识别特拉革兰氏阴性杆菌窝藏的载体肺炎克雷伯菌"或新德里金属-β-内酰胺酶的基因
检测肺炎克雷伯菌"(KPC)和新德里金属-β-内酰胺酶(NDM) DNA(与抗菌素耐药性)perirectal /直肠肛周的/肛门拭子或粪便标本。
实时聚合酶链反应(PCR)使用LightCycler和荧光共振能量转移(FRET)
不同
这个试验应该用于监视测试perirectal /直肠/肛周的,肛门拭子或粪便标本。如果从文化测试隔离,订单KPNRP / KPC (blaKPC)和NDM (blaNDM)在革兰氏阴性杆菌,分子检测、PCR,各不相同。
标本来源是必需的。
放大的高灵敏度聚合酶链反应需要的标本处理在一个环境污染的标本肺炎克雷伯菌"或新德里金属-β-内酰胺酶DNA不太可能。
提交以下标本:只有1
首选:
样品类型:肛周的,肛交,perirectal,直肠
供应:Culturette(洗液文化棍)(T092)
容器/管:文化运输拭子(涤纶或人造丝拭子与铝或塑料轴用斯图尔特或定制的液体培养基中)
样品数量:拭子
样品稳定性信息:冷藏(首选)/冻结
可以接受的:
样品类型:保存粪便
供应:文化和敏感性凳子运输瓶(T058)
容器/管:商用运输系统特定的肠道病原体的复苏从粪便标本(15毫升含酚红的无营养的传输介质作为酸碱指示剂,Cary-Blair或Para-Pak C和S瓶)
样品数量:代表的粪便
收集产品说明:
1。采集新鲜粪便和提交1克或5毫升集装箱的运输介质。
2。防腐剂在2小时内粪便的收集。
样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏
如果不是电子订购,完成,打印和发送微生物测试请求(T244)标本。
看到标本要求
E-swab 藻酸钙拭子 Cotton-tipped拭子 拭子中发送凝胶传输介质 拭子中发送病毒或最普遍的交通工具 |
拒绝 |
标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
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不同 | 变化(首选) |
识别特拉革兰氏阴性杆菌窝藏的载体肺炎克雷伯菌"或新德里金属-β-内酰胺酶的基因
T疾病控制和预防中心建议影响监控检测未被殖民的患者可能是一个潜在来源为特拉(耐药)肠杆菌科(CRE)传播。这种监测测试可能集中在某些高风险设置或病人组(如重症监护病房,长期急症护理,患者从区域或设施转移高患病率CRE)或感染控制调查疫情。Nonsusceptibility在革兰氏阴性杆菌通过碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌" (KPC)或新德里金属-β-内酰胺酶(NDM)正变得越来越普遍。的基因blaKPC和bla分别的NDM编码KPC和NDM酶生产,。聚合酶链反应测试是一个敏感的、具体的和快速的方法识别病人CRE-harboring殖民blaKPC或bla的NDM。
负
这个聚合酶链反应(PCR)测试检测和区分blaKPC和bla在监视的NDM标本(perirectal /直肠/肛周的/肛门拭子或粪便)。一个积极的肺炎克雷伯菌" (KPC)和/或新德里金属-β-内酰胺酶(NDM) PCR结果表明,病人是由革兰氏阴性杆菌(革兰氏阴性杆菌)殖民窝藏"基因,blaKPC和/或bla分别的NDM。
阴性结果表明没有检测DNA。
假阴性结果可能发生由于抑制聚合酶链反应,序列变化潜在的引物和探针,或的存在blaKPC或bla的NDM基因数量低于试验的检测极限。
性能的分析证明了在perirectal拭子和粪便标本(30积极和30 -每个标本类型)与量化heat-killed细菌携带bla的NDM或bla原谅。的敏感性和特异性飙升粪便样本的100%blaNDM和blaKPC;为perirectal棉签的敏感性和特异性分别为93%和100%,分别blaKPC和100%和100%,分别bla的NDM。检测的试验有以下限制perirectal拭子和凳子,分别为:blaKPC 9和90 CFU /微升bla1.9和1.9的NDM CFU /微升。
此外,33直肠拭子标本之前包含分离的特点肺炎克雷伯菌" (KPC)聚合酶链反应(PCR)阳性肠杆菌科使用洛兰的方法(1)测试由梅奥诊所KPC和新德里金属-β-内酰胺酶(NDM) PCR分析。与预期结果完全一致。
1。洛兰Calvert K, K,赢得了年代,克拉克J,海登马克:直接厄他培南磁盘识别KPC-producing筛查方法肺炎克雷伯菌和大肠杆菌在监测拭子标本中国Microbiol。2010;48:836 - 841。doi: 10.1128 / JCM.01988-09。
2。新的特拉肠杆菌科保证医疗服务提供者采取额外的行动。疾病控制和预防中心健康警报网络,2013年2月14日
3所示。坎宁安SA Vasoo年代,科恩PC, et al:比较直接和broth-enriched PCR, HardyCHROM ESBL和CDC法检测肺炎克雷伯菌"马车在监测直肠拭子。摘要第九抗菌药物国际研讨会和阻力,吉隆坡,马来西亚。2013年3月13 - 15日
Perirectal拭子处理中和缓冲管和生物体的细胞溶解释放他们的基因材料。粪便标本进行DNA提取前聚合酶链反应(PCR)。这个试验放大和检测到一个特定的基因编码的一部分肺炎克雷伯菌" (KPC)和新德里金属-β-内酰胺酶(NDM)的酶。LightCycler仪器放大和监控目标核酸序列中被荧光PCR循环。这是一个自动PCR系统能够迅速发现放大产品开发通过严格的空气缸温度循环和毛细管比色皿。放大产品的检测是基于fluorescent-resonance能量转移(烦恼)原则。担心产品的检测,与供体荧光团杂交探针,荧光素,3 '端是兴奋由外部光源,发光,吸收了第二个杂交探测与受体荧光团LC-Led 610 (blaKPC特定)和LC-red 670 (blaNDM具体),5 '末端。受体荧光团然后发出不同波长的光,可以测量信号正比于特定PCR产品的数量。检测过程是完成在不到1小时使用一个封闭的管道系统。莫尼耶坎宁安SA Noorie T, D,伍德福德N, Patel R:快速同时检测的基因编码肺炎克雷伯菌" (blaKPC)和新德里金属-β内酰胺酶(bla在革兰氏阴性杆菌的NDM)。中国Microbiol 51:66 2013; 69年。doi: 10.1128 / JCM.03062-12)。
星期一到星期五
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
87798 x 2
测试Id | 测试顺序的名字 | 订单LOINC价值 |
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KNSRP | KPC和NDM监视PCR | 85502 - 3 |
结果Id | 测试结果的名字 | 结果LOINC值
结果LOINC值提示
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SRCKP | 标本来源 | 31208 - 2 |
35165年 | KPC PCR | 49617 - 4 |
35166年 | 的NDM PCR | 73982 - 1 |