测试Id:OVSRP

Oxacillin-Hydrolyzing Beta-Lactamase (blaOXA-48-like)和维罗纳Integron-Encoded监测金属-β-内酰胺酶(blaVIM) DNA, PCR,各不相同

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

识别的载体革兰氏阴性杆菌窝藏oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase (OXA-48-like)或维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶(VIM)基因

突出了

这个测试检测oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase (blaOXA-48-like)和维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶基因(与抗菌素耐药性)perirectal /直肠肛周的/肛门拭子或粪便标本。

方法名称
一个简短的描述方法用于执行测试

实时聚合酶链反应(PCR)使用LightCycler和荧光共振能量转移(FRET)

纽约的状态
表明纽约国家批准的状态,如果测试是公开为纽约州立客户定货。

是的

报告名称
列出了短或缩写为一个测试版本的发布名称

OXA-48和VIM监测PCR

别名
列表附加测试常见的名字,作为一个帮助搜索

碳青霉烯耐药的肠杆菌科

碳青霉烯耐药CRE

"

"生产,碳青霉烯耐药肠杆菌科

CP-CRE

Oxacillinase

OXA

OXA-48

OXA-48-like

VIM

CRE

标本类型
描述了标本类型验证测试

不同

订购指南

这个试验是用于监测测试perirectal /直肠肛周的/肛门拭子或粪便标本。如果测试隔离来自文化,请求OXVRP / Oxacillin-Hydrolyzing Beta-Lactamase (blaOXA-48-like)和维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶(blaVIM)革兰氏阴性杆菌,分子检测、PCR,各不相同。

耐碳青霉烯的其他机制,包括其他carbapenemase-types孔蛋白突变,或hyper-expression射流泵可能导致耐碳青霉烯药物。这些都不是被这个试验。如果检测肺炎克雷伯菌" (KPC)或新德里金属-β-内酰胺酶(NDM),订单KNSRP /肺炎克雷伯菌" (blaKPC)和新德里金属-β-内酰胺酶(bla的NDM)监测、PCR、各不相同。

额外的测试需求

如果检测肺炎克雷伯菌" (KPC)或新德里金属-β-内酰胺酶(NDM)还需要;还命令KNSRP /肺炎克雷伯菌" (blaKPC)和新德里金属-β-内酰胺酶(bla的NDM)监测、PCR、各不相同。

必要的信息

标本来源是必需的。

标本要求
定义了执行测试所需的最佳标本和首选的体积来完成测试

放大的高灵敏度聚合酶链反应需要的标本处理在一个环境污染的标本oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase (blaOXA-48-like)或维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶(blaVIM) DNA是不可能的。

提交以下标本:只有1

首选:

样品类型:肛周的,perirectal、直肠、肛门

供应:Culturette(洗液文化棍)(T092)

容器/管:文化运输拭子(涤纶或人造丝拭子与铝或塑料轴斯图尔特或定制的液体培养基中)

样品数量:拭子

样品稳定性信息:冷藏(首选)/冻结

可以接受的:

供应:C和S瓶(T058)

样品类型:保存粪便

容器/管:商用运输系统特定的肠道病原体的复苏从粪便标本(15毫升的少量的运输介质含有酚红作为酸碱指示剂,Cary-Blair或Para-Pak C和S瓶)

样品数量:代表的粪便

收集产品说明:

1。采集新鲜粪便标本和提交1克或5毫升集装箱的运输介质。

2。防腐剂在2小时内粪便的收集。

样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏

形式

如果不是电子订购,完成,打印和发送微生物测试请求(T244)标本。

拒绝原因
识别标本类型和条件可能会导致样品被拒绝

E-swab
藻酸钙拭子
Cotton-tipped拭子
拭子中发送凝胶传输介质
拭子中发送病毒或最普遍的交通工具
拒绝

样品稳定性信息
提供了一个描述运输所需的温度进行实验室的标本,替代还包括可接受的温度

标本类型 温度 时间 特种集装箱
不同 变化(首选)

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

识别的载体革兰氏阴性杆菌窝藏oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase (OXA-48-like)或维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶(VIM)基因

临床信息
讨论了生理学、病理生理学和一般临床方面,与实验室测试

在美国,肺炎克雷伯菌" (KPC)是最常见的",其次是新德里金属-β-内酰胺酶(NDM)。Oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase (OXA-48-like)和维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶(VIM) "占主导地位在世界的其它地方,但确实发生在美国。的基因blaOXA-48-like和bla分别VIM编码OXA-48-like和VIM酶的生产。聚合酶链反应是一个敏感的、具体的和快速的方法识别这些基因。

这个测试检测到基因编码OXA-48-like和VIM类型的beta-lactamases粪便和perirectal /直肠/肛周的/肛门拭子。它可以用作一个工具找到病人被殖民。美国疾病控制和预防中心建议监测以发现识别患者殖民,谁可能是一个潜在来源carbapenemase-producing革兰氏阴性杆菌的传播在某些情况下。这种监测可能集中在某些高风险设置或病人组(如重症监护病房、长期护理设施,患者从区域或设施转移高患病率的相关类型的电阻)或可能是由感染预防和控制疫情进行调查。

参考价值
描述参考区间和附加信息的解释测试结果。可能包括在适当的时间间隔根据年龄和性别。间隔Mayo-derived,除非另有指定。如果一个提供解释报告,参考价值字段将这个状态。

解释
提供信息,协助解释测试结果

这个聚合酶连锁反应(PCR)分析检测和区分blaOXA-48-like和blaVIM在监测标本(perirectal /直肠/肛周的/肛门拭子或粪便)。积极OXA-48-like (oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase)和/或VIM(维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶)PCR表明病人是由革兰氏阴性杆菌(革兰氏阴性杆菌)殖民窝藏blaOXA-48-like和/或bla分别VIM。阴性结果表明没有检测DNA。

