测试Id:TSCP

结节性硬化症基因小组,各不相同

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

建立一个分子诊断结节性硬化症(TSC)复杂的个人特征。

识别中的致病变种TSC1TSC2相关基因已知TSC,允许预测高危家庭成员的测试。

产前诊断胎儿的超声发现的TSC(如心脏横纹肌)

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

这个测试利用新一代测序检测单核苷酸和拷贝数变异TSC1TSC2基因与结节性硬化症复杂有关。

鉴定致病变种可能协助诊断、预后、临床管理、家族性检查,复发风险评估,并为结节性硬化症复杂遗传咨询。

反射测试
列出测试,可能会或可能不会被执行,在一个额外的费用,根据初始测试的结果和解释。

测试Id 报告名称 可单独购买 总是表现
FIBR 成纤维细胞培养 是的 没有
CRYOB 生物化学研究同行 没有 没有
MATCC 母细胞污染,B 是的 没有
CULAF 羊水文化/基因测试 是的 没有
CULFB 纤维母细胞文化基因测试 是的 没有

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

只对皮肤活检标本:

如果收到皮肤活检,纤维母细胞生化研究文化和低温贮藏将增加额外的费用。

仅供产前标本:

如果一个羊水标本或收到nonconfluent文化,羊水文化/基因测试将被添加一个额外的费用。

任何收到的产前样品,孕产妇细胞污染测试将执行一个额外的费用。

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法名称
一个简短的描述方法用于执行测试

序列捕获和有针对性的下一代测序随后聚合酶链反应(PCR)和Sanger测序。

纽约的状态
表明纽约国家批准的状态,如果测试是公开为纽约州立客户定货。

是的

报告名称
列出了短或缩写为一个测试版本的发布名称

结节性硬化症基因面板

别名
列表附加测试常见的名字,作为一个帮助搜索

次世代测序检测

TSC

结节性硬化症复杂

心脏横纹肌瘤

Lymphangiomyomatosis

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

只对皮肤活检标本:

如果收到皮肤活检,纤维母细胞生化研究文化和低温贮藏将增加额外的费用。

仅供产前标本:

如果一个羊水标本或收到nonconfluent文化,羊水文化/基因测试将被添加一个额外的费用。

任何收到的产前样品,孕产妇细胞污染测试将执行一个额外的费用。

标本类型
描述了标本类型验证测试

不同

订购指南

目标测试(也称为特定站点或已知的变异测试)可发现这种基因变体。看到FMTT /家族突变,有针对性的测试,各不相同。

定制的面板和单基因分析对任何基因出现在这个面板是可用的。看到CGPH /自定义面板中,基因遗传,下一代测序,各不相同。

额外的测试需求

所有产前标本必须伴随着母亲的血液标本;秩序MATCC /母体细胞污染,分子分析,不同的孕产妇标本必须比产前样品不同的订单号。

装船指示

首选标本收集的96小时内到达。

标本要求
定义了执行测试所需的最佳标本和首选的体积来完成测试

病人准备:先前的骨髓移植同种异体的捐赠会干扰测试。电话800-533-1710说明测试的病人接受了骨髓移植手术。

提交以下标本:只有1

样品类型:全血

容器/管:薰衣草(EDTA)或黄色大(ACD)

可以接受的:任何抗凝剂

样品数量:3毫升

收集产品说明:

1。反几次混合血。

2。在原始管发送全血标本。不整除

样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏

标本类型:皮肤活组织检查

供应:成纤维细胞活检传输媒体(T115)

容器/与任何标准细胞培养基:无菌容器(例如,最小的重要媒体,RPMI 1640)。解决方案应该补充青霉素和链霉素为1%。

试样体积:4毫米

样品稳定性信息:冷藏(首选)/环境

附加信息:一个单独的文化电荷将评估在FIBR /纤维母细胞生化和分子检测,组织。需要一个额外的4周文化成纤维细胞在基因检测可以发生。

标本类型:培养的成纤维细胞

容器/管:T-25瓶

标本体积:2烧瓶

集合指令:提交汇合的培养成纤维细胞从一个来自另一个实验室的皮肤活检。

样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏(< 24小时)

附加信息:一个文化电荷分离将评估在FIBR /纤维母细胞文化生化和分子检测、组织。需要一个额外的4周文化成纤维细胞在基因检测可以发生。

标本类型:血液现货

供应:Card-Blood点集合(过滤纸)(T493)

容器/管:

首选:采集卡(绘画纸蛋白质节省903纸)

可接受的:PerkinElmer 226(原seppo 226)滤纸,或血液点收集卡片(T493)

试样体积:5点血

托收指示:

1。另一个选择才是对病人采血1岁以上是一个手指针刺。1岁以下的婴儿,应该使用一个跟贴。看到干血现货教程集合如何收集血液通过手指针刺点。

2。让干血滤纸在水平位置的环境温度至少3小时。

3所示。不暴露标本高温或阳光直射。

4所示。不叠湿标本。

5。保持标本干燥。

样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏

附加信息:

1。托收指示,请参阅血的地方收集指令

2。托收指示在西班牙,看到的血现货Card-Spanish指令集合(T777)

3所示。托收指示,明白了血现货Card-Chinese指令集合(T800)

4所示。由于低浓度的DNA产生了从血液,可能可能需要额外的标本来完成测试。

样品类型:唾液

病人准备:病人不能吃、喝、吸烟或嚼口香糖30分钟前集合。

供应:唾液拭子采集设备(T786)

样品数量:1拭子

收集产品说明:收集和发送样品每箱指令。

附加信息:由于低浓度的DNA产生唾液,这是可能的,可能需要额外的标本来完成测试。

样品稳定性信息:周围30天

由于产前测试的复杂性,需要与实验室协商所有产前测试。产前样品可以发送星期一到星期四必须收到星期五下午5点CT吗为了妥善处理。所有产前标本必须伴随着母亲的血液标本。订单MATCC /母体细胞污染,分子分析,不同产妇标本。

样品类型:羊水

容器/管:羊水容器

样品数量:20毫升

样品稳定性信息:冷藏(首选)/环境

附加信息:一个单独的文化电荷将评估在CULAF /文化基因检测,羊水。

标本类型:绒膜绒毛

容器/管:15毫升管包含15毫升的传输媒体

样品数量:20毫克

样品稳定性信息:冷藏

附加信息:一个单独的文化电荷将评估在CULFB /纤维母细胞分子测试,绒毛膜/产品的概念。

可以接受的:

样品类型:融合性的培养细胞

容器/管:T-25瓶

样品数量:2烧瓶

收集产品说明:从另一个实验室提交汇合的培养细胞。

样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

形式

1。纽约Clients-Informed同意是必需的。请求的文档形式或电子订单,一份文件。下列文件是可用的:

- - - - - -基因检测的知情同意(T576)

- - - - - -知情同意的基因检测(西班牙语)(T826)

2。分子遗传学:神经病人信息

拒绝原因
识别标本类型和条件可能会导致样品被拒绝

所有标本都被梅奥诊所实验室测试适用性的评价。yabo208

样品稳定性信息
提供了一个描述运输所需的温度进行实验室的标本,替代还包括可接受的温度

标本类型 温度 时间 特种集装箱
不同 变化(首选)

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

建立一个分子诊断结节性硬化症(TSC)复杂的个人特征。

识别中的致病变种TSC1TSC2相关基因已知TSC,允许预测高危家庭成员的测试。

产前诊断胎儿的超声发现的TSC(如心脏横纹肌)

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

这个测试利用新一代测序检测单核苷酸和拷贝数变异TSC1TSC2基因与结节性硬化症复杂有关。

鉴定致病变种可能协助诊断、预后、临床管理、家族性检查,复发风险评估,并为结节性硬化症复杂遗传咨询。

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

只对皮肤活检标本:

如果收到皮肤活检,纤维母细胞生化研究文化和低温贮藏将增加额外的费用。

仅供产前标本:

如果一个羊水标本或收到nonconfluent文化,羊水文化/基因测试将被添加一个额外的费用。

任何收到的产前样品,孕产妇细胞污染测试将执行一个额外的费用。

临床信息
讨论了生理学、病理生理学和一般临床方面,与实验室测试

结节性硬化症(TSC)是一种常染色体显性遗传神经皮肤疾病与致病性变异有关TSC1TSC2基因。TSC涉及多个器官系统包括皮肤(血管纤维瘤,低黑色素斑点、粗糙补丁),大脑(皮层块茎,室结节和巨细胞星形细胞瘤,癫痫包括婴儿痉挛症),肾脏血管肌脂肪瘤,心脏横纹肌瘤,眼睛视网膜(多个结节性错构瘤)和肺(lymphangioleiomyomatosis)。TSC也可能与孤独症相关,认知障碍和精神困境。中枢神经系统肿瘤发病率和死亡率的主要原因。

