测试Id:UGTFG

UDP-Glucuronosyltransferase 1 a1 (UGT1A1),全基因测序,各不相同

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

识别个体的风险增加药物不良反应与药物代谢的UGT1A1,包括伊立替康、atazanavir、nilotinib pazopanib, belinostat

识别人血胆红素过多的风险

后续测试个人怀疑UGT1A1变体,- TA重复测试

建立一个诊断吉尔伯特,Crigler-Najjar综合症I型和II型

建立航母吉尔伯特的地位,Crigler-Najjar综合症I型和II型

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

这是一个完整的基因测序检测UGT1A1包括助教重复启动子和内含子/外显子区域边界。结果解释UGT1A1药物代谢的目的和遗传性高胆红素血综合症(吉尔伯特综合症和Crigler-Najjar综合症)。

突出了

这个测试屏幕UGT1A1基因变异与药物不良反应的风险增加时UGT1A1-metabolized药物。这些药物包括伊立替康、atazanavir nilotinib, pazopanib, belinostat

这个测试屏幕UGT1A1基因变异与先天性高胆红素血条件包括吉尔伯特综合症,Crigler-Najjar综合症I型和II型

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

看到UGT1A1Test-Ordering算法在特殊的指令。

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法名称
一个简短的描述方法用于执行测试

聚合酶链反应(PCR)其次是DNA序列分析

纽约的状态
表明纽约国家批准的状态,如果测试是公开为纽约州立客户定货。

是的

报告名称
列出了短或缩写为一个测试版本的发布名称

UGT1A1全基因测序

别名
列表附加测试常见的名字,作为一个帮助搜索

Atazanavir

Belinostat

GNT1

伊立替康

伊立替康glucuronidation

伊立替康的新陈代谢

Nilotinib

Pazopanib

苯酚/胆红素

UDP-Glucuronosyltransferase

UDP-Glucosyltransferase 1

UGT1A1

尿嘧啶葡糖醛酸基转移酶

尿苷二磷酸葡糖基转移酶1

Crigler-Najjar综合症

吉尔伯特综合症

高胆红素血

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

看到UGT1A1Test-Ordering算法在特殊的指令。

标本类型
描述了标本类型验证测试

不同

订购指南

如果只有UGT1A1启动子分析TA重复区域(* 28日* 36 * 37的等位基因),看到U1A1Q / UDP-Glucuronosyl转移酶1 a1 TA重复基因型,UGT1A1,各不相同。

装船指示

如果提交超小型电子管,内部更大的管或瓶运输

必要的信息

UGT1A1基因测试病人信息(T664)推荐,但不是必需的,填写和发送样品吗

标本要求
定义了执行测试所需的最佳标本和首选的体积来完成测试

多个全血EDTA测试可以执行一个标本后一个提取。看到多个全血EDTA基因测试在特殊说明的测试列表可以一起订购。

病人准备:前一个外源的捐赠者的骨髓移植或最近一次(< 6周时间的样本集合)不等的输血会干扰测试。电话800-533-1710说明测试的病人接受了骨髓移植手术。

提交以下标本:只有1

标本类型:全血

容器/管:

成人:薰衣草上(EDTA)

儿科:紫色超小型电子管

试样体积:

成人:3毫升

儿科:1毫升

托收指示:

1。反几次混合血。

2。在原始管发送样品。不整除。

样品稳定性信息:环境(首选)9天/冷藏30天

标本类型:唾液

病人准备:病人不能吃、喝、吸烟或嚼口香糖30分钟前集合。

供应:唾液拭子采集设备(T786)

容器/管:唾液棉签收集装备

试样体积:一个拖把

托收指示:收集和发送样品每箱指令。

样品稳定性信息:环境30天

标本类型:提取DNA

容器/管:2毫升螺旋管

标本体积:100制程(每毫升)

托收指示:

1。首选的体积是100制程50 ng /制程的浓度。

2。包括浓度和体积管。

样品稳定性信息:冻结(首选)/环境/冷藏

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

形式

1。纽约Clients-Informed同意是必需的。请求的文档形式或电子订单,一份文件。下列文件中可用的特别指示:

- - - - - -基因检测的知情同意(T576)

- - - - - -为遗传Testing-Spanish知情同意(T826)

2。UGT1A1基因测试病人信息请求(T664)但不是必需的。看到的特别指示。

3所示。如果不是电子订购,完成,打印,发送1以下形式的标本:

- - - - - -肿瘤学试验要求(T729)

- - - - - -疗法测试请求(T831)

试样体积最小
定义样本的数量必须提供一个临床相关的结果取决于测试实验室

血:0.45毫升

唾液:1拭子

拒绝原因
识别标本类型和条件可能会导致样品被拒绝

所有标本将评估在梅奥诊所实验室测试适用性。yabo208

样品稳定性信息
提供了一个描述运输所需的温度进行实验室的标本,替代还包括可接受的温度

标本类型 温度 时间 特种集装箱
不同 变化(首选)

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

识别个体的风险增加药物不良反应与药物代谢的UGT1A1,包括伊立替康、atazanavir、nilotinib pazopanib, belinostat

识别人血胆红素过多的风险

后续测试个人怀疑UGT1A1变体,- TA重复测试

建立一个诊断吉尔伯特,Crigler-Najjar综合症I型和II型

建立航母吉尔伯特的地位,Crigler-Najjar综合症I型和II型

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

这是一个完整的基因测序检测UGT1A1包括助教重复启动子和内含子/外显子区域边界。结果解释UGT1A1药物代谢的目的和遗传性高胆红素血综合症(吉尔伯特综合症和Crigler-Najjar综合症)。

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

看到UGT1A1Test-Ordering算法在特殊的指令。

临床信息
讨论了生理学、病理生理学和一般临床方面,与实验室测试

UGT1A1基因是一个复杂的基因位于染色体的一部分2编码几个酶称为尿苷二磷酸(UDP) -glycuronosyl转移酶。这些酶进行化学反应称为glucuronidation,一个主要的途径,增强消除小亲脂性的分子,如类固醇、胆红素、激素和药物,为水溶性代谢物,可以从身体排出。

UGT1A1酶,主要发现在肝脏,负责gluronidation胆红素,把它从有毒的胆红素(间接胆红素)无毒,水溶性形式(结合胆红素)。基因变异的UGT1A1可能导致UGT1A1酶活性减弱或消失,导致条件与非结合的高胆红素血包括吉尔伯特综合症和Crigler-Najjar综合症类型I和II。

吉尔伯特综合征是最常见的遗传原因增加胆红素和特点是血清总胆红素水平的1到6 mg / dL。吉尔伯特综合症通常被认为是一种常染色体隐性障碍,尽管常染色体显性遗传建议在某些情况下。(1)吉尔伯特综合症是由于减少了25%到50% glucuronidation UGT1A1酶的活动特点是集轻度间歇性黄疸和肝病的缺失。

Crigler-Najjar综合症类型I和II (CN1和CN2)引起的常染色体隐性障碍更严重UGT1A1 glucuronidation减少活动。CN1是最严重的形式,完全缺乏酶活性和血清总胆红素水平的20到45 mg / dL。CN1表现为黄疸患儿出生后不久之后,这个问题仍然存在。(2)CN2比CN1温和,至少部分UGT1A1活动和血清总胆红素从6到20 mg / dL。苯巴比妥,药物诱导的肝酶的合成,有效降低血清胆红素水平约25%患者CN2;苯巴比妥治疗的CN1不响应。如果不及时治疗,在新生儿胆红素的累积会引起bilirubin-induced脑损伤,称为核黄疽。除了苯巴比妥,CN的治疗可能包括光疗,血红素加氧酶抑制剂,口服钙磷酸盐和碳酸盐和肝移植。

