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测试Id:MTBT

这个测试顺序

结核分枝杆菌复杂,分子检测、PCR、石蜡、组织

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概述

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有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

快速检测的首选方法结核分枝杆菌复杂的DNA formalin-fixed,石蜡包埋组织标本

检测米肺结核复杂的

PCR分析是不用于潜伏性结核和的检测不能使用代替测试用于检测潜在的结核病,如结核菌素皮肤试验(TST /产后抑郁症)或一个γ干扰素释放试验(干扰素释放)。

方法名称
一个简短的描述方法用于执行测试

实时聚合酶链反应(PCR)

纽约的状态
表明纽约国家批准的状态,如果测试是公开为纽约州立客户定货。

是的

报告名称
列出了短或缩写为一个测试版本的发布名称

MTB复杂的PCR, FFPE

别名
列表附加测试常见的名字,作为一个帮助搜索

抗酸的细菌(AFB)

空军基地(抗酸的杆菌)

杆菌、抗酸的

MTB(结核分枝杆菌)

结核分枝杆菌(MTB)

结核病(肺结核)

结节杆菌:结核分枝杆菌

结核病

标本类型
描述了标本类型验证测试

组织,石蜡

必要的信息

标本来源是必需的。

订单问题和答案

问题ID 描述 答案
SRCTB MTB复杂PCR、FFPE来源

标本要求
定义了执行测试所需的最佳标本和首选的体积来完成测试

扩增的PCR的灵敏度高要求要处理的标本在一个环境污染的标本结核分枝杆菌DNA是不可能的。

首选的石蜡包埋组织块:

供应:组织块容器(T553)

样品类型:Formalin-fixed,石蜡包埋组织块(FFPE)

来源:人体组织

容器/管:组织块

收集产品说明:提交formalin-fixed,石蜡包埋组织块剪切和返回。

可接受的石蜡包埋组织块:

样品类型:Formalin-fixed,石蜡包埋组织块(FFPE)

来源:人体组织

容器/管:无菌容器为每个单独的截口(滚动)。

收集产品说明:执行切片法和五个单独的10微米部分做准备。每个部分(滚动)必须放置在一个单独的无菌容器提交。

试样体积最小
定义样本的数量必须提供一个临床相关的结果取决于测试实验室

看到样品。

拒绝原因
识别标本类型和条件可能会导致样品被拒绝

其他 任何non-FFPE组织块,FFPE幻灯片,FFPE体液

样品稳定性信息
提供了一个描述运输所需的温度进行实验室的标本,替代还包括可接受的温度

标本类型 温度 时间 特种集装箱
组织,石蜡 环境(首选)
冷藏

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

快速检测的首选方法结核分枝杆菌复杂的DNA formalin-fixed,石蜡包埋组织标本

检测米肺结核复杂的

PCR分析是不用于潜伏性结核和的检测不能使用代替测试用于检测潜在的结核病,如结核菌素皮肤试验(TST /产后抑郁症)或一个γ干扰素释放试验(干扰素释放)。

临床信息
讨论了生理学、病理生理学和一般临床方面,与实验室测试

每一年,结核分枝杆菌占了约140万人死亡,负责全球结核病的900万例新诊断病例。M肺结核通过呼吸道传播,从人际传播和有潜力成为许多或所有的抗生素产生抗药性,目前如果抗细菌治疗不及时启动使用。因此,快速、准确的检测M肺结核病人标本的临床和公共健康的重要性。

传统文化的方法通常可以检测到M肺结核在2到3周,虽然可能需要8周的潜伏期在某些情况下。开发的梅奥诊所,这种快速PCR试验检测M肺结核直接从呼吸道标本和其他复杂的DNA标本没有文化和等待增长,因此,结果是可用的同一天收到样品在实验室。分枝杆菌的文化应该被执行除了PCR分析。这个试验是快速但文化增加了灵敏度。PCR分析目标中的一个独特的序列katG存在于成员的基因M肺结核复杂。此外,分析可以检测基因型变异耐异烟肼介导的katG目标,当礼物。

参考价值
描述参考区间和附加信息的解释测试结果。可能包括在适当的时间间隔根据年龄和性别。间隔Mayo-derived,除非另有指定。如果一个提供解释报告,参考价值字段将这个状态。

不适用

解释
提供信息,协助解释测试结果

一个积极的结果表明存在结核分枝杆菌复杂的DNA。的成员M肺结核复杂的分析包括探测到肺结核、米宝,宝卡介苗(BCG)、M africanum M canettii,M microti。内的其他物种M肺结核复杂(如M caprae, M pinnipedii, M mungi理论上)应该被使用的引物和探针序列测定,但是他们并没有被测试。这个试验方法不区分的物种M肺结核复杂。

一个消极的结果表明没有检测到M肺结核复杂的DNA。

耐异烟肼(INH)通过介导的katG变体将报告当观察到但缺乏katG变种并不意味着分离是容易受到异烟肼。还有其他的基因位点除了katG这种药有助于抵抗。

的结果表明,抑制抑制剂存在标本可以预防的检测M肺结核DNA。新的样品可以重新提交下一个新的订单,如果需要的话。

注意事项
讨论了条件,可能会导致诊断的混乱,包括样本收集和处理不当,不恰当的测试选择、干扰物质

这种快速PCR试验检测结核分枝杆菌复杂的核酸,因此不区分可行,疾病相关的生物和核酸持久化之前感染。测试结果应该与病人症状和临床表现作出明确的诊断。

并不排除负面结果的存在M肺结核复杂或活动性疾病,因为生物体可能存在水平低于这个试验的检测极限。

这个测试还没有被研究用于标本与代理antituberculous病人接受治疗,因此,不应该用于确定细菌学的治愈或监控对治疗的反应。现在还不知道多久PCR试验可以保持积极的治疗M肺结核。

