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测试Id:COGTF
t细胞急性淋巴细胞白血病/淋巴瘤(所有),儿童肿瘤协会入学测试,鱼,各不相同
有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的
评价小儿骨髓和外周血标本的荧光原位杂交探针分析经典的重组和染色体拷贝数变化与t细胞急性相关联淋巴细胞白血病病人正在考虑在儿童肿瘤协会注册临床试验和研究协议
反射测试
列出测试,可能会或可能不会被执行,在一个额外的费用,根据初始测试的结果和解释。
列出测试,可能会或可能不会被执行,在一个额外的费用,根据初始测试的结果和解释。
| 测试Id | 报告名称 | 可单独购买 | 总是表现 |
|---|---|---|---|
| COGTB | 探测器,每个额外的(COGTF) | 不,(仅法案) | 没有 |
测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。
这个测试只进行儿科患者的标本被考虑录取在儿童肿瘤协会(齿轮)协议。
荧光原位杂交(FISH)面板包括测试下面的异常使用列出的鱼类探测器:
+ 9/9p - CDKN2A / D9Z1
t(9; 22)或ABL1放大,ABL1 / BCR
11 q23处重排,MLL (KMT2A)分开
17/17p, TP53 / D17Z1
t (5; 14), TLX3 / BCL11B融合
7 q34重排,民国分开
14 q11.2重排,传统的分开
t (10、11), MLLT10 / PICALM融合
1 p33重排,TAL1 /保修期内
MLL重排(KMT2A)确定时,反射测试将识别进行易位的合作伙伴。调查包括识别:
t (11、19) (q23处;p13.3) MLL / MLLT1
t(6; 11)(问;q23处)MLLT4 (AFDN) / MLL
t(4; 11)(温度系数;q23处)AFF1 / MLL
t(9、11)(第22位;q23处)MLLT3 / MLL
t (10、11) (p12; q23处)MLLT10 / MLL
t (11、19) (q23处;p13.1) MLL / l形
识别,传统的重排时反射测试将识别进行易位的合作伙伴。调查包括识别:
t (11、14) (p15; q11.2) LMO1 /传统的
t (8; 14) (q24.1; q11.2) MYC /传统的
t(10; 14)(抓起;q11.2) TLX1 (HOX11) /传统的
t (11、14) (p13; q11.2) LMO2 /传统的
当一个民国确定重排,反射测试将识别进行易位伙伴。调查包括识别:
t (7; 10) (q34;抓起)民国/ TLX1
t (7、11) (q34; p15)民国/ LMO1
t (7、11) (q34; p13)民国/ LMO2
t (6、7) (q23处;q34) MYB分委会
在缺乏BCR / ABL1融合或明显游离ABL1放大,当一个额外ABL1信号识别,反射测试将使用ABL1分开探测器将评估的存在与否ABL1重排。
方法名称
一个简短的描述方法用于执行测试
一个简短的描述方法用于执行测试
荧光原位杂交(FISH)
纽约的状态
表明纽约国家批准的状态,如果测试是公开为纽约州立客户定货。
表明纽约国家批准的状态,如果测试是公开为纽约州立客户定货。
是的
报告名称
列出了短或缩写为一个测试版本的发布名称
列出了短或缩写为一个测试版本的发布名称
齿轮,(t细胞),鱼
别名
列表附加测试常见的名字,作为一个帮助搜索
列表附加测试常见的名字,作为一个帮助搜索
9 p - (9 p删除)或者CDKN2A p16
t (9、22) (q34; q11.2) - BCR / ABL1
MLL或KMT2A (11 q23处)重排
t(4; 11)(温度系数;q23处)- AFF1 / MLL或AFF4 / MLL
t(6; 11)(问;q23处)——MLLT4 (AFDN) / MLL或AFDN / MLL
t(9、11)(第22位;q23处)- MLLT3 / MLL或AF9 / MLL
t (10、11) (p13; q23处)- MLLT10 / MLL
t (11、19) (q23处;p13.3) - MLL / MLLT1或MLL / ENL
t (11、19) (q23处;p13.1) - MLL / l形
17 p - (17 p删除)或者TP53
t (5; 14) (q35;问)- TLX3 / BCL11B或HOX11L2 / BCL11B
