测试标识符 :COMCP

遗传常见癌症板

实用性
推荐临床失序或设置

评估有个人或家庭历史的病人遗传癌症表示遗传癌症综合症

建立遗传癌症综合症诊断机制,允许基于相关风险目标癌症监控

识别遗传变异与增加癌症风险相关联,允许预测测试并适当筛选有风险家庭成员

多亚代松二磷酸聚合酶(PARP)基于某些基因变换(eg,BRCA1,BRCA2)选择肿瘤类型

遗传测试信息
提供信息帮助选择正确基因测试或正确提交测试请求

本测试使用下一代排序检测与遗传癌症综合症有关的36个基因单核化物和拷贝数变异PARP运维包括推广者1A和1BATMAXIN2BARD1BRPIABCA1BRCA2BRIP1CDH1CDK4CDKN2ACHEK2DICER1EPCAM数位变异GREM1上流增强区域复制HOXB13MLH1MSH2MSH3MSH6MUTYHNBNNNF1NTHLL1PALB2PMS2PLD1PLEPETEN内含推介RAD51C、RAD51D、RET、SMAD4、STK11、TP53详情见方法描述目标基因方法细节异教常见癌症板.

识别致病变异物可能有助于诊断、预测、临床管理、家庭筛选和遗传癌症综合症咨询

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

更多信息见ynch综合症测试算法.

特殊指令
PDF库,包括有关测试的信息和表格

方法名称
简单描述测试使用法

序列抓取和下一序量计算,聚合数链响应,Sanger定序和/或多路取用

纽约州可用
表示纽约州批准状态和测试对纽约州客户可排序性

报表名称
列表短或缩写版本

遗传常见癌症板

异类
列表附加常用名测试辅助搜索

减代多功能性

乳腺癌

克隆癌症

HBOC

HDGC

遗传性乳腺癌和Ovarian癌症综合症

遗传式分解胃癌

ONCC

FAP系统

family异常多波斯

胃癌

少年多功能综合症

LiFrameni综合症

林奇综合症

IMAP大全

美兰诺马

MEN1

MEN2

多内分泌肿瘤综合症类型1

多内分泌肿瘤综合症2类

MUTYH关联多义

extGen定序测试

Ovarian癌症

泛型癌症

eutz-Jeghers综合症

eutz Jeghers综合症

复用词

PTENHamartoma肿瘤综合症

前列腺癌

甲状腺癌

内核癌症

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

更多信息见ynch综合症测试算法.

特征类型
描述样本类型验证测试

变迁

排序指南

自定义面板和单基因分析更多资料见CGPH/自定义Gene面板、推理学、下一序号、Varies

面向家庭变异测试(也称网站专用或已知变异测试)可供本板基因使用更多信息见FMTT/Familical变换、定向测试、Varies获取更多测试选项信息,电话800-533-1710

美国儿科院、美国医学遗传学和基因组学院以及国家遗传咨询师协会都劝阻未成年人测试成人偏态综合症

发运指令

Specimen宁可在96小时内赶到

特征需求
定义执行测试所需的最优试样和完成测试首选卷

病人准备:原骨髓移植自配方会干扰测试电话800-533-1710测试接受骨髓移植的病人指令

特征类型 :全血

容器/图贝:

首选 :淡顶部或黄顶

可接受性:任何抗coaplan

样本量 :3mL

集合指令 :

开工多次反转混合血液

二叉发送全血液标本原型管复数标注.

特征稳定信息Ambient4天/冷冻

特殊指令
PDF库,包括有关测试的信息和表格

表单

开工纽约客户端非格式化协议文档请求表或电子命令副本存档

-知情录用基因测试576

-知情基因测试(西班牙语)T826

二叉分子遗传学:继承癌症综合症患者信息表519

3级非电子排序完整打印发送肿瘤测试请求729标本

样本最小量
定义样本量以提供测试实验室确定的临床相关结果最小量足以一次测试

1 ml

拒绝到期
识别样本类型和条件可能导致样本被拒绝

yabo208所有样本都将在maio诊所实验室评估测试适配性

特征稳定信息
提供向执行实验室运输标本所需温度描述,并包括替代可接受温度

特征类型 温度学 时间轴 专用容器
变迁 变迁

实用性
推荐临床失序或设置

评估有个人或家庭历史的病人遗传癌症表示遗传癌症综合症

建立遗传癌症综合症诊断机制,允许基于相关风险目标癌症监控

识别遗传变异与增加癌症风险相关联,允许预测测试并适当筛选有风险家庭成员

多亚代松二磷酸聚合酶(PARP)基于某些基因变换(eg,BRCA1,BRCA2)选择肿瘤类型

遗传测试信息
提供信息帮助选择正确基因测试或正确提交测试请求

本测试使用下一代排序检测与遗传癌症综合症有关的36个基因单核化物和拷贝数变异PARP运维包括推广者1A和1BATMAXIN2BARD1BRPIABCA1BRCA2BRIP1CDH1CDK4CDKN2ACHEK2DICER1EPCAM数位变异GREM1上流增强区域复制HOXB13MLH1MSH2MSH3MSH6MUTYHNBNNNF1NTHLL1PALB2PMS2PLD1PLEPETEN内含推介RAD51C、RAD51D、RET、SMAD4、STK11、TP53详情见方法描述目标基因方法细节异教常见癌症板.

