诊断的疑似常染色体隐性多囊肾病(ARPKD)
产前诊断是否有高涉嫌ARPKD基于超声发现
运营商测试ARPKD家族史的个体,但影响个人不是用于测试或致病变种尚未确定
这个测试包括下一代测序评估的变体PKHD1基因。桑格测序可能执行确认检测到变异。
测试Id | 报告名称 | 可单独购买 | 总是表现 |
---|---|---|---|
CULFB | 纤维母细胞文化基因测试 | 是的 | 没有 |
CULAF | 羊水文化/基因测试 | 是的 | 没有 |
MATCC | 母细胞污染,B | 是的 | 没有 |
仅供产前标本:如果羊水(nonconfluent收到培养细胞),羊水文化/基因测试将被添加并分别收取。如果绒毛标本(nonconfluent收到培养细胞),纤维母细胞文化基因测试将被添加并分别收取。任何收到的产前样品,孕产妇细胞污染的研究将被添加。
自定义序列捕获和有针对性的下一代测序(上天)紧随其后聚合酶链反应(PCR)和桑格测序在适当的时候
ARPKD
PKHD1
多囊肾疾病(PKD)
接下来一代测序测试
仅供产前标本:如果羊水(nonconfluent收到培养细胞),羊水文化/基因测试将被添加并分别收取。如果绒毛标本(nonconfluent收到培养细胞),纤维母细胞文化基因测试将被添加并分别收取。任何收到的产前样品,孕产妇细胞污染的研究将被添加。
不同
所有产前标本必须伴随着母亲的血液标本;订单MATCC /母体细胞污染,分子分析,不同产妇标本。
全血标本首选的96小时内到达集合。
病人准备:先前的骨髓移植同种异体的捐赠会干扰测试。调用800-533-1710说明测试的病人接受了骨髓移植手术。
附加信息:以确保最小体积和浓度的DNA,首选的标本必须提交。测试可能被取消如果DNA的需求是不够的。
提交以下标本:只有1
样品类型:全血
容器/管:
首选:薰衣草(EDTA)或黄色大(ACD)
可以接受的:任何抗凝剂
样品数量:3毫升
收集产品说明:
1。反几次混合血。
2。在原始管发送样品。不整除。
样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏
产前样品
由于产前测试的复杂性,需要与实验室协商所有产前测试。
样品类型:羊水
容器/管:羊水容器
样品数量:20毫升
样品稳定性信息:冷藏(首选)/环境
标本类型:绒膜绒毛
容器/管:15毫升管包含15毫升的传输媒体
样品数量:20毫克
样品稳定性信息:冷藏
可以接受的:
样品类型:融合性的培养细胞
容器/管:T-25瓶
样品数量:2烧瓶
收集产品说明:从另一个实验室提交汇合的培养细胞。
样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏
1。纽约Clients-Informed同意是必需的。请求的文档形式或电子订单,一份文件。下列文件中可用的特别指示:
- - - - - -基因检测的知情同意(T576)
- - - - - -为遗传Testing-Spanish知情同意(T826)
2。分子遗传学:先天性遗传性疾病患者信息(T521)在特殊指令
3所示。如果不是电子订购,完成,打印和发送肾诊断测试请求(T830)标本。
血:1毫升
羊水:10毫升
绒毛膜绒毛:5毫克
标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
---|---|---|---|
不同 | 变化(首选) |
诊断的疑似常染色体隐性多囊肾病(ARPKD)
产前诊断是否有高涉嫌ARPKD基于超声发现
运营商测试ARPKD家族史的个体,但影响个人不是用于测试或致病变种尚未确定
这个测试包括下一代测序评估的变体PKHD1基因。桑格测序可能执行确认检测到变异。
仅供产前标本:如果羊水(nonconfluent收到培养细胞),羊水文化/基因测试将被添加并分别收取。如果绒毛标本(nonconfluent收到培养细胞),纤维母细胞文化基因测试将被添加并分别收取。任何收到的产前样品,孕产妇细胞污染的研究将被添加。
