测试Id:DHCRZ

史密斯Lemli Opitz综合症,DHCR7基因,基因分析,各不相同

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

跟进异常生化结果暗示Smith-Lemli-Opitz综合症

建立一个分子诊断Smith-Lemli-Opitz综合症患者

确定改变内DHCR7允许预测高危家庭成员的测试

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

这个测试利用新一代测序检测单核苷酸和拷贝数变异DHCR7相关基因,史密斯Lemli Opitz物资货柜综合症。

鉴定致病变种可能协助诊断、预后、临床管理、家族性筛选和遗传咨询SLO综合症。

额外的第一层测试可能被视为/推荐。更多信息见点指导。

反射测试
列出测试,可能会或可能不会被执行,在一个额外的费用,根据初始测试的结果和解释。

测试Id 报告名称 可单独购买 总是表现
CULFB 纤维母细胞文化基因测试 是的 没有

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

皮肤活检或培养的成纤维细胞标本,成纤维细胞培养测试将执行一个额外的费用。如果没有获得可行的细胞中,客户端会通知。

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法名称
一个简短的描述方法用于执行测试

序列捕获和有针对性的下一代测序随后聚合酶链反应(PCR)和Sanger测序

纽约的状态
表明纽约国家批准的状态,如果测试是公开为纽约州立客户定货。

是的

报告名称
列出了短或缩写为一个测试版本的发布名称

DHCR7基因,基因分析

别名
列表附加测试常见的名字,作为一个帮助搜索

次世代测序检测

史密斯Lemli Opitz (SLOS)

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

皮肤活检或培养的成纤维细胞标本,成纤维细胞培养测试将执行一个额外的费用。如果没有获得可行的细胞中,客户端会通知。

标本类型
描述了标本类型验证测试

不同

订购指南

推荐的一线测试屏幕史密斯Lemli Opitz物资货柜是血浆中胆固醇前体的测量。订单SLO / Smith-Lemli-Opitz屏幕、等离子体。

测试DHCR7基因作为自定义面板的一部分是可用的。更多信息见CGPH /自定义面板中,基因遗传,下一代测序,各不相同。

装船指示

首选标本收集的96小时内到达。

标本要求
定义了执行测试所需的最佳标本和首选的体积来完成测试

病人准备:从一个以前的骨髓移植同种异体的捐赠会干扰测试。电话800-533-1710说明测试的病人接受了骨髓移植手术。

提交以下标本:只有1

样品类型:全血

容器/管:

首选:薰衣草(EDTA)或黄色大(ACD)

可以接受的:任何抗凝剂

样品数量:3毫升

收集产品说明:

1。反几次混合血。

2。在原始管发送全血标本。不整除

样品稳定性信息:环境(首选)4天/冷藏14天

标本类型:皮肤活组织检查

供应:成纤维细胞活检传输媒体(T115)

容器/与任何标准细胞培养基:无菌容器(例如,最小的重要媒体,RPMI 1640)。解决方案应该补充青霉素和链霉素为1%。

试样体积:4毫米

样品稳定性信息:冷藏(首选)/环境

附加信息:一个单独的文化电荷将评估在CULFB /纤维母细胞的生化和分子检测。需要额外的3到4周文化成纤维细胞在基因检测可以发生。

标本类型:培养的成纤维细胞

容器/管:T-25瓶

标本体积:2烧瓶

集合指令:提交汇合的培养成纤维细胞从一个来自另一个实验室的皮肤活检。培养细胞的产前样品不会被接受。

样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏(< 24小时)

附加信息:一个单独的文化电荷将评估在CULFB /纤维母细胞的生化和分子检测。需要额外的3到4周文化成纤维细胞在基因检测可以发生。

标本类型:血液现货

供应:Card-Blood点收集(滤纸)(T493)

容器/管:

首选:采集卡(绘画纸蛋白质节省903纸)

可接受的:PerkinElmer 226(226年以前seppo)滤纸或血液收集卡片

试样体积:5点血

托收指示:

1。另一种血液收集选项1岁以上的病人的手指。看到干血现货教程集合如何收集血液斑点。

2。让干血滤纸在水平位置的环境温度至少3小时。

3所示。不暴露标本高温或阳光直射。

4所示。不叠湿标本。

5。保持标本干燥

样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏

附加信息:

1。由于低浓度的DNA产生了从血液,可能可能需要额外的标本来完成测试。

2。托收指示,请参阅血的地方收集指令

3所示。托收指示在西班牙,看到的血现货Card-Spanish指令集合(T777)

4所示。托收指示,明白了血现货Card-Chinese指令集合(T800)

样品类型:唾液

病人准备:病人不能吃、喝、吸烟或嚼口香糖30分钟前集合。

供应:唾液拭子采集设备(T786)

样品数量:1拭子

收集产品说明:收集和发送样品每箱指令。

样品稳定性信息:周围30天

附加信息:由于低浓度的DNA产生唾液,这是可能的,可能需要额外的标本来完成测试。

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

形式

1。纽约Clients-Informed同意是必需的。请求的文档形式或电子订单,一份文件。下列文件中可用的特别指示:

- - - - - -基因检测的知情同意(T576)

- - - - - -知情同意的基因检测(西班牙语)(T826)

2。分子遗传学:生化紊乱患者信息(T527)在特殊指令

试样体积最小
定义样本的数量必须提供一个临床相关的结果取决于测试实验室

看到标本要求

拒绝原因
识别标本类型和条件可能会导致样品被拒绝

所有标本将评估在梅奥诊所实验室测试适用性。yabo208

样品稳定性信息
提供了一个描述运输所需的温度进行实验室的标本,替代还包括可接受的温度

标本类型 温度 时间 特种集装箱
不同 不同

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

跟进异常生化结果暗示Smith-Lemli-Opitz综合症

建立一个分子诊断Smith-Lemli-Opitz综合症患者

确定改变内DHCR7允许预测高危家庭成员的测试

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

这个测试利用新一代测序检测单核苷酸和拷贝数变异DHCR7相关基因,史密斯Lemli Opitz物资货柜综合症。

鉴定致病变种可能协助诊断、预后、临床管理、家族性筛选和遗传咨询SLO综合症。

额外的第一层测试可能被视为/推荐。更多信息见点指导。

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

皮肤活检或培养的成纤维细胞标本,成纤维细胞培养测试将执行一个额外的费用。如果没有获得可行的细胞中,客户端会通知。

临床信息
讨论了生理学、病理生理学和一般临床方面,与实验室测试

胆固醇在许多细胞和发育过程中扮演着重要的角色。除了作为膜脂质,它是大量分子的前兆,扮演了一个重要的角色在细胞生长和分化、蛋白质糖基化和信号通路。胆固醇的生物合成及其后续转换到其他重要的化合物是复杂的,涉及大量的中间体和酶。这些酶的缺乏而导致的疾病导致特定的中间体和抑制的积累重要的生物分子的形成。临床表现常见的胆固醇生物合成障碍包括先天性骨骼畸形,畸形的面部特征,精神运动发育迟缓,未能茁壮成长。

Smith-Lemli-Opitz综合症物资货柜)是一种常染色体隐性障碍改变造成的DHCR7基因导致7-dehydrocholesterol还原酶酶的缺乏。它的特点是通过生化反应明显7-dehydrocholesterol等离子体浓度的增加(7-DHC)和8-dehydrocholesterol (8-DHC)水平。临床上的特性可以包括头小畸型,生长迟缓,发育迟缓,畸形面部特征,腭裂,肢体异常(尤其是2 - 3并趾的脚趾和postaxial多指趾畸形),和心脏和肾脏畸形。临床频谱范围从轻微到严重,一些温和影响个人展示只有2到3脚趾并趾和轻度认知障碍。

SLO在常染色体隐性遗传方式,由致病性变异的两个等位基因引起的DHCR7基因。报告发病率从20000年的1 1 40000年,但它可能是更普遍由于underdiagnosis温和影响个人。

血浆中胆固醇前体的测量(SLO / Smith-Lemli-Opitz屏幕、等离子体)应该作为SLO一线测试屏幕上执行。

胆固醇补充但不治疗可能导致临床改善。

参考价值
描述参考区间和附加信息的解释测试结果。可能包括在适当的时间间隔根据年龄和性别。间隔Mayo-derived,除非另有指定。如果一个提供解释报告,参考价值字段将这个状态。

一个将提供解释报告。

解释
提供信息,协助解释测试结果

所有检测到的变化评估根据美国大学医学遗传学和基因组学(ACMG)建议。(1)变体进行分类的基础上,预测,或可能的致病性和报告详细注释解释他们的潜在的或已知的意义。