识别致病变异物可能有助于诊断、预测、临床管理、家庭筛选和遗传癌症综合症咨询

测试算法
缩放测试入初始顺序时的情况包括反射测试和附加测试

更多信息见ynch综合症测试算法.

诊断信息
讨论生理学、病理学和泛临床方面,因为它们与实验室测试相关

遗传癌症综合症约占癌症病例的5%-10%.确定个人或家庭是否有遗传风险因素可帮助定制监视计划、考虑预防风险减少干预、考虑定向治疗和确定家庭成员风险

本面板评价36个已知与多子体风险增加相关联的基因和数种常见癌症,包括乳腺癌、结肠癌、胃癌、卵巢癌、肝脏癌、前列腺癌、皮肤癌、甲状腺癌和内核癌致癌风险以及与这些综合症有关的其他特征各不相同。本板上的许多基因都确定了癌症风险和国家综合癌症网络或专家组管理指南和建议

表示测试包括但不限于:

内生多初级癌症

人工诊断癌症

与多亲癌症家族历史相联

家庭癌症史似与多位遗传癌症综合症重合

引用值
描述参考间隔和额外信息解释测试结果可酌情包括基于年龄和性别的间隔区间衍生马约,除非另行指定如果提供解析报告,引用值字段将说明这一点。

提供解析报告

传译
提供信息帮助解释测试结果

检测到的变量都根据美国医学遗传学和基因组学院建议评价。 (1) 变量根据已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性评论报告,详细说明其潜在或已知意义

警告符
讨论可能造成诊断混淆的条件,包括不当标本采集处理、不适当测试选择和干扰物质

临床交错:

测试结果应结合临床发现、家庭历史和其他实验室数据理解信息不准确或不完整时,结果误解可能发生

如果测试是由于临床上意义重大的家族历史完成的,则通常宜先测试受影响的家庭成员检测受影响家庭成员中可报告变异可允许对风险个人作更多信息测试

yabo208讨论额外测试选项可用性或帮助解释这些结果时,联系Mayo诊所遗传咨询师800-533-1710

技术约束:

下一代测序可能检测不到所有类型基因组变异稀有案例可能出现假阴性或假阳性结果深度覆盖对目标区域可变性分析性能低于最低可接受标准或失灵区域基于这些限制,负结果并不排除诊断遗传失序疑似特定临床失序时,可考虑替代方法评价

可能有些区域基因无法通过排序或删除和重复分析有效评价,这些区域包括同族学区域、高抗量子素内容区和重复序列选择可报告变异性确认工作将以内部实验室标准为基础用替代方法完成

测试验证95%删除至75基对并插入至47b卸载插入量40分或40分以上,包括移动元插入量,可能比小deins更难可靠检测

删除/重复分析 :

本分析目标单倍删除/重复然而,在某些情况下单前解法无法实现,原因是单次减少序列覆盖或固有基因组复杂性平衡结构重排列(如移位和反转等)可能检测不到

本测试设计不是为了检测低量马赛斯或区分声波变异和子波变异万一检测到的变异体可能有体性,可能需要额外测试以澄清结果意义

基因可基于更新临床关联性增删最新基因列表包含于测试中,见目标基因方法细节异教常见癌症板.有关基因特效和技术约束的详细信息见方法描述或联系实验室遗传咨询师

如果病人有异构干细胞移植或最近输血,结果可能不准确,因为有捐献式脱氧核糖核酸yabo208调用mao诊所实验室指令测试接受骨髓移植的病人

变换策略重新分类

目前,实验室系统审查先前分类变异非标准做法实验室鼓励保健提供者随时联系实验室学习特定变异分类如何随时间变化

变换评价:

变异评价和分类使用已出版的美国医学遗传学和基因学学院和分子病理学建议协会指南来进行。变量根据已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性注释报告,详细说明其潜在或已知意义分类为良性或似良性变量不报告

多线程评价工具可用于帮助解释这些结果硅评价工具预测精度高度依赖特定基因可用数据,定期更新这些工具可能导致预测随时间变化silco评价工具结果应谨慎解读和专业临床判断

临床参考
深入阅读临床性质建议

开工理查斯S公司、AzizN公司、BaleS公司等序列变异解释标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会联合协商一致建议基因医疗2015;17(5):405-424

二叉HowladerN公司,NooneAM公司,KrapchoM公司等SEER癌症统计评论1975-2018年国家癌症学院更新2021年4月访问2023年6月28日Available at: https://seer.cancer.gov/csr/1975_2018/

3级NagyRSweetKENC高渗透性遗传癌症综合症Occogene市2004;23(38):6445-6470

4级DalyMB、PalT、BerryMP等遗传/家庭高危险评估:乳房、卵巢和封口版2.2021NCCN肿瘤学临床实践指南JNTL康普尔坎昆网2021;19(1):77-102