t细胞受体β(民国)(7 q34)重排
t细胞受体α/δ(传统的)(14 q11.2)重排
t (10、11) (p13; q14) - MLLT10 / PICALM或AF10 / PICALM
TAL1 /保修期内(1 p33)重排或塔尔/银
儿童肿瘤协会,齿轮
测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。
这个测试只进行儿科患者的标本被考虑录取在儿童肿瘤协会(齿轮)协议。
荧光原位杂交(FISH)面板包括测试下面的异常使用列出的鱼类探测器:
+ 9/9p - CDKN2A / D9Z1
t(9; 22)或ABL1放大,ABL1 / BCR
11 q23处重排,MLL (KMT2A)分开
17/17p, TP53 / D17Z1
t (5; 14), TLX3 / BCL11B融合
7 q34重排,民国分开
14 q11.2重排,传统的分开
t (10、11), MLLT10 / PICALM融合
1 p33重排,TAL1 /保修期内
MLL重排(KMT2A)确定时,反射测试将识别进行易位的合作伙伴。调查包括识别:
t (11、19) (q23处;p13.3) MLL / MLLT1
t(6; 11)(问;q23处)MLLT4 (AFDN) / MLL
t(4; 11)(温度系数;q23处)AFF1 / MLL
t(9、11)(第22位;q23处)MLLT3 / MLL
t (10、11) (p12; q23处)MLLT10 / MLL
t (11、19) (q23处;p13.1) MLL / l形
识别,传统的重排时反射测试将识别进行易位的合作伙伴。调查包括识别:
t (11、14) (p15; q11.2) LMO1 /传统的
t (8; 14) (q24.1; q11.2) MYC /传统的
t(10; 14)(抓起;q11.2) TLX1 (HOX11) /传统的
t (11、14) (p13; q11.2) LMO2 /传统的
当一个民国确定重排,反射测试将识别进行易位伙伴。调查包括识别:
t (7; 10) (q34;抓起)民国/ TLX1
t (7、11) (q34; p15)民国/ LMO1
t (7、11) (q34; p13)民国/ LMO2
t (6、7) (q23处;q34) MYB分委会
在缺乏BCR / ABL1融合或明显游离ABL1放大,当一个额外ABL1信号识别,反射测试将使用ABL1分开探测器将评估的存在与否ABL1重排。
标本类型
描述了标本类型验证测试
描述了标本类型验证测试
不同
订购指南
这个测试只进行儿科患者的标本被考虑录取在儿童肿瘤协会(齿轮)协议。如果这个测试是有序和实验室告知病人不是一个齿轮协议,这个测试将自动取消,重新排序的实验室TALPF /t细胞急性淋巴细胞白血病/淋巴瘤(全部)、鱼、儿科各不相同。
在随访,常规细胞遗传学研究(CHRBM /染色体分析、血液疾病,骨髓)和有针对性的所有鱼类探测器可以评估基于异常的诊断研究。秩序TALMF / t细胞急性淋巴细胞白血病/淋巴瘤(所有),指定鱼、变化和请求特定的探测或异常。
如果病人临床复发,常规染色体研究是有用的确定肿瘤克隆细胞遗传学变化或可能出现新的therapy-related骨髓克隆。
患者t细胞淋巴瘤、秩序TLPDF / t细胞淋巴瘤,诊断鱼,各不相同。
测试从患者t细胞淋巴细胞淋巴瘤石蜡包埋组织样本,TLBLF /T-Lymphoblastic白血病/淋巴瘤、鱼、组织。
额外的测试需求
(COGBM /诊断,常规细胞遗传学研究染色体分析、血液疾病,儿童肿瘤协会入学测试,骨髓),这个页面应该执行。如果有样本有限,只有这个测试将被执行。
装船指示
建议特快专递或同等如果不是快递服务。
必要的信息
1。原因测试、流式细胞术和/或骨髓病理报告,和一个儿童肿瘤协会(齿轮)注册号和协议数量与每个标本应提交。实验室测试拒绝不提供这些信息,但是适当的测试和解释可能被削弱或延迟。如果不提供这些信息,一个适当的指示进行测试可以由梅奥诊所进入实验室。yabo208
2。如果病人已收到一个异性骨髓移植,注意这个信息请求。
标本要求
定义了执行测试所需的最佳标本和首选的体积来完成测试
定义了执行测试所需的最佳标本和首选的体积来完成测试
提交以下标本:只有1
首选
样品类型:骨髓
容器/管:
首选:黄色(ACD)
可以接受的:绿色(肝素)或薰衣草面上(EDTA)
样品数量:2到3毫升
收集产品说明:
1。最好从骨髓采集发送第一个送气音。
2。反几次混合骨髓。
可接受的
样品类型:血
容器/管:
首选:黄色(ACD)
可以接受的:绿色(肝素)或薰衣草面上(EDTA)