大约三分之一的TSC患者有一个影响家长,和三分之二的结果发生新创致病变种。外显率虽然完整,TSC与表型的重要国际米兰,家庭内部的变化。

参考价值
描述参考区间和附加信息的解释测试结果。可能包括在适当的时间间隔根据年龄和性别。间隔Mayo-derived,除非另有指定。如果一个提供解释报告,参考价值字段将这个状态。

一个将提供解释报告。

解释
提供信息,协助解释测试结果

所有检测到变异评估根据美国大学医学遗传学和基因组学(ACMG)建议。(1)基于已知变异进行分类,预测,或可能的致病性和报告详细注释解释他们的潜在的或已知的意义。

注意事项
讨论了条件,可能会导致诊断的混乱,包括样本收集和处理不当,不恰当的测试选择、干扰物质

临床相关性:
测试结果应解释在临床中发现,家族史和其他实验室数据。误解的结果可能发生如果提供的信息不准确或不完整的。

如果测试执行,因为临床上重要的家族史,这第一个测试通常是很有用的一个家庭成员的影响。检测可报告的变体的影响家庭成员将允许更多的信息检测的高危个体。

讨论额外的可用性测试选项或协助解释这些结果,梅奥诊所实验室遗传顾问800-533-1710联系。yabo208

技术上的限制:
下一代测序可能无法检测所有类型的基因变异。在极少数情况下,可能出现假阴性或假阳性结果。的深度报道可能变量对于一些目标区域;分析性能低于最低可接受的标准或失败的地区将会指出。考虑到这些限制,负面结果不排除遗传性疾病的诊断。如果一个特定的临床障碍被怀疑,可以被认为是评价的替代方法。

可能存在不能有效地评价区域的基因测序或删除和重复分析由于技术的局限性分析,包括区域的同源性、高guanine-cytosine (GC)内容,和重复序列。确认选择可报告的变异将由替代方法基于内部实验室标准。

这个测试是验证检测95%的删除75个碱基对47英国石油(bp)和插入。缺失插入(利林)40岁以上的英国石油公司,包括移动元素插入,可能不如小利林可靠地检测到。

删除/复制分析:

这种分析目标单一和multi-exon删除/复制;然而,在某些情况下单一外显子决议不能实现减少由于孤立序列覆盖或固有的基因组的复杂性。平衡结构重组(如易位和反演)可能不能被检测到。

这个测试不是为了检测低水平的镶嵌性或区分体细胞和生殖系变异。是否有可能检测到变异体细胞,额外的测试可能需要澄清的结果的意义。

基因可能是添加或删除基于更新的临床意义。关于基因的特定性能的详细信息和技术的局限性,看到方法描述或实验室基因顾问联系。

如果病人有同种异体造血干细胞移植或最近的异种输血,结果可能是不准确的,由于供体DNA的存在。叫梅奥诊所yabo208实验室说明测试的病人接受了骨髓移植手术。

变异的重新分类:
此时,它不是标准实践的实验室系统地回顾之前定期分类变量。实验室鼓励卫生保健提供者随时联系实验室学习特定的变体的分类可能已经改变了。由于扩大遗传知识,有可能是实验室可能会发现新的信息相关的病人。应该说发生在实验室可能发布一份报告。

变体的评估:
执行评估和分类变量使用发表美国大学医学遗传学和基因组学和分子病理学协会作为指导原则建议。(1)其他gene-specific指南也可以考虑。基于已知变异进行分类,预测,或可能的致病性和报告详细注释解释他们的潜在的或已知的意义。变异分为良性或可能良性不报道。

多在网上评估工具可以用来帮助解释这些结果。预测的准确性由在硅片评估工具是高度依赖于数据对于一个给定的基因,并定期更新这些工具可能导致预测随时间变化的。结果在网上评估工具进行解释时应特别谨慎和专业临床判断。

很少,偶然的发现或二次发现可能影响另一个倾向或活动性疾病的存在。这些发现将仔细审查,以确定他们是否会报道。

临床参考
对临床性质的深入阅读的建议

1。理查兹,阿齐兹N,贝尔,et al:标准和指导方针的序列变异的解释:一个联合一致推荐的美国大学医学遗传学和基因组学和分子病理学协会。地中海麝猫。2015年5月,17 (5):405 - 424。doi: 10.1038 / gim.2015.30