5级Gupta S,ProvenzaleD,Llor X等NCCN指南透视:遗传/家庭高危险评估JNTL康普尔坎昆网2019;17(9):1032-1041

6级SaslowD公司、BoetesC公司、BurkeW公司等美国癌症协会乳房筛检指南MRI辅助造影CA癌症Jclin2007;57(2):75-89

7Smith RA,AndrewsKS,BrooksD等2019年美国癌症筛选:审查当前美国癌症协会指南和当前癌症筛选问题CA癌症Jclin2019;69(3):184-210

八点八分CoitDG、ThompsonJA、AlbertiniMR等广度梅兰诺马22019版NCCN肿瘤学临床实践指南JNTL康普尔坎昆网2019;17(4):367-402

9.Haddad RI、Nasr C、Bischoff L等NCCN指南透视:甲状腺癌22018版JNTL康普尔坎昆网2018;16(12):1429-1440

10号SamadderNJ,Rigert-JohnsonD, BoardmanL等通用遗传测试比较面向遗传癌症综合症患者定向测试JAMAOncol2021;7(2):230-237

特殊指令
PDF库,包括有关测试的信息和表格

方法描述
描述测试执行方式并提供方法专用参考

下一代测序和/或Sanger测序测试变量在编码区和经分析基因异次/Exron/ex人类基因组参考GRCh37/hg19构建用于序列阅读对齐至少有99%的基底覆盖深度超过30X单核变异估计感知度99%以上,删除插入值94%以上小于40基对b测试基因分析中是否存在删除和重复,NGS、多目依赖探解放大法和/或聚合物链反射法PCR和gel电阻测试MSH2基因学

可能有些区域基因无法通过排序或删除和重复分析有效评价,这些区域包括同族学区域、高抗量子素内容区和重复序列目标基因分析细节或未例行覆盖的具体基因区域见目标基因方法细节异教常见癌症板.未公开maio方法

选择可报告变异可用基于内部实验室标准的替代方法验证

Genes分析PARP运维包括推广者1A和1BATMAXIN2BARD1BRPIABCA1BRCA2BRIP1CDH1CDK4CDKN2ACHEK2DICER1EPCAM数位变异GREM1上流增强区域复制HOXB13MLH1MH2MSH3MSH6MUTYHNBNNNVNF1NTHL1PALB2PMS2PLD1PLEPETEN内含推介RAD51C、RAD51D、RET、SMAD4、STK11、TP53

PDF报表
表示报表中是否包含带图表、图像或其他丰富信息的额外文档

辅助性

天执行
轮廓测试执行现场显示样本必须在测试实验室开始测试过程,并包括测试前的任何样本准备和处理时间部分测试列为连续执行,这意味着日间多次执行解析

变迁

报表可用性
yabo208时间间隔(接收maio诊所实验室样本以获取结果),并计及标准搭建日与周末第一天通常需要时间提供结果最后一天可能需要时间 算出重复测试

21至28天

样本保留时间
轮廓测试标本在丢弃前存放在实验室

全血:2周提取脱氧核糖核酸:3个月

性能实验室定位
表示执行测试的实验室位置

罗切斯特

收费
数项因素决定执行测试收费联系你的美国或国际区域管理员信息建立收费表或学习更多资源优化测试选择

测试分类
提供医学设备分类信息实验室测试包和试剂测试可归为美国食品药品管理局清理或核准并按制造商指令使用或归为未经过FDA全面审核和批准的产品,并贴上分析专用试剂标签

测试开发完成,性能特征由maioClinic以符合CLIA要求的方式确定测试未经美国食品药管局审核或批准

CPT代码信息
指导确定当前程序术语代码信息对每次测试或剖面yabo208列表CPT编码反映Mayo临床实验室对CPT编码要求的解释由每个实验室负责确定正确的CPT代码用于计费

CPT代码由演艺实验室提供

81201

81408x2

81162

81406x4

81404

81403

81405x2

8192

81295

81298

81307

81319

81321

81351

81479

81479(如果适合政府支付者)

LOINCQQ信息
指导判定逻辑观察标识器名称代码值LOINC值由演艺实验室提供

测试i 测试顺序名 指令LOINC值
COMCP 遗传常见癌症板 97656-3
结果Id 测试结果名 结果LOINC值
仅适用于执行实验室最初报告的单位计量结果值并不适用于转换为其他度量单位的结果
614683 测试描述 62364-5
614684 样板 3208-2
614685 源码 3208-2
614686 结果汇总 50397-9
614687 结果 82939-0
614688 传译 69047-9
614689 资源类 99622-3
614690 附加信息 48767-8
614691 方法论 850693
614692 Genes解析 48018-6
614693 免责声明 62364-5
614694 发布方式 18771-6

测试搭建资源

搭建文件
yabo208测试搭建信息包含测试文件定义细节支持顺序并产生maio诊所实验室与实验室信息系统接口

Excel应用|Pdf

样本报表
正常异常样本报告作为报告外观参考

正常报表|异常报表

SI样本报表
单元报告国际系统提供数目有限的测试这些报告供国际账号使用,仅通过mayeLINK账号提供,这些账号已被定义接收

SI正常报表|SI异常报告