评价小儿骨髓和外周血标本的荧光原位杂交(FISH)调查分析经典的重组和染色体拷贝数变化与急性髓系白血病(AML)患者在儿童肿瘤协会考虑招生(齿轮)的临床试验和研究协议
作为一个兼职在执行常规染色体研究儿童AML患者正在考虑齿轮的注册协议
测试Id | 报告名称 | 可单独购买 | 总是表现 |
---|---|---|---|
COGMB | 探测器,每个额外的(COGMF) | 不,比尔只 | 没有 |
这个测试只进行儿科患者的标本被考虑录取在儿童肿瘤协会(齿轮)协议。
荧光原位杂交(FISH)面板包括测试下面的异常使用列出的鱼类探测器:
发票(16),(M4, Eos], MYH11 / CBFB
t (8; 21), (M2), RUNX1T1 / RUNX1
t (15、17), (M3), PML / RARA
11 q23处重排,[M0-M7], MLL (KMT2A)
t(6, 9)平方米,M4, DEK / NUP214
发票(3)和t (3; 3), (M1、2、4、6、7), RPN1 / MECOM
t (8; 16), (M4、M5) KAT6A / CREBBP
t (1; 22), [M7], RBM15 / MKL1
5/5q, D5S630 / EGR1
7/7q, D7Z1 / D7S486
12 p13重排,ETV6
发票(16),GLIS2 / CBFA2T3
11 p15.4重排,NUP98
MLL重排(KMT2A)确定时,反射测试将识别进行易位的合作伙伴。调查包括识别:
t(4; 11)(温度系数;q23处)AFF1 / MLL
t(6; 11)(问;q23处)MLLT4 (AFDN) / MLL
t(9、11)(第22位;q23处)MLLT3 / MLL
t (10、11) (p12; q23处)MLLT10 / MLL
t (11、16) (q23处;p13.3) MLL / CREBBP
t (11、19) (q23处;p13.1)
MLL / l形的
t (11、19) (q23处;p13.3) MLL / MLLT1。
在缺乏RPN1 / MECOM融合,w母鸡一个额外的MECOM信号识别,的MECOM / RUNX1探针集将被认为是确定一个潜在的t (3; 21) (q26.2;如)重排。
在缺乏RPN1 / MECOM融合,当一个额外的RPN1信号识别,反射测试使用PRDM16 / RPN1探针设置将被认为确定一个潜在的t (1; 3) (p36;温度系数)。
在缺乏MYH11 / CBFB融合,当一个额外CBFB信号识别,反射测试将使用CBFB分开探测器将评估CBFB的存在与否重排。
没有PML / RARA融合,当一个额外的或非典型RARA信号识别,测试使用分开RARA探针组将进行易位包括识别潜在的变体RARA;例如:t (17; var)(温度系数;?)。
当一个确定ETV6重排,反射测试使用MNX1 / ETV6探针集将被执行来识别潜在的t (7; 12) (q36; p13)重排。
当确定NUP98重排,反射测试使用HOXA9 / NUP98探针集将被执行来识别潜在的t (7; 11) (p15; p15.4)重排。
以下算法可用,看到特别指示:
- - - - - -急性白血病的模棱两可的血统检测算法
- - - - - -急性髓系白血病:测试算法
- - - - - -急性早幼粒细胞白血病:指导诊断和随访
荧光原位杂交(FISH)
5(单体性5)
7(染色体7)
5 q - q删除(5)
删除7 q - q (7)
急性早幼粒细胞白血病(APL)
AML-M0
AML-M1
AML-M2
AML-M3
AML-M4
AML-M4eo
AML-M5
巨
发票(16)-发票(16)- MYH11 / CBFB
发票(3)发票(3)- RPN1 / MECOM或RPN1 /增强型植被指数
MLL或KMT2A (11 q23处)重排
t (1; 22) (p13.3; q13.1q13.2) - RBM15 / MKL1
t (1; 3) (p36.3; q21.3)——PRDM16 / RPN1
t (10、11) (p13; q23处)- MLLT10 / MLL或AF10 / MLL
t (11、16) (q23处;p13.3) - MLL / CREBBP
t (11、19) (q23处;p13.1) - MLL / l形