除了UGT1A1胆红素代谢的作用,这种酶在几种药物的代谢中也扮演了重要的角色。UGT1A1参与伊立替康的新陈代谢,拓扑异构酶抑制剂。伊立替康化疗药物用于治疗实体肿瘤包括结肠癌、直肠和肺癌。这个药物前体形成了活性代谢物,SN-38。SN-38通常是灭活与葡萄糖醛酸结合胆汁排泄到胃肠道紧随其后。如果UGT1A1活动受损或不足,SN-38未能成为与葡萄糖醛酸结合,增加SN-38的浓度。这可能导致严重的中性粒细胞减少。嗜中性白血球减少症的组合与腹泻可以危及生命。(3、4)

额外的药物也被增加的风险患者的不良结果UGT1A1酶活性降低。FDA药品标签nilotinib、pazopanib belinostat都含有警告风险增加(发病率)患者的不良结果UGT1A1变异与活动减少有关。临床药物基因学实现联盟(集团)发布的指南atazanavir治疗,表明纯合子患者UGT1A1等位基因与活动减少或降低相关表达式应该考虑另一种药物由于重大风险开发高胆红素血(黄疸)。

UGT1A1基因映射到2号染色体的地区,包含5个外显子。在这个试验,启动子,外显子和exon-intron边界是变异的评估。(5)

参考价值
描述参考区间和附加信息的解释测试结果。可能包括在适当的时间间隔根据年龄和性别。间隔Mayo-derived,除非另有指定。如果一个提供解释报告,参考价值字段将这个状态。

一个将提供解释报告。

解释
提供信息,协助解释测试结果

将提供一份解释报告,其中包括对UGT1A1-associated药品不良反应的风险评价以及解释为高胆红素血综合症。

额外的信息关于基因药物基因组学及其相关药物,看到药物基因组学关联表在特殊的指令。这个资源包括关于酶抑制剂和诱导物的信息,以及潜在的替代药物的选择。

注意事项
讨论了条件,可能会导致诊断的混乱,包括样本收集和处理不当,不恰当的测试选择、干扰物质

可能包含供体DNA样本如果获得病人异种输血或同种异体造血干细胞移植。样本获得的结果在这种情况下不可能准确反映出接收方的基因型。对于那些接受输血,基因型通常在6周内恢复的收件人。人收到了同种异体造血干细胞,移植前DNA标本建议进行测试。

UGT1A1基因测试结果接受肝移植的患者可能不准确地反映病人的UGT1A1的地位。

没有检测到的基因并不排除这样一种可能性,即病人可能有遗传原因增加的间接胆红素。

罕见变异的存在,可能导致假阴性或假阳性结果。如果结果不匹配的临床研究结果,应考虑额外的测试。

临床参考
对临床性质的深入阅读的建议

1。Innocenti F, Grimsley C, Das, et al: UDP-glucuronosyltransferase 1 a1启动子的单体型结构在不同的民族。药物基因学。2002;12:725 - 733。doi: 10.1097 / 00008571-200212000-00006

2。科斯塔E,维埃拉E,马丁斯M, et al:分析UDP-glucuronosyltransferase基因的患者在葡萄牙吉尔伯特和Crigler-Najjar综合征的临床诊断。血细胞摩尔说。2006;36:91 - 97。doi: 10.1016 / j.bcmd.2005.09.002

3所示。Goetz MP, Safgren年代,戈德堡RM, et al:第一阶段剂量升级研究伊立替康(CPT-11),草酸铂(Oxal)和卡培他滨(Cap) UGT1A1 TA启动子在三组(6/6、6/7和7/7)。ASCO 2005 ASCO年会摘要没有:2014

4所示。NDA 20 - 571 / s - 024 / s - 027 / s - 028。Camptosar(盐酸伊立替康)最终的标签。2005年7月21日。辉瑞

