测试Id:WARSQ

华法令阻凝剂反应基因型,不同

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

识别患者可能需要华法林剂量调整(3,4)包括:

病人开始在华法林的第一个处方

患者此前规定的华法林和需要多个剂量调整维护国际标准化比率在目标范围内

史的患者血栓或出血时服用华法林

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

这个测试是用来评估的CYP2C9,VKORC1,CYP4F2,rs12777823变异影响华法林代谢(香豆素)。这个试验应该下令在患者首次接受华法林或正在经历困难的人在维护国际标准化比率(INR)治疗范围。

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法名称
一个简短的描述方法用于执行测试

实时聚合酶链反应(PCR)分析等位基因歧视

纽约的状态
表明纽约国家批准的状态,如果测试是公开为纽约州立客户定货。

是的

报告名称
列出了短或缩写为一个测试版本的发布名称

华法令阻凝剂反应基因型,V

别名
列表附加测试常见的名字,作为一个帮助搜索

2 c9

香豆素基因型

CYP4F2

细胞色素P450 2 c9 CYP2C9基因分型

rs 12777823

维生素K环氧还原酶亚基1

维生素K基因型(VKORC1)

VKORC1

华法林的基因型

华法林抗

华法林的敏感性

标本类型
描述了标本类型验证测试

不同

订购指南

如果病人使用药物华法林以外,测试2 c9qt /细胞色素P450的首选2 c9基因型不同,测试的CYP2C9基因。

测试是可用的单基因试验(测试)或作为一个重点药物基因组学小组的一部分,其中包括测试以下基因:CYP年代1 a2, 2 c9 2 c19 2 d6, 3 a4、a5, 4 f2, SLCO1B1,VKORC1。秩序PGXQP /重点药物基因组学面板中,如果多个药物基因组学不同基因型检测。

标本要求
定义了执行测试所需的最佳标本和首选的体积来完成测试

多个基因测试可以执行一个单一萃取后标本。看到多个基因型测试列表在特殊说明的测试列表可以一起订购。

提交以下标本:只有1

样品类型:全血

容器/管:薰衣草(EDTA)

样品数量:3毫升

收集产品说明:

1。反几次混合血。

2。在原始管发送样品。

样品稳定性信息:环境(首选)9天/冷藏30天

样品类型:唾液

病人准备:病人不能吃、喝、吸烟或嚼口香糖30分钟前集合。

供应:唾液拭子采集设备(T786)

样品数量:1拭子

收集产品说明:收集和发送样品每箱指令。

样品稳定性信息:周围30天

样品类型:中提取DNA

容器/管:2毫升螺旋管

标本体积:100制程(每毫升)

收集产品说明:

1。首选的体积是100制程50 ng /制程的浓度。

2。包括浓度和体积管。

样品稳定性信息:冷冻(首选)/环境/冷藏

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

形式

1。纽约Clients-Informed同意是必需的。请求的文档形式或电子订单,一份文件。下列文件中可用的特别指示:

- - - - - -基因检测的知情同意(T576)

- - - - - -为遗传Testing-Spanish知情同意(T826)

2。如果不是电子订购,完成,打印,发送1以下形式的标本:

- - - - - -神经病学专业测试客户端测试的要求(T732)

- - - - - -疗法测试请求(T831)

试样体积最小
定义样本的数量必须提供一个临床相关的结果取决于测试实验室

血:0.4毫升

唾液:1拭子

拒绝原因
识别标本类型和条件可能会导致样品被拒绝

所有标本将评估在梅奥诊所实验室测试适用性。yabo208

样品稳定性信息
提供了一个描述运输所需的温度进行实验室的标本,替代还包括可接受的温度

标本类型 温度 时间 特种集装箱
不同 变化(首选)

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

识别患者可能需要华法林剂量调整(3,4)包括:

病人开始在华法林的第一个处方

患者此前规定的华法林和需要多个剂量调整维护国际标准化比率在目标范围内

史的患者血栓或出血时服用华法林

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

这个测试是用来评估的CYP2C9,VKORC1,CYP4F2,rs12777823变异影响华法林代谢(香豆素)。这个试验应该下令在患者首次接受华法林或正在经历困难的人在维护国际标准化比率(INR)治疗范围。

