评估患慢性髓白血病和费城染色体阳性B细胞急性淋巴性白血病接受强效动脉抑制器治疗
首选初始测试识别已获取BCR-ABL1与TKI抗争关联的变异
| 测试i | 报表名称 | 单独可用 | 一贯性能 |
|---|---|---|---|
| BADX | BCR/ABL1,RNA定性诊断 | 对 | 号 |
ifBCR/ABL1聚变类型(p210,p190,p205或p230)不提供,BADX/BCR/ABL1定性诊断解析变异将附加收费
万一无聚变表(p190,p205,p210,p230)通过定性测试识别,测试将取消
更多信息见BCR/ABL1顺序指南血液骨髓.
逆序分量链响应Sanger定序
E255K
E355G
F317L
F369V
G250E
H396R
M244V
M351T
问题252H
T315I
Y253F
Y253H
T315A
V299L
Tyrosine回文抑制器
金斯域变换ABL
Imatinib抗药性
慢性近似白血病
慢性局部白血病
BCR-ABL1
BCR/ABL
BCRABL
急性淋巴白血病
ifBCR/ABL1聚变类型(p210,p190,p205或p230)不提供,BADX/BCR/ABL1定性诊断解析变异将附加收费
万一无聚变表(p190,p205,p210,p230)通过定性测试识别,测试将取消
更多信息见BCR/ABL1顺序指南血液骨髓.
变迁
优先初始测试识别已获取BCR/ABL1突变与TKI抗药性
开工冷藏试样必须在收集后5天内运抵,环境试样必须在采集后3天(72小时)内运达
二叉绘制并打包标本尽可能接近运输时间
需要以下信息:
开工病人聚变类型(p210,p190,p205或p230)
二叉相关临床历史
3级临床或模拟猜疑
4级日期收集
5级样素源码(血或骨髓)
| 问题ID | 描述性 | 答案解析 |
|---|---|---|
| MP004 | 特征类型 | |
| 莫夫 | BCRABL聚合(210,190,205,230) |
仅提交下列标本中的 1
首选 :
特征类型 :全血
容器/图贝:稀疏顶部
样本量 :10m
集合指令 :
开工多次反转混合血液
二叉发送全血液标本原型管非liquot
3.标签标本为血
可接受性:
特征类型 :骨髓
容器/图贝:稀疏顶部
样本量 :4mL
集合指令 :
开工多次反转混合骨髓
二叉发送骨髓标本原型管非liquot
3.标签标本骨髓
开工染病者信息(T676)
二叉非电子排序完整打印发送染色体学/遗传学测试请求726标本
血迹8毫升
骨髓2m
| 毛透析 | 拒绝 |
| 其余 | 中度阻塞 |
| 特征类型 | 温度学 | 时间轴 | 专用容器 |
|---|---|---|---|
| 变迁 | 冷冻器 | 5天 | PURPLE或PINKtoP/EDTA |
| 广度 | 72小时 | PURPLE或PINKtoP/EDTA |
评估患慢性髓白血病和费城染色体阳性B细胞急性淋巴性白血病接受强效动脉抑制器治疗
首选初始测试识别已获取BCR-ABL1与TKI抗争关联的变异
ifBCR/ABL1聚变类型(p210,p190,p205或p230)不提供,BADX/BCR/ABL1定性诊断解析变异将附加收费
万一无聚变表(p190,p205,p210,p230)通过定性测试识别,测试将取消
更多信息见BCR/ABL1顺序指南血液骨髓.
