识别患者可能需要华法林剂量调整(3,4)包括:
病人开始在华法林的第一个处方
患者此前规定的华法林和需要多个剂量调整维护国际标准化比率在目标范围内
史的患者血栓或出血时服用华法林
这个测试是用来评估的CYP2C9,VKORC1,CYP4F2,rs12777823变异影响华法林代谢(香豆素)。这个试验应该下令在患者首次接受华法林或正在经历困难的人在维护国际标准化比率(INR)治疗范围。
实时聚合酶链反应(PCR)分析等位基因歧视
2 c9
香豆素基因型
CYP4F2
细胞色素P450 2 c9 CYP2C9基因分型
rs 12777823
维生素K环氧还原酶亚基1
维生素K基因型(VKORC1)
VKORC1
华法林的基因型
华法林抗
华法林的敏感性
不同
如果病人使用药物华法林以外,测试2 c9qt /细胞色素P450的首选2 c9基因型不同,测试的CYP2C9基因。
测试是可用的单基因试验(测试)或作为一个重点药物基因组学小组的一部分,其中包括测试以下基因:CYP年代1 a2, 2 c9 2 c19 2 d6, 3 a4、a5, 4 f2, SLCO1B1,和VKORC1。秩序PGXQP /重点药物基因组学面板中,如果多个药物基因组学不同基因型检测。
多个基因测试可以执行一个单一萃取后标本。看到多个基因型测试列表在特殊说明的测试列表可以一起订购。
提交以下标本:只有1
样品类型:全血
容器/管:薰衣草(EDTA)
样品数量:3毫升
收集产品说明:
1。反几次混合血。
2。在原始管发送样品。
样品稳定性信息:环境(首选)9天/冷藏30天
样品类型:唾液
病人准备:病人不能吃、喝、吸烟或嚼口香糖30分钟前集合。
供应:唾液拭子采集设备(T786)
样品数量:1拭子
收集产品说明:收集和发送样品每箱指令。
样品稳定性信息:周围30天
样品类型:中提取DNA
容器/管:2毫升螺旋管
标本体积:100制程(每毫升)
收集产品说明:
1。首选的体积是100制程50 ng /制程的浓度。
2。包括浓度和体积管。
样品稳定性信息:冷冻(首选)/环境/冷藏
1。纽约Clients-Informed同意是必需的。请求的文档形式或电子订单,一份文件。下列文件中可用的特别指示:
- - - - - -基因检测的知情同意(T576)
- - - - - -为遗传Testing-Spanish知情同意(T826)
2。如果不是电子订购,完成,打印,发送1以下形式的标本:
- - - - - -神经病学专业测试客户端测试的要求(T732)
血:0.4毫升
唾液:1拭子
标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
---|---|---|---|
不同 | 变化(首选) |
识别患者可能需要华法林剂量调整(3,4)包括:
病人开始在华法林的第一个处方
患者此前规定的华法林和需要多个剂量调整维护国际标准化比率在目标范围内
史的患者血栓或出血时服用华法林
这个测试是用来评估的CYP2C9,VKORC1,CYP4F2,rs12777823变异影响华法林代谢(香豆素)。这个试验应该下令在患者首次接受华法林或正在经历困难的人在维护国际标准化比率(INR)治疗范围。
华法林是Coumarin-based药物通常用于抗凝治疗预防血栓由于遗传和后天止血紊乱。药物也被运用于其他医疗条件和治疗包括心房纤颤和髋关节置换手术。华法林作用通过干扰维生素K的新陈代谢,这是凝固生产所必需的关键因素。华法令阻凝剂抑制维生素K回收通过阻断其新陈代谢维生素K-epoxide中间;从而减少可用的维生素k .华法林治疗窗窄;undermedicating增加血栓形成的风险和增加overmedicating脑血管意外的风险。华法林治疗严重药品不良反应率最高的国家之一。
华法林给使用nongenetic因素包括性别,体重,年龄,是由凝固监控测试为了维护国际标准化比率(INR)在特定的范围内。然而,华法林代谢是高度可变,取决于遗传因素。基因变异在3和1基因内轨迹已知影响华法林的新陈代谢和保持所需的剂量正确的血清水平和程度的抗凝药物。
的CYP2C9基因编码细胞色素P450 (CYP) 2 c9主要代谢酶,这种酶异构体的华法林(S-warfarin)越活跃不活跃的产品。一些CYP2C9变异导致酶活性降低,可能导致增加血清华法林和overmedicating驾驶上面的INR治疗目标。
第二个基因,VKORC1编码维生素K环氧subunit-1还原酶复杂,一个小跨膜蛋白的内质网的一部分维生素K周期和华法林治疗的目标。(1)维生素K环氧,凝血因子的羧化作用的副产品,是减少维生素KVKORC1。一个VKORC1子变异会导致基因的表达减少,导致减少了可用性的维生素k .这可能导致增加血清华法林和overmedicating,推动INR高于治疗目标。此外,有变化VKORC1导致华法林阻力测试的试验。这些变化是罕见的。
CYP4F2代谢减少维生素K hydroxyl-vitamin K1,从而把它从通路参与凝血因子的激活影响华法林。在那些自认为是非洲以外的祖先,航空公司的CYP4F2 * 3(C.1297G >;rs2108622)变体可能需要一个小(5% - -10%)华法林剂量增加达到治疗目标。
rs12777823G >位于基因内的一个变体CYP2C轨迹10号染色体上。与需要相关联的一个等位基因剂量减少10%至15%的人自认为是被非洲血统。
CYP2C9:
CYP2C9代谢多种药物华法林和苯妥英等。(注意,如果需要测试其他CYP2C9底物,订单2 c9qt /细胞色素P4502 c9基因型,不同。
一些特定的CYP2C9变异导致酶缺陷。以下信息概述变异之间的关系在这个试验发现,它们对酶的活性的影响(表1):
表1:
CYP2C9等位基因
|
互补脱氧核苷酸变化 (NM_000771.3) |
影响酶代谢
|
* 1
|
没有(野生型) |
正常的活动 |
* 2
|
c.430C > T |
减少活动 |
* 3
|
c.1075A > C |
没有活动 |
* 4
|
c.1076T > C |
减少活动 |
* 5
|
c.1080C > G |
减少活动 |
* 6
|
c.818delA |
没有活动 |
* 8
|
c.449G >一 |
减少活动 |
* 9
|
c.752A > G |
正常的活动 |
* 11
|
c.1003C > T |
减少活动 |
* 12
|
c.1465C > T |
减少活动 |
* 13
|
c.269C > T |
没有活动 |
* 14
|
c.374G >一 |
减少活动 |
* 15
|
c.485C >一 |
没有活动 |
* 16
|
c.895A > G |
减少活动 |
* 17
|
c.1144C > T |
减少活动 |
* 18
|
c.1190A > C |
没有活动 |
* 25
|
c.353_362del |
没有活动 |
* 26
|
c.389C > G |
减少活动 |
* 28
|
c.641A > T |
减少活动 |
* 30
|
c.1429G >一 |
减少活动 |
* 33
|
c.395G >一 |
没有活动 |
* 35
|
c.374G > T; c.430C > T |
没有活动 |
VKORC1:
c。- - - - - -1639 promoter variant is located in the second nucleotide of an E-Box (CANNTG), and its presence disrupts the consensus sequence, reducing promoter activity. In vitro experiments show a 44% higher transcription level of the G versus the A allele.(1) The c.-1639G>A nucleotide change results in decreased gene expression and reduced enzyme activity. This test also determines the genotype for multiple other loci withinVKORC1已经与华法林电阻有关。这些变化的机制导致华法林阻力并不清楚。
表2:额外的变异测试
基因/ SNV
|
互补脱氧核苷酸变化 (VKORC1NM_024006.5;CYP4F2NM_001082.4) |
影响酶代谢
|
VKORC1
|
c - 1639 g > A |
华法林的敏感性 |
VKORC1
|
c.85G > T |
华法林抗 |
VKORC1
|
c.106G > T |
华法林抗 |
VKORC1
|
c.121G > T |
华法林抗 |
VKORC1
|
c.134T > C |
华法林抗 |
VKORC1
|
c.172A > G |
华法林抗 |
VKORC1
|
c.196G >一 |
华法林抗 |
VKORC1
|
c.358C > T |
华法林抗 |
VKORC1
|
c.383T > G |
华法林抗 |
CYP4F2 * 3
|
c.1297G >一 |
华法林抗 |
rs12777823G > A * |
N /一个 |
华法林的敏感性 |
* rs12777823G >是一个基因间的单核苷酸变异(SNV)
华法林剂量可能需要调整根据确定的基因型和表型预测。患者华法林高灵敏度可能受益于大大降低华法林剂量或过渡到另一个类似的药物。(2)同样,在罕见的情况下,个人VKORC1华法林抗变异,可能需要更高的华法林剂量或可能受益于选择另一种药物。
一个将提供解释报告。
将提供一份解释报告,包括试验信息,基因型和解释说明病人的预测华法林的回应。
的CYP2C9和CYP4F2与明星相关的等位基因,基因型,分配使用标准的等位基因命名为Pharmacogene变异(PharmVar)发表的财团。(5)
个人没有被改变CYP2C9或CYP4F2将被指定为CYP2C9 * 1 / * 1或CYP4F2 * 1 / * 1
额外的信息关于基因药物基因组学及其相关药物,明白了药物基因组学关联表在特殊的指令。这个资源还包括关于酶抑制剂和诱导物的信息,以及潜在的替代药物的选择。
个人1或多个基因的变异测试的试验可能需要更频繁的监测国际标准化比率(INR)保持印度卢比在目标范围内。
药物之间的相互作用和药物/代谢物抑制华法林处方时必须考虑。华法林代谢可能是通过抑制药物之间的相互作用,包括胺碘酮和一些他汀类药物。是很重要的解释结果的测试和剂量调整的背景下,肝和肾功能和患者年龄。
可能包含供体DNA样本如果获得病人non-leukoreduced输血或同种异体造血干细胞移植。样本获得的结果在这种情况下不可能准确反映出接收方的基因型。对于那些接受输血,基因型通常在6周内恢复的收件人。收到的人同种异体造血干细胞移植,移植前DNA标本建议进行测试。