临床信息
讨论了生理学、病理生理学和一般临床方面,与实验室测试

华法林是Coumarin-based药物通常用于抗凝治疗预防血栓由于遗传和后天止血紊乱。药物也被运用于其他医疗条件和治疗包括心房纤颤和髋关节置换手术。华法林作用通过干扰维生素K的新陈代谢,这是凝固生产所必需的关键因素。华法令阻凝剂抑制维生素K回收通过阻断其新陈代谢维生素K-epoxide中间;从而减少可用的维生素k .华法林治疗窗窄;undermedicating增加血栓形成的风险和增加overmedicating脑血管意外的风险。华法林治疗严重药品不良反应率最高的国家之一。

华法林给使用nongenetic因素包括性别,体重,年龄,是由凝固监控测试为了维护国际标准化比率(INR)在特定的范围内。然而,华法林代谢是高度可变,取决于遗传因素。基因变异在3和1基因内轨迹已知影响华法林的新陈代谢和保持所需的剂量正确的血清水平和程度的抗凝药物。

CYP2C9基因编码细胞色素P450 (CYP) 2 c9主要代谢酶,这种酶异构体的华法林(S-warfarin)越活跃不活跃的产品。一些CYP2C9变异导致酶活性降低,可能导致增加血清华法林和overmedicating驾驶上面的INR治疗目标。

第二个基因,VKORC1编码维生素K环氧subunit-1还原酶复杂,一个小跨膜蛋白的内质网的一部分维生素K周期和华法林治疗的目标。(1)维生素K环氧,凝血因子的羧化作用的副产品,是减少维生素KVKORC1。一个VKORC1子变异会导致基因的表达减少,导致减少了可用性的维生素k .这可能导致增加血清华法林和overmedicating,推动INR高于治疗目标。此外,有变化VKORC1导致华法林阻力测试的试验。这些变化是罕见的。

CYP4F2代谢减少维生素K hydroxyl-vitamin K1,从而把它从通路参与凝血因子的激活影响华法林。在那些自认为是非洲以外的祖先,航空公司的CYP4F2 * 3(C.1297G >;rs2108622)变体可能需要一个小(5% - -10%)华法林剂量增加达到治疗目标。

rs12777823G >位于基因内的一个变体CYP2C轨迹10号染色体上。与需要相关联的一个等位基因剂量减少10%至15%的人自认为是被非洲血统。

CYP2C9:

CYP2C9代谢多种药物华法林和苯妥英等。(注意,如果需要测试其他CYP2C9底物,订单2 c9qt /细胞色素P4502 c9基因型,不同。

一些特定的CYP2C9变异导致酶缺陷。以下信息概述变异之间的关系在这个试验发现,它们对酶的活性的影响(表1):

表1:

CYP2C9等位基因

互补脱氧核苷酸变化

(NM_000771.3)

影响酶代谢

* 1

没有(野生型)

正常的活动

* 2

c.430C > T

减少活动

* 3

c.1075A > C

没有活动

* 4

c.1076T > C

减少活动

* 5

c.1080C > G

减少活动

* 6

c.818delA

没有活动

* 8

c.449G >一

减少活动

* 9

c.752A > G

正常的活动

* 11

c.1003C > T

减少活动

* 12

c.1465C > T

减少活动

* 13

c.269C > T

没有活动

* 14

c.374G >一

减少活动

* 15

c.485C >一

没有活动

* 16

c.895A > G

减少活动

* 17

c.1144C > T

减少活动

* 18

c.1190A > C

没有活动

* 25

c.353_362del

没有活动

* 26

c.389C > G

减少活动

* 28

c.641A > T

减少活动

* 30

c.1429G >一

减少活动

* 33

c.395G >一

没有活动

* 35

c.374G > T; c.430C > T

没有活动

VKORC1:

c。- - - - - -1639 promoter variant is located in the second nucleotide of an E-Box (CANNTG), and its presence disrupts the consensus sequence, reducing promoter activity. In vitro experiments show a 44% higher transcription level of the G versus the A allele.(1) The c.-1639G>A nucleotide change results in decreased gene expression and reduced enzyme activity. This test also determines the genotype for multiple other loci withinVKORC1已经与华法林电阻有关。这些变化的机制导致华法林阻力并不清楚。

表2:额外的变异测试

基因/ SNV

互补脱氧核苷酸变化

(VKORC1NM_024006.5;CYP4F2NM_001082.4)

影响酶代谢

VKORC1

c - 1639 g > A

华法林的敏感性

VKORC1

c.85G > T

华法林抗

VKORC1

c.106G > T

华法林抗

VKORC1

c.121G > T

华法林抗

VKORC1

c.134T > C

华法林抗

VKORC1

c.172A > G

华法林抗

VKORC1

c.196G >一

华法林抗

VKORC1

c.358C > T

华法林抗

VKORC1

c.383T > G

华法林抗

CYP4F2 * 3

c.1297G >一

华法林抗

rs12777823G > A *

N /一个

华法林的敏感性

* rs12777823G >是一个基因间的单核苷酸变异(SNV)

