测试Id:2 ohgp

2-Hydroxyglutaric酸尿基因小组,各不相同

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

跟进异常生化结果暗示2-hydroxyglutaric酸尿

建立一个分子诊断患者2-hydroxyglutaric酸尿

识别在已知的基因变异与2-hydroxyglutaric酸尿,允许预测高危家庭成员的测试

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

这个测试利用下一代测序检测单核苷酸和4基因拷贝数变异与2-hydroxyglutaric酸尿:D2HGDH,IDH2,L2HGDH,SLC25A1。查看更多细节描述方法。

鉴定致病变种可能协助诊断、预后、临床管理、家族性筛选和遗传咨询2-hydroxyglutaric酸尿。

额外的第一层测试可能被视为/推荐。更多信息见咨询信息。

反射测试
列出测试,可能会或可能不会被执行,在一个额外的费用,根据初始测试的结果和解释。

测试Id 报告名称 可单独购买 总是表现
FIBR 成纤维细胞培养 是的 没有
CRYOB 生物化学研究同行 没有 没有

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法名称
一个简短的描述方法用于执行测试

自定义序列捕获和有针对性的下一代测序随后聚合酶链反应(PCR)和Sanger测序

纽约的状态
表明纽约国家批准的状态,如果测试是公开为纽约州立客户定货。

是的

报告名称
列出了短或缩写为一个测试版本的发布名称

2哦戊二酸尿基因面板

别名
列表附加测试常见的名字,作为一个帮助搜索

次世代测序检测

2-Hydroxyglutaric酸尿

L-2-Hydroxyglutaric酸尿

结合d2和l2 hydroxyglutaric酸尿

标本类型
描述了标本类型验证测试

不同

订购指南

推荐的一线测试2-hydroxyglutaric酸尿尿有机酸;订单非统/有机酸屏幕,尿液。

装船指示

首选标本收集的96小时内到达。

标本要求
定义了执行测试所需的最佳标本和首选的体积来完成测试

病人准备:先前的骨髓移植同种异体的捐赠会干扰测试。电话800-533-1710说明测试的病人接受了骨髓移植手术。

样品类型:全血

容器/管:

首选:薰衣草(EDTA)或黄色大(ACD)

可以接受的:任何抗凝剂

样品数量:3毫升

收集产品说明:

1。反几次混合血。

2。在原始管发送样品。

样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

形式

1。纽约Clients-Informed同意是必需的。请求的文档形式或电子订单,一份文件。下列文件中可用的特别指示:

- - - - - -基因检测的知情同意(T576)

- - - - - -知情同意的基因检测(西班牙语)(T826)

2。分子遗传学:生化紊乱患者信息(T527)在特殊指令

试样体积最小
定义样本的数量必须提供一个临床相关的结果取决于测试实验室

看到标本要求

拒绝原因
识别标本类型和条件可能会导致样品被拒绝

所有标本将评估在梅奥诊所实验室测试适用性。yabo208

样品稳定性信息
提供了一个描述运输所需的温度进行实验室的标本,替代还包括可接受的温度

标本类型 温度 时间 特种集装箱
不同 变化(首选)

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

跟进异常生化结果暗示2-hydroxyglutaric酸尿

建立一个分子诊断患者2-hydroxyglutaric酸尿

识别在已知的基因变异与2-hydroxyglutaric酸尿,允许预测高危家庭成员的测试

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

这个测试利用下一代测序检测单核苷酸和4基因拷贝数变异与2-hydroxyglutaric酸尿:D2HGDH,IDH2,L2HGDH,SLC25A1。查看更多细节描述方法。

鉴定致病变种可能协助诊断、预后、临床管理、家族性筛选和遗传咨询2-hydroxyglutaric酸尿。

额外的第一层测试可能被视为/推荐。更多信息见咨询信息。

临床信息
讨论了生理学、病理生理学和一般临床方面,与实验室测试

的2-hydroxyglutaric酸尿障碍是一组脑有机酸尿生化与海拔2-hydroxyglutaric酸(2-HG)尿液。有两种对映体或形式的2-hydroxyglutaric酸、d和l形。根据遗传缺陷,个人可能海拔2-HG或两种形式之一。常规有机酸分析(非统/有机酸屏幕、尿液),虽然能够检测2-HG,无法区分这两个对映体;然而,他们可以与更专业的生化分离测试。

L-2-hydroxyglutaric酸尿(L-2-HGA)是由缺陷引起的L2HGDH特点是进步的小脑性共济失调和智力障碍,癫痫发作,巨头开始在婴儿期或早期的童年。症状恶化随着时间的推移导致严重残疾成年早期。磁共振成像(MRI)的发现包括皮层下脑白质病、广义小脑和大脑萎缩,萎缩的胼胝体。

