识别可能对靶向治疗的肺肿瘤通过评估多个基因同时在目标表皮生长因子受体,BRAF,喀斯特,极品,国家管制当局方面,筛选,ERBB2,满足,alaska airlines, ROS1、RET和NTRK1基因
肺癌患者的诊断和管理
这个测试是不适用血液恶性肿瘤。
这个测试使用有针对性的下一代测序为体细胞突变在评估表皮生长因子受体,BRAF,喀斯特,极品,国家管制当局方面,筛选,ERBB2,见过基因。下一代测序也用来确定重组涉及(融合)碱性、ROS1 RET, NTRK1。看到由肺靶向基因区域审问面板和激活/伴侣基因断点导致目标融合转录被肺询问面板目标基因的详细信息区域评估这个测试。
值得注意的是,这个测试执行评估的体细胞突变和重组(融合)固体肿瘤样本。这个测试是不适用的血液恶性肿瘤。此外,这个测试不评估生殖系在列出的基因改变。
这个测试标识14跳过激活外显子突变满足。
评估formalin-fixed,肿瘤石蜡包埋或细胞学幻灯片肺癌患者的基因突变和重组(融合)来识别候选靶向治疗。
当前数据表明的功效表皮生长因子受体针对非小细胞肺癌患者的治疗仅限于肿瘤的突变表皮生长因子受体基因。
当前数据表明肺部癌碱性重组可能是敏感碱性抑制剂。
测试Id | 报告名称 | 可单独购买 | 总是表现 |
---|---|---|---|
SLIRV | 幻灯片回顾在毫克 | 不,(仅法案) | 是的 |
这个测试命令时,幻灯片回顾总是会执行一个额外的费用。
聚合酶链反应(PCR)的下一代测序
表皮生长因子受体
BRAF
喀斯特
极品
国家管制当局方面
ERBB2
见过
碱性
ROS1
受潮湿腐烂
NTRK1
肺癌面板
肺癌重排
肺癌的融合
肺面板
肺肿瘤小组
肿瘤小组
肿瘤学面板
接下来一代测序测试
总会在
这个测试命令时,幻灯片回顾总是会执行一个额外的费用。
不同
多个肿瘤(癌症)基因面板是可用的。更多信息见肿瘤体细胞门店测试指南。
病理报告(最终或初步)至少包含以下信息必须伴随标本为了测试执行:
1。患者姓名
2。块数字必须是对所有块,幻灯片和文书工作(可以手写的文件)
3所示。组织收集日期
4所示。源的组织
这个实验需要至少20%的肿瘤细胞核。
首选的肿瘤区域有足够的百分比肿瘤细胞核:tissue144毫米(2)
最小数量的肿瘤区域:组织36毫米(2)
这些数量累计超过10清白的幻灯片,必须有足够的百分比肿瘤细胞核。
组织固定:10%中性缓冲福尔马林,不脱钙
——样品制备的指导,请参阅实体瘤组织要求下一代测序。在本文档中,给出的尺寸4毫米x 4毫米x 10幻灯片作为首选:近似/相当于144毫米(2)和最低3毫米x 1毫米x 10幻灯片:近似/相当于36毫米(2)。
首选:
样品类型:组织块
收集产品说明:提交formalin-fixed,石蜡包埋组织块可接受数量的肿瘤组织。
可以接受的:
样品类型:组织的幻灯片
幻灯片:1彩色和10个清白的
收集产品说明:提交1张幻灯片与苏木精和伊红染色和10清白的,nonbaked幻灯片5微米厚的部分肿瘤组织。
注意:需要肿瘤细胞核的总量可以通过刮10幻灯片从同一块。
样品类型:细胞学幻灯片(直接涂片或ThinPrep)
幻灯片:1到3张幻灯片
收集产品说明:提交1 - 3张幻灯片染色和封面下滑首选5000有核细胞或至少至少3000有核细胞。
注意:玻璃盖玻片是首选;塑料盖玻片是可以接受的,但将导致周转时间过长。
附加信息:细胞学幻灯片恕不退还。
如果不是电子订购,完成,打印,发送一个肿瘤学试验要求(T729)标本。
看到标本要求
其他 | 标本已脱钙(所有方法)标本,尚未formalin-fixed,石蜡包埋 |
标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
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不同 | 环境(首选) | ||
冻 | |||
冷藏 |
识别可能对靶向治疗的肺肿瘤通过评估多个基因同时在目标表皮生长因子受体,BRAF,喀斯特,极品,国家管制当局方面,筛选,ERBB2,满足,alaska airlines, ROS1、RET和NTRK1基因
肺癌患者的诊断和管理
这个测试是不适用血液恶性肿瘤。
这个测试使用有针对性的下一代测序为体细胞突变在评估表皮生长因子受体,BRAF,喀斯特,极品,国家管制当局方面,筛选,ERBB2,见过基因。下一代测序也用来确定重组涉及(融合)碱性、ROS1 RET, NTRK1。看到由肺靶向基因区域审问面板和激活/伴侣基因断点导致目标融合转录被肺询问面板目标基因的详细信息区域评估这个测试。
值得注意的是,这个测试执行评估的体细胞突变和重组(融合)固体肿瘤样本。这个测试是不适用的血液恶性肿瘤。此外,这个测试不评估生殖系在列出的基因改变。
这个测试标识14跳过激活外显子突变满足。
这个测试命令时,幻灯片回顾总是会执行一个额外的费用。
有针对性的癌症疗法被定义为抗体或小分子药物阻断癌症的生长和传播通过干扰细胞的特定分子参与肿瘤的生长和发展。多个靶向治疗已被FDA批准用于治疗特定的癌症。分子遗传学分析通常需要确定目标服从于靶向治疗和治疗费用和治疗相关性风险降到最低。