慢性近似白血病特征为t(9:22)BCR/ABL1异常化形成聚变BCR/ABL1送信机RNA和蛋白质ABL1组件内含暴动脉动并被认为在这一白血病扩散型芬型中起中心作用
最近的进展已导致多类治疗药抑制ABL1暴频数体以及其他蛋白质暴频数Imatinibmylate(Gleevec,Novartis)原型这些暴动抑制器(TKI),这些抑制器能诱导耐用电解解解析并(在大多数病人中)细胞分解大量子类病人对TKI产生功能性抗药性,原因很多(约50%)是因为获取动脉域的点变异ABL1基因学迄今已描述50多位奇特变异,尽管其中小小子集( <20)占对TKTI有临床抗药性病人的大多数,或有详实文献记录体外数据
TKI抗药性在CML中很重要,因为某些变异效果可以通过增加imatinib剂量消除,而另一些则需要转换为异代TKI或替代疗法公共T315IKD变异尤其重要,因为这种变异赋予除ponatinib外所有目前使用tki通常TKI抗药性疑似CML病人,显示初始治疗响应失效(eg,细胞遗传复发)或分子量显著持续增加BCR/ABL1量化水平费城染色体阳性B细胞急性淋巴性白血病患者也存在类似因素,他们也可以使用TKI治疗处理
点变异生成BCR/ABL1通常通过聚合物链响应产品直接排序检测,继反转录PCR放大BCR/ABLmRNA样本这种方法确保综合筛选临床相关KD区域因为这种技术需要加长区域ABL1中BCR/ABL1RT-PCR产品低水平BCR/ABL1mRNA笔录(低于0.01%规范化BCR/ABL1上国际尺度:IS)可能不高效放大(对比量化RT-PCR生成诊断或监控的相似实例)。
提供解析报告
移位段中存在一个或多个点变异ABL1区域BCR/ABL1聚变送信者RNA被视为正结果,表示TKI抗药性具体类型突变可能影响对特定TKI的敏感度,并可用于指导单个病人的治疗选择
本解析综合检测BCR/ABL1kde域变异,但无法检测所有可能的变异ABL1脱机负结果并不排除稀有、次优特征或未知变异的存在,这些变异可能与某种程度暴利阻抗极少发生的突变的临床意义尚不确定
量化水平BCR/ABL1笔录对成功解析变异分析至关重要,因为长送RNA模板放大效率随目标丰度低而下降ifBCR/ABL1量化聚合物链反射度太低,反转转录入-PCR放大BCR/ABL1出产序列产品可能不成功实验室标准尚有待开发BCR-ABL1/ABL0.1%以上量化水平通常被视为检测KD突变需要本解析
子克隆变异可能很难用Sanger测序法识别,即使Sanger测序法BCR/ABL1mRNA放大成功这是因为继承敏感度测序,通常在野性背景中介于15%至20%变异 Alele
EDTA样本优先测试骨髓标本可接受偶尔骨髓RNA样本失效 原因不完全理解因PCR抑制而无法使用Heparin抗coa
检测精度似乎没有受到样本运输或中度延迟处理的重大影响。下层样本BCR/ABL条件可能导致充分RNA退化产生假负结果样本应尽快运出接收时3天安眠标本5天冷冻标本是不可接受的
开工Hughes T, Deininger M,Hoshaus A等:监控CML病人用暴动脉抑制器处理:审查并推荐统一当前检测BCR-ABL记录和动脉域变异法法并表达结果方法血迹2006 Jul 1;108(1):28-37doi: 10.1182/blood-2006-01-0092
二叉d:BCR-ABL1RT-qPCR监测分子响应JML Diagn2013sep;15(5):565-576doi: 10.1016/j.jmoldx.2013.04.007
3级BaccaraniM,DeiningerMW,RostiG等:欧洲LeukemiaNet管理建议2013年血迹2013年8月8日;122(6):872-884doi: 10.1182/blood-2013-05-501569
4级JonesD, Kamel-ReidS,BahlerD等:实验室实践指南检测并报告CR-ABL慢性髓白血病和急性淋巴性白血病突变:分子病理学协会报告JML Diagn2009年1月11日(1):4-11doi: 10.2353/jmoldx.2009.080095
全RNA使用抽取包采样补充式脱氧核糖核酸转录并用素数反射聚合子子链BCR测试并ABL1区域生成长PCR产品仅表示转定位alleABL1区域排行7第二次(免责)PCR放大ABL1stripse域使用首轮PCR产品模板Aliquot嵌套ABL1PCR产品通过Sanger排序和序列后软件解释分析
星期一至星期五
测试开发完成,性能特征由maioClinic以符合CLIA要求的方式确定测试未经美国食品药管局审核或批准
81170-ABL1原生素1非受体暴频数(eg, 获取imatinib电流抑制器)、基因分析、变异矩数域
| 测试i | 测试顺序名 | 指令LOINC值 |
|---|---|---|
| BAKDM | BCR/ABL1变换顺序 | 55135-8 |
| 结果Id | 测试结果名 | 结果LOINC值
仅适用于执行实验室最初报告的单位计量结果值并不适用于转换为其他度量单位的结果
|
|---|---|---|
| MP004 | 特征类型 | 3208-2 |
| 莫夫 | BCRABL聚合(210,190,205,230) | 55135-8 |
| 19824 | 最终诊断: | 34574-4 |