注意事项
讨论了条件,可能会导致诊断的混乱,包括样本收集和处理不当,不恰当的测试选择、干扰物质

临床相关性:

测试结果应解释在临床中发现,家族史和其他实验室数据。误解的结果可能发生如果提供的信息不准确或不完整的。

如果测试执行,因为临床上重要的家族史,这第一个测试通常是很有用的一个家庭成员的影响。检测至少一个可报告的变体在受影响的家庭成员将允许更多的信息检测的高危个体。

讨论额外的可用性测试选项或协助解释这些结果,联系梅奥诊所实验室遗传顾问800-533-1710。

技术上的限制:

下一代测序可能无法检测所有类型的基因变异。在极少数情况下,可能出现假阴性或假阳性结果。的深度报道可能变量对于一些目标区域;分析性能低于最低可接受的标准或失败的地区将会指出。考虑到这些限制,负面结果不排除遗传性疾病的诊断。如果一个特定的临床障碍被怀疑,可以被认为是评价的替代方法。

可能存在不能有效地评价区域的基因测序或删除和重复分析由于技术的局限性分析,包括区域的同源性、高guanine-cytosine (GC)内容,和重复序列。确认选择可报告的变异将由替代方法基于内部实验室标准。

这个测试是验证检测95%的删除75个碱基对47英国石油(bp)和插入。插入/删除(indels) 40岁以上的英国石油公司,包括移动元素插入,可能不如小indels可靠地检测到。

删除/复制分析:

这种分析目标单一和multi-exon删除/复制;然而,在某些情况下单一外显子决议不能实现减少由于孤立序列覆盖或固有的基因组的复杂性。平衡结构重组(如易位和反演)可能不能被检测到。

这个测试不是为了检测低水平的镶嵌性或区分体细胞和生殖系变异。是否有可能检测到变异体细胞,额外的测试可能需要澄清的结果的意义。

关于基因的特定性能的详细信息和技术的局限性,看到方法描述或实验室基因顾问联系。

如果病人有同种异体造血干细胞移植或最近的异种输血,结果可能是不准确的,由于供体DNA的存在。叫梅奥诊所yabo208实验室说明测试的病人接受了骨髓移植手术。

重新分类的变体:

此时,它不是标准实践的实验室系统地回顾之前定期分类变量。实验室鼓励卫生保健提供者随时联系实验室学习特定的变体的分类可能已经改变了。

不同的评估:

执行评估和分类变量使用发表美国大学医学遗传学和基因组学和分子病理学协会作为指导原则建议。(1)其他gene-specific指南也可以考虑。基于已知变异进行分类,预测,或可能的致病性和报告详细注释解释他们的潜在的或已知的意义。变异分为良性或可能良性不报道。

多在网上评估工具可以用来帮助解释这些结果。预测的准确性由在硅片评估工具是高度依赖于数据对于一个给定的基因,并定期更新这些工具可能导致预测随时间变化的。结果在网上评估工具进行解释时应特别谨慎和专业临床判断。

临床参考
对临床性质的深入阅读的建议

1。理查兹,阿齐兹N,贝尔,et al:标准和指导方针的序列变异的解释:一个联合一致推荐的美国大学医学遗传学和基因组学和分子病理学协会。地中海麝猫。2015年5月,17 (5):405 - 424

2。哈斯D,赫尔曼通用电气、霍夫曼女友:胆固醇生物合成的缺陷。:Sarafoglou K,霍夫曼GF,罗斯KS, eds。儿科内分泌学和先天性代谢缺陷。第二版。麦格劳-希尔教育;2017:413 - 426

3所示。Nowaczyk MJM Wassif CA: Smith-Lemli-Opitz综合症。:亚当MP, Ardinger HH,冰内生物RA, et al, eds。GeneReviews[网络]。华盛顿大学西雅图分校的;1998年。更新2020年1月30日。2020年10月27日通过。可以在www.ncbi.nlm.nih.gov /书/ NBK1143 /

4所示。大厅P, V米歇尔,Gavrilov D, et al:阿立哌唑和曲唑酮导致海拔7-dehydrocholesterol没有Smith-Lemli-Opitz综合症。摩尔麝猫金属底座。2013;9月- 10月110 (2):176 - 178