常染色体隐性多囊肾病(ARPKD)是一个障碍引起的变异在多囊肾和肝脏疾病1 (PKHD1)基因。ARPKD的发生率大约是1:20,000和估计载波频率1:70一般人群。ARPKD回波的肾脏肿大,先天性肝纤维化、肺发育不全(二级羊水过少(羊水量不足]在子宫内)。大多数人对ARPKD目前在新生儿期,其中近三分之一死于呼吸衰竭。早期诊断,除了启动肾脏替代治疗(透析或移植)和呼吸支持,大大增加了10年生存率。表现症状包括双边明显的侧面群众在婴儿和后续观察典型的肾超声发现,通常在高血压的临床背景和产前羊水过少。在罕见的情况下,个人不得在儿童或成人肝脾肿大。那些在新生儿期,进展到终末期肾病和三分之一到二分之一发展慢性肾脏功能不全。
的PKHD1基因映射到6 p12和包括67个外显子。的PKHD1基因编码蛋白fibrocystin,局部肾小管的初级纤毛和基体和胆道上皮细胞。因为ARPKD是一种常染色体隐性疾病,影响个人必须携带2内有害的变异PKHD1基因。尽管疾病外显率为100%,家庭内部疾病严重程度的变化被观察到。基因变异检测往往是困难由于大尺寸和私人的流行跨的整个长度的变异基因。
一个将提供解释报告。
所有检测到的变化评估根据美国大学医学遗传学和基因组学(ACMG)建议。(1)变体进行分类的基础上,预测,或可能的致病性和报告详细注释解释他们的潜在的或已知的意义。
一小部分人运营商或常染色体隐性多囊肾疾病的诊断(ARPKD)可能有变异,不确定这个方法(例如,大基因缺失/重复,发起人改变、深intronic变体)。没有一个变体,因此,并不能消除的可能性积极的载体状态或ARPKD的诊断。载波检测,重要的是第一个文档的多囊肾和肝脏疾病1 (PKHD1在一个受影响的家庭成员)基因变异。
测试结果应解释在临床中发现,家族史和其他实验室数据。错误可能发生在我们的解释结果如果资料不准确或不完整的。
技术的局限性:
在某些情况下,DNA变异的待定意义可能是确定的。
罕见的改变(多态性)存在,可能导致假阴性或假阳性结果。如果结果不匹配的临床研究结果,应考虑额外的测试。
评估工具:
多个in-silico评估工具被用来帮助解释这些结果。这些工具是定期更新;因此,改变这些算法对于一个给定的变更可能导致不同的预测。另外,这些工具的可预测性的致病性测定目前未经验证。
除非报道或将引起疾病,改变蛋白质编码基因,不会导致一个氨基酸替换不报道。这些常见的变化确定了这个病人可按照客户要求定制。
Variants-Policy重新分类:
此时,它不是标准实践的实验室系统地审查可能致病的改变或变异的不确定的意义之前发现和报道。实验室鼓励卫生保健提供者联系实验室随时了解一个特定的变体的状态随着时间的推移可能会改变。
1。理查兹,阿齐兹N,贝尔,et al:标准和指导方针的序列变异的解释:一个联合一致推荐的美国大学医学遗传学和基因组学和分子病理学协会。麝猫2015;17 (5):405 - 424。doi: 10.1038 / gim.2015.30
2。德斯蒙德RA Guay-Woodford LM:常染色体隐性多囊肾疾病:北美的临床经验。儿科。2003;111:1072 - 1080。doi: 10.1542 / peds.111.5.1072
3所示。Guay-Woodford LM Bissler JJ,布劳恩MC, et al:共识专家建议常染色体隐性多囊肾疾病的诊断和管理:一个国际会议的报告。J Pediatr。2014年9月,165 (3):611 - 617。doi: 10.1016 / j.jpeds.2014.06.015
4所示。Gunay-Aygun M,会员E, Bacallao RL, et al:常染色体隐性多囊肾疾病和先天性肝纤维化:总结第一次国家卫生研究院/罕见病办公室会议。J Pediatr。2006; 149:159 - 164。doi: 10.1016 / j.jpeds.2006.03.014
5。哈里斯PC,罗赛蒂史:常染色体隐性多囊肾疾病的分子遗传学。摩尔麝猫金属底座。2004;81:75 - 85。doi: 10.1016 / j.ymgme.2003.10.010
下一代测序进行测试在66年变异的存在外显子(外显子2 - 67)多囊肾和肝脏疾病1 (PKHD1)基因。桑格排序是用来证实改变探测到下一代测序在适当的时候。(未发表的梅奥法)
不同
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
81408年
纤维母细胞文化基因测试
88233 -(如果合适的话)
88240 -(如果合适的话)
羊水文化/基因测试
88235 -(如果合适的话)
88240 -(如果合适的话)
母细胞污染,B
81265 -(如果合适的话)