测试Id:ACARP

Acanthamoeba物种分子检测、PCR、眼

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

艾滋病在阿米巴角膜炎的诊断与临床结果

突出了

这个分析的目的是帮助在阿米巴角膜炎的诊断与临床结果。

这个测试也有类似的文化敏感性和特异性,但提供了一个更快速的结果。

Acanthamoeba物种是独立生存的生物,可能发现广泛的环境中。

方法名称
一个简短的描述方法用于执行测试

实时聚合酶链反应(PCR) / TaqMan DNA探针杂交

纽约的状态
表明纽约国家批准的状态,如果测试是公开为纽约州立客户定货。

是的

报告名称
列出了短或缩写为一个测试版本的发布名称

Acanthamoeba物种检测PCR

标本类型
描述了标本类型验证测试

不同

订购指南

虽然没有检测验证实验Acanthamoeba物种的DNA在隐形眼镜从无症状的成年人,这是可能的聚合酶链反应(PCR)检测无症状的殖民/污染,因此,测试应该在无症状的个体被执行

必要的信息

标本来源是必需的。

标本要求
定义了执行测试所需的最佳标本和首选的体积来完成测试

这个测试的首选标本是角膜刮或活检。

提交以下标本:只有1

样品类型:组织、新鲜

来源:

容器/管:无菌容器

样品数量:5 - 10毫米

收集产品说明:提交组织无菌容器1毫升无菌生理盐水,最小的重要媒体(MEM),或病毒传输媒体。

首选的石蜡包埋组织块:

供应:组织块容器(T553)

样品类型:Formalin-fixed,石蜡包埋组织块(FFPE)

来源:

容器/管:组织块

收集产品说明:提交一份FFPE组织块剪切和返回。

可接受的石蜡包埋组织块:

样品类型:Formalin-fixed,石蜡包埋组织块(FFPE)

来源:

容器/管:无菌容器为每个单独的截口(滚动)。

收集产品说明:执行切片法和五个单独的10微米部分做准备。每个部分(滚动)必须放置在一个单独的无菌容器提交。

样品类型:差点崩溃拭子,

来源:眼,眼,角膜

容器/管:无菌容器

样品数量:1毫升

收集产品说明:

1。收集角膜被刮削下使用手术刀或其它尖锐的设备来消除细胞的外层。

2。漂亮的收集装置1毫升无菌生理盐水,最小的重要媒体(MEM),或病毒传输媒体。

3所示。从集合中删除收集设备容器之前提交给实验室。

4所示。标本包含手术刀刀片将被取消。

附加信息:拭子不是首选标本这个测试,并可能产生假阴性结果。标本收集使用木制撑船拭子和钙alginate-tipped棉签将被取消。

样品类型:隐形眼镜

容器/管:无菌容器

样品数量:整个集合

收集产品说明:

1。整个隐形眼镜在无菌容器1毫升无菌生理盐水,病毒传输媒体,或基本媒体(MEM)。

2。左、右镜片必须提交单独使用多个无菌容器或在原来的隐形眼镜的情况。必须创建多个订单。

3所示。显示左或右的标本来源。

样品类型:隐形眼镜的情况下没有镜片

容器/管:无菌容器

样品数量:1毫升溶液或整个情况

附加信息:

1。根据类型的情况下提交,可能需要单独测试右和左室。必须创建多个订单。

2。显示左或右的标本来源。

形式

如果不是电子订购,完成,打印和发送微生物测试请求(T244)标本。

试样体积最小
定义样本的数量必须提供一个临床相关的结果取决于测试实验室

活检组织:5毫米

屑:0.5毫升

隐形眼镜解决方案在隐形眼镜的情况下:1毫升

拒绝原因
识别标本类型和条件可能会导致样品被拒绝

钙alginate-tipped擦洗木拭子运输含有凝胶拭子标本包含手术刀叶片无污点的幻灯片 拒绝

样品稳定性信息
提供了一个描述运输所需的温度进行实验室的标本,替代还包括可接受的温度

标本类型 温度 时间 特种集装箱
不同 冷藏(首选) 7天
7天

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

艾滋病在阿米巴角膜炎的诊断与临床结果

临床信息
讨论了生理学、病理生理学和一般临床方面,与实验室测试

Acanthamoeba无处不在,生活无拘束的,微观的阿米巴原虫引起罕见,但严重的感染,皮肤、肺和中枢神经系统(CNS)。他们发现在全球水和土壤,可能通过吸入进入人体,污染的伤口,和隐形眼镜使用。多达24种组成18个基因型(T1-T18)描述,尽管大多数人类感染是由于基因型T4。考虑到他们在环境中广泛分布,许多人将会暴露Acanthamoeba在他们的一生中,但很少会生病的风险。