2。贝蒂H, Aronow M, Bebin E, et al:更新国际结节性硬化症复杂的诊断标准和监测和管理建议。Pediatr神经。2021年10月,123:50 - 66。doi: 10.1016 / j.pediatrneurol.2021.07.011

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法描述
描述如何执行测试并提供method-specific参考

下一代测序(上天)和/或执行Sanger测序检测中存在变异基因的编码区和内含子/外显子边界分析,以及一些其他地区已知致病变种。人类基因组参考GRCh37 / hg19构建用于序列读一致性。至少99%的基地覆盖在阅读的深度超过30 x。灵敏度是单核苷酸变异估计在99%以上,94%以上为删除/插入(利林)不到40碱基对(bp), 95%以上为删除75个基点,并插入47个基点。门店和/或聚合酶链反应(PCR)的定量方法来测试执行删除和复制的基因分析。

可能存在不能有效地评价区域的基因测序或删除和重复分析由于技术的局限性分析,包括区域的同源性、高guanine-cytosine (GC)内容,和重复序列。(未发表的梅奥法)

基因分析:TSC1, TSC2

PDF报告
表明报告包括一个额外的文档是否与图表、图像或其他丰富的信息

补充

天(s)
概述了天测试执行。这个领域反映了天,样品必须在测试实验室开始测试过程,包括任何样品制备和测试执行之前处理时间。列出了一些测试,不断进行,这意味着化验白天多次执行。

不同

报告可用
时间的间隔(收到样品在梅奥诊所实验室结果可用)考虑标准设置和周末。yabo208第一天的时间通常是结果可用。最后一天的时间可能需要,占任何必要的重复测试。

28日至42天

样品保留时间
轮廓的时间在测试标本保存在实验室之前就会被丢弃

全血:2周(如果可用);提取的DNA: 3个月;血液,唾液,培养成纤维细胞,皮肤活检,脐带血,羊水,培养amniocytes,绒毛膜绒毛,培养绒毛膜:1个月

执行实验室的位置
表明实验室的位置执行测试

罗彻斯特

费用
几个因素决定执行一个测试的费用收取。联系你的美国或国际区域经理建立费用表的信息或了解更多关于资源优化测试的选择。

  • 授权用户可以登录测试价格费用的详细信息。
  • 客户没有测试价格可以联系亚搏一天24小时,一周7天。
  • 潜在客户应该联系他们的区域经理。寻求帮助,请联系亚搏

测试的分类
提供信息关于医疗器械分类为实验室测试工具和试剂。测试可以分为清除或通过美国食品和药物管理局(FDA)和每个制造商使用说明,或产品,不接受FDA审查和批准,并贴上一个分析物特定试剂(ASR)产品。

这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。

CPT编码信息
提供指导在决定适当的当前程序的术语(CPT)代码(s)为每个测试或概要信息。梅奥诊所上市CPT编码反映实验室的解释CPT编码需求。yabo208每个实验室有责任来确定正确的CPT编码用于计费。

CPT编码由执行实验室提供。

81406年

81407年

81265年孕产妇细胞污染(如果合适的话)

88233 -组织培养、皮肤、固体组织活检(如果合适的话)

88235 -羊水文化(如果合适的话)

88240 -低温贮藏(如果合适的话)

LOINC®信息
提供指导在确定逻辑观察标识符名称和代码(LOINC)值的顺序和结果代码的测试。LOINC表演实验室提供的值。

测试Id 测试顺序的名字 订单LOINC价值
TSCP 结节性硬化症基因面板 34650 - 2
结果Id 测试结果的名字 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
616538年 测试描述 62364 - 5
616539年 标本 31208 - 2
616540年 31208 - 2
616541年 结果总结 50397 - 9
616542年 结果 82939 - 0
616543年 解释 69047 - 9
616544年 资源 过程中
616545年 额外的信息 48767 - 8
616546年 方法 85069 - 3
616547年 基因分析 48018 - 6
616548年 免责声明 62364 - 5
616549年 发布的 18771 - 6

测试设置资源

设置文件
测试设置信息包含测试文件定义支持订单细节和结果之间的接口梅奥诊所实验室和实验室信息系统。yabo208

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样品报告
正常和异常样本报告作为参考提供报告的外观。

正常的报告|异常报告

如果样品报告
国际体系(SI)的单位报告提供有限数量的测试。这些报告仅用于国际帐户,只可以通过MayoLINK账户已定义接收他们。

如果正常的报告|如果异常报告