t (11、19) (q23处;p13.3) - MLL / MLLT1或MLL / ENL
t (15、17) (q24.1;温度系数)- PML / RARA
t (16; 16) (p13.1;如)- MYH11 / CBFB
t (3; 21) (q26.2;如)- MECOM / RUNX1or邪恶/ AML1
t (3; 3) (q21.3; q26.2) - RPN1 / MECOM或RPN1 /邪恶
t(4; 11)(温度系数;q23处)- AFF1 / MLL或AF4 / MLL
t (6; 9) (p23; q34) - DEK / NUP214或卡片/
t (7、11) (p15; p15.4) - HOXA9 / NUP98
t (8; 16) (p11.2; p13.3) - KAT6A / CREBBP或MYST3 / CREBBP
t(8; 21)(如;如)- RUNX1T1 / RUNX1或环氧乙烷/ AML1
t(9、11)(第22位;q23处)- MLLT3 / MLL或AF9 / MLL
NUP98重排
t(6; 11)(问;q23处)——MLLT4 (AFDN) / MLL或AF6 / MLL
发票(16)(p24.3; p13.3) - GLIS2 / CBFA2T3
儿童肿瘤协会,齿轮
这个测试只进行儿科患者的标本被考虑录取在儿童肿瘤协会(齿轮)协议。
荧光原位杂交(FISH)面板包括测试下面的异常使用列出的鱼类探测器:
发票(16),(M4, Eos], MYH11 / CBFB
t (8; 21), (M2), RUNX1T1 / RUNX1
t (15、17), (M3), PML / RARA
11 q23处重排,[M0-M7], MLL (KMT2A)
t(6, 9)平方米,M4, DEK / NUP214
发票(3)和t (3; 3), (M1、2、4、6、7), RPN1 / MECOM
t (8; 16), (M4、M5) KAT6A / CREBBP
t (1; 22), [M7], RBM15 / MKL1
5/5q, D5S630 / EGR1
7/7q, D7Z1 / D7S486
12 p13重排,ETV6
发票(16),GLIS2 / CBFA2T3
11 p15.4重排,NUP98
MLL重排(KMT2A)确定时,反射测试将识别进行易位的合作伙伴。调查包括识别:
t(4; 11)(温度系数;q23处)AFF1 / MLL
t(6; 11)(问;q23处)MLLT4 (AFDN) / MLL
t(9、11)(第22位;q23处)MLLT3 / MLL
t (10、11) (p12; q23处)MLLT10 / MLL
t (11、16) (q23处;p13.3) MLL / CREBBP
t (11、19) (q23处;p13.1)
MLL / l形的
t (11、19) (q23处;p13.3) MLL / MLLT1。
在缺乏RPN1 / MECOM融合,w母鸡一个额外的MECOM信号识别,的MECOM / RUNX1探针集将被认为是确定一个潜在的t (3; 21) (q26.2;如)重排。
在缺乏RPN1 / MECOM融合,当一个额外的RPN1信号识别,反射测试使用PRDM16 / RPN1探针设置将被认为确定一个潜在的t (1; 3) (p36;温度系数)。
在缺乏MYH11 / CBFB融合,当一个额外CBFB信号识别,反射测试将使用CBFB分开探测器将评估CBFB的存在与否重排。
没有PML / RARA融合,当一个额外的或非典型RARA信号识别,测试使用分开RARA探针组将进行易位包括识别潜在的变体RARA;例如:t (17; var)(温度系数;?)。
当一个确定ETV6重排,反射测试使用MNX1 / ETV6探针集将被执行来识别潜在的t (7; 12) (q36; p13)重排。
当确定NUP98重排,反射测试使用HOXA9 / NUP98探针集将被执行来识别潜在的t (7; 11) (p15; p15.4)重排。
以下算法可用,看到特别指示:
- - - - - -急性白血病的模棱两可的血统检测算法
- - - - - -急性髓系白血病:测试算法
- - - - - -急性早幼粒细胞白血病:指导诊断和随访
不同