最常见的形式Acanthamoeba感染阿米巴角膜炎(AK)。感染主要发生在戴隐形眼镜的使用者由于镜片污染,清洁的解决方案,或存储情况。阿米巴原虫也可以进入角膜创伤后。AK党是一个痛苦的、亚急性角膜感染与广泛的疤痕,如果未经处理的失明。通常情况下应对治疗但复发是很常见的。相比,角膜感染、中枢神经系统的参与是罕见的,主要在免疫系统严重受损患者,如器官移植受者和艾滋病患者。中枢神经系统感染引起的也可能是相关的变形虫,Balamuthia mandrillaris

正义与发展党通常是根据症状和临床疑似共焦眼科检查。确认感染角膜组织的显微镜检查确认的传统和文化,隐形眼镜或设备使用自来水琼脂板表面阿米巴原虫和细菌作为食物来源。不幸的是,它必须举行了7天的最大灵敏度。聚合酶链反应测定提供了一种更快速的结果与文化敏感性相似,因此,确认AK的临床诊断的首选方法。

参考价值
描述参考区间和附加信息的解释测试结果。可能包括在适当的时间间隔根据年龄和性别。间隔Mayo-derived,除非另有指定。如果一个提供解释报告,参考价值字段将这个状态。

解释
提供信息,协助解释测试结果

一个积极的结果表明存在Acanthamoeba物种的DNA和符合活跃或近期感染。而积极的结果是高度特定疾病的指标,他们应该与症状,临床发现,和共焦眼科检查。

注意事项
讨论了条件,可能会导致诊断的混乱,包括样本收集和处理不当,不恰当的测试选择、干扰物质

虽然这个试验的目的是检测感染症状Acanthamoeba这些独立生存的物种,广泛分布的微观环境中的阿米巴原虫可能污染无生命的物体,如隐形眼镜和案例。因此,它应该用于患者临床病史和眼部症状符合阿米巴角膜炎。

不充分的样本收集或储存不当可能无效的测试结果。

Acanthamoeba物种的DNA可能会检测到一个未知的适当治疗后一段时间。

支持数据

以下试验验证数据支持使用这对临床试验测定。

物种包容性:

Acanthamoeba聚合酶链反应(PCR)分析检测的20种不同的菌株Acanthamoeba导致人类疾病,包括基因型。

/诊断的敏感性和准确性Specificity-Fresh标本:

结果从该PCR试验检测的18 s rRNA基因Acanthamoeba物种相比,文化结果112联系/眼标本。12个标本的积极的文化,11被PCR检测(敏感性92%)。PCR也发现一个额外的2份阳性标本,这都是来自同一病人的临床诊断阿米巴角膜炎(AK),而98年标本负面文化和PCR(特异性为98%)。

/诊断的敏感性和准确性Specificity-Formalin-Fixed石蜡包埋标本:

24 formalin-fixed石蜡包埋组织块(FFPE)归档测试的Acanthamoeba物种PCR检测结果与病理(光显微镜)的诊断。十四的组织的形态学诊断acanthamebic角膜炎;其中,12被PCR阳性(敏感性86%)。十标本负组织病理学和PCR(特异性为100%)。

补充精度数据:

飙升的研究进行使用眼部材料传输媒体(隐形眼镜液,基本媒体),与新鲜组织和FFPE组织越来越多Acanthamoeba基因组DNA在50目标/制程的近似浓度。所有样本被蒙蔽的方式提取和测试。在50个目标/制程,100%的眼材料,新鲜,FFPE组织被PCR阳性。

分析灵敏度/检测极限:

——检测极限(LOD)确定连续稀释的讲究的Acanthamoeba囊肿(计算使用血细胞计数器)被认为是1囊肿/加工样品。

——建立LOD使用基因组DNA飙升到隐形眼镜解决方案/基本传输媒体1.26目标副本/制程。

——建立LOD使用基因组DNA飙升到6.5目标拷贝/毫升新鲜组织矩阵。

——建立LOD使用基因组DNA飙升到5.7 FFPE组织矩阵是目标拷贝/毫升。

分析特异性:

没有PCR信号获得47提取的细菌,病毒,寄生虫和真菌隔离来自相似的生物体或生物标本中常见测试。

精度:

定性的国米,intra-assay精度为100%。所有通道值在2周期的意思。

参考范围:

这个试验的参考范围是“消极”。PCR和文化上执行291隐形眼镜从无症状个人未能发现AcanthamoebaDNA或增长。

然而,PCR检测Acanthamoeba物种殖民由于广泛分布的独立生存的环境中的阿米巴,和PCR测试应该只被用于患者临床病史和眼部症状符合正义与发展党。

可报告范围:

这是一个定性测定,结果报告为有针对性的正面或负面的Acanthamoeba物种。

临床参考
对临床性质的深入阅读的建议

1。Trabelsi H, Dendana Sellami, et al:致病性独立生存的变形虫:流行病学和临床检查。中华医学杂志(巴黎)。2012年12月,60 (6):399 - 405

2。汤普森PP、Kowalski RP,小腿RMQ戈登YJ:验证实验室诊断的实时PCRAcanthamoeba角膜炎。中国Microbiol。2008年10月,46 (10):3232 - 3236

方法描述
描述如何执行测试并提供method-specific参考

执行分析的罗氏LightCycler (LC) 480 II仪器后DNA提取的罗氏麦格纳纯或西门子组织制备系统。LC 480 II仪器是一个自动化仪器放大和显示器的发展目标核酸(扩增子)在每个周期的聚合酶链反应(PCR)。

PCR检测的DNA的目标是一种基因编码核小亚基核糖体18 s rRNA。

PCR混合包含一个特定的正向和反向引物Acanthamoeba物种模板放大和1 TaqMan探针(CY5)。CY5探测器包含一个荧光团(5 ')和冷却器(3 '端)附近;冷却器抑制荧光团的荧光信号探针时完好无损。在探测目标免疫印迹Acanthamoeba18 s rRNA,随后由DNA聚合酶降解5‘3’核酸外切酶活性,导致释放荧光团和生产检测荧光信号。Qvarnstrom Y, Visvesvara GS,斯R, da Silva AJ:多路实时PCR试验的同时检测Acanthamoebaspp,Balamuthia mandrillaris,Naegleria fowleri。中国Microbiol。2006年10月,44 (10):3589 - 3595;康纳利L, Anijeet D,亚历山大CL。描述性的持久Acanthamoeba角膜炎:唤起对这个复杂的眼部疾病。访问Microbiol。2019年11月28日;2 (3):acmi000084)

PDF报告
表明报告包括一个额外的文档是否与图表、图像或其他丰富的信息

没有

天(s)
概述了天测试执行。这个领域反映了天,样品必须在测试实验室开始测试过程,包括任何样品制备和测试执行之前处理时间。列出了一些测试,不断进行,这意味着化验白天多次执行。

星期一到星期六

报告可用
时间的间隔(收到样品在梅奥诊所实验室结果可用)考虑标准设置和周末。yabo208第一天的时间通常是结果可用。最后一天的时间可能需要,占任何必要的重复测试。

2到3天

样品保留时间
轮廓的时间在测试标本保存在实验室之前就会被丢弃

7天

执行实验室的位置
表明实验室的位置执行测试

罗彻斯特

费用
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  • 授权用户可以登录测试价格费用的详细信息。
  • 客户没有测试价格可以联系亚搏一天24小时,一周7天。
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测试的分类
提供信息关于医疗器械分类为实验室测试工具和试剂。测试可以分为清除或通过美国食品和药物管理局(FDA)和每个制造商使用说明,或产品,不接受FDA审查和批准,并贴上一个分析物特定试剂(ASR)产品。

这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。

CPT编码信息
提供指导在决定适当的当前程序的术语(CPT)代码(s)为每个测试或概要信息。梅奥诊所上市CPT编码反映实验室的解释CPT编码需求。yabo208每个实验室有责任来确定正确的CPT编码用于计费。

CPT编码由执行实验室提供。

87798年

测试设置资源

设置文件
测试设置信息包含测试文件定义支持订单细节和结果之间的接口梅奥诊所实验室和实验室信息系统。yabo208

Excel|Pdf

样品报告
正常和异常样本报告作为参考提供报告的外观。

正常的报告|异常报告

如果样品报告
国际体系(SI)的单位报告提供有限数量的测试。这些报告仅用于国际帐户,只可以通过MayoLINK账户已定义接收他们。

如果正常的报告|如果异常报告