快速检测呼吸道感染引起的以下几点:
腺病毒
冠状病毒(血清型HKU1 NL63 229 e, OC43)
严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2 (SARS-CoV-2),冠状病毒病的病原体2019 (COVID-19)
载体metapneumovirus
载体鼻病毒、肠道病毒
流感(H1, H1 - 2009, H3)
流感B
副流感病毒病毒(血清型1 - 4)
呼吸道合胞病毒(RSV)
- - - - - -百日咳博德特氏菌
博代氏杆菌属parapertussis
- - - - - -衣原体肺炎
- - - - - -肺炎支原体
这个测试是不推荐作为测试的治疗。
这个测试是一个多重聚合酶链反应(PCR)的测试能力的定性检测DNA或RNA 22病原体(细菌和病毒)在大约1小时内使用鼻咽拭子标本。
这个测试可能诊断腺病毒引起的感染,冠状病毒(HKU1 NL63 229 e, OC43),严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2 (SARS-CoV-2),人类metapneumovirus人类鼻病毒/肠病毒、甲型流感(H1, H1 - 2009, H3),乙型流感,副流感病毒(1、2、3、4),呼吸道合胞病毒,百日咳博德特氏菌,博代氏杆菌属parapertussis、衣原体肺炎和肺炎支原体。
多重聚合酶链反应(PCR)
腺病毒
博代氏杆菌属parapertussis
百日咳博德特氏菌
衣原体肺炎
冠状病毒229 e
冠状病毒HKU1
冠状病毒NL63
冠状病毒OC43
COVID
COVID-19
人类metapneumovirus
人类鼻病毒、肠道病毒
甲型流感
流感A / H1
流感A / h1 - 2009
流感A / H3
乙型流感
肺炎支原体
副流感病毒1
副流感病毒2
副流感病毒3
副流感病毒4
呼吸道合胞体病毒
RSV
SARS-CoV-2
严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2
不同
这种分析不是预测检测严重急性呼吸系统综合症(SARS)相关冠状病毒或中东呼吸系统综合症冠状病毒(即)。
这个测试是不为了健康,免疫活性的病人可能有轻微,自限性的呼吸道感染。如果需要测试,这些病人应该使用更有针对性的测试诊断化验根据接触史和临床表现。
-FLUNP / A型和B型流感病毒,呼吸道合胞病毒(RSV),分子检测、PCR、鼻咽拭子
-BPRP/百日咳博德特氏菌和博代氏杆菌属parapertussis,PCR分子检测,各不相同
mprp /肺炎支原体,PCR分子检测,各不相同
-COVOO /严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2 (SARS-CoV-2) RNA检测,各不相同
它是不推荐以下测试,与此同时下令当这个测试要求:
-FLUNP / A型和B型流感病毒,呼吸道合胞病毒(RSV),分子检测、PCR、鼻咽拭子
-LADV /腺病毒分子检测、PCR、各不相同
借给/肠病毒分子检测、PCR、各不相同
-BPRP /百日咳博德特氏菌和博代氏杆菌属parapertussis,PCR分子检测各不相同
mprp / Mycoplasma肺炎、分子检测,PCR,不同
-COVOO /严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2 (SARS-CoV-2) RNA检测,各不相同
这个测试是合适的鼻咽拭子只有。对支气管肺泡灌洗或支气管洗液标本,以强化/呼吸面板中,PCR,各不相同。
标本,梅奥诊所不能冷藏运往实验室在3天(72小时)应该冻结之前装运。yabo208标本接收超过72小时(冷藏)或超过30天(冻结)将被取消。
样品类型:鼻咽拭子
供应:
np拭子(T861)
文化拭子-液体斯图亚特王室/单拭子(NP棍)(T515)
bartels FlexTrans VTM-3毫升(T892)
江苏VTM-3毫升(T891)
-M4-RT (T605)
收集容器/管:拭子。见附加信息可接受的拭子。
提交集装箱/管:传输介质。见附加信息可接受的媒体。
样品数量:鼻咽拭子在最小体积的1毫升的传输媒体
收集产品说明:
1。鼻咽拭子标本应立即根据标准技术和收集放在传输媒体和提交测试。
2。提交拭子在原始容器中。不整除。
附加信息:
如果有鼻咽拭子或传输媒体不下面列出的使用,测试可能被取消。
接受鼻咽拭子(NP)科潘人造丝棉签,科潘尼龙植绒拭子,科潘聚酯棉签,清教徒藻酸钙棉签,SteriFlock NP拭子。
