测试Id:TPNUQ

对于thiopurine甲基转移酶(硫代嘌呤甲基转移酶)酶活性测试,订单TPMT3 / thiopurine甲基转移酶活动概要,红细胞;然而,这个测试也应该下令因为硫代嘌呤甲基转移酶酶活性测试无法检测到变异NUDT15,也影响thiopurine新陈代谢。

多个基因测试可以执行一个单一萃取后标本。看到多个基因型测试列表的测试,可以一起订购。

提交以下标本:只有1

样品类型:全血

容器/管:薰衣草(EDTA)

样品数量:3毫升

收集产品说明:

1。反几次混合血。

2。在原始管发送全血标本。不整除。

样品稳定性信息:环境(首选)9天/冷藏30天

样品类型:唾液

病人准备:病人不能吃、喝、吸烟或嚼口香糖30分钟前集合。

供应:唾液拭子采集设备(T786)

样品数量:1拭子

收集产品说明:收集和发送样品每箱指令。

样品稳定性信息:周围30天

标本类型:提取DNA

容器/管:2毫升螺旋管

标本体积:100制程

托收指示:

1。首选的体积是100制程50 ng /制程的浓度。

2。提供的DNA浓度和体积管。

样品稳定性信息:冻结(首选)/环境/冷藏

• 基因检测的知情同意
• 药物基因组学关联表
• 多个基因型测试列表
• 知情同意的基因检测(西班牙语)

1。纽约Clients-Informed同意是必需的。请求的文档形式或电子订单,一份文件。下列文件是可用的:

- - - - - -基因检测的知情同意(T576)

- - - - - -为遗传Testing-Spanish知情同意(T826)

2。如果不是电子订购,完成,打印,发送1以下形式的标本:

- - - - - -神经病学专业测试客户端测试的要求(T732)

- - - - - -胃肠病学和肝脏病学客户测试要求(T728)

- - - - - -疗法测试请求(T831)

血:0.4毫升

唾液中提取DNA:需要看到样品

所有标本将评估在梅奥诊所实验室测试适用性。yabo208

预测潜在的毒性thiopurine药物(6 -巯基嘌呤、6-thioguanine和咪唑硫嘌呤)

thiopurine药物嘌呤抗代谢物是有用的治疗急性淋巴细胞白血病,自身免疫性疾病(如克罗恩病、类风湿性关节炎),和器官移植受者。thiopurine药物,6 -巯基嘌呤(6 -巯基嘌呤),6-thioguanine (6-TG)和硫唑嘌呤(AZA)高活性化合物,需要细胞内激活6-thioguanine核苷酸(6-TGN)。这个活动是由多个酶催化。thiopurine药物的细胞毒性效应实现主要是通过整合6-TGN DNA和RNA。活跃的细胞毒性途径导致合成6-TGN thiopurine与失活途径催化竞争的甲基转移酶(硫代嘌呤甲基转移酶)。这个途径的评估是很重要的,因为6-TGN以红细胞水平已经与两个thiopurine myelosuppression等治疗效果和毒性。

硫代嘌呤甲基转移酶活性是遗传的单基因共显性的特征,和变量与硫代嘌呤甲基转移酶的活动硫代嘌呤甲基转移酶的遗传变异。硫代嘌呤甲基转移酶活动的分布在红细胞三峰在白色的人口,大约有0.3%的人有缺陷(察觉)硫代嘌呤甲基转移酶活性,11%低(中间)活动,89%正常硫代嘌呤甲基转移酶的活动。正常的硫代嘌呤甲基转移酶活动的等位基因(野生型)已经被指定硫代嘌呤甲基转移酶* 1。四个硫代嘌呤甲基转移酶等位基因,由三个不同的组合单核苷酸变异(SNV),占大多数的灭活等位基因在某些种族,包括白人:硫代嘌呤甲基转移酶* 2,硫代嘌呤甲基转移酶3 *,硫代嘌呤甲基转移酶c * 3。不经常发生硫代嘌呤甲基转移酶等位基因硫代嘌呤甲基转移酶* 4,硫代嘌呤甲基转移酶* 5,硫代嘌呤甲基转移酶* 8,硫代嘌呤甲基转移酶* 12还缺牵扯等位基因。如果没有硫代嘌呤甲基转移酶变异检测到的等位基因的分析,最有可能的基因型的硫代嘌呤甲基转移酶* 1 / * 1虽然不能排除其他罕见的等位基因的存在。

