测试Id:PSYQP

精神药物遗传学基因小组,各不相同

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

有个性的选择和剂量的药物处方治疗抑郁症和其他精神疾病基于遗传变异

识别已知的基因遗传变异与反应和/或与精神药物毒性的风险

评估患者治疗失败和选择性5 -羟色胺再摄取抑制剂(SSRI)

评价难治性抑郁症患者

预测响应时间与SSRI改进

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

这个测试包括有针对性的测试来评估以下基因:ANKK1、ADRA2 CHRNA3, COMT的、CYP1A2 CYP2B6, CYP2C9, CYP2C19、CYP2D6, CYP3A4, CYP3A5, DRD2, EPHX1, GRIK4,抗原* 31:01 HLA-B * 15:02 HTR2A, HTR2C, MTHFR, OPRM1, SCN1A, SLC6A4 (5 - htt基因),UGT2B15。

CYP2D6测试是在需要的时候在2层。一级采用聚合酶链反应(PCR)的5 '核酸酶试验确定变异。所有的样品也有拷贝数由pcr 5 '核酸酶试验。测试一级支持所有常见的检测CYP2D6变体(如* 2 * 3 * 4 * 5 * 6 * 7 * 8 * 9 * 10 * 17 * 35 * 41 * 29日等)和罕见的等位基因* 11,* 15 * 12 * 14日,* 114。等位基因的复制和乘法也确认。单一和串联CYP2D7-2D6(* 13)等位基因和CYP2D6-2D7(例如,* 4 n,* 36,* 68)等位基因也可以检测到。二级测试包括测序使用荧光dye-terminator化学只做,如果一个模棱两可的表型结果一级测试。大约有3%的样品需要二级测试。

之前的授权这个试验是可用的。

反射测试
列出测试,可能会或可能不会被执行,在一个额外的费用,根据初始测试的结果和解释。

测试Id 报告名称 可单独购买 总是表现
2 d61z 完整CYP2D6基因序列 不,(仅法案) 没有
2 d62z CYP2D6创CYP2D6-2D7混合 不,(仅法案) 没有
2 d63z CYP2D6创CYP2D7-2D6混合 不,(仅法案) 没有
2 d64z CYP2D6 Nonduplicated基因 不,(仅法案) 没有
2 d65z CYP2D6基因5 ' DUP /匝 不,(仅法案) 没有
2 d66z CYP2D6基因3 ' DUP /匝 不,(仅法案) 没有

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

如果样品需要跟进CYP2D6,然后反射测试将执行适当的额外费用。

看到CYP2D6全面的级联测试算法

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法名称
一个简短的描述方法用于执行测试

实时聚合酶链反应(rt - PCR)等位基因歧视分析/定性Allele-Specific rt - PCR、PCR粒度分析紧随其后

纽约的状态
表明纽约国家批准的状态,如果测试是公开为纽约州立客户定货。

是的

报告名称
列出了短或缩写为一个测试版本的发布名称

精神PGx面板中,V

别名
列表附加测试常见的名字,作为一个帮助搜索

ADRA2

ANKK1

抗焦虑的面板

抗抑郁药失败

抗抑郁药面板

抗精神病面板

CHRNA3

COMT的

CYP1A2

CYP2B6

CYP2C19

CYP2C9

CYP2D6

CYP3A4

CYP3A5

细胞色素P450

抑郁症的面板

DRD2

EPHX1

基因面板

GRIK4

于* 31:01

HLA-B * 15:02

HTR2A

HTR2C

心境稳定剂面板

MTHFR

OPRM1

P450基因型

P450基因分型

PGx

PGx面板

药理遗传学小组

先发制人的基因分型

精神药物基因组学面板

精神科药物基因组学面板

精神药理遗传学小组

SCN1A

选择正确的药物

SLC6A4 (5 - htt基因)

UGT2B15

1 a2

2 b6

286年

2 c19

2 c9

2 d6

3 a4

3 a5

HLAA 3101

HLAB 1502

B1502

A3101

HLAA3101

HLAB1502

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

如果样品需要跟进CYP2D6,然后反射测试将执行适当的额外费用。

看到CYP2D6全面的级联测试算法

标本类型
描述了标本类型验证测试

不同

必要的信息

标本要求
定义了执行测试所需的最佳标本和首选的体积来完成测试

之前授权可用测试。提交要求形式标本。

提交只有1标本:

样品类型:全血

容器/管:薰衣草(EDTA)

标本体积:3毫升

收集产品说明:

1。反几次混合血。

2。在原始管发送全血标本。不整除。

样品稳定性信息:环境(首选)9天/冷藏30天

标本类型:唾液

病人准备:病人应该吃,喝酒,吸烟,咀嚼口香糖30.分钟之前收集。

供应:唾液拭子集合工具包(T786)

标本体积:2拭子,使用2包集合

托收指示:收集和发送样品每箱指令。

额外的信息:由于低浓度的DNA产生唾液,测试不能继续CYP2D6反射测试测序和初始测试完成后就会停止。

样品稳定性信息:环境30天

样品类型:中提取DNA

容器/管:2毫升螺丝上管

标本体积:One hundred.制程(每毫升)

集合产品说明:

1。的首选体积One hundred.制程一个浓度50ng /制程。

2。提供浓度DNA体积管。

标本稳定信息:(首选)1年/环境/冷藏

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

形式

1。纽约Clients-Informed同意是必需的。请求的文档形式或电子订单,一份文件。下列文件是可用的:

- - - - - -基因检测的知情同意(T576)

- - - - - -为遗传Testing-Spanish知情同意(T826)

2。精神药物遗传学基因小组事先授权命令指示要求

3所示。如果不是电子订购,完成,打印和发送疗法测试请求(T831)标本。

试样体积最小
定义样本的数量必须提供一个临床相关的结果取决于测试实验室

血:1毫升

唾液中提取DNA:需要看到样品

拒绝原因
识别标本类型和条件可能会导致样品被拒绝

所有标本将评估在梅奥诊所实验室测试适用性。yabo208

样品稳定性信息
提供了一个描述运输所需的温度进行实验室的标本,替代还包括可接受的温度

标本类型 温度 时间 特种集装箱
不同 变化(首选)

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

有个性的选择和剂量的药物处方治疗抑郁症和其他精神疾病基于遗传变异

识别已知的基因遗传变异与反应和/或与精神药物毒性的风险

评估患者治疗失败和选择性5 -羟色胺再摄取抑制剂(SSRI)

评价难治性抑郁症患者

预测响应时间与SSRI改进

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

这个测试包括有针对性的测试来评估以下基因:ANKK1、ADRA2 CHRNA3, COMT的、CYP1A2 CYP2B6, CYP2C9, CYP2C19、CYP2D6, CYP3A4, CYP3A5, DRD2, EPHX1, GRIK4,抗原* 31:01 HLA-B * 15:02 HTR2A, HTR2C, MTHFR, OPRM1, SCN1A, SLC6A4 (5 - htt基因),UGT2B15。

CYP2D6测试是在需要的时候在2层。一级采用聚合酶链反应(PCR)的5 '核酸酶试验确定变异。所有的样品也有拷贝数由pcr 5 '核酸酶试验。测试一级支持所有常见的检测CYP2D6变体(如* 2 * 3 * 4 * 5 * 6 * 7 * 8 * 9 * 10 * 17 * 35 * 41 * 29日等)和罕见的等位基因* 11,* 15 * 12 * 14日,* 114。等位基因的复制和乘法也确认。单一和串联CYP2D7-2D6(* 13)等位基因和CYP2D6-2D7(例如,* 4 n,* 36,* 68)等位基因也可以检测到。二级测试包括测序使用荧光dye-terminator化学只做,如果一个模棱两可的表型结果一级测试。大约有3%的样品需要二级测试。

之前的授权这个试验是可用的。

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

如果样品需要跟进CYP2D6,然后反射测试将执行适当的额外费用。

看到CYP2D6全面的级联测试算法

临床信息
讨论了生理学、病理生理学和一般临床方面,与实验室测试

这个面板提供了一个综合分析多个基因有很强的药物基因组学对药物用于治疗精神疾病,包括抑郁症。每个样品检测特定的变化与已知功能的影响。综述了药物基因组学数据为以下特定变异和报告(如果存在):

-ADRA2Ars1800544

-ANKK1(DRD2相关)rs1800497

-CHRNA3rs1051730

comt的rs4680

cyp1a2 * 1 f,* 1 k,* 6,* 7

-CYP2B6 * 4 * 5 * 6 * 7 * 8 * 9 * 11 * 12 * 13 * 14 * 15 * 16(也称为* 18.002)* * * 18日,19日,20日,22日,* 27 * 26日,* 35 * 36,* 38