5。北川C,安藤M,安藤Y, et al:遗传多态性phenobarbital-responsive UDP-glucuronosyltransferase 1 a1基因的增强子模块和伊立替康的毒性。Pharmacogenet基因组学。2005;15:35-41。doi: 10.1097 / 01213011-200501000-00006

6。Guilemette C:人类UDP-glucuronosyltransferase酶的药物基因组学。药物基因组学j . 2003; 3:136 - 158

7所示。Gammal R,法院M,海达尔C, et al:临床药物基因学实现财团(集团)UGT1A1指南和atazanavir处方。中国新药杂志。2015 doi: 10.1002 / cpt.269

8。柴田T,南城Y, Mitsuma, et al:联系UGT1A1多态性在日本严重nilotinib毒性和慢性粒细胞性白血病患者。Int J肿瘤防治杂志。2014;19:391 - 396。doi: 10.1007 / s10147 - 013 - 0562 - 5

9。美国食品和药物管理局,药物基因组学在药物标签生物标志物。2015年11月访问。可以在www.fda.gov /药品/ ScienceResearch / ResearchAreas /药物基因学/ ucm083378.htm

10。UDP-Glucuronosyltransferase等位基因命名页面。2018年3月访问。可以在www.pharmacogenomics.pha.ulaval.ca ugt-alleles-nomenclature /

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法描述
描述如何执行测试并提供method-specific参考

从全血中提取基因组DNA。UGT1A1基因扩增聚合酶链反应(PCR)。然后PCR产物纯化,并使用荧光dye-terminator化学测序在两个方向上。测序产品分离自动测序仪的序列变异和跟踪文件分析了外显子和内含子/外显子边界使用变异检测软件和目视检查。(Skierka J O 'Kane D: UDP-glucuronosyltransferase 1 a1和glucuronidation肿瘤应用和高胆红素血。:格罗迪WW,中村RM, Kiechle FL,斯特罗姆厘米,eds。分子诊断:临床实验室技术和应用程序。学术出版社;2010:409 - 420)

PDF报告
表明报告包括一个额外的文档是否与图表、图像或其他丰富的信息

没有

天(s)
概述了天测试执行。这个领域反映了天,样品必须在测试实验室开始测试过程,包括任何样品制备和测试执行之前处理时间。列出了一些测试,不断进行,这意味着化验白天多次执行。

周二

报告可用
时间的间隔(收到样品在梅奥诊所实验室结果可用)考虑标准设置和周末。yabo208第一天的时间通常是结果可用。最后一天的时间可能需要,占任何必要的重复测试。

7到14天

样品保留时间
轮廓的时间在测试标本保存在实验室之前就会被丢弃

全血/口水拭子:2周;提取的DNA: 2个月

执行实验室的位置
表明实验室的位置执行测试

罗彻斯特

费用
几个因素决定执行一个测试的费用收取。联系你的美国或国际区域经理建立费用表的信息或了解更多关于资源优化测试的选择。

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测试的分类
提供信息关于医疗器械分类为实验室测试工具和试剂。测试可以分为清除或通过美国食品和药物管理局(FDA)和每个制造商使用说明,或产品,不接受FDA审查和批准,并贴上一个分析物特定试剂(ASR)产品。

这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。

CPT编码信息
提供指导在决定适当的当前程序的术语(CPT)代码(s)为每个测试或概要信息。梅奥诊所上市CPT编码反映实验室的解释CPT编码需求。yabo208每个实验室有责任来确定正确的CPT编码用于计费。

CPT编码由执行实验室提供。

81404年

测试设置资源

设置文件
测试设置信息包含测试文件定义支持订单细节和结果之间的接口梅奥诊所实验室和实验室信息系统。yabo208

Excel|Pdf

样品报告
正常和异常样本报告作为参考提供报告的外观。

正常的报告|异常报告

如果样品报告
国际体系(SI)的单位报告提供有限数量的测试。这些报告仅用于国际帐户,只可以通过MayoLINK账户已定义接收他们。

如果正常的报告|如果异常报告