这个测试只进行儿科患者的标本被考虑录取在儿童肿瘤协会(齿轮)协议。如果这个测试是有序和实验室告知病人并不在儿童肿瘤协会(齿轮)协议,这个测试将自动取消,重新排序的实验室AMLPF /急性髓系白血病(AML)、鱼、儿科,各不相同。
儿童疾病复发或次要的骨髓肿瘤是一种关心和登记在一个新的齿轮协议被认为是;秩序COGBM /染色体分析、血液疾病,儿童肿瘤协会入学测试,骨髓。
建议特快专递或同等如果不是快递服务。
1。测试的原因、流式细胞术和/或骨髓病理报告,和一个儿童肿瘤协会(齿轮)注册号和协议数量与每个标本应提交。实验室测试拒绝不提供这些信息,但是适当的测试和解释可能被削弱或延迟。如果不提供这些信息,一个适当的指示进行测试可以由梅奥诊所进入实验室。yabo208
2。如果病人已收到一个异性骨髓移植前为该协议样本收集,注意这个信息请求。
提交以下标本:只有1
首选:
样品类型:骨髓
容器/管:
首选:黄色(ACD)
可以接受的:绿色(肝素)或薰衣草面上(EDTA)
样品数量:2到3毫升
收集产品说明:
2。反几次混合骨髓。
可以接受的:
样品类型:血
容器/管:
首选:黄色(ACD)
可以接受的:绿色(肝素)或薰衣草面上(EDTA)
样品数量:6毫升
收集产品说明:反几次混合血。
血:2毫升
骨髓:1毫升
标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
---|---|---|---|
不同 | 环境(首选) | ||
冷藏 |
评价小儿骨髓和外周血标本的荧光原位杂交(FISH)调查分析经典的重组和染色体拷贝数变化与急性髓系白血病(AML)患者在儿童肿瘤协会考虑招生(齿轮)的临床试验和研究协议
作为一个兼职在执行常规染色体研究儿童AML患者正在考虑齿轮的注册协议
这个测试只进行儿科患者的标本被考虑录取在儿童肿瘤协会(齿轮)协议。
荧光原位杂交(FISH)面板包括测试下面的异常使用列出的鱼类探测器:
发票(16),(M4, Eos], MYH11 / CBFB
t (8; 21), (M2), RUNX1T1 / RUNX1
t (15、17), (M3), PML / RARA
11 q23处重排,[M0-M7], MLL (KMT2A)
t(6, 9)平方米,M4, DEK / NUP214
发票(3)和t (3; 3), (M1、2、4、6、7), RPN1 / MECOM
t (8; 16), (M4、M5) KAT6A / CREBBP
t (1; 22), [M7], RBM15 / MKL1
5/5q, D5S630 / EGR1
7/7q, D7Z1 / D7S486
12 p13重排,ETV6
发票(16),GLIS2 / CBFA2T3
11 p15.4重排,NUP98
MLL重排(KMT2A)确定时,反射测试将识别进行易位的合作伙伴。调查包括识别:
t(4; 11)(温度系数;q23处)AFF1 / MLL
t(6; 11)(问;q23处)MLLT4 (AFDN) / MLL
t(9、11)(第22位;q23处)MLLT3 / MLL
t (10、11) (p12; q23处)MLLT10 / MLL
t (11、16) (q23处;p13.3) MLL / CREBBP
t (11、19) (q23处;p13.1)
MLL / l形的
t (11、19) (q23处;p13.3) MLL / MLLT1。
在缺乏RPN1 / MECOM融合,w母鸡一个额外的MECOM信号识别,的MECOM / RUNX1探针集将被认为是确定一个潜在的t (3; 21) (q26.2;如)重排。
在缺乏RPN1 / MECOM融合,当一个额外的RPN1信号识别,反射测试使用PRDM16 / RPN1探针设置将被认为确定一个潜在的t (1; 3) (p36;温度系数)。
在缺乏MYH11 / CBFB融合,当一个额外CBFB信号识别,反射测试将使用CBFB分开探测器将评估CBFB的存在与否重排。
没有PML / RARA融合,当一个额外的或非典型RARA信号识别,测试使用分开RARA探针组将进行易位包括识别潜在的变体RARA;例如:t (17; var)(温度系数;?)。
当一个确定ETV6重排,反射测试使用MNX1 / ETV6探针集将被执行来识别潜在的t (7; 12) (q36; p13)重排。
当确定NUP98重排,反射测试使用HOXA9 / NUP98探针集将被执行来识别潜在的t (7; 11) (p15; p15.4)重排。
