确定一种结核分枝杆菌复杂的培养物分离
测试ID | reporting Name | 一种vailable Separately | 一种lways Performed |
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RTBSP | ID,MTB形成,PCR | no, (Bill Only) | 是的 |
在排序此测试时,物种识别将始终以额外的费用进行。
实时聚合酶链反应(PCR)
酸性杆菌(AFB)
AFB(酸性杆菌)
芽孢杆菌,酸像
mtb(Mycobacterium tuberculosis)
结核分枝杆菌(MTB)
结核病(结核病)
结核菌:结核分枝杆菌
结核病(TB)
MTB复合物种
物种识别
结核病复杂物种
在排序此测试时,物种识别将始终以额外的费用进行。
varies
该测试应用于识别结核分枝杆菌来自已知的复杂结核病复合物分离株。
用于识别结核病complex from isolate growth, order CTBID / Culture Referred for Identification,mycobacteriumandnocardia,变化。
用于快速识别结核病complex directly from a specimen, order MTBRP/ 结核分枝杆菌复合物,分子检测,PCR,变化或MTBXP/ 结核分枝杆菌Complex, Molecular Detection, PCR, Sputum.
1.见感染标本运输指南在特殊说明中。
2. Place specimen in a large infectious container (T146) and label as an etiologic agent/infectious substance.
标本来源和S需要使用USPED的有机体识别。
补给品:我nfectious Container, Large (T146)
标本类型:结核分枝杆菌complex isolate growing in pure culture
容器/管:固体倾斜介质的增长,例如Middlebrook 7H10,7H11和Lowenstein Jensen。肉汤培养基的生长,例如分枝杆菌生长指示灯,7H9肉汤Bact/Alert MP或Versatrek。如果需要向Middlebrook琼脂培养基亚文化以确保纯度,则可能会延迟结果的周转时间。
标本卷:在固体培养基上具有可见生长的分离;如果发送肉汤,>或= 3毫升的肉汤培养物
收集说明:
1.有机体必须处于纯文化中,积极成长。do not submit mixed cultures.
2.将样品放在大型传染箱中,并将标签作为病因学药物/传染性物质。
琼脂板 混养 |
reject |
标本类型 | 温度 | 时间 | 特殊容器 |
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varies | 环境(首选) | ||
冷藏 |
确定一种结核分枝杆菌复杂的培养物分离
在排序此测试时,物种识别将始终以额外的费用进行。
该测定法提供了先前被鉴定为该成员的微生物培养物分离株的物种水平的鉴定结核分枝杆菌复杂的。species level identification can be important for patient care or for epidemiologic investigations. For example, the species-level identification ofmycobacterium牛在化学疗法期间使用疫苗作为辅助药物后,芽孢杆菌Calmette-Guerin(BCG)可以帮助鉴定传播感染。
不适用
该测定可以区分结核分枝杆菌complex, which are,结核病,,,,mycobacterium牛,,,,mycobacterium牛芽孢杆菌Calmette-Guerin(BCG;疫苗菌株),mycobacteriumcanettii,,,,mycobacterium卡普雷,,,,mycobacteriumMicroti,,,,andmycobacteriumpinnepedii..此测定无法区分mycobacteriumafricanum从mycobacterium蒙吉因此,如果获得了该结果,则将报告m非洲人/m mungi。
仅分离结核分枝杆菌复合物应提交,它们必须处于纯文化中。不应提交非结核分枝杆菌。混合文化将导致延迟,因为结核病复杂的生物必须在执行聚合酶链反应测定之前分离。
该测定尚未验证以直接检测结核病complex from clinical specimens. It is intended for use on microbiologic culture isolates already identified as结核病复杂的。
类型应变结核分枝杆菌使用物种鉴定聚合酶链反应(PCR)测定测试复合构件,并正确鉴定出所有。测试的类型应变是结核病一种tCC27294,分枝杆菌ATCC 19210,m牛BCG ATCC 101472,非洲分枝杆菌ATCC 25240,分枝杆菌微裂片ATCC 19422,分枝杆菌一种tCCb一种一种824,分枝杆菌pinnipediiATCC BAA 688。
另外,临床分离分枝杆菌canettii,identified by whole genome sequencing at the New York State Department of Health Wadsworth Center, was tested and confirmed to bem canettii由结核病复杂的物种鉴定PCR分析。
一种s part of the verification of this assay, 78结核病使用物种鉴定PCR测定法测试了与参考实验室中鉴定的物种的复杂分离株。所有78个分离株均被正确识别为物种水平。
LC 480 PCR结果
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species reported by reference laboratory
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结核病
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m牛
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m牛BCG |
m非洲
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结核病
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53
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m牛
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4
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m牛BCG |
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14
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m非洲
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7
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尽管物种识别测试只能用于已经识别为的分枝杆菌分离株结核病复杂,其他159mycobacteriumspecies isolates were tested to determine whether any nontuberculous mycobacteria would be positive in the test. No nontuberculous mycobacteria were positive in the结核病复杂的物种鉴定PCR分析。
Fitzgerald DW,Sterling TR,Haas DW:结核分枝杆菌。我n: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R, eds. Mandell, Douglas and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases. 9th ed. Elsevier; 2020:2985-3021
该方法在Lightcycler 480平台上使用实时聚合酶链反应(PCR)结核分枝杆菌complex-specific primers coupled with fluorescence resonance energy transfer (FRET) probes to differentiate the members of the complex to the species level. The probes target specific regions of difference (RD) within the结核病complex genome. Detection of the presence or absence of these RD allows for differentiation of the species within the结核病复合物(Halse TA,Escuyer VE,Musser KA:评估单管多重实时PCR用于分化结核病临床标本中的复合物。J Clin Microbiol。2011; 49:2562-2567)
the RD's expected for each species within the结核病复合物显示在下表中。“+”表示存在区域,“ - ”表示该区域不存在。
预期RD签名模式 |
RD1
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RD4
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RD9
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RD12
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RD9-2
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结核分枝杆菌
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+ |
+ |
+ |
+ |
+ |
分枝杆菌
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+ |
- |
- |
- |
+ |
分枝杆菌BCG
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- |
- |
- |
- |
+ |
非洲分枝杆菌
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+ |
+ |
- |
+ |
+ |
mycobacterium canettii
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+ |
+ |
+ |
- |
+ |
分枝杆菌
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+ |
+ |
- |
- |
+ |
分枝杆菌微裂片
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- |
+ |
- |
+ |
+ |
Mungi分枝杆菌
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+ |
+ |
- |
+ |
+ |
mycobacterium pinnepedii
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+ |
+ |
- |
- |
+ |
从星期一到星期五
该测试已被美国食品药品监督管理局清除,批准或豁免,并根据制造商的说明使用。梅奥诊所以与CLIA要求一致的方式验证了绩效特征。
87150
测试ID | test Order Name | 订单loinc值 |
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汤匙 | M结核病物种ID,PCR | 94576-6 |
结果ID | test Result Name | 结果lainc值
仅适用于最初由表演实验室报告的度量单位表达的结果。这些值不适用于转换为其他度量单位的结果。
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汤匙 | M结核病物种ID,PCR | 94576-6 |