样品数量:6毫升
收集产品说明:反几次混合血。
形式
试样体积最小
定义样本的数量必须提供一个临床相关的结果取决于测试实验室
定义样本的数量必须提供一个临床相关的结果取决于测试实验室
血:2毫升
骨髓:1毫升
拒绝原因
识别标本类型和条件可能会导致样品被拒绝
识别标本类型和条件可能会导致样品被拒绝
所有标本将评估在梅奥诊所实验室测试适用性。yabo208
样品稳定性信息
提供了一个描述运输所需的温度进行实验室的标本,替代还包括可接受的温度
提供了一个描述运输所需的温度进行实验室的标本,替代还包括可接受的温度
| 标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
|---|---|---|---|
| 不同 | 环境(首选) | ||
| 冷藏 | |||
有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的
评价小儿骨髓和外周血标本的荧光原位杂交探针分析经典的重组和染色体拷贝数变化与t细胞急性相关联淋巴细胞白血病病人正在考虑在儿童肿瘤协会注册临床试验和研究协议
测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。
这个测试只进行儿科患者的标本被考虑录取在儿童肿瘤协会(齿轮)协议。
荧光原位杂交(FISH)面板包括测试下面的异常使用列出的鱼类探测器:
+ 9/9p - CDKN2A / D9Z1
t(9; 22)或ABL1放大,ABL1 / BCR
11 q23处重排,MLL (KMT2A)分开
17/17p, TP53 / D17Z1
t (5; 14), TLX3 / BCL11B融合
7 q34重排,民国分开
14 q11.2重排,传统的分开
t (10、11), MLLT10 / PICALM融合
1 p33重排,TAL1 /保修期内
MLL重排(KMT2A)确定时,反射测试将识别进行易位的合作伙伴。调查包括识别:
t (11、19) (q23处;p13.3) MLL / MLLT1
t(6; 11)(问;q23处)MLLT4 (AFDN) / MLL
t(4; 11)(温度系数;q23处)AFF1 / MLL
t(9、11)(第22位;q23处)MLLT3 / MLL
t (10、11) (p12; q23处)MLLT10 / MLL
t (11、19) (q23处;p13.1) MLL / l形
识别,传统的重排时反射测试将识别进行易位的合作伙伴。调查包括识别:
t (11、14) (p15; q11.2) LMO1 /传统的
t (8; 14) (q24.1; q11.2) MYC /传统的
t(10; 14)(抓起;q11.2) TLX1 (HOX11) /传统的
t (11、14) (p13; q11.2) LMO2 /传统的
当一个民国确定重排,反射测试将识别进行易位伙伴。调查包括识别:
t (7; 10) (q34;抓起)民国/ TLX1
t (7、11) (q34; p15)民国/ LMO1
t (7、11) (q34; p13)民国/ LMO2
t (6、7) (q23处;q34) MYB分委会
在缺乏BCR / ABL1融合或明显游离ABL1放大,当一个额外ABL1信号识别,反射测试将使用ABL1分开探测器将评估的存在与否ABL1重排。
临床信息
讨论了生理学、病理生理学和一般临床方面,与实验室测试
讨论了生理学、病理生理学和一般临床方面,与实验室测试
在美国,急性淋巴细胞白血病(ALL)的发生率大约是每年6000新病例(2019年)。所有占大约70%的儿童白血病病例(0 - 19岁),是最常见的儿童癌症。
大约有85%的儿童病例都是b细胞谱系(b)和15% t细胞系(t)。t更常见的比年轻的儿童和青少年占25%的成年。当发生作为主要淋巴母细胞性淋巴瘤(LBL),大约90%是t细胞系和只有10%的b细胞谱系。T-LBL经常出现在年轻的纵隔肿瘤患者并发骨髓或不参与。
特定的基因异常识别t在大多数情况下,尽管许多经典的染色体异常是由传统的“神秘”的研究,必须确定荧光原位杂交(FISH)研究。每个基因子组是重要的预后标志物检测,可以至关重要的。一个预测标志,放大的ABL1基因区域,已被确定在所有的5%,这些病人可能对有针对性的酪氨酸激酶抑制剂。
细胞遗传学和鱼的组合测试是目前推荐在所有儿童和成人患者的预后基因子组t克隆。染色体异常的特征的总结中确定所有列在下表中。
表。常见的染色体异常t细胞急性淋巴细胞白血病
细胞遗传学改变
|
基因
|
德尔(1 p33)
|
TAL1 /保修期内
|