可接受的传输媒体Remel M4 Remel M4-RT, Remel M5, Remel M6, BD环球病毒传输媒体(VTM),科潘通用传输媒体(UTM) PrimeStore分子传输介质(MTM)。
可接受的收集和运输系统Sigma-Virocult病毒收集和运输系统(拭子和传输介质),科潘ESwab样本收集和交付系统(拭子和液体定制介质),和BD ESwab收集装备(植绒拭子和液体定制介质)。
如果不是电子订购,完成,打印和发送微生物测试请求(T244)标本。
看到标本要求
任何传输媒体或NP拭子类型中列出标本要求 | 拒绝 |
标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
---|---|---|---|
不同 | 冷藏(首选) | 72小时 | |
冻 | 30天 | ||
环境 | 4个小时 |
快速检测呼吸道感染引起的以下几点:
腺病毒
冠状病毒(血清型HKU1 NL63 229 e, OC43)
严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2 (SARS-CoV-2),冠状病毒病的病原体2019 (COVID-19)
载体metapneumovirus
载体鼻病毒、肠道病毒
流感(H1, H1 - 2009, H3)
流感B
副流感病毒病毒(血清型1 - 4)
呼吸道合胞病毒(RSV)
- - - - - -百日咳博德特氏菌
博代氏杆菌属parapertussis
- - - - - -衣原体肺炎
- - - - - -肺炎支原体
这个测试是不推荐作为测试的治疗。
呼吸道感染是常见的,通常导致健康的自限性疾病,免疫活性的主机。病毒占相当比例的呼吸道疾病,但细菌可以与呼吸道感染有关。虽然呼吸道疾病通常是温和的,病毒可能会导致重大的发病率和死亡率在宿主免疫功能不全的患者(如移植受者,潜在的恶性肿瘤)。
流感病毒A和B(类型)和呼吸道合胞病毒(RSV)是2病毒性呼吸道疾病的常见原因,发病高峰在冬季和春季月在北半球。两种病毒可以导致临床上无法区分综合症,表现为发热、咳嗽、头痛、全身不适。RSV是儿童呼吸道疾病的主要原因。流感和RSV的早期诊断是非常重要的,所以必要的感染控制措施可以采取如果住院病人,和抗病毒治疗可以考虑如果病人住院或被认为是严重疾病的高风险。(1)人类metapneumovirus也是导致儿童和成人的呼吸道疾病。
人类鼻病毒、冠状病毒血清型HKU1 NL63 229 e,和OC43普通感冒的病原体,症状包括流鼻涕,喉咙痛和不适。感染鼻病毒、冠状病毒是非常常见的,由于大量的这些病毒的血清型。大多数感染症状较轻,并且具有自限性;然而,免疫力低下的个人可能遭受更严重的疾病,包括下呼吸道疾病。
严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2 (SARS-CoV-2)是一种引起冠状病毒RNA病毒疾病2019 (COVID-19)。与其他冠状病毒感染人类,SARS-CoV-2可引起上呼吸道和下呼吸道疾病。症状的范围可以从轻微(如感冒)严重(如肺炎)在健康和免疫功能低下的患者。SARS-CoV-2发生主要通过呼吸道飞沫传播。在COVID-19疾病的早期阶段,症状可能是特异性的,像其他常见的呼吸道感染,如流感。
副流感病毒病毒和腺病毒病毒感染也是常见的原因,尤其是儿童。副流感病毒病毒是最常见的在春天,夏天,秋天月,症状包括发烧,流鼻涕,咳嗽。然而,副流感病毒的病毒也可能导致更严重的下呼吸道疾病,比如臀部或肺炎。腺病毒可以感染的器官系统,后遗症从冷若症状(喉咙痛)肺炎,结膜炎(红眼),或腹泻。类似于上述病毒,副流感病毒病毒和腺病毒通常导致轻微,自限性感染但可能引起严重的免疫抑制患者的疾病。
呼吸道感染也可能引起的细菌性病原体,包括百日咳博德特氏菌,博代氏杆菌属parapertussis,衣原体肺炎,肺炎支原体。B百日咳百日咳的病原体或百日咳,疾病特点是长期咳嗽,可能与一个吸气呐喊和post-tussive呕吐。B parapertussis导致一个类似的,但一般不太严重,疾病。肺炎支原体引起的上呼吸道感染、咽炎、气管支气管炎和肺炎。C肺炎是一种罕见的肺炎。
未被发现的(对所有目标)
结果旨在帮助诊断疾病和是与其他临床和流行病学研究结果结合使用。
阴性结果不能排除感染患者高预发性呼吸道感染。试验没有测试所有潜在的传染性病原体的呼吸道疾病。标本收集太早或太晚了在临床课程可能不会产生微生物引起疾病。负面结果的上下文中应该考虑病人的临床病程和治疗的历史,如果适用的话。
免疫功能不全的患者和负面FilmArray呼吸面板测试从鼻咽样本但高怀疑感染,可能会有额外的价值在测试一个支气管肺泡灌洗标本(反应器/呼吸面板中,PCR,各不相同)。
