测试Id:CSFME

脑膜炎或脑炎面板算法

它通常不建议以下测试是与此同时下令如果这个测试要求:

淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒和巨细胞病毒(CMV)、分子检测、PCR,不同

借给/肠病毒分子检测PCR,不同

-HSVC /单纯疱疹病毒(HSV),分子检测、PCR、脊髓液

-HHV6V /人类Herpesvirus-6、分子检测、PCR、脊髓液

-LVZV /水痘一带状疱疹病毒,PCR分子检测,不同

1。在某些情况下,可能会有当地公共卫生需求影响梅奥诊所实验室(制程)客户需要额外的测试标本和积极的结果从这个面板。yabo208应该熟悉当地客户的需求。制程建议客户保留一个整除的每个标本提交测试执行额外的测试,根据需要。

2。建议以下测试与这个测试要求:

信心/细胞计数和微分,脊髓液

-TPSF /蛋白质、总、脊髓液

-GLSF /葡萄糖,脊髓液

创/细菌培养,有氧 ,不同

克/革兰氏染色剂 ,不同

3所示。如果有临床症状表现,以下测试还应该与这个测试命令:

fs /真菌涂片 ,不同

-FGEN /真菌文化,习惯

-LFACX /隐球菌抗原与反射、脊髓液

样品必须在7天内到达冷藏温度收集。

标本来源是必需的。

样品类型:脊髓液

容器/管:无菌瓶

样品数量:1毫升

托收指示:冷冻标本不可以接受的。

• 脑膜炎或脑炎面板算法

如果不是电子订购,完成,打印,发送1以下形式的标本:

- - - - - -神经病学专业测试客户端测试的要求(T732)

- - - - - -微生物测试请求(T244)

0.5毫升

任何标本,标本在传输媒体离心机分流液

拒绝

快速检测引起的脑膜炎和脑炎:

- - - - - -大肠杆菌K1 (K1)血清型

- - - - - -流感嗜血杆菌

- - - - - -单核细胞增多性李斯特氏菌

- - - - - -脑膜炎奈瑟氏菌(封装)

- - - - - -链球菌agalactiae(B组链球菌)

- - - - - -链球菌引起的肺炎

巨细胞病毒(CMV)

肠病毒

单纯疱疹病毒1(1型单纯疱疹病毒)

单纯疱疹病毒2 - 2)

单纯疱疹病毒6 (hhv - 6)

载体parechovirus

水痘带状疱疹病毒(带状疱疹)

- - - - - -新型隐球菌/ gattii

这个测试是不适用与CSF来自内在的医疗设备(如脑脊液分流术)。

这个测试是不推荐作为测试的治疗。

脑膜炎或脑炎面板算法

细菌:

大肠杆菌K1菌株占近80%大肠杆菌与脑脊液(CSF)。虽然大多数大肠杆菌是无害的肠生物居住在人类和动物的肠道,导致肠胃疾病和一些extraintestinal感染(如尿路感染、菌血症和脑膜炎)。大肠杆菌与脑膜炎含有毒性的因素导致他们的发病机制,允许他们通过血液传播,劫持宿主细胞正常功能,渗透内皮细胞,获得组织的中枢神经系统(CNS)。K1抗原是一种胶囊,保护细菌免受免疫系统。这些感染是特别关注的早产婴儿和新生儿和负责近45%和30%的脑膜炎病例在这些年龄段的死亡率为13%和25%,分别。成年人是不太常见的感染,通常机会在自然暴露后无菌器官外伤或手术后胃肠道内容;成年人的死亡率是28%到36%。

流感嗜血杆菌是一种革兰阴性球杆菌,是孤立的只从人类。菌株的H流感嗜血杆菌分为两组基于多糖胶囊的存在与否。封装的菌株进一步分为6种血清型(a到f)。之前的广泛使用H流感嗜血杆菌b型(Hib)共轭疫苗,Hib导致超过80%的入侵H流感嗜血杆菌感染,主要是在5岁以下儿童的死亡率为3%至6%,进一步发展中永久性的后遗症,从20%到30%的轻度智力障碍听力损失。在常规接种疫苗的地区,大部分的入侵H流感嗜血杆菌感染是由nontypeable引起脑膜炎的菌株并保持一个重要的原因,特别是人与诱因如中耳炎、鼻窦炎、糖尿病、免疫缺陷或头部外伤与脑脊液漏。脑膜炎由于H流感嗜血杆菌发生在大约每100000人0.08例的速度在美国,据报道,细菌性脑膜炎的病原体在20%到50%的情况下全球在过去几十年。