华法林剂量可能需要调整根据确定的基因型和表型预测。患者华法林高灵敏度可能受益于大大降低华法林剂量或过渡到另一个类似的药物。(2)同样,在罕见的情况下,个人VKORC1华法林抗变异,可能需要更高的华法林剂量或可能受益于选择另一种药物。

参考价值
描述参考区间和附加信息的解释测试结果。可能包括在适当的时间间隔根据年龄和性别。间隔Mayo-derived,除非另有指定。如果一个提供解释报告,参考价值字段将这个状态。

一个将提供解释报告。

解释
提供信息,协助解释测试结果

将提供一份解释报告,包括试验信息,基因型和解释说明病人的预测华法林的回应。

CYP2C9CYP4F2与明星相关的等位基因,基因型,分配使用标准的等位基因命名为Pharmacogene变异(PharmVar)发表的财团。(5)

个人没有被改变CYP2C9CYP4F2将被指定为CYP2C9 * 1 / * 1CYP4F2 * 1 / * 1

额外的信息关于基因药物基因组学及其相关药物,明白了药物基因组学关联表在特殊的指令。这个资源还包括关于酶抑制剂和诱导物的信息,以及潜在的替代药物的选择。

个人1或多个基因的变异测试的试验可能需要更频繁的监测国际标准化比率(INR)保持印度卢比在目标范围内。

药物之间的相互作用和药物/代谢物抑制华法林处方时必须考虑。华法林代谢可能是通过抑制药物之间的相互作用,包括胺碘酮和一些他汀类药物。是很重要的解释结果的测试和剂量调整的背景下,肝和肾功能和患者年龄。

注意事项
讨论了条件,可能会导致诊断的混乱,包括样本收集和处理不当,不恰当的测试选择、干扰物质

可能包含供体DNA样本如果获得病人non-leukoreduced输血或同种异体造血干细胞移植。样本获得的结果在这种情况下不可能准确反映出接收方的基因型。对于那些接受输血,基因型通常在6周内恢复的收件人。收到的人同种异体造血干细胞移植,移植前DNA标本建议进行测试。

CYP2C9,VKORC1 CYP4F2,和rs12777823基因测试结果接受肝移植的患者可能不准确地反映病人的CYP2C9VKORC1的地位。

这种方法可能无法检测所有变异影响华法林敏感性或耐药性。因此,没有检测到变异并不排除这种可能性,一个病人有一个改变CYP2C9或VKORC1代谢由于用这种方法不能检测到的其他变体。此外,当两个或更多变异得到识别,顺式/反式-状态(是否相同或相反的染色体的变异)并不总是知道的。

临床参考
对临床性质的深入阅读的建议

1。奥尔登堡J,贝CG、穆勒CR Watzka M:复合维生素K环氧还原酶亚基1 (VKORC1):关键蛋白质维生素K的周期。Antioxid氧化还原信号。2006;8 (3 - 4):347 - 353。doi: 10.1089 / ars.2006.8.347

2。Watzka M,盖森C,贝CG, et al: 13小说VKORC1突变与口服抗凝剂相关的阻力:洞察改善病人的诊断和治疗。J Thromb Haemost。2011; 9 (1): 109 - 118。doi: 10.1111 / j.1538-7836.2010.04095.x

3所示。元,为什么陈JJ,李太,et al:功能性VKORC1启动子多态性与inter-individual华法林的敏感性和种族间的差异。哼摩尔麝猫。2005;14 (13):1745 - 1751。doi: 10.1093 /物流/ ddi180

4所示。头盖EA,汗TI,魏恩哈,等:CYP2C9和VKORC1遗传多态性和病人的影响特征在华法林剂量要求:建议新给药方案。血。2005;106 (7):2329 - 2333。doi: 10.1182 / - 2005 - 03 - 1108血

5。PharmVar: Pharmacogene变异财团。2021年3月3日更新。2021年3月22日通过。可以在www.pharmvar.org/gene/CYP2C9

6。约翰逊JA,粥汤客,龚L, et al:临床药物基因学实现联盟(集团)指导pharmacogenetics-guided华法林剂量:2017更新。中国新药杂志。2017;102 (3):397 - 404。doi: 10.1002 / cpt.668