t (5; 14) (q35;问)
|
TLX3/BCL11B
|
t (10、11) (p12; q14)
|
MLLT10/PICALM
|
游离放大
|
ABL1
|
德尔(9 p) |
CDKN2A(p16)
|
t (11 q23处;var)
|
MLL(KMT2A)
|
t(4; 11)(温度系数;q23处)
|
AFF1/MLL(KMT2A)
|
t (6; 11) (问;q23处) |
MLLT4 (AFDN)/MLL(KMT2A)
|
t(9、11)(第22位;q23处)
|
MLLT3/MLL(KMT2A)
|
t (10、11) (p12; q23处)
|
MLLT10) /MLL(KMT2A)
|
t (11、19) (q23处;p13.1)
|
MLL(KMT2A) /l形的
|
t (11、19) (q23处;p13.3)
|
MLL(KMT2A) /MLLT1
|
t (7 q34; var)
|
交通研究
|
t (6、7) (q23处;q34)
|
MYB/交通研究
|
t (7; 10) (q34;抓起)
|
交通研究/TLX1
|
t (7、11) (q34; p15)
|
交通研究/LMO1
|
t (7、11) (q34; p13)
|
交通研究/LMO2
|
t (14 q11.2; var)
|
传统的
|
t (8; 14) (q24.1; q11.2)
|
MYC/传统的
|
t(10; 14)(抓起;q11.2)
|
TLX1/传统的
|
t (11、14) (p15; q11.2)
|
LMO1/传统的
|
t (11、14) (p13; q11.2)
|
LMO2/传统的
|
德尔(p) 17日
|
TP53
|
参考价值
描述参考区间和附加信息的解释测试结果。可能包括在适当的时间间隔根据年龄和性别。间隔Mayo-derived,除非另有指定。如果一个提供解释报告,参考价值字段将这个状态。
描述参考区间和附加信息的解释测试结果。可能包括在适当的时间间隔根据年龄和性别。间隔Mayo-derived,除非另有指定。如果一个提供解释报告,参考价值字段将这个状态。
一个将提供解释报告。
解释
提供信息,协助解释测试结果
提供信息,协助解释测试结果
注意事项
讨论了条件,可能会导致诊断的混乱,包括样本收集和处理不当,不恰当的测试选择、干扰物质
讨论了条件,可能会导致诊断的混乱,包括样本收集和处理不当,不恰当的测试选择、干扰物质
这个测试是不经美国食品和药物管理局批准,,最好是用作现有的临床和病理信息的一个附属物。
荧光原位杂交(FISH)是不能代替传统的染色体研究因为后者检测染色体异常与许多其他血液疾病,将错过这条鱼板测试。
骨髓是首选这条鱼标本类型测试。如果骨髓不可用,血液标本可以使用如果有恶性肿瘤细胞在血液标本(如由hematopathologist验证)。
支持数据
每个探测是独立测试和验证如果外周血和骨髓标本。正常达标计算结果的基础上25正常标本。每个探针集评估确认探头检测到异常它旨在检测。
临床参考
对临床性质的深入阅读的建议
对临床性质的深入阅读的建议
1。Swerdlow SH,坎波E,哈里斯问eds等:世卫组织分类的肿瘤淋巴造血组织。研究出版社;2017年
2。Gesk年代,Martin-Subero霁,更难L, et al:分子细胞遗传学检测t细胞受体基因位点的染色体断点。白血病。2003;17:738 - 745
3所示。下巴,Mugishima H, Takamura M, et al: Hemophagocytic综合症和hepatosplenic(γ)(δ)t细胞淋巴瘤等臂染色体7 q和8三染色体细胞。J Pediatr内科杂志杂志。2004;26 (6):375 - 378
4所示。Graux C,冷却J,葡萄L,等:t细胞急性淋巴细胞白血病的细胞遗传学和分子遗传学:从thymocyte淋巴母细胞。白血病。2006;20:1496 - 1510
5。刘Y,伊斯顿J,邵Y, et al:基因组景观的儿童和年轻成人T-lineage急性淋巴细胞白血病。Nat麝猫。2017;49 (8):1211 - 1218
方法描述
描述如何执行测试并提供method-specific参考
描述如何执行测试并提供method-specific参考