单核细胞增多性李斯特氏菌李氏杆菌病的病原体,是革兰氏阳性杆菌,无处不在的水土和胃肠道中可以找到5%的健康成人。李氏杆菌病被认为是最严重的细菌性食源性感染由于其高死亡率甚至早期抗生素治疗(11% - -60%)。入侵李氏杆菌病可以导致流产,败血症,脑膜炎、脑膜脑炎。人口发展入侵李氏杆菌病的风险包括免疫抑制、孕妇、新生儿,胎儿和老年人。脑膜炎由于L monocytogenes据报道,大约每100000人0.05例每年在美国,从0.5%到2.0%,导致的细菌性脑膜炎病例在美国以外的国家。(1)

脑膜炎奈瑟氏菌(封装)是一个挑剔的,有氧,革兰氏阴性双球菌,通过接触粘液或呼吸道飞沫传播,通常从无症状携带者。至少有12个不同血清型的N双球菌6与流行相关联(组A, B, C, W135群,X, Y)。荚膜抗原的血清群指的类型,通常只封装N双球菌被认为是致病性。脑膜炎球菌病(脑膜炎和脑膜炎球菌血症)是罕见的在发达国家,但可以发生在暴发和仍然是一个发展中国家的公共卫生问题。最常见的婴儿、儿童和年轻人,和出现在生活条件拥挤的地方(如大学宿舍和军营)。季节性发病高峰在冬末春初每年发病率约为每100000人0.2例在美国。疾病进展非常迅速(< 24小时)和低血压、multiorgan障碍、休克、周边缺血,和四肢损失,而且死亡率约为5%到10%。有执照的脑膜炎球菌疫苗在美国,可以在所有年龄段的人使用,根据不同的疫苗。尽管世界范围内开展广泛的疫苗接种工作,好几种N双球菌仍然引起季节性暴发,尤其是在撒哈拉以南的非洲地区。极端减少血清组C脑膜炎球菌性脑膜炎曾被观察到在疫苗提供保护的国家介绍了血清组。

链球菌agalactiae(B组链球菌或GBS)在新生儿脑膜炎的一个重要原因,尤其是那些早产,新生儿败血症往往是重合的。新生儿疾病最重要的危险因素与GBS孕产妇殖民。自1996年以来,美国疾病控制与预防中心的指导意见中(在2010年更新)呼吁预防性抗生素治疗高危交货交货前几个小时,导致新生儿GBS的下降率。在成人患者,GBS与先进的年龄或严重的潜在的健康状况。总发病率在美国估计有0.25每100000人感染和新生儿GBS疾病范围从0.2到2.4每1000个出生在欧洲在过去的几十年里。新生儿死亡率从10%到25%到30%的成年人。

链球菌引起的肺炎殖民上呼吸道和经常是最孤立的呼吸道病原体在社区获得性肺炎。脑膜炎的主要原因,尤其是在儿童和老年人患者,特别是那些有潜在疾病,发病率约为0.8每100000在美国和感染引起细菌性脑膜炎病例的20%到31%在美国以外的国家。死亡率也很高:8%到15%的儿童和20%的成年人的37%。死亡率接近50%在资源贫乏的国家,特别是在艾滋病毒合并感染是一个因素。神经系统后遗症(认知障碍、耳聋、癫痫)报道多达40%的幸存者。疫苗已经帮助减少侵入性疾病和肺炎球菌肺炎的风险为50%到80%。

病毒:

人类巨细胞病毒(CMV)的双链DNA病毒Herpesviridae家庭。Seroprevalence数据显示,全球感染人群中几乎无处不在,在利率接近100%,发展中国家36%到90%在美国根据年龄和种族。在免疫活性的严重疾病患者很少见,巨细胞病毒是一种投机取巧的病原体在免疫力低下或免疫抑制的个体,作为最初的感染或激活潜伏性感染。在一些病人(如移植受者)、巨细胞病毒感染中枢神经系统,引起脑膜脑炎。

