评估纯耐碳青霉烯的革兰氏阴性杆菌的分离机制
快速分子检测OXA-48-like测试beta-lactamase和VIM金属-β-内酰胺酶DNA与抗菌素耐药性革兰氏阴性杆菌的分离。
实时聚合酶链反应(PCR)使用LightCycler和荧光共振能量转移(FRET)
碳青霉烯耐药的肠杆菌科
碳青霉烯耐药CRE
"生产,碳青霉烯耐药肠杆菌科
"
CP-CRE
Oxacillinase
OXA
OXA-48
OXA-48-like
VIM
CRE
不同
这个试验应该用于测试隔离的革兰氏阴性杆菌。如果直接从直肠拭子检测,perirectal棉签、肛拭子,肛周的拭子,或粪便,请求OVSRP / OXA-48-like (blaOXA-48-like)和VIM (blaVIM)监测、PCR。
耐碳青霉烯的其他机制,包括其他carbapenemase-types孔蛋白突变,或hyperexpression射流泵可能导致耐碳青霉烯药物。这些都不是被这个试验。如果测试肺炎克雷伯菌" (KPC)或新德里金属-β-内酰胺酶(NDM),订单KPNRP / KPC (blaKPC)和NDM (blaNDM)在革兰氏阴性杆菌,PCR分子检测。
1。必须提供生物识别。如果未知生物识别,与此同时顺序识别/生物被识别、有氧细菌。
2。如果需要敏感性测试;还命令ZMMLS /抗菌药物敏感性,有氧细菌,麦克风。
3所示。如果测试肺炎克雷伯菌" (KPC)或新德里金属-β-内酰胺酶(NDM)还需要;也为了KPNRP / KPC (blaKPC)和NDM (blaNDM)在革兰氏阴性杆菌,PCR分子检测。
1。看到传染性标本运输指南配送信息的特别指示。
2。将标本放在一个大传染性容器(T146)和标签作为病原体/传染性物质,如果合适。
生物识别和标本来源是必需的。
扩增的PCR的灵敏度高要求要处理的标本在一个环境污染的标本oxacillin-hydrolyzingbeta-lactamase(OXA-48-like)或维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶(VIM) DNA是不可能的。
供应:传染性容器,大(T146)
收集容器/管:偏
样品数量:隔离
收集产品说明:
1。执行隔离感染细菌。
2。细菌生物必须提交在纯培养,积极成长。不提交混合文化。
如果不是电子订购,完成,打印和发送微生物测试请求(T244)标本。
其他 | 琼脂板,混合文化 |
标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
---|---|---|---|
不同 | 环境(首选) | ||
冷藏 |
评估纯耐碳青霉烯的革兰氏阴性杆菌的分离机制
在美国,肺炎克雷伯菌" (KPC)是最常见的",其次是新德里金属-β-内酰胺酶(NDM)。OXA-48-like和VIM "占主导地位在世界的其他部分,但是发生在美国。的基因blaOXA-48-like和bla分别VIM编码OXA-48-like和VIM酶的生产。PCR是一个敏感的、具体的和快速的方法识别这些基因。这个测试检测到基因编码OXA-48-like (oxacillin-hydrolyzingbeta-lactamase)和VIM(维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶)类型的beta-lactamases在细菌隔离。
不适用
这PCR检测和区分blaOXA-48-like和blaVIM。一个积极的blaOXA-48-like (oxacillin-hydrolyzingbeta-lactamase)PCR表明隔离blaOXA-48-like。一个积极的活力(维罗纳integron-encoded金属-β-内酰胺酶)PCR表明隔离blaVIM。阴性结果表明没有检测DNA。
由于抑制PCR可能出现假阴性结果,序列变化潜在的引物和探针,或blaOXA-48-like的存在blaVIM基因数量低于试验的检测极限。
试验是验证使用46革兰氏阴性杆菌,包括30 carbapenemase-producers (26 OXA / VIM-type 1 NMC / IMI, 1 ndm - 1和2 KPC)和2革兰氏阳性生物体。提供的试验目标100%的敏感性和特异性。
1。费尔南德斯J,坎宁安SA, Fernandez-Verdugo等:评价一个实时PCR测定OXA-48-producing直肠检查肠杆菌科在一般地方医院的重症监护室。诊断微生物学和传染病2017年7月,88 (3):252 - 258doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2017.04.001
2。布什K,费舍尔摩根富林明:流行病学扩张,结构研究和临床的挑战新beta-lactamases革兰氏阴性细菌。年度回顾微生物65:455 2011;478年
3所示。Poirel L, Potron,高加索P: OXA-48-like ":幽灵的威胁》。抗菌化疗杂志》2012;67:1597 - 1606
4所示。高加索P, Naas T, carbapenemase-producing Poirel L:全球的传播肠杆菌科。新发传染病2011;17:1791 - 1798
分离细胞溶解在缓冲释放他们的DNA。这个试验放大和检测到一个特定部分的基因编码OXA-48-like (oxacillin-hydrolyzingβ内酰胺酶)和VIM(维罗纳integron-encoded金属- beta-lactamase)的酶。LightCycler仪器放大和监控目标核酸序列中被荧光PCR循环。这是一个自动PCR系统能够迅速发现放大产品开发通过严格的空气缸温度循环和毛细管比色皿。放大产品的检测是基于fluorescent-resonance能量转移(烦恼)原则。担心产品检测、供体荧光团杂交探针,荧光素,3 '结束兴奋由外部光源,发光与受体吸收二次杂交探针荧光团,LC-Red 610 (blaOXA-48-like)和LC-Red 670 (blaVIM) 5 '末端。受体荧光团然后发出不同波长的光,可以测量信号正比于特定PCR产品的数量。检测过程是完成在不到1小时使用一个封闭的管道系统。莫尼耶(坎宁安SA Noorie T、D等:快速同时检测的基因编码肺炎克雷伯菌" (blaKPC)和新德里金属- beta-Lactamase (blaNDM)革兰氏阴性杆菌。中国Microbiol 51:1269 2013; 1271)
星期一到星期五
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
87150 x 2