D-2-hydroxylglutaric酸尿(D-2-HGA)的特点是高浓度的D-2-hydroxyglutaric酸,通常体现发育迟缓,癫痫,和张力减退,虽然可以从无症状到严重差别很大。有2种D-2-HGA取决于遗传原因。D-2-HGA可以是常染色体隐性遗传,变异所造成的D2HGDH导致酶活性降低功能(I型)或常染色体显性遗传的变异IDH2导致生产过剩的D-2-HG (II型)。

D, L-2-hydroxylglutaric酸尿是最严重的3和由缺陷引起的SLC25A1柠檬酸,编码线粒体载体。它的特点是neonatal-onset脑病有严重的肌肉无力,棘手的癫痫发作,呼吸窘迫,缺乏精神运动的发展导致过早死亡。

因为遗传异质性的2-hydroxyglutaric酸尿和专业生化测试需要区分的条件,这种基因面板,包含了D2HGDH,L2HGDH,IDH2,SLC25A1诊断这些条件,是一种有效的方法。

参考价值
描述参考区间和附加信息的解释测试结果。可能包括在适当的时间间隔根据年龄和性别。间隔Mayo-derived,除非另有指定。如果一个提供解释报告,参考价值字段将这个状态。

一个将提供解释报告。

解释
提供信息,协助解释测试结果

所有检测到的变化评估根据美国大学医学遗传学和基因组学(ACMG)建议。(1)变体进行分类的基础上,预测,或可能的致病性和报告详细注释解释他们的潜在的或已知的意义。

注意事项
讨论了条件,可能会导致诊断的混乱,包括样本收集和处理不当,不恰当的测试选择、干扰物质

临床相关性:

测试结果应该在上下文中解释临床发现,家族史和其他实验室数据。误解的结果可能发生如果提供的信息不准确或不完整的。

如果测试执行,因为临床上重要的家族史,这第一个测试通常是很有用的一个家庭成员的影响。检测可报告的变体的影响家庭成员将允许更多的测试风险的个人。

讨论额外的测试选项的可用性,协助一般测试选择,或协助解释这些结果,梅奥诊所实验室遗传辅导员可以联系800-533-1710。

技术的局限性:

下一代测序可能无法检测所有类型的基因变异。在极少数情况下,可能出现假阴性或假阳性结果。的深度报道可能对一些目标区域变量,但试验性能低于最低可接受的标准或失败的地区将会指出。考虑到这些限制,负面结果不排除遗传性疾病的诊断。如果特定的临床疾病被怀疑,评估替代方法可以考虑。

如果病人有同种异体造血干细胞移植或最近的异种输血,这些结果可能是不准确的由于供体DNA的存在。叫梅奥诊所yabo208实验室说明测试的病人接受了骨髓移植手术。

可能存在区域的基因测序或删除不能有效放大,重复分析由于技术的局限性分析,包括区域的同源性、高guanine-cytosine (GC)内容,和重复序列。确认选择可报告的变异将由替代方法基于内部实验室标准。

这个试验不可靠地检测插入/删除(indels) 40以上的碱基对(bp),包括Alu插入,长点缀的核元素(行)和短点缀的核元素(正弦)。生物信息学软件验证管道检测95%的删除75基点和插入到47个基点。

此外,低水平花叶变异可能不能被检测到。

这个测试不是为了区分体细胞和生殖系变体。是否有可能检测到变异体细胞,额外的测试可能需要澄清的结果的意义。

重新分类的变异策略:

此时,它不是标准实践的实验室系统地回顾之前定期分类变量。实验室鼓励卫生保健提供者联系实验室随时了解一个特定的变体的状态随着时间的推移可能会改变。

变体的评估:

执行评估和分类变量使用发表美国大学医学遗传学和基因组学(ACMG)和分子病理学协会(AMP)作为指导原则建议。(1)还可以考虑其他基因的具体指导方针。基于已知变异进行分类,预测,或可能的致病性和报告详细注释解释他们的潜在的或已知的意义。变异分为良性或可能良性不报道。

多在网上评估工具可以用来帮助解释这些结果。预测的准确性由在硅片评估工具是高度依赖于数据对于一个给定的基因,并定期更新这些工具可能导致预测随时间变化的。结果在网上评估工具进行解释时应特别谨慎和专业临床判断。Intronic和同义的序列变异不预测影响拼接或导致疾病都没有报告。

临床参考
对临床性质的深入阅读的建议

1。理查兹,阿齐兹N,贝尔,et al:标准和指导方针的序列变异的解释:一个联合一致推荐的美国大学医学遗传学和基因组学和分子病理学协会。地中海麝猫。2015年5月,17 (5):405 - 424

