预测反应的基因型1丙型肝炎病毒感染pegylated-interferon和ribavirin-based疗法相结合
实时聚合酶链反应(PCR)分析等位基因歧视
IFNL3
IL28
IL28B
白介素28 b
聚乙二醇干扰素
rs12979860
不同
多个基因测试可以执行一个单一萃取后标本。看到多个基因型测试列表在特殊说明的测试列表可以一起订购。
提交以下标本:只有1
样品类型:全血
容器/管:薰衣草(EDTA)
样品数量:3毫升
收集产品说明:
1。反几次混合血。
2。在原始管发送样品。
样品稳定性信息:环境(首选)9天/冷藏30天
样品类型:唾液
病人准备:病人不能吃、喝、吸烟或嚼口香糖30分钟前集合。
供应:唾液拭子采集设备(T786)
样品数量:1拭子
收集产品说明:收集和发送样品每箱指令。
样品稳定性信息:周围30天
样品类型:中提取DNA
容器/管:2毫升螺旋管
样品数量:100制程(每毫升)
收集产品说明:
1。首选的体积是100制程250 ng /制程的浓度。
2。包括浓度和体积管。
样品稳定性信息:冻结(首选)/环境/冷藏
1。纽约Clients-Informed同意是必需的。请求的文档形式或电子订单,一份文件。下列文件中可用的特别指示:
- - - - - -基因检测的知情同意(T576)
- - - - - -为遗传Testing-Spanish知情同意(T826)
2。如果不是电子订购,完成,打印和发送疗法测试请求(T831)标本。
血:0.4毫升
唾液:1拭子
所有标本将评估在梅奥诊所实验室测试适用性。yabo208 |
标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
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不同 | 变化(首选) |
预测反应的基因型1丙型肝炎病毒感染pegylated-interferon和ribavirin-based疗法相结合
患者感染丙型肝炎病毒(HCV)基因型1变量反应治疗pegylated-interferon和利巴韦林联合治疗。一些人将如何应对持续治疗病毒反应,而其他患者不良反应,无法实现持续的病毒清除。
应对pegylated-interferon和利巴韦林联合治疗HCV基因型1-infected个体已经发现与单核苷酸变异密切相关(SNV),指定rs12979860位于3个碱基的上游白介素28 b基因位点(IL28B,一个交响乐团被称为IFNL3出现在人类染色体19。
丙肝病毒基因型1-infected CC基因型的个体,与CT或TT基因型相比,这个SNPIL28B有大约2 -三倍大的利率的持续病毒应答pegylated-interferon和利巴韦林联合治疗。(1)类似的增加持续病毒应答率观察在不同种族,包括欧洲的美国人(95% CI, 1.8 - 2.3倍),非裔美国人(95% CI, 1.9 - 4.7倍),和西班牙裔(95% CI, 1.4 - 3.2倍)。(1)CC基因型也被关联到一个三倍增加自发清除丙肝病毒。(2、4)SNVIL28B只有一个的众多因素可以影响响应率pegylated-interferon和利巴韦林联合治疗HCV基因型1感染,和SNV基因型的结果应该被在其他临床因素的背景下,在一个给定的病人。
rs12979860 C等位基因频率在不同的种族和族裔群体不同。rs12979860 C变体是最常出现在个人从东亚(等位基因频率> 0.9)在个人和最常见的非洲起源等位基因频率(0.2 - -0.5)。(2)在美国最近的一项研究,有利CC基因型在37%的白人,29%的西班牙裔,14%的非裔美国人进行测试。
的机制IL28B基因型介导反应pegylated-interferon和利巴韦林联合治疗丙肝病毒基因型1-infected个人还没有理解,当前的研究课题。的影响IL28B有关的蚀变反应率在患者感染丙肝病毒基因型除了基因型1仍在调查中。
一个将提供解释报告。
一个将提供解释报告。
罕见变异可能存在可能导致假阴性或假阳性结果。如果结果不匹配的临床结果(表现型),应考虑额外的测试。
可能包含供体DNA样本如果获得病人non-leukoreduced输血或同种异体造血干细胞移植。样本获得的结果在这种情况下不可能准确反映出接收方的基因型。对于那些接受输血,基因型通常在6周内恢复的收件人。收到的人同种异体造血干细胞移植,移植前DNA标本建议进行测试。
对肝移植患者,IL28B基因型的接受者和捐赠者的独立预测因子持续病毒学反应pegylated-interferon和利巴韦林联合治疗。(3)
这个测试没有检测变异除了rs12979860单核苷酸变异。
1。通用电气D, Fellay J,汤普森AJ, et al:遗传变异在IL28B预测丙肝treatment-induced病毒清除。大自然。2009年8月,461 (7262):399 - 401
2。含硫的CL托马斯•DL马丁MP, et al: IL28B基因变异和自发的丙型肝炎病毒的间隙。大自然。2009年10月,461 (7265):798 - 801
3所示。查尔顿先生,汤普森,草原BJ, et al: Interleukin-28B多态性与组织学患者肝移植后和治疗反应复发丙型肝炎病毒感染。肝脏病学。2011年1月,53 (1):317 - 324
4所示。汤普森AJ,缪尔AJ, Sulkowski女士,et al: Interleukin-28B多态性提高病毒动力学和最强的预处理预测持续病毒学反应基因型1丙型肝炎病毒。胃肠病学。2010年7月,139 (1):120 - 9. - e18。doi: 10.1053 / j.gastro.2010.04.013
从全血中提取基因组DNA或唾液。基因分型的IL28B执行单核苷酸变异使用聚合酶链反应(PCR)的5 '核酸酶试验。荧光标记检测DNA探针退火到目标。PCR用于放大部分的DNA包含变种。如果检测探针是精确匹配目标DNA, 5 '核酸酶聚合酶降解调查,记者染料释放的影响淬火染料,荧光信号检测。基因型分配基于allele-specific荧光信号检测。(说明书:TaqMan SNP基因分型检测用户的指南。应用生物系统公司;修订格01/2014)
星期一到星期五
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
81283年
测试Id | 测试顺序的名字 | 订单LOINC价值 |
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IL28Q | IL28B基因型,V | 60279 - 7 |
结果Id | 测试结果的名字 | 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
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610145年 | IL28B基因型 | 60279 - 7 |
610146年 | IL28B表型 | 过程中 |
610147年 | 解释 | 69047 - 9 |
610148年 | 额外的信息 | 48767 - 8 |
610149年 | 方法 | 85069 - 3 |
610150年 | 免责声明 | 62364 - 5 |
610151年 | 看过的 | 18771 - 6 |