7所示。佩妈,Cavallari LH Limdi NA,等。基因变异与华法林剂量在非洲裔美国人:全基因组关联研究。柳叶刀》。2013;382 (9894):790 - 796。doi: 10.1016 / s0140 - 6736 (13) 60681 - 9

8。麦当劳MG, Rieder MJ, Nakano M,夏朝CK, Rettie AE: CYP4F2维生素K1氧化酶:解释了改变华法林剂量V433M运营商的变体。摩尔杂志。2009;75 (6):1337 - 1346。doi: 10.1124 / mol.109.054833

9。Warfarindosing.org。华盛顿大学;2020年10月14日通过。可以在www.warfarindosing.org/Source/Home.aspx

10。U。年代National Library of Medicine: DailyMed. National Institutes of Health; Accessed October 14, 2020. Available at https://dailymed.nlm.nih.gov/dailymed/index.cfm

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法描述
描述如何执行测试并提供method-specific参考

从全血中提取基因组DNA或唾液。多用于执行等位基因用聚合酶链反应(PCR)的5 '核酸酶试验。荧光标记检测DNA探针退火到目标。PCR用于放大部分的DNA包含变种。如果检测探针是精确匹配目标DNA, 5 '核酸酶聚合酶降解调查,记者染料释放的影响淬火染料,荧光信号检测。基因型分配基于allele-specific荧光信号检测。(说明书:TaqMan SNP基因分型检测用户指南;应用生物系统公司;修订格04/2014)

PDF报告
表明报告包括一个额外的文档是否与图表、图像或其他丰富的信息

没有

天(s)
概述了天测试执行。这个领域反映了天,样品必须在测试实验室开始测试过程,包括任何样品制备和测试执行之前处理时间。列出了一些测试,不断进行,这意味着化验白天多次执行。

星期一到星期五

报告可用
时间的间隔(收到样品在梅奥诊所实验室结果可用)考虑标准设置和周末。yabo208第一天的时间通常是结果可用。最后一天的时间可能需要,占任何必要的重复测试。

3 - 10天

样品保留时间
轮廓的时间在测试标本保存在实验室之前就会被丢弃

全血/口水拭子:2周;提取的DNA: 2个月

执行实验室的位置
表明实验室的位置执行测试

罗彻斯特

费用
几个因素决定执行一个测试的费用收取。联系你的美国或国际区域经理建立费用表的信息或了解更多关于资源优化测试的选择。

  • 授权用户可以登录测试价格费用的详细信息。
  • 客户没有测试价格可以联系亚搏一天24小时,一周7天。
  • 潜在客户应该联系他们的区域经理。寻求帮助,请联系亚搏

测试的分类
提供信息关于医疗器械分类为实验室测试工具和试剂。测试可以分为清除或通过美国食品和药物管理局(FDA)和每个制造商使用说明,或产品,不接受FDA审查和批准,并贴上一个分析物特定试剂(ASR)产品。

这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。

CPT编码信息
提供指导在决定适当的当前程序的术语(CPT)代码(s)为每个测试或概要信息。梅奥诊所上市CPT编码反映实验室的解释CPT编码需求。yabo208每个实验室有责任来确定正确的CPT编码用于计费。

CPT编码由执行实验室提供。

0030 u

LOINC®信息

测试Id 测试顺序的名字 订单LOINC价值
WARSQ 华法令阻凝剂反应基因型,V 93196 - 4
结果Id 测试结果的名字 结果LOINC值
结果LOINC值提示
610175年 华法林CYP2C9基因型 46724 - 1
610176年 华法林VKORC1启动子基因型 50722 - 8
610560年 华法林CYP2C9和VKORC1子表型 54451 - 0
610177年 华法林抗变异 50722 - 8
614410年 华法林VKORC1抗性基因型 50722 - 8
610178年 华法林CYP4F2 * 3基因型 93197 - 2
610179年 华法林rs12777823基因型 93198 - 0
610180年 解释 69047 - 9
610181年 额外的信息 48767 - 8
610182年 方法 85069 - 3
610183年 免责声明 62364 - 5
610184年 看过的 18771 - 6

测试设置资源

设置文件
测试设置信息包含测试文件定义支持订单细节和结果之间的接口梅奥诊所实验室和实验室信息系统。yabo208

Excel|Pdf

样品报告
正常和异常样本报告作为参考提供报告的外观。

正常的报告|异常报告

如果样品报告
国际体系(SI)的单位报告提供有限数量的测试。这些报告仅用于国际帐户,只可以通过MayoLINK账户已定义接收他们。

如果正常的报告|如果异常报告