肠道病毒(EV)小RNA病毒引起的家庭成员和与人类相关疾病从无症状或轻微感染严重的中枢神经系统疾病需要住院治疗。在儿童感染率最高,大多数感染发生在夏季。最常见的EV血清型是柯萨奇病毒A9, B1,艾柯病毒6,9日和18日,占超过50%的血清型检测。感染是通过粪口传播和呼吸的路线,可以迅速传播在社区环境中,特别是在卫生条件较差的地区,。电动汽车是一种常见的传染性脑炎/脑膜炎的确定原因,有患病率在5.5%和30%之间根据位置和病人的人口统计数据。

单纯疱疹病毒1和2(1型单纯疱疹病毒和HSV-2) Herpesviridae家族的DNA病毒传播命名的皮肤溃疡感染这些病毒引起的。1型单纯疱疹病毒感染通常发生在童年和清单主要是口腔病变早期,而HSV-2主要是与生殖器损伤和感染是收购了在以后的生活中,与性活动相关。HSV建立居住在神经细胞初始感染(无症状在大多数情况下)。病毒激活导致病变或其他严重疾病的结果(如中枢神经系统感染),可能发生在生活,伴发热,受伤,暴露在紫外线照射(阳光),情绪压力,荷尔蒙的违规行为,和免疫状态的变化。在美国,整体seroprevalence 1型单纯疱疹病毒是在60%左右。总体seroprevalence HSV-2约为16%,但随年龄、性别和种族。在世界范围内,据估计,大约90%的人感染1型单纯疱疹病毒;HSV-2不常见有15%到80%的人感染。HSV是最常见的原因之一,病毒性脑炎和脑膜炎的一个重要原因。超过1600的大型研究脑脊液标本在英国,1型单纯疱疹病毒被发现在25个(1.5%)病人(几乎所有人脑炎)和HSV-2 33例(1.9%)患者被发现(几乎所有人脑膜炎)。 This overall prevalence of approximately 3% in CSF is similar to that seen in a recent study of CSF patients in New York State. This study also saw a similar distribution of HSV-1 and HSV-2 in encephalitis versus meningitis.

人类疱疹病毒6型(hhv - 6)被发现在1980年代中期,当免疫功能低下的患者的兴起导致了人口的增加容易严重疾病的结果。有2种:HHV-6A HHV-6B。研究表明,超过95%的人年龄在2正1或变异和感染建立延迟由于病毒整合进宿主细胞。而主要感染HHV-6B导致婴儿红疹,原发感染的临床表现与HHV-6A仍有些定义;然而,一些研究表明,HHV-6A感染可能与炎症或神经系统疾病,这比HHV-6B HHV-6A可能增加神经亲和力。支持这一假设发现hhv - 6居住在中枢神经系统组织,包括大脑,它可能会导致组织损伤导致脑炎或脑膜炎。此外,hhv - 6被发现在1.8%的病人CSF脑炎或脑膜炎在最近的一项研究。中枢神经系统疾病与hhv - 6在儿童和成人,建议在原发感染中枢神经系统的入侵是可能的。虽然免疫活性的病人可能经历中枢神经系统感染,在严重免疫抑制的个体更常见。然而,hhv - 6是在无症状的患者和激活可以通过PCR检测健康人中间没有活跃的hhv - 6感染的迹象。 Studies of HHV-6 in normal brain tissue have also identified HHV-6 DNA via PCR in up to 85% of patients without signs of active infection and HHV-6 DNA may persist in the CSF after acute infection. In a study of 56 allogeneic stem cell transplant patients, HHV-6 DNA was detected in the CSF of 14 (27%) patients without CNS symptoms. Given the prevalence of latent infection and potential for asymptomatic reactivation, positive HHV-6 results should be carefully interpreted in association with clinical symptoms and supplemental laboratory testing.

人类parechoviruses (HPeV)组成的另一个属引起的家庭。HPeV最初分为肠病毒在他们发现在1950年代已确定,至少十几种血清型。Seroprevalence HPeV-1接近100%的成年人口,大多数感染发生在儿童早期。与电动汽车一样,通过粪口传播感染和呼吸道路线;最常见的症状是轻微的呼吸道或消化道疾病。从HPeV-1中枢神经系统疾病是罕见的,但HPeV-3与败血症等严重疾病的结果有关,脑炎、脑膜炎、和肝炎3个月以下的儿童时代。最近的研究可疑的中枢神经系统疾病或脓毒症患儿的脑脊液显示HPeV患病率为3%到17%,几乎所有的HPeV-3。磁共振成像的研究婴儿生存HPeV中枢神经系统疾病显示大脑白质损伤和发育障碍。