-CYP2C9* 2,* 3,* 4,* 5,* 6,* 8,* 9,* 11,* 12,* 13,* 14,* 15,* 16,* 17,* 18,* 25,* 26,* 28,* 30,* 33,* 35

-CYP2C19* 2,* 3,* 4,* 5,* 6,* 7,* 8,* 9,* 10,* 17,* 35

cyp2d6* 2,* 2个,* 3,* 4,* 4 n,* 5,* 6,* 7,* 8,* 9,* 10,* 11,* 12,* 13,* 14(现在被称为* 114),* 14 b(现在被称为* 14),* 15,* 17,* 29,* 35,* 36,* 41,* 68,CYP2D6基因重复;额外的CYP2D6通过反射测试过程变异可能检测到

-CYP3A4* 8,* 11,* 12,* 13,* 16,* 17,* 18,* 22,* 26

-CYP3A5* 3,* 5,* 6,* 7,* 8,* 9

drd2rs1799978

-EPHX1rs2234922

-GRIK4rs1954787

-HLA-A * 31:01

-HLA-B * 15:02

-HTR2Ars7997012

-HTR2Crs3813929和rs1414334

-MTHFRrs1801131和rs1801133

-OPRM1rs1799971

-SCN1Ars3812718

-SLC6A4与多态区域(LPR),一双44-base子插入/缺失多态性

-UGT2B15rs1902023

根据每次试验的结果,分配一个基因型和表现型预计为每一个基因。评估多个基因可能协助订购与个性化药物临床医生的建议,避免药品不良反应,优化药物治疗。

参考价值
描述参考区间和附加信息的解释测试结果。可能包括在适当的时间间隔根据年龄和性别。间隔Mayo-derived,除非另有指定。如果一个提供解释报告,参考价值字段将这个状态。

一个将提供解释报告。

解释
提供信息,协助解释测试结果

将提供一份解释报告,关注药物和基因药物基因组学实践指南发布的与临床药物基因学实现财团或其他专业组织,(1 - 3)强大的FDA指南已发布在药物标签,(4)或同行评议的文献强烈表明,评估药物基因组变异可能提高病人护理(5 - 8)。

额外的信息关于药物基因组学及其相关基因药物,明白了药物基因组学关联表。这个资源还包括关于酶抑制剂和诱导物的信息,以及潜在的替代药物的选择。

注意事项
讨论了条件,可能会导致诊断的混乱,包括样本收集和处理不当,不恰当的测试选择、干扰物质

可能包含供体DNA样本如果获得病人non-leukoreduced输血或同种异体造血干细胞移植。样本获得的结果在这种情况下不可能准确反映出接收方的基因型。对于那些接受输血,基因型通常在6周内恢复的收件人。收到的人同种异体造血干细胞移植,移植前DNA标本建议进行测试。基因测试结果接受肝移植的患者可能不准确地反映病人的遗传基因的地位在这个面板。

这个测试不是被设计来提供特定的剂量使用建议和帮助临床决策。药品标签指导时应使用剂量药物患者无论预测表型。

有关更多信息,请参见下列测试:

1 a2q /细胞色素P4501 a2不同基因型,

2 c9qt /细胞色素P4502 c9不同基因型,

2 c19r /细胞色素P4502 c19不同基因型,

2 d6q /细胞色素P4502 d6全面的级联,各不相同

3 a4q /细胞色素P4503 a4不同基因型,

3 a5q /CYP3A5不同基因型,

-CARBR /卡马西平过敏药物基因组学,各不相同

-COMTQ / Catechol-O-Methyltransferase (COMT的)基因型,不同

临床参考
对临床性质的深入阅读的建议

1。PharmVar: Pharmacogene变异财团。更新3马赫,2021年。2021年3月22日通过。可以在www.pharmvar.org/

2。临床药物基因学实现联盟(集团)。2020年10月14日通过。可以在https://cpicpgx.org/

3所示。希克斯JK, Sangkuhl K,斯文JJ, et al .临床药物基因学实现财团CYP2D6指南(集团)和CYP2C19基因型和三环类抗抑郁药的剂量:2016更新。中国新药杂志。2017;102 (1):37-44。doi: 10.1002 / cpt.597