注意事项
讨论了条件,可能会导致诊断的混乱,包括样本收集和处理不当,不恰当的测试选择、干扰物质

假阴性结果可能发生由于聚合酶链反应的抑制,序列变化潜在的引物和探针,或的存在blaOXA-48-like或blaVIM基因数量低于试验的检测极限。

支持数据

试验是验证使用46革兰氏阴性杆菌,包括30 carbapenemase-producers (26 OXA / VIM-type 1 NMC / IMI, 1 ndm - 1和2 KPC),和2革兰氏阳性生物体。提供的试验目标100%的敏感性和特异性。

试验检测oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase (OXA-48-like)和维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶(VIM)监测perirectal /直肠/肛周的/肛拭子和粪便检测以下限制:OXA-48-like VIM,分别为78和75 CFU /毫升。盲板的飙升perirectal /直肠/肛周的/肛门监测拭子和大便化验。测定100%的敏感性和特异性,为目标,在所有临床样品。

临床参考
对临床性质的深入阅读的建议

1。费尔南德斯J,坎宁安SA, Fernandez-Verdugo et al:评价一个实时PCR测定OXA-48-producing直肠检查肠杆菌科在一般地方医院的重症监护室。成岩作用Microbiol感染说。2017年7月,88 (3):252 - 258。doi: 10.1016 / j.diagmicrobio.2017.04.001

2。布什K,费舍尔摩根富林明:流行病学扩张,结构研究和临床的挑战新beta-lactamases革兰氏阴性细菌。为Microbiol。2011; 65:455 - 478

3所示。Poirel L, Potron,高加索P: OXA-48-like ":幽灵的威胁》。J Antimicrob Chemother。2012年7月,67 (7):1597 - 1606

4所示。高加索P, Naas T, carbapenemase-producing Poirel L:全球的传播肠杆菌科。紧急情况感染说。2011年10月,17 (10):1791 - 1798

方法描述
描述如何执行测试并提供method-specific参考

Perirectal、直肠肛周的,肛门拭子处理中和缓冲管和生物体的细胞溶解释放他们的基因材料。粪便标本进行DNA提取前聚合酶连锁反应(PCR)。这个试验放大和检测到一个特定部分的基因编码oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase (OXA-48-like)和维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶(VIM)的酶。LightCycler仪器放大和监控目标核酸序列中被荧光PCR循环。这是一个自动PCR系统能够迅速发现放大产品开发通过严格的空气缸温度循环和毛细管比色皿。放大产品的检测是基于fluorescent-resonance能量转移(烦恼)原则。担心产品检测、供体荧光团杂交探针,荧光素,3 '结束兴奋由外部光源,发光与受体吸收二次杂交探针荧光团,LC-Red 610 (blaOXA-48-like)和LC-Red 670 (blaVIM) 5 '末端。受体荧光团然后发出不同波长的光,可以测量信号正比于特定PCR产品的数量。检测过程是完成在不到1小时使用一个封闭的管道系统。莫尼耶(坎宁安SA Noorie T、D,伍德福德N, Patel R:快速同时检测的基因编码肺炎克雷伯菌" (blaKPC)和新德里金属-β-内酰胺酶革兰氏阴性杆菌(blaNDM)。中国Microbiol。2013年4月,5194):1269 - 1271)

PDF报告
表明报告包括一个额外的文档是否与图表、图像或其他丰富的信息

没有

天(s)
概述了天测试执行。这个领域反映了天,样品必须在测试实验室开始测试过程,包括任何样品制备和测试执行之前处理时间。列出了一些测试,不断进行,这意味着化验白天多次执行。

星期一到星期五

报告可用
时间的间隔(收到样品在梅奥诊所实验室结果可用)考虑标准设置和周末。yabo208第一天的时间通常是结果可用。最后一天的时间可能需要,占任何必要的重复测试。

1到4天

样品保留时间
轮廓的时间在测试标本保存在实验室之前就会被丢弃

3天如果收到拭子运输;如果收到7天在C和S瓶

执行实验室的位置
表明实验室的位置执行测试

罗彻斯特

费用
几个因素决定执行一个测试的费用收取。联系你的美国或国际区域经理建立费用表的信息或了解更多关于资源优化测试的选择。

  • 授权用户可以登录测试价格费用的详细信息。
  • 客户没有测试价格可以联系亚搏一天24小时,一周7天。
  • 潜在客户应该联系他们的区域经理。寻求帮助,请联系亚搏

测试的分类
提供信息关于医疗器械分类为实验室测试工具和试剂。测试可以分为清除或通过美国食品和药物管理局(FDA)和每个制造商使用说明,或产品,不接受FDA审查和批准,并贴上一个分析物特定试剂(ASR)产品。

这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。

CPT编码信息
提供指导在决定适当的当前程序的术语(CPT)代码(s)为每个测试或概要信息。梅奥诊所上市CPT编码反映实验室的解释CPT编码需求。yabo208每个实验室有责任来确定正确的CPT编码用于计费。

CPT编码由执行实验室提供。

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测试设置资源

设置文件
测试设置信息包含测试文件定义支持订单细节和结果之间的接口梅奥诊所实验室和实验室信息系统。yabo208

Excel|Pdf

样品报告
正常和异常样本报告作为参考提供报告的外观。

正常的报告|异常报告

如果样品报告
国际体系(SI)的单位报告提供有限数量的测试。这些报告仅用于国际帐户,只可以通过MayoLINK账户已定义接收他们。

如果正常的报告|如果异常报告