积极的结果并不区分一个可行的或复制生物不能存活的生物的存在或核酸,也不排除潜在的合并感染的生物体不包括在面板。核酸在一些患者可能会持续数天到数周,甚至在适当的治疗。检测1或更多生物包含在这个测试表明,病毒或细菌存在于临床样本;然而,测试并不区分生物体造成疾病和那些存在但不与临床疾病相关。合并感染(如检测多个病毒或细菌或病毒和细菌)可以观察到这个测试。在这种情况下,应当检查临床病史和表示彻底确定多个病原体的临床意义相同的标本。
测试结果应作为辅助诊断。单一试验不应作为唯一标准,形成一个临床的结论,但结果应该与病人症状和临床表现。阴性结果并不否定有机体或活动性疾病的存在。
微生物DNA或RNA的检测是依赖于适当的样本收集、处理、运输、存储和准备。有一个假阴性结果的风险由于序列变异株的存在或基因重组在目标区域的化验或水平的生物测试的检测极限以下。
积极的结果与其他病原体不排除合并感染。
负面结果结合呼吸道疾病可能是由于病原体不被这个面板。
不应进行重复测试样本收集不到7天。
对严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2 (SARS-CoV-2)从这个化验结果,如果重复测试后7天时间内被认为是一个初始负SARS-CoV-2结果,考虑订购一个目标SARS-CoV-2试验。如果初始SARS-CoV-2从这个化验结果是积极的,建议等到14天随后的测试执行,如果需要的话。
腺病毒
分析可能显示变量检测与非呼吸道内血清型物种,D, F, G。
甲型流感
性能特征建立了甲型H1 - 2009时,H1和H3在循环主要的A型流感病毒。性能检测甲型流感可能会有所不同,如果其他甲型流感病毒甲型流感病毒出现循环或一本小说。FilmArray呼吸道面板的性能尚未成立于个人收到了流感疫苗。最近政府的鼻流感疫苗可能导致假阳性结果甲型流感或流感b菌株的人类,猪、禽流感的起源预计与甲型流感检测反应导致甲型流感(未检测到子类型)的结果。
试验检测和区分常见流感病毒血凝素亚型基于只有血凝素基因,通过使用2甲型流感化验血凝素基因和3子类型化分析。结果报告为“发现”当甲型流感的至少一个化验和子类型化的化验都是积极的。如果两个流感没有血凝素亚型的化验是积极的,结果报告为甲型流感(无亚型检测)。模棱两可的结果报告后重复测试2的场景:
——甲型流感的化验是积极的,但血凝素基因是正的。
甲型流感的一种化验是正的,血凝素基因是负的。
试验不能检测或区分流感病毒神经氨酸酶基因。
鼻病毒/肠病毒组
由于这些病毒的遗传相似性,分析无法准确区分它们。
百日咳博德特氏菌/博代氏杆菌属parapertussis
一些非细胞疫苗含有DNA聚合酶链反应(PCR)检测。污染的标本与疫苗会导致假阳性百日咳博德特氏菌PCR结果。收集的标本不应暴露或加工领域B百日咳疫苗的材料。分析目标单副本百日咳毒素基因的启动子区域。这个试验的结果可能不是和常用的一致博代氏杆菌属PCR分析,目标multicopy插入序列(IS481)。可能会发生交叉反应性与高水平或罕见的变异等其他物种的序列博代氏杆菌属bronchiseptica和博代氏杆菌属parapertussis。
冠状病毒
冠状病毒与冠状病毒HKU1 OC43试验可能交叉作用。结果,当HKU1和OC43都发现在同一病人标本,结果可能是由于试验大。与这两种病毒同时感染也是可能的。
SARS-CoV-2
下列动物冠状病毒株,不大可能发现在人类,可能交叉反应SARS-CoV-2目标:蝙蝠冠状病毒RaTG13(加入:MN996532)、穿山甲冠状病毒(加入:MT084071),和蝙蝠类似非典冠状病毒序列(入世MG772933和MG772934)。
这个测试是检测鼻咽拭子(NP)批准;制造商已经评估这个样例的临床性能数据类型。梅奥诊所进行了临床细菌学实验室验证2.1 FilmArray呼吸道面板(RP2.1)分析严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2 (SARS-CoV-2)使用2的商业化池正面和负面的控制材料。与预期结果分析表明100%整体协议。的实验室也进行了单独的验证FilmArray呼吸面板2 (RP2)测定使用4池已知的目标分析物从商业化验证小组。与预期结果分析表明100%整体协议。此外,临床细菌学实验室检测35例临床NP样本RP2并排,相比之前的测试结果在FilmArray呼吸道面板(RP)。积极的协议是百分比95%以上所有目标测试,除了人类鼻病毒/肠病毒的75%,由于错过了一个检测四个发现RP相比测定。一些目标并不代表在临床NP样本集,包括冠状病毒229 e,冠状病毒NL63,人类metapneumovirus乙型流感病毒、副流感病毒1 - 4。