Nudix水解酶(NUDT15)被认为脱去磷酸thiopurines的活性代谢物,TGTP TdGTP,防止他们并入DNA和减少细胞毒性的影响。基因变异的NUDT15减少这个活动紧密相关thiopurine-related myelosuppression。NUDT15东亚之间的缺乏是最常见(22.6%)、南亚(13.6%),和美国本土人群(12.5% - -21.2%)。目前正在研究其他人群。这个测试评估变异有关NUDT15 * 2, NUDT15 * 3, NUDT15 * 4,和NUDT15 * 5。如果没有NUDT15变异检测到的等位基因的分析,最有可能的基因型的NUDT15 * 1 / * 1虽然不能排除其他罕见的等位基因的存在。个人与变异硫代嘌呤甲基转移酶和NUDT15已确定,巯嘌呤更敏感比个人只有一个基因的杂合的一个变体。集成的硫代嘌呤甲基转移酶和NUDT15测试可能允许更精确的预测thiopurine-related指导剂量毒性风险,尤其是病人来自不同人群。

表1。硫代嘌呤甲基转移酶酶活性的个人明星等位基因

硫代嘌呤甲基转移酶等位基因	互补脱氧核苷酸变化 (NM_000367.4)	氨基酸的变化	影响酶代谢
* 1	没有(野生型)	没有(野生型)	正常功能
* 2	c.238G > C	p。一个la80Pro (p.A80P)	没有活动
* 3	c.460G >一和c.719A > G	p。一个la154Thr (p.A154T) and p.Tyr240Cys (p.Y240C)	没有活动
* 3 b	c.460G >一	p。一个la154Thr (p.A154T)	没有活动
* 3 c	c.719A > G	p。Tyr240Cys (p.Y240C)	没有活动
* 4	c.626-1G >一	不适用,拼接的网站	没有活动
* 5	c.146T > C	p。leu49Ser (p.L49S)	没有活动
* 8	c.644G >一	p。一个rg215His (p.R215H)	减少活动
* 12	c.374C > T	p。年代er125Leu (p.S125L)	减少活动

表2。NUDT15单个明星等位基因的酶活性

NUDT15等位基因	互补脱氧核苷酸变化 (NM_018283.3)	氨基酸的变化	影响酶代谢
* 1	没有(野生型)	没有(野生型)	正常的活动
* 2或* 3	c.415C > T	p。一个rg139Cys (p.R139C)	没有活动
* 4	c.416G >一	p。一个rg139His (p.R139H)	没有活动
* 5	c.52G >一	p。Val18Ile (p.V18I)	没有活动

美国食品和药物管理局,临床药物基因学实现财团,和一些专业协会推荐考虑硫代嘌呤甲基转移酶和NUDT15基因型测试或硫代嘌呤甲基转移酶酶活性测试NUDT15基因型检测开始前用thiopurine药物的治疗。有大量的证据表明硫代嘌呤甲基转移酶和NUDT15基因型与表型的变化。剂量调整的基础上硫代嘌呤甲基转移酶和NUDT15基因型减少了thiopurine-induced副作用的抗肿瘤和免疫抑制治疗效果的前提下在多个临床设置。

基因分型结果不影响其他药物抑制硫代嘌呤甲基转移酶活性。补充临床试验可用来测量硫代嘌呤甲基转移酶酶活性在红细胞(TPMT3 / Thiopurine甲基转移酶活动概要,红细胞)如果临床医生要检查硫代嘌呤甲基转移酶酶活性较低,无论事业。变异测试硫代嘌呤甲基转移酶酶活性没有影响NUDT15。

一个将提供解释报告。

一个将提供解释报告。

的硫代嘌呤甲基转移酶与明星相关的等位基因,基因型是分配使用标准的等位基因命名为硫代嘌呤甲基转移酶命名法委员会发表的。(1)NUDT15基因型和相关明星等位基因被本森山et al。(2)和编目Pharmacogene变异财团(www.pharmvar.org)。

额外的信息关于基因药物基因组学及其相关药物,看到药物基因组学关联表。这个资源还包括关于酶抑制剂和诱导物的信息,以及潜在的替代药物的选择。

罕见变异可能存在可能导致假阴性或假阳性结果。如果没有硫代嘌呤甲基转移酶变异等位基因检测的这个分析最可能的基因型硫代嘌呤甲基转移酶* 1 / * 1虽然不能排除其他罕见的等位基因的存在。此外,如果没有NUDT15变异等位基因检测的这个分析最可能的基因型NUDT15 * 1 / * 1虽然不能排除其他罕见的等位基因的存在。

如果基因型结果不匹配的临床发现,额外的测试应该考虑thiopurine甲基转移酶酶活性(TPMT3 / thiopurine甲基转移酶活动概要,红细胞)。相应的活动分析NUDT15不是当前可用。

