识别的载体革兰氏阴性杆菌窝藏oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase (OXA-48-like)或维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶(VIM)基因
这个测试检测oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase (blaOXA-48-like)和维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶基因(与抗菌素耐药性)perirectal /直肠肛周的/肛门拭子或粪便标本。
实时聚合酶链反应(PCR)使用LightCycler和荧光共振能量转移(FRET)
碳青霉烯耐药的肠杆菌科
碳青霉烯耐药CRE
"
"生产,碳青霉烯耐药肠杆菌科
CP-CRE
Oxacillinase
OXA
OXA-48
OXA-48-like
VIM
CRE
不同
这个试验是用于监测测试perirectal /直肠肛周的/肛门拭子或粪便标本。如果测试隔离来自文化,请求OXVRP / Oxacillin-Hydrolyzing Beta-Lactamase (blaOXA-48-like)和维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶(blaVIM)革兰氏阴性杆菌,分子检测、PCR,各不相同。
耐碳青霉烯的其他机制,包括其他carbapenemase-types孔蛋白突变,或hyper-expression射流泵可能导致耐碳青霉烯药物。这些都不是被这个试验。如果检测肺炎克雷伯菌" (KPC)或新德里金属-β-内酰胺酶(NDM),订单KNSRP /肺炎克雷伯菌" (blaKPC)和新德里金属-β-内酰胺酶(bla的NDM)监测、PCR、各不相同。
如果检测肺炎克雷伯菌" (KPC)或新德里金属-β-内酰胺酶(NDM)还需要;还命令KNSRP /肺炎克雷伯菌" (blaKPC)和新德里金属-β-内酰胺酶(bla的NDM)监测、PCR、各不相同。
标本来源是必需的。
放大的高灵敏度聚合酶链反应需要的标本处理在一个环境污染的标本oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase (blaOXA-48-like)或维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶(blaVIM) DNA是不可能的。
提交以下标本:只有1
首选:
样品类型:肛周的,perirectal、直肠、肛门
供应:Culturette(洗液文化棍)(T092)
容器/管:文化运输拭子(涤纶或人造丝拭子与铝或塑料轴斯图尔特或定制的液体培养基中)
样品数量:拭子
样品稳定性信息:冷藏(首选)/冻结
可以接受的:
供应:C和S瓶(T058)
样品类型:保存粪便
容器/管:商用运输系统特定的肠道病原体的复苏从粪便标本(15毫升的少量的运输介质含有酚红作为酸碱指示剂,Cary-Blair或Para-Pak C和S瓶)
样品数量:代表的粪便
收集产品说明:
1。采集新鲜粪便标本和提交1克或5毫升集装箱的运输介质。
2。防腐剂在2小时内粪便的收集。
样品稳定性信息:环境(首选)/冷藏
如果不是电子订购,完成,打印和发送微生物测试请求(T244)标本。
E-swab 藻酸钙拭子 Cotton-tipped拭子 拭子中发送凝胶传输介质 拭子中发送病毒或最普遍的交通工具 |
拒绝 |
标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
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不同 | 变化(首选) |
识别的载体革兰氏阴性杆菌窝藏oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase (OXA-48-like)或维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶(VIM)基因
在美国,肺炎克雷伯菌" (KPC)是最常见的",其次是新德里金属-β-内酰胺酶(NDM)。Oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase (OXA-48-like)和维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶(VIM) "占主导地位在世界的其它地方,但确实发生在美国。的基因blaOXA-48-like和bla分别VIM编码OXA-48-like和VIM酶的生产。聚合酶链反应是一个敏感的、具体的和快速的方法识别这些基因。
这个测试检测到基因编码OXA-48-like和VIM类型的beta-lactamases粪便和perirectal /直肠/肛周的/肛门拭子。它可以用作一个工具找到病人被殖民。美国疾病控制和预防中心建议监测以发现识别患者殖民,谁可能是一个潜在来源carbapenemase-producing革兰氏阴性杆菌的传播在某些情况下。这种监测可能集中在某些高风险设置或病人组(如重症监护病房、长期护理设施,患者从区域或设施转移高患病率的相关类型的电阻)或可能是由感染预防和控制疫情进行调查。
负
这个聚合酶连锁反应(PCR)分析检测和区分blaOXA-48-like和blaVIM在监测标本(perirectal /直肠/肛周的/肛门拭子或粪便)。积极OXA-48-like (oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase)和/或VIM(维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶)PCR表明病人是由革兰氏阴性杆菌(革兰氏阴性杆菌)殖民窝藏blaOXA-48-like和/或bla分别VIM。阴性结果表明没有检测DNA。
假阴性结果可能发生由于聚合酶链反应的抑制,序列变化潜在的引物和探针,或的存在blaOXA-48-like或blaVIM基因数量低于试验的检测极限。
试验是验证使用46革兰氏阴性杆菌,包括30 carbapenemase-producers (26 OXA / VIM-type 1 NMC / IMI, 1 ndm - 1和2 KPC),和2革兰氏阳性生物体。提供的试验目标100%的敏感性和特异性。
试验检测oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase (OXA-48-like)和维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶(VIM)监测perirectal /直肠/肛周的/肛拭子和粪便检测以下限制:OXA-48-like VIM,分别为78和75 CFU /毫升。盲板的飙升perirectal /直肠/肛周的/肛门监测拭子和大便化验。测定100%的敏感性和特异性,为目标,在所有临床样品。
1。费尔南德斯J,坎宁安SA, Fernandez-Verdugo et al:评价一个实时PCR测定OXA-48-producing直肠检查肠杆菌科在一般地方医院的重症监护室。成岩作用Microbiol感染说。2017年7月,88 (3):252 - 258。doi: 10.1016 / j.diagmicrobio.2017.04.001
2。布什K,费舍尔摩根富林明:流行病学扩张,结构研究和临床的挑战新beta-lactamases革兰氏阴性细菌。为Microbiol。2011; 65:455 - 478
3所示。Poirel L, Potron,高加索P: OXA-48-like ":幽灵的威胁》。J Antimicrob Chemother。2012年7月,67 (7):1597 - 1606
4所示。高加索P, Naas T, carbapenemase-producing Poirel L:全球的传播肠杆菌科。紧急情况感染说。2011年10月,17 (10):1791 - 1798
Perirectal、直肠肛周的,肛门拭子处理中和缓冲管和生物体的细胞溶解释放他们的基因材料。粪便标本进行DNA提取前聚合酶连锁反应(PCR)。这个试验放大和检测到一个特定部分的基因编码oxacillin-hydrolyzing beta-lactamase (OXA-48-like)和维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶(VIM)的酶。LightCycler仪器放大和监控目标核酸序列中被荧光PCR循环。这是一个自动PCR系统能够迅速发现放大产品开发通过严格的空气缸温度循环和毛细管比色皿。放大产品的检测是基于fluorescent-resonance能量转移(烦恼)原则。担心产品检测、供体荧光团杂交探针,荧光素,3 '结束兴奋由外部光源,发光与受体吸收二次杂交探针荧光团,LC-Red 610 (blaOXA-48-like)和LC-Red 670 (blaVIM) 5 '末端。受体荧光团然后发出不同波长的光,可以测量信号正比于特定PCR产品的数量。检测过程是完成在不到1小时使用一个封闭的管道系统。莫尼耶(坎宁安SA Noorie T、D,伍德福德N, Patel R:快速同时检测的基因编码肺炎克雷伯菌" (blaKPC)和新德里金属-β-内酰胺酶革兰氏阴性杆菌(blaNDM)。中国Microbiol。2013年4月,5194):1269 - 1271)
星期一到星期五
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
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