这个测试使用商用和laboratory-developed执行调查。Deletion的CDKN2A9号染色体位点和TP5317号染色体上检测到使用枚举策略调查。重组涉及TAL1 /保修期内,民国,MLL(KMT2A),传统的检测到使用既分开(BAP)策略探讨。既,dual-fusion荧光原位杂交(D-FISH)战略探针集是用来检测t (5; 14), t (9; 22), t(10、11),在反射测试当重组MLL,民国,或传统的基因检测。放大的ABL1(9 q34)使用D-FISH探针检测策略。枚举和软面包卷策略探针集,100间期核得分;200间期核得分当D-FISH探测器使用。所有的结果都表示为百分数异常细胞核。(未发表的梅奥法)
PDF报告
表明报告包括一个额外的文档是否与图表、图像或其他丰富的信息
表明报告包括一个额外的文档是否与图表、图像或其他丰富的信息
没有
天(s)
概述了天测试执行。这个领域反映了天,样品必须在测试实验室开始测试过程,包括任何样品制备和测试执行之前处理时间。列出了一些测试,不断进行,这意味着化验白天多次执行。
概述了天测试执行。这个领域反映了天,样品必须在测试实验室开始测试过程,包括任何样品制备和测试执行之前处理时间。列出了一些测试,不断进行,这意味着化验白天多次执行。
星期一到星期五
报告可用
时间的间隔(收到样品在梅奥诊所实验室结果可用)考虑标准设置和周末。yabo208第一天的时间通常是结果可用。最后一天的时间可能需要,占任何必要的重复测试。
时间的间隔(收到样品在梅奥诊所实验室结果可用)考虑标准设置和周末。yabo208第一天的时间通常是结果可用。最后一天的时间可能需要,占任何必要的重复测试。
7到10天
样品保留时间
轮廓的时间在测试标本保存在实验室之前就会被丢弃
轮廓的时间在测试标本保存在实验室之前就会被丢弃
4周
执行实验室的位置
表明实验室的位置执行测试
表明实验室的位置执行测试
罗彻斯特
费用
几个因素决定执行一个测试的费用收取。联系你的美国或国际区域经理建立费用表的信息或了解更多关于资源优化测试的选择。
几个因素决定执行一个测试的费用收取。联系你的美国或国际区域经理建立费用表的信息或了解更多关于资源优化测试的选择。
测试的分类
提供信息关于医疗器械分类为实验室测试工具和试剂。测试可以分为清除或通过美国食品和药物管理局(FDA)和每个制造商使用说明,或产品,不接受FDA审查和批准,并贴上一个分析物特定试剂(ASR)产品。
提供信息关于医疗器械分类为实验室测试工具和试剂。测试可以分为清除或通过美国食品和药物管理局(FDA)和每个制造商使用说明,或产品,不接受FDA审查和批准,并贴上一个分析物特定试剂(ASR)产品。
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
CPT编码信息
提供指导在决定适当的当前程序的术语(CPT)代码(s)为每个测试或概要信息。梅奥诊所上市CPT编码反映实验室的解释CPT编码需求。yabo208每个实验室有责任来确定正确的CPT编码用于计费。
CPT编码由执行实验室提供。
提供指导在决定适当的当前程序的术语(CPT)代码(s)为每个测试或概要信息。梅奥诊所上市CPT编码反映实验室的解释CPT编码需求。yabo208每个实验室有责任来确定正确的CPT编码用于计费。
CPT编码由执行实验室提供。
CPT编码由执行实验室提供。
88271 x2 88275 x1, 88291 x1 -鱼类调查,分析,解释;1探针组
88271 x2 88275 x1 -鱼调查、分析;每个额外的探针集(如果合适的话)
LOINC®信息
提供指导在确定逻辑观察标识符名称和代码(LOINC)值的顺序和结果代码的测试。LOINC表演实验室提供的值。
提供指导在确定逻辑观察标识符名称和代码(LOINC)值的顺序和结果代码的测试。LOINC表演实验室提供的值。
| 测试Id | 测试顺序的名字 | 订单LOINC价值 |
|---|---|---|
| COGTF | 齿轮,(t细胞),鱼 | 过程中 |
| 结果Id | 测试结果的名字 | 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
|
|---|---|---|
| 602286年 | 结果总结 | 50397 - 9 |
| 602287年 | 解释 | 69965 - 2 |
| 602288年 | 结果表 | 93356 - 4 |
| 602289年 | 结果 | 62356 - 1 |
| GC016 | 推荐的理由 | 42349 - 1 |
| GC017 | 标本 | 31208 - 2 |
| 602291年 | 源 | 31208 - 2 |
| 602292年 | 方法 | 85069 - 3 |
| 602293年 | 额外的信息 | 48767 - 8 |
| 602294年 | 免责声明 | 62364 - 5 |
| 602295年 | 发布的 | 18771 - 6 |