4所示。U。年代N一个tional Library of Medicine: DailyMed. National Institutes of Health. Accessed October 14, 2020. Available at https://dailymed.nlm.nih.gov/dailymed/index.cfm

5。Shiekh布拉德利·P M,用V, et al:改进的有效性与针对性pharmacogenetic-guided患者抑郁和焦虑的治疗:一项随机临床试验证明临床效用。J Psychiatr杂志2018;96:100 - 107

6。布伦南外汇,加德纳KR,伦巴第J, et al:自然的遗传测试的有效性的研究指导治疗精神病患者心境和焦虑障碍。拘谨的照顾同伴CNS Disord。2015年4月16日,17 (2)。doi: 10.4088 / PCC.14m01717

7所示。佩雷斯V, Salavert Espadaler J, et al:疗效的潜在药理遗传学测试治疗重度抑郁症:结果的随机、双盲的临床试验。BMC精神病学。2017年7月14日,17 (1):250

8。麦高文OO雷诺兹GP,道尔顿CF:药物基因组学在精神病学:受体和转运蛋白多态性的相关性。Br中国新药杂志。2014年4月,77 (4):654 - 672

9。人员KR,蒙特AA, Huddart R, et al:临床药物基因学实现财团CYP2D6指南,OPRM1, COMT基因型和选择阿片类药物治疗。中国新药杂志。2021年10月,110 (4):888 - 896。doi: 10.1002 / cpt.2149

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法描述
描述如何执行测试并提供method-specific参考

从样本中提取基因组DNA。

多用于执行以下基因用聚合酶链反应(PCR)的5 '核酸酶试验。荧光标记检测目标DNA探针退火:ANKK1,ADRA2 CHRNA3, COMT, CYP1A2、CYP2B6 CYP2C9, CYP2C19、CYP2D6, CYP3A4, CYP3A5, DRD2, EPHX1, GRIK4, HTR2A, HTR2C, MTHFR, OPRM1, SCN1A,UGT2B15。PCR用于放大部分的DNA包含变种。如果检测探针是精确匹配目标DNA, 5 '核酸酶聚合酶降解调查,记者染料释放的影响淬火染料,荧光信号检测。基因型分配基于allele-specific荧光信号检测。(说明书:TaqMan SNP基因分型检测用户指南。应用生物系统公司;修订格,01/2014)

放大的HLA-B * 15:02于* 31:01等位基因和一个内部控制基因是由实时PCR在SYBR绿色,与双链DNA时它会发出荧光。分配一个基因型的基础上allele-specific SYBR绿色荧光信号检测出来。(未发表的梅奥法)

SLC6A4周围的地区执行利用PCR扩增多态性紧随其后的是大小的产品分离。(lesch KP, Bengel D, Heils A, et al: Association of anxiety-related traits with a polymorphism in the serotonin transporter gene regulatory region. Science. 1996 Nov;274[5292]:1527-1531)

CYP2D6拷贝数检测:

本试验利用双实时PCR,其中包括1拷贝数调查和参考试验反应。每个拷贝数探测器检测到感兴趣的基因组序列和参考试验检测序列是已知的在副本2份二倍体基因组。相对定量用于确定目标的相对拷贝数的兴趣(gDNA)基因组DNA样本归一化到每个探针ng /制程。每个探测规范化到已知的参考序列的拷贝数,而校准器样本与已知目标序列包含在每次运行的副本。(包插入:Taqman拷贝数化验。应用生物系统公司;版本B)

2 d6测序分析(Tier 2,根据需要):

CYP2D6等位基因的利益由PCR扩增。然后PCR产物纯化,并使用荧光dye-terminator化学测序在两个方向上。测序产品分离自动测序仪和跟踪文件分析变化的外显子和内含子/外显子边界9外显子突变检测软件和目视检查。(未发表的梅奥法)

PDF报告
表明报告包括一个额外的文档是否与图表、图像或其他丰富的信息

补充再保险

天(s)
概述了天测试执行。这个领域反映了天,样品必须在测试实验室开始测试过程,包括任何样品制备和测试执行之前处理时间。列出了一些测试,不断进行,这意味着化验白天多次执行。

周一到周四

报告可用
时间的间隔(收到样品在梅奥诊所实验室结果可用)考虑标准设置和周末。yabo208第一天的时间通常是结果可用。最后一天的时间可能需要,占任何必要的重复测试。