1。黄李N,刘晔GC, KT, et al:高发病率和死亡率在成人呼吸道合胞病毒感染住院。中国感染说。2013年10月:57 (8):1069 - 1077。doi: 10.1093 / cid / cit471
2。Miliander C,看到M, Binnicker MJ:评估BioFire FilmArray呼吸道病毒的检测在临床样本。临床病毒学研讨会年会。佛罗里达州代托纳;2013年4月
3所示。Ramanan P,布赖森,Binnicker MJ,普里特BS, Patel R:综合征在临床微生物学基于仪表盘测试。中国Microbiol启2017年11月15日,31 (1):e00024-17。doi: 10.1128 / CMR.00024-17
FilmArray呼吸道面板是一个封闭的系统,执行所需的所有化学隔离、放大和检测核酸从多种病毒性和细菌性呼吸道病原体在单个鼻咽拭子标本。面板包含试剂在冻干形式,分为离散段所需的化学过程。患者样本和水化液由真空到面板,然后放入FilmArray乐器。检测流程操作自动化(核酸纯化、聚合酶链反应(PCR),第一阶段第二阶段PCR,和融化分析)和完成在45分钟在这个封闭的系统。
核酸纯化:
样品细胞溶解的化学和力学机制和解放核酸捕获,清洗,使用磁珠技术筛选了。
一期PCR:
逆转录一步执行前将病毒RNA转化为互补DNA扩增。纯化核酸的解决方案是结合预热大师混合启动逆转录一步多重PCR和随后的热循环。
阶段的聚合酶链反应:
第一阶段的产品PCR被稀释和新鲜PCR试剂混合,这是分布在第二阶段PCR数组。数组的个别井包含不同的引物化验(一式三份),目标的特定核酸序列从每个病原体检测,以及控制模板材料。
DNA分析:融化
T温度正在慢慢增加,荧光在每个数组的监测和分析,生成一个融化曲线。
分析融化曲线:
软件评价DNA融化曲线为每个来确定一个PCR产品出现在。如果融化概要显示PCR产物的存在,然后分析软件计算曲线的熔化温度,然后对比试验的预期范围。当软件确定融化曲线落在assay-specific熔化温度范围内,它被称为积极的。当它融化曲线确定不是在适当的范围内,它被称为负的。
复制的分析:
融化曲线每个3为每个复制的分析评估,以确定试验的结果。分析被称为积极的,至少2相关的3曲线必须被称为积极的融化,融化温度(Tm)至少2的3正融化曲线必须相似(在1度),化验不符合这些标准被称为负。(说明书:FilmArray呼吸道面板2.1 (RP2.1)。BioFire诊断,有限责任公司;vfr0000 - 8303 05/2020)
这个测试已经清除、批准或由美国食品和药物管理局是免税的,按照制造商的说明使用。性能特征验证了梅奥诊所的方式符合CLIA需求。
0202 u
测试Id | 测试顺序的名字 | 订单LOINC价值 |
---|---|---|
RP | 呼吸面板中,PCR, NP | 82159 - 5 |
结果Id | 测试结果的名字 | 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
|
---|---|---|
SS021 | 标本来源 | 31208 - 2 |
609644年 | 腺病毒 | 82160 - 3 |
609645年 | 冠状病毒229 e | 82163 - 7 |
609646年 | 冠状病毒HKU1 | 82161 - 1 |
609647年 | 冠状病毒NL63 | 82162 - 9 |
609648年 | 冠状病毒OC43 | 82164 - 5 |
609650年 | 人类鼻病毒、肠道病毒 | 82175 - 1 |
609651年 | 人类Metapneumovirus | 82165 - 2 |
609652年 | 甲型流感 | 82166 - 0 |
609653年 | 乙型流感 | 82170 - 2 |
609654年 | 副流感病毒病毒1 | 82171 - 0 |
609655年 | 副流感病毒病毒2 | 82172 - 8 |
609656年 | 副流感病毒病毒3 | 82173 - 6 |
609657年 | 副流感病毒病毒4 | 82174 - 4 |
609658年 | 呼吸道合胞体病毒 | 82176 - 9 |
609660年 | 百日咳博德特氏菌 | 82179 - 3 |
609659年 | 博代氏杆菌属parapertussis | 87621 - 9 |
609661年 | 衣原体肺炎 | 82178 - 5 |
609662年 | 肺炎支原体 | 82177 - 7 |
609663年 | 解释 | 59464 - 8 |
609649年 | 非典Coronavirus-2 | 94565 - 9 |