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法描述
描述如何执行测试并提供method-specific参考

下一代测序(上天)和/或执行Sanger测序检测中存在变异和内含子/外显子编码区域的边界DHCR7以及一些其他地区已知的致病变种。人类基因组参考GRCh37 / hg19构建用于序列读一致性。至少99%的基地覆盖在阅读的深度超过30 x。灵敏度是单核苷酸变异估计在99%以上,94%以上插入/删除(indels)不到40碱基对(bp), 95%以上为删除75基点和插入到47个基点。门店和/或聚合酶链反应(PCR)的定量方法执行测试的删减和复制的存在DHCR7

可能存在的区域DHCR7不能有效地评估通过测序或删除和重复分析由于技术的局限性分析,包括区域的同源性,高guanine-cytosine (GC)内容,和重复序列。

的参考记录DHCR7基因NM_001360.2。参考记录数字可能被更新由于成绩单版本控制。总是把最后一个病人报告基因转录时引用的测试信息。确认选择可报告的变异可能是由交替方法基于内部实验室标准。(未发表的梅奥法)

PDF报告
表明报告包括一个额外的文档是否与图表、图像或其他丰富的信息

补充

天(s)
概述了天测试执行。这个领域反映了天,样品必须在测试实验室开始测试过程,包括任何样品制备和测试执行之前处理时间。列出了一些测试,不断进行,这意味着化验白天多次执行。

不同

报告可用
时间的间隔(收到样品在梅奥诊所实验室结果可用)考虑标准设置和周末。yabo208第一天的时间通常是结果可用。最后一天的时间可能需要,占任何必要的重复测试。

4到6周

样品保留时间
轮廓的时间在测试标本保存在实验室之前就会被丢弃

全血:2周(如果可用);提取的DNA: 3个月;血液斑点/唾液:1个月

执行实验室的位置
表明实验室的位置执行测试

罗彻斯特

费用
几个因素决定执行一个测试的费用收取。联系你的美国或国际区域经理建立费用表的信息或了解更多关于资源优化测试的选择。

  • 授权用户可以登录测试价格费用的详细信息。
  • 客户没有测试价格可以联系亚搏一天24小时,一周7天。
  • 潜在客户应该联系他们的区域经理。寻求帮助,请联系亚搏

测试的分类
提供信息关于医疗器械分类为实验室测试工具和试剂。测试可以分为清除或通过美国食品和药物管理局(FDA)和每个制造商使用说明,或产品,不接受FDA审查和批准,并贴上一个分析物特定试剂(ASR)产品。

这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。

CPT编码信息
提供指导在决定适当的当前程序的术语(CPT)代码(s)为每个测试或概要信息。梅奥诊所上市CPT编码反映实验室的解释CPT编码需求。yabo208每个实验室有责任来确定正确的CPT编码用于计费。

CPT编码由执行实验室提供。

81405年

88233 -组织培养、皮肤、固体组织活检(如果合适的话)

88240 -低温贮藏(如果合适的话)

LOINC®信息
提供指导在确定逻辑观察标识符名称和代码(LOINC)值的顺序和结果代码的测试。LOINC表演实验室提供的值。

测试Id 测试顺序的名字 订单LOINC价值
DHCRZ DHCR7基因,基因分析 99058 - 0
结果Id 测试结果的名字 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
608704年 测试描述 62364 - 5
608705年 标本 31208 - 2
608706年 31208 - 2
608707年 结果总结 50397 - 9
608708年 结果 82939 - 0
608709年 解释 69047 - 9
608710年 资源 99622 - 3
608711年 额外的信息 48767 - 8
608712年 方法 85069 - 3
608713年 基因分析 48018 - 6
608714年 免责声明 62364 - 5
608715年 发布的 18771 - 6

测试设置资源

设置文件
测试设置信息包含测试文件定义支持订单细节和结果之间的接口梅奥诊所实验室和实验室信息系统。yabo208

Excel|Pdf

样品报告
正常和异常样本报告作为参考提供报告的外观。

正常的报告|异常报告

如果样品报告
国际体系(SI)的单位报告提供有限数量的测试。这些报告仅用于国际帐户,只可以通过MayoLINK账户已定义接收他们。

如果正常的报告|如果异常报告

测试更新资源

变化类型 生效日期
文件定义,算法 2022-02-03
新的测试 2021-02-23