可能包含供体DNA样本如果获得病人non-leukoreduced输血或同种异体造血干细胞移植。样本获得的结果在这种情况下不可能准确反映出接收方的基因型。对于那些接受输血,基因型通常在6周内恢复的收件人。收到的人同种异体造血干细胞移植,移植前DNA标本建议进行测试。

结果不排除这种可能性,一个病人在港口的另一个变体硫代嘌呤甲基转移酶、NUDT15或另一个基因可以影响药物反应或药物的副作用。这些基因分型过程不会区分杂合的硫代嘌呤甲基转移酶3 *罕见的硫代嘌呤甲基转移酶* 3 * 3 b / c,估计有1:120,890的频率。这种罕见的基因型与低酶活性有关。酶活性评价有必要明确识别这种罕见基因型(TPMT3 / Thiopurine甲基转移酶活动概要,红细胞)。

这个测试将不检测硫代嘌呤甲基转移酶或NUDT15的遗传变异。负面结果并不排除毒性的可能性,如果使用thiopurines,因为多种因素(如其他遗传因素,药物之间的相互作用)中发挥作用。它别嘌呤醇可能抑制硫代嘌呤甲基转移酶活性。其他药物已经被证明能够抑制硫代嘌呤甲基转移酶活性包括萘普生、布洛芬、ketoprofen,呋喃苯胺酸,柳氮磺胺吡啶,mesalamine, olsalazine,甲灭酸、噻嗪类利尿剂,苯甲酸抑制剂。

1。硫代嘌呤甲基转移酶命名法委员会(硫代嘌呤甲基转移酶等位基因):林雪平大学;2019年5月更新。2020年10月14日通过。可以在www.imh.liu.se tpmtalleles

2。本森山T, Nishii R, Perez-Andreu V, et al: NUDT15多态性改变thiopurine新陈代谢和造血毒性。Nat麝猫。2016;48 (4):367 - 373。doi: 10.1038 / ng.3508

3所示。阿佩尔ML, Berg J, Duley J, et al:命名thiopurine等位基因的甲基转移酶基因。Pharmacogenet基因组学。2013;23 (4):242 - 248。1 . doi: 0.1097 / FPC.0b013e32835f1cc0

4所示。阮厘米,门德斯马,马JD: Thiopurine甲基转移酶(硫代嘌呤甲基转移酶)的基因预测myelosuppression风险。公共科学图书馆咕咕叫。2011;3:RRN1236。doi: 10.1371 / currents.RRN1236

5。rel MV,施瓦布M, Whirl-Carrillo M, et al:临床药物基因学实现联盟指导Thiopurine剂量根据硫代嘌呤甲基转移酶和NUDT15基因型:2018更新。中国新药杂志。2019;105 (5):1095 - 1105。doi: 10.1002 / cpt.1304

6。温什波姆R: Thiopurine药物基因学:临床和分子研究Thiopurine甲基转移酶。药物金属底座Dispos。2001; 29 (4 Pt 2): 601 - 605。

7所示。Zaza公司G, Cheok M, Krynetskaia N, et al: Thiopurine通路。Pharmacogenet基因组学。2010;20 (9):573 - 574。doi: 10.1097 / FPC.0b013e328334338f

• 基因检测的知情同意
• 药物基因组学关联表
• 多个基因型测试列表
• 知情同意的基因检测(西班牙语)

从全血中提取基因组DNA或唾液。基因分型的硫代嘌呤甲基转移酶和NUDT15等位基因执行使用聚合酶链反应(PCR)的5 '核酸酶试验。荧光标记检测DNA探针退火到目标。PCR用于放大段包含多态性的DNA。如果检测探针是精确匹配目标DNA, 5 '核酸酶聚合酶降解调查,记者染料释放的影响淬火染料,荧光信号检测。基因型分配基于allele-specific荧光信号检测。(说明书:TaqMan SNP基因分型检测用户指南。应用生物系统公司;修订格,01/2014)

没有

星期一到星期五

1到4天

全血/唾液:2周;提取的DNA: 2个月

罗彻斯特

• 授权用户可以登录测试价格费用的详细信息。
• 客户没有测试价格可以联系亚搏一天24小时,一周7天。
• 潜在客户应该联系他们的区域经理。寻求帮助,请联系亚搏。

这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。

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样品报告

正常和异常样本报告作为参考提供报告的外观。

正常的报告|异常报告

如果样品报告

国际体系(SI)的单位报告提供有限数量的测试。这些报告仅用于国际帐户,只可以通过MayoLINK账户已定义接收他们。

如果正常的报告|如果异常报告