这个测试的灵敏度formalin-fixed,石蜡包埋组织大约是63%;因此,额外的测试标本应考虑如果结果从第一个标本是负的。

支持数据

化验分析特异性的决心使用基本的局部比对搜索工具(爆炸)的分析国家生物技术信息中心(NCBI)基因库数据库和未发现序列干扰LightCycler PCR分析。进一步,分析测试使用一组104呼吸道病原体(细菌和病毒),提取并受到LightCycler PCR分析。正如预测的那样,只结核分枝杆菌复杂的检测从这个面板。此外,复合菌群近100种非结核分枝杆菌进行评估使用这个PCR试验和没有大发现。的分析灵敏度分析确定10使用稀释的一系列目标副本/微升结核分枝杆菌上升到呼吸道标本一式三份。

formalin-fixed的抑制率,石蜡包埋组织37% 30飙升标本是积极的(19)。

可以产生两个山峰融化在这个试验。一个熔融峰Tm 64.0度C +或- 2.5度C可以对应于isoniazid-susceptible或isoniazid-resistantM肺结核因此,没有迹象表明异烟肼易感性提供这些隔离。然而,一个隔离融化峰值发生在58.0摄氏度的Tm +或- 2.5度与异烟肼耐药性决定使用肉汤参考方法在100%(26/26)的隔离测试。隔离的Tm峰值58.0摄氏度+或- 2.5摄氏度报告为“积极的、可能的异烟肼耐药性检测。”The PCR result is available 7 to 14 days prior to the broth method and, therefore, may be helpful in selecting appropriate antibiotic therapy for these patients. Confirmation of isoniazid resistance must be ordered if the isolate grows in culture.

临床参考
对临床性质的深入阅读的建议

1。Iseman MD:临床医生指南肺结核。第二版。费城,宾夕法尼亚州。Lippincott威廉姆斯和威尔金斯,2013年

2。疾病控制和预防中心:治疗肺结核、美国胸科学会,疾病预防控制中心和美国传染病学会。MMWR Morb凡人每周代表2003;52(没有。RR-11): 1 - 88

方法描述
描述如何执行测试并提供method-specific参考

标本处理后,基因组DNA提取和纯化基因组DNA放在LightCycler仪器、放大和监控,通过荧光,核苷酸序列的发展目标后PCR循环。一个具体的目标序列的一部分凯特G基因结核分枝杆菌复杂的放大,产生的部分被使用sequence-specific melt-curve分析荧光共振能量转移杂交探针。PCR LightCycler PCR试验是一个封闭的系统,大大减少了潜在的假阳性结果由于标本交叉污染与传统开放系统的PCR或其他像transcription-mediated放大放大方法。(未发表的梅奥法)

PDF报告
表明报告包括一个额外的文档是否与图表、图像或其他丰富的信息

没有

天(s)
概述了天测试执行。这个领域反映了天,样品必须在测试实验室开始测试过程,包括任何样品制备和测试执行之前处理时间。列出了一些测试,不断进行,这意味着化验白天多次执行。

星期一到星期五

报告可用
时间的间隔(收到样品在梅奥诊所实验室结果可用)考虑标准设置和周末。yabo208第一天的时间通常是结果可用。最后一天的时间可能需要,占任何必要的重复测试。

5到7天

样品保留时间
轮廓的时间在测试标本保存在实验室之前就会被丢弃

7天;后这段时间块将被返回给客户端

执行实验室的位置
表明实验室的位置执行测试

罗彻斯特

费用
几个因素决定执行一个测试的费用收取。联系你的美国或国际区域经理建立费用表的信息或了解更多关于资源优化测试的选择。

  • 授权用户可以登录测试价格费用的详细信息。
  • 客户没有测试价格可以联系亚搏一天24小时,一周7天。
  • 潜在客户应该联系他们的区域经理。寻求帮助,请联系亚搏。

测试的分类
提供信息关于医疗器械分类为实验室测试工具和试剂。测试可以分为清除或通过美国食品和药物管理局(FDA)和每个制造商使用说明,或产品,不接受FDA审查和批准,并贴上一个分析物特定试剂(ASR)产品。

这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。

CPT编码信息
提供指导在决定适当的当前程序的术语(CPT)代码(s)为每个测试或概要信息。梅奥诊所上市CPT编码反映实验室的解释CPT编码需求。yabo208每个实验室有责任来确定正确的CPT编码用于计费。

CPT编码由执行实验室提供。

87556 -结核分枝杆菌、复杂、分子检测、PCR、石蜡

LOINC®信息
提供指导在确定逻辑观察标识符名称和代码(LOINC)值的顺序和结果代码的测试。LOINC表演实验室提供的值。

测试Id 测试顺序的名字 订单LOINC价值
MTBT MTB复杂的PCR, FFPE 38379 - 4
结果Id 测试结果的名字 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
SRCTB MTB复杂PCR、FFPE来源 31208 - 2
TBRR FFPE, MTB复杂PCR的结果 38379 - 4

测试设置资源

设置文件
测试设置信息包含测试文件定义支持订单细节和结果之间的接口梅奥诊所实验室和实验室信息系统。yabo208

Excel|Pdf

样品报告
正常和异常样本报告作为参考提供报告的外观。

正常的报告|异常报告

如果样品报告
国际体系(SI)的单位报告提供有限数量的测试。这些报告仅用于国际帐户,只可以通过MayoLINK账户已定义接收他们。

如果正常的报告|如果异常报告