CYP2C9,VKORC1 CYP4F2,和rs12777823基因测试结果接受肝移植的患者可能不准确地反映病人的CYP2C9或VKORC1的地位。
这种方法可能无法检测所有变异影响华法林敏感性或耐药性。因此,没有检测到变异并不排除这种可能性,一个病人有一个改变CYP2C9或VKORC1代谢由于用这种方法不能检测到的其他变体。此外,当两个或更多变异得到识别,顺式/反式-状态(是否相同或相反的染色体的变异)并不总是知道的。
1。奥尔登堡J,贝CG、穆勒CR Watzka M:复合维生素K环氧还原酶亚基1 (VKORC1):关键蛋白质维生素K的周期。Antioxid氧化还原信号。2006;8 (3 - 4):347 - 353。doi: 10.1089 / ars.2006.8.347
2。Watzka M,盖森C,贝CG, et al: 13小说VKORC1突变与口服抗凝剂相关的阻力:洞察改善病人的诊断和治疗。J Thromb Haemost。2011; 9 (1): 109 - 118。doi: 10.1111 / j.1538-7836.2010.04095.x
3所示。元,为什么陈JJ,李太,et al:功能性VKORC1启动子多态性与inter-individual华法林的敏感性和种族间的差异。哼摩尔麝猫。2005;14 (13):1745 - 1751。doi: 10.1093 /物流/ ddi180
4所示。头盖EA,汗TI,魏恩哈,等:CYP2C9和VKORC1遗传多态性和病人的影响特征在华法林剂量要求:建议新给药方案。血。2005;106 (7):2329 - 2333。doi: 10.1182 / - 2005 - 03 - 1108血
5。PharmVar: Pharmacogene变异财团。2021年3月3日更新。2021年3月22日通过。可以在www.pharmvar.org/gene/CYP2C9
6。约翰逊JA,粥汤客,龚L, et al:临床药物基因学实现联盟(集团)指导pharmacogenetics-guided华法林剂量:2017更新。中国新药杂志。2017;102 (3):397 - 404。doi: 10.1002 / cpt.668
7所示。佩妈,Cavallari LH Limdi NA,等。基因变异与华法林剂量在非洲裔美国人:全基因组关联研究。柳叶刀》。2013;382 (9894):790 - 796。doi: 10.1016 / s0140 - 6736 (13) 60681 - 9
8。麦当劳MG, Rieder MJ, Nakano M,夏朝CK, Rettie AE: CYP4F2维生素K1氧化酶:解释了改变华法林剂量V433M运营商的变体。摩尔杂志。2009;75 (6):1337 - 1346。doi: 10.1124 / mol.109.054833
9。Warfarindosing.org。华盛顿大学;2020年10月14日通过。可以在www.warfarindosing.org/Source/Home.aspx
10。U。年代National Library of Medicine: DailyMed. National Institutes of Health; Accessed October 14, 2020. Available at https://dailymed.nlm.nih.gov/dailymed/index.cfm
从全血中提取基因组DNA或唾液。多用于执行等位基因用聚合酶链反应(PCR)的5 '核酸酶试验。荧光标记检测DNA探针退火到目标。PCR用于放大部分的DNA包含变种。如果检测探针是精确匹配目标DNA, 5 '核酸酶聚合酶降解调查,记者染料释放的影响淬火染料,荧光信号检测。基因型分配基于allele-specific荧光信号检测。(说明书:TaqMan SNP基因分型检测用户指南;应用生物系统公司;修订格04/2014)
星期一到星期五
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
0030 u
测试Id | 测试顺序的名字 | 订单LOINC价值 |
---|---|---|
WARSQ | 华法令阻凝剂反应基因型,V | 93196 - 4 |
结果Id | 测试结果的名字 | 结果LOINC值
结果LOINC值提示
|
---|---|---|
610175年 | 华法林CYP2C9基因型 | 46724 - 1 |
610176年 | 华法林VKORC1启动子基因型 | 50722 - 8 |
610560年 | 华法林CYP2C9和VKORC1子表型 | 54451 - 0 |
610177年 | 华法林抗变异 | 50722 - 8 |
614410年 | 华法林VKORC1抗性基因型 | 50722 - 8 |
610178年 | 华法林CYP4F2 * 3基因型 | 93197 - 2 |
610179年 | 华法林rs12777823基因型 | 93198 - 0 |
610180年 | 解释 | 69047 - 9 |
610181年 | 额外的信息 | 48767 - 8 |
610182年 | 方法 | 85069 - 3 |
610183年 | 免责声明 | 62364 - 5 |
610184年 | 看过的 | 18771 - 6 |