阅读临床性质建议

开工Skokowa J,Dale DC,TouwIP,ZeidlerC,WelteK:重先天性神经元Nat RevDS素数2017 Jun 8;3:17032doi:10.1038/nrdp.2017.32

二叉fadeel B,GarwiczD,Carlsson G,Sandsted B,NordenskjoldM:Kostmann病和其他形式的重先天性中子Acta Paediatr2021年11月;110(11):2912-2920doi:10.1111/apa.16005

3级TayalA、MeenaJP、KaurR等新奇同族古斯HAX1变异Pediatr HematolOncol2022 Mar1;44(2):e420-e423doi:10.1097/MPH.0000000000002110

4级戴尔-DC MakaryanV:ELANE相关中子Adam MP、EvermanDB、MirzaaGM等编辑Gene审查[Internets]华府西雅图2002年8月23日更新2018存取2023年1月19日Available at www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1533/

5级ChandraS,BronickiL,NagarajCB等Adam MP、EvermanDB、MirzaaGM等编辑Gene审查[Internets]华府西雅图2004年2016年9月22日更新存取2023年1月19日Available at https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1178/

6级TangyeSG公司、Al-Herz W公司、BousfihaA公司等人类自生豁免错误:2022年国际免疫社联合会专家委员会分类更新JlinImunol2022Oct:42(7):14731507doi: 10.1007/s10875-022-01289-3

7理查斯SAzizNBALES等ACMG实验室质量保证委员会:序列变异解释标准和指南:美国医学遗传学和基因组学院和分子病理学协会联合协商一致建议Genet Med20155月17(5):405-424

特殊指令
PDF库,包括有关测试的信息和表格

方法描述
描述测试执行方式并提供方法专用参考

下一代测序和/或Sanger测序测试变量在编码区和经分析基因异次/Exron/ex人类基因组参考GRCh37/hg19构建用于序列阅读对齐至少有99%的基底覆盖深度超过30X单核变异估计感知度超过99%,删除/插入小于40基对估计感知度超过94%,删除/插入最大达47bNGS和/或聚合酶链反射量化法测试所分析基因中是否存在删除和复制

可能有些区域基因无法通过排序或删除和重复分析有效评价,这些区域包括同族学区域、高抗量子素内容区和重复序列看吧目标基因方法细节 重元元元元元元元元元元元元元金板目标基因分析细节和未例行覆盖的具体基因区域

选择可报告变异可用基于内部实验室标准的替代方法验证

Genes分析AK2,AP3B1,AP3D1,CD40LG,CEPE,CLB,CSF3RCR2,CXCR4DGJC21,EFLIP1ELANE,G6PC3,GATA2GFI1GINS1HX1JAGN1LYST,RAC2SBDSSSSLC37A4SMARCD2SRP54TAZSB1VPS13BVPS45WIPF1

PDF报表
表示报表中是否包含带图表、图像或其他丰富信息的额外文档

辅助性

天执行
轮廓测试执行现场显示样本必须在测试实验室开始测试过程,并包括测试前的任何样本准备和处理时间部分测试列为连续执行,这意味着日间多次执行解析

变迁

报表可用性
&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;时间间隔(接收maio诊所实验室样本以获取结果),并计及标准搭建日与周末第一天通常需要时间提供结果最后一天可能需要时间 算出重复测试

28至42天

样本保留时间
轮廓测试标本在丢弃前存放在实验室

全血:2周提取脱氧核糖核酸3个月培养式纤维卷积皮肤活检:1个月

性能实验室定位
表示执行测试的实验室位置

罗切斯特

收费
数项因素决定执行测试收费联系你的美国或国际区域管理员信息建立收费表或学习更多资源优化测试选择

测试分类
提供医学设备分类信息实验室测试包和试剂测试可归为美国食品药品管理局清理或核准并按制造商指令使用或归为未经过FDA全面审核和批准的产品,并贴上分析专用试剂标签

测试开发完成,性能特征由maioClinic以符合CLIA要求的方式确定测试未经美国食品药管局审核或批准

CPT代码信息
指导确定当前程序术语代码信息对每次测试或剖面&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;列表CPT编码反映Mayo临床实验室对CPT编码要求的解释由每个实验室负责确定正确的CPT代码用于计费

CPT代码由演艺实验室提供

81443

88233-组织培养、皮肤、固组织生物检测

88240-密码保护

LOINCQQ信息
指导判定逻辑观察标识器名称代码值LOINC值由演艺实验室提供

测试i 测试顺序名 指令LOINC值
SCCNP 遗传神经元Gene 进程内
结果Id 测试结果名 结果LOINC值
仅适用于执行实验室最初报告的单位计量结果值并不适用于转换为其他度量单位的结果
619873 测试描述 62364-5
619874 样板 3208-2
619875 源码 3208-2
619876 结果汇总 50397-9
619877 结果 82939-0
619878 传译 69047-9
619879 附加结果 进程内
619880 资源类 99622-3
619881 附加信息 48767-8
619882 方法论 850693
619883 Genes解析 82939-0
619884 免责声明 62364-5
619885 发布方式 18771-6

测试搭建资源

搭建文件
&#121;&#97;&#98;&#111;&#50;&#48;&#56;测试搭建信息包含测试文件定义细节支持顺序并产生maio诊所实验室与实验室信息系统接口

Excel应用|Pdf

样本报表
正常异常样本报告作为报告外观参考

正常报表|异常报表

SI样本报表
单元报告国际系统提供数目有限的测试这些报告供国际账号使用,仅通过mayeLINK账号提供,这些账号已被定义接收

SI正常报表|SI异常报告

测试更新资源

更改类型 有效日期
新建测试 2023-03-23