以下算法可用,看到特别指示:
- - - - - -急性白血病的模棱两可的血统检测算法
- - - - - -急性髓系白血病:测试算法
- - - - - -急性早幼粒细胞白血病:指导诊断和随访
急性髓系白血病(AML)是最常见的成人白血病之一,每年有近10000新病例诊断。AML还包括15%的小儿急性白血病和占大多数的婴儿(< 1岁)白血病。
在AML复发性染色体异常几件物品已经被确认。最常见的染色体异常与AML包括t (8; 21)、t(15、17)、发票(16),和异常的MLL(KMT2A11 q23处)基因。最常见的基因并列MLL通过在AML包括易位事件MLTT4 (AFDN)t (6; 11),MLLT3 -t (9。11),MLLT10- - - - - -t (10、11)厄尔-t (11; 19 p13.1)。
AML也可以从脊髓发育不良(MDS)。因此,常见的染色体异常与MDS AML也可以确定,其中包括:发票(3),5/5q, 7/7q和17 p。总的来说,在AML患者复发性染色体异常发现观察诊断AML大约60%的情况下。
常规染色体分析是识别常见的黄金标准,在AML复发性染色体异常。然而,一些微妙的重组可以错过的核型,其中包括发票(16)MLL重组。
荧光原位杂交(FISH)分析nonproliferating(界面)的细胞可以用来检测常见的染色体异常在AML患者。异常诊断和预后的相关性,和鱼测试也可以用来跟踪对治疗的反应。
中期鱼确认经典神秘而不是视觉检测的易位染色体分析(即t(6; 11)联系在一起KMT2A / MLLT4 (AFDN)融合)执行根据儿童肿瘤协会(齿轮),包括电子的一部分案例提交由齿轮的梅奥诊所基因组学实验室中央审查。
额外的细胞遗传学技术,如染色体微阵列(CMAH /染色体微阵列、血液疾病,不同)可能有助于解决问题相关的倍性(超二倍体的克隆和亚二倍的克隆翻了一番)。
一个将提供解释报告。
检测到肿瘤克隆细胞的百分比时异常超过正常参考范围的任何调查。
没有异常克隆并不排除肿瘤疾病的存在。
这个测试是不经美国食品和药物管理局批准,,最好是用作现有的临床和病理信息的一个附属物。
荧光原位杂交(FISH)是不能代替传统的染色体研究因为后者检测染色体异常与许多其他血液疾病,将错过这条鱼板测试。
骨髓是首选这条鱼标本类型测试。如果骨髓不可用,血液标本可以使用如果有恶性肿瘤细胞在血液标本(如由hematopathologist验证)。
1。Grimwade D,山RK,穆斯林AV, et al:急性髓系白血病细胞遗传学分类的细化:确定预后意义或罕见的经常性染色体异常在5876年轻成年患者在英国研究理事会试验。血。2010年7月22日,116 (3):354 - 365
2。Swerdlow SH,坎波E,哈里斯问,等人eds:谁分类肿瘤的淋巴造血组织。研究出版社;2017年
3。多恩H, Estey E, Grimwade D, et al:诊断和管理AML的成人:2017年民族解放军从一个国际专家小组的建议。血。2017年1月26日,129 (4):424 - 447。doi: 10.1182 / - 2016 - 08 - 733196血
执行这个测试使用商用和laboratory-developed探针。删除5和7的染色体或染色体检测使用枚举策略调查。重组涉及MLL(KMT2A),NUP98、ETV6 CBFB,和RARA检测到使用既分开(BAP)策略调查。既,dual-fusion探针荧光原位杂交(D-FISH)策略集是用来检测发票(3),发票(16),t (8; 21)、t (15、17)、t (6, 9)、t (8; 16)、t (3; 21), t (1; 3), t (1; 22), t (7; 11)、t(7; 12),在反射测试当重组MLL基因检测。枚举和软面包卷策略探针集,100间期核得分;200间期核得分当D-FISH探测器使用。所有的结果都表示为百分数异常细胞核。(未发表的梅奥法)
星期一到星期五
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
88271 x 88275, 88291 -鱼类调查,分析,解释;1探针组
88271 x 88275 -鱼调查、分析;每个额外的探针集(如果合适的话)