3 - 14天

样品保留时间
轮廓的时间在测试标本保存在实验室之前就会被丢弃

全血/唾液:2周;提取的DNA: 2个月

执行实验室的位置
表明实验室的位置执行测试

罗彻斯特

费用
几个因素决定执行一个测试的费用收取。联系你的美国或国际区域经理建立费用表的信息或了解更多关于资源优化测试的选择。

  • 授权用户可以登录测试价格费用的详细信息。
  • 客户没有测试价格可以联系亚搏一天24小时,一周7天。
  • 潜在客户应该联系他们的区域经理。寻求帮助,请联系亚搏

测试的分类
提供信息关于医疗器械分类为实验室测试工具和试剂。测试可以分为清除或通过美国食品和药物管理局(FDA)和每个制造商使用说明,或产品,不接受FDA审查和批准,并贴上一个分析物特定试剂(ASR)产品。

这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。

CPT编码信息
提供指导在决定适当的当前程序的术语(CPT)代码(s)为每个测试或概要信息。梅奥诊所上市CPT编码反映实验室的解释CPT编码需求。yabo208每个实验室有责任来确定正确的CPT编码用于计费。

CPT编码由执行实验室提供。

81479年

81226年

81225年

81227年

81230年

81231年

81291年

81381 x 2

LOINC®信息
提供指导在确定逻辑观察标识符名称和代码(LOINC)值的顺序和结果代码的测试。LOINC表演实验室提供的值。

测试Id 测试顺序的名字 订单LOINC价值
PSYQP 精神PGx面板中,V 94753 - 1
结果Id 测试结果的名字 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
610209年 ADRA2A rs1800544基因型 94401 - 7
610210年 ANKK1 rs1800497基因型 94402 - 5
610211年 CHRNA3 rs1051730基因型 94403 - 3
610212年 COMT rs4680基因型 74511 - 7
610213年 CYP1A2基因型 72884 - 0
610214年 CYP1A2表型 94254 - 0
610215年 CYP2B6基因型 72882 - 4
610216年 CYP2B6表型 79720 - 9
610573年 CYP2B6活动得分 过程中
610217年 CYP2C19基因型 57132 - 3
610218年 CYP2C19表型 79714 - 2
610574年 CYP2C19活动得分 过程中
610219年 CYP2C9基因型 46724 - 1
610220年 CYP2C9表型 79716 - 7
610575年 CYP2C9活动得分 过程中
610221年 CYP2D6基因型 40425 - 1
610222年 CYP2D6表型 79715 - 9
610576年 CYP2D6活动得分 过程中
610227年 DRD2 rs1799978基因型 94411 - 6
610228年 EPHX1 rs2234922基因型 94412 - 4
610229年 GRIK4 rs1954787基因型 94413 - 2
610230年 于* 31:01基因型 79712 - 6
610231年 HLA-B * 15:02基因型 57979 - 7
610232年 HTR2A rs7997012基因型 93190 - 7
610233年 HTR2C rs3813929基因型 93191 - 5
610234年 HTR2C rs1414334基因型 93192 - 3
610235年 MTHFR基因型 94414 - 0
610236年 OPRM1 rs1799971基因型 94415 - 7
610237年 SCN1A rs3812718基因型 94416 - 5
610238年 5 httlpr SLC6A4基因型 94417 - 3
610239年 UGT2B15 rs1902023基因型 94418 - 1
610240年 解释 69047 - 9
610241年 额外的信息 48767 - 8
610242年 方法 85069 - 3
610243年 免责声明 62364 - 5
610244年 看过的 18771 - 6
610223年 CYP3A4基因型 81139 - 8
610224年 CYP3A4表型 81145 - 5
610225年 CYP3A5基因型 81140 - 6
610226年 CYP3A5表型 79717 - 5

测试设置资源

设置文件
测试设置信息包含测试文件定义支持订单细节和结果之间的接口梅奥诊所实验室和实验室信息系统。yabo208

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样品报告
正常和异常样本报告作为参考提供报告的外观。

正常的报告|异常报告

如果样品报告
国际体系(SI)的单位报告提供有限数量的测试。这些报告仅用于国际帐户,只可以通过MayoLINK账户已定义接收他们。

如果正常的报告|如果异常报告