2。背板B, Struys EA,流行,et al:缺乏SLC25A1,编码线粒体柠檬酸载体,使结合d2, L-2-hydroxyglutaric酸尿。J哼麝猫。2013;92:627 - 631。doi: 10.1016 / j.ajhg.2013.03.009

3所示。Kranendijk M, Struys EA,范Schaftingen E, et al: IDH2基因突变患者D-2-hydroxyglutaric酸尿。科学。2010年10月15日,330 (6002):336。doi: 10.1126 / science.1192632

4所示。Kranendijk M, Struys EA,所罗门GS, Van der Knaap女士,手跟前C:进步在理解2-hydroxyglutaric酸尿。35 J继承金属底座说。2012;(4):571 - 587。doi: 10.1007 / s10545 - 012 - 9462 - 5

5。流行,Struys EA, Jansen EEW et al: D-2-hydroxyglutaric酸尿我类型:功能分析的D2HGDH错义变体。哼Mutat。2019;40 (7):975 - 982。doi: 10.1002 / humu.23751

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法描述
描述如何执行测试并提供method-specific参考

下一代测序(上天)和/或执行Sanger测序检测中存在变异基因的编码区和内含子/外显子边界进行了分析。门店和/或聚合酶链反应(PCR)的定量方法来测试执行删除和复制的基因分析。

可能存在区域的基因测序或删除不能有效放大,重复分析由于技术的局限性分析,包括区域的同源性、高guanine-cytosine (GC)内容,和重复序列。确认选择可报告的变异可能是由交替方法基于内部实验室标准。

pcr方法和/或Sanger测序是用来证实变异检测到门店在适当的时候。(未发表的梅奥法)

基因分析:D2HGDH、IDH2 L2HGDH SLC25A1

PDF报告
表明报告包括一个额外的文档是否与图表、图像或其他丰富的信息

补充

天(s)
概述了天测试执行。这个领域反映了天,样品必须在测试实验室开始测试过程,包括任何样品制备和测试执行之前处理时间。列出了一些测试,不断进行,这意味着化验白天多次执行。

不同

报告可用
时间的间隔(收到样品在梅奥诊所实验室结果可用)考虑标准设置和周末。yabo208第一天的时间通常是结果可用。最后一天的时间可能需要,占任何必要的重复测试。

3 - 4周

样品保留时间
轮廓的时间在测试标本保存在实验室之前就会被丢弃

全血:2周(如果可用);提取的DNA: 3个月

执行实验室的位置
表明实验室的位置执行测试

罗彻斯特

费用
几个因素决定执行一个测试的费用收取。联系你的美国或国际区域经理建立费用表的信息或了解更多关于资源优化测试的选择。

  • 授权用户可以登录测试价格费用的详细信息。
  • 客户没有测试价格可以联系亚搏一天24小时,一周7天。
  • 潜在客户应该联系他们的区域经理。寻求帮助,请联系亚搏

测试的分类
提供信息关于医疗器械分类为实验室测试工具和试剂。测试可以分为清除或通过美国食品和药物管理局(FDA)和每个制造商使用说明,或产品,不接受FDA审查和批准,并贴上一个分析物特定试剂(ASR)产品。

这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。

CPT编码信息
提供指导在决定适当的当前程序的术语(CPT)代码(s)为每个测试或概要信息。梅奥诊所上市CPT编码反映实验室的解释CPT编码需求。yabo208每个实验室有责任来确定正确的CPT编码用于计费。

CPT编码由执行实验室提供。

81479年

LOINC®信息

测试Id 测试顺序的名字 订单LOINC价值
2 ohgp 2哦戊二酸尿基因面板 过程中
结果Id 测试结果的名字 结果LOINC值
结果LOINC值提示
608764年 测试描述 62364 - 5
608765年 标本 31208 - 2
608766年 31208 - 2
608767年 结果总结 50397 - 9
608768年 结果 82939 - 0
608769年 解释 69047 - 9
608770年 资源 99622 - 3
608771年 额外的信息 48767 - 8
608772年 方法 85069 - 3
608773年 基因分析 48018 - 6
608774年 免责声明 62364 - 5
608775年 发布的 18771 - 6

测试设置资源

设置文件
测试设置信息包含测试文件定义支持订单细节和结果之间的接口梅奥诊所实验室和实验室信息系统。yabo208

Excel|Pdf

样品报告
正常和异常样本报告作为参考提供报告的外观。

正常的报告|异常报告

如果样品报告
国际体系(SI)的单位报告提供有限数量的测试。这些报告仅用于国际帐户,只可以通过MayoLINK账户已定义接收他们。

如果正常的报告|如果异常报告