下一代测序最近成为一个准确的,具有成本效益的方法来识别变化等多个相关基因已知反应或抵抗特定的靶向治疗。这是一个试验,使用formalin-fixed石蜡包埋组织或细胞学幻灯片为常见的体细胞突变和重组评估(融合)涉及11个基因与肺癌有关。本次测试的结果可以用于评估预后和指导治疗肺肿瘤患者。这些数据也可以用来帮助确定临床试验资格改变患者的基因不适合当前fda批准的靶向治疗。
看到由肺靶向基因区域审问面板和激活/伴侣基因断点导致目标融合转录被肺询问面板目标基因的详细信息区域评估这个测试。
一个将提供解释报告。
一个将提供解释报告。
这个测试不能区分体细胞和生殖系的变化。额外的测试可能需要澄清结果的意义是否有潜在的遗传风险。
DNA变异可能识别不确定的意义。
负(野生型)结果不排除存在突变或重组(融合)可能存在但低于极限的检测分析。
点突变和小插入/删除突变将检测到表皮生长因子受体,BRAF,喀斯特,极品,国家管制当局方面,ERBB2,碱性和见过基因。基因重组(融合)涉及碱性、ROS1仓促和NTRK1基因只有将被检测到。这个测试没有发现大单或multiexon删除或复制或基因组拷贝数变异的基因测试。
罕见的多态性可能存在可能导致假阴性或假阳性结果。测试结果应解释在临床中发现,肿瘤采样和其他实验室数据。如果结果不匹配其他临床或实验室发现,请联系实验室更新的解释。误解的结果可能发生如果提供的信息不准确或不完整的。
可靠的结果依赖于足够的样本收集和处理。这个测试已验证细胞学幻灯片和formalin-fixed石蜡包埋组织;其他类型的固定液是气馁。组织的治疗不当,如脱钙作用,可能会导致PCR失败。
我们已经开发了下一代测序分析检测体细胞突变和基因重组(融合),可用于协助识别和预测预后靶向治疗对于肺癌患者的管理。这个试验已被证明是可再生的,有100%的一致性为内部和interassay再现性实验。
体细胞突变的检测(DNA)
我们观察到96.2%的一致性,检测75 78体细胞突变,以前检测到各种其他分子的方法。这些变异包括61个snp和17 Indels碱性(n = 3),BRAF(n = 15),表皮生长因子受体(n = 17),ERBB2(n = 7),极品(n = 2),喀斯特(n = 17),见过(n = 5)国家管制当局方面(n = 12)基因在70年被独特的样本。未发现致病变种29独特,已知突变阴性样品。
检测融合成绩单(RNA)
我们观察到100%的一致性,检测重组导致融合转录本在26个26独特的样品与之前检测到荧光原位杂交(鱼)或另一个测序分析。这些重组涉及到碱性(n = 19),ROS1(n = 3),和受潮湿腐烂(n = 4)基因。未发现融合转录本在72年独特的样本,互斥的突变或负重组鱼作为评估标准分析。
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2。Sharma SV,贝尔DW, Settleman J,哈伯DA:表皮生长因子受体突变的肺癌。Nat牧师癌症2007;7 (3):169 - 181
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8。埃伯哈德DA,约翰逊,aml LC, et al:表皮生长因子受体突变和喀斯特预测和预后指标仅在非小细胞肺癌患者接受化疗和抗结合埃罗替尼。中华肿瘤防治杂志2005;23 (25):5900 - 5909
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10。Vaishnavi, Capelletti M, Le, et al:致癌和非NTRK1重组在肺癌。Nat地中海。2013年11月,19 (11):1469 - 1472
下一代测序(上天)执行测试的目标区域的突变的存在表皮生长因子受体,BRAF,喀斯特,极品,国家管制当局方面,筛选,ERBB2,见过基因。门店执行测试重组涉及的存在碱性、ROS1 RET,和NTRK1基因。看到由肺靶向基因区域审问面板和激活/伴侣基因断点导致目标融合转录被肺询问面板目标基因的详细信息区域评估这个测试。
星期一到星期五
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
81445 -目标基因组序列分析面板中,固体器官肿瘤
幻灯片回顾
88381 -显微解剖,手册
测试Id | 测试顺序的名字 | 订单LOINC价值 |
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LNGPR | 肺面板与重排肿瘤 | 过程中 |
结果Id | 测试结果的名字 | 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
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44143年 | 结果总结 | 50397 - 9 |
44144年 | 结果 | 82939 - 0 |
44145年 | 解释 | 69047 - 9 |
44146年 | 额外的信息 | 48767 - 8 |
44147年 | 标本 | 31208 - 2 |
44148年 | 源 | 31208 - 2 |
46912年 | 组织ID | 80398 - 1 |
44149年 | 发布的 | 18771 - 6 |