水痘带状疱疹病毒(带状疱疹)Herpesviridae家族的双链DNA病毒,通常导致儿童感染(水痘)和建立潜伏在细胞会在今后的生活中重新激活(带状疱疹和带状疱疹)。带状疱疹主要是通过呼吸道分泌物传播或直接接触受感染的病变,和感染新宿主的呼吸道上皮细胞内的开始。原发感染后(发热、不适伴随着斑丘疹的皮疹),能建立自己的感觉神经节的神经系统仍是潜在的。在美国,近90%的人口被感染带状疱疹出现之前的疫苗。类似的利率在欧洲国家已报告。10%和30%之间的感染,患带状疱疹(痛苦的皮疹沿背ganglia),主要是在以后的生活中。据估计,全球发病率的中位数带状疱疹是每1000人每年4.0到4.5,这突显出全球能复活的频率。研究表明,带状疱疹是暂时性的PCR检测的血液的,无症状的个体(包括免疫活性的免疫功能不全的),建议重新激活发生贯穿人的一生。但是通常是由免疫系统。脑炎和脑膜炎是水痘和带状疱疹感染的并发症。在1的研究中,带状疱疹是第三大发现病毒脑炎或脑膜炎的症状和体征,患者普遍报道的研究人群的1.9%。 There are live, attenuated VZV vaccines licensed for use in the United States for the vaccination of children against varicella and adults against zoster.

酵母:

新型隐球菌和隐球菌gattii是通过吸入和致病性真菌可以扩散到其他器官系统(特别是大脑和脑膜)。C neoformans被认为是一个投机取巧的病原体的免疫功能不全的人。它是一种由艾滋病诱发疾病多达50%的艾滋病患者。C gattii感染是相对罕见但似乎越来越多。而通常与热带和亚热带气候,自1990年代以来,C gattii感染已报告在不列颠哥伦比亚,加拿大、美国西北太平洋地区,美国东北部,在欧洲。除了那些免疫功能降低,C gattii也可以引起疾病的免疫活性的,特别是人与潜在的健康状况。隐球菌脑膜炎的死亡率高,在免疫功能低下的患者从10%到50%。(1)

-(对所有目标)

一个积极的结果表明1或更多的生物样本中核酸的生物存在。

核酸的阴性结果表明14常见病原体的中枢神经系统没有出现在示例。

阴性结果不应该排除中枢神经系统(CNS)感染患者的高预发性脑膜炎或脑炎。试验没有测试所有潜在的传染性病原体的中枢神经系统疾病。负面结果的上下文中应该考虑病人的临床病程和治疗的历史,如果适用的话。假阴性结果可能发生在样品中核酸的浓度低于检测极限测试。

检测多个病毒或细菌或病毒和细菌可以观察到这个测试。在这种情况下,应当检查临床病史和表示彻底确定多个病原体的临床意义相同的标本。

结果旨在帮助诊断疾病和是与其他临床和流行病学研究结果结合使用。

微生物DNA或RNA的检测是依赖于适当的样本收集、处理、运输、存储和准备。有一个假阴性结果的风险由于序列变异株的存在或基因重组在目标区域的化验。

假阴性结果单纯疱疹病毒(HSV)可能发生;因此,考虑由另一个核酸扩增检测HSV测试(例如,HSVC /单纯疱疹病毒(HSV),分子检测、PCR、脊髓液)如果脑膜炎脑炎面板的结果是负和临床怀疑是高。

脑膜炎脑炎面板可能为阴性新型隐球菌/ gattii隐球菌脑膜炎患者,特别是那些正在接受治疗;因此,隐球菌抗原检测CSF (CLFAT /隐球菌抗原效价、侧流试验、脊髓液)应该考虑如果脑膜炎脑炎面板的结果是消极的,和临床怀疑是高。血清(SLFA /隐球菌屏幕抗原效价,血清)也可能表明在这种情况下。脑膜炎脑炎面板不应该用于监控反应治疗隐球菌脑膜炎。

不应进行重复测试样本收集不到7天。

以下测试制造商所提供的信息是:

——过度的样品中蛋白质(白蛋白)水平升高可能会干扰测试。

——这个测试的性能还没有专门为脑脊液标本进行免疫功能不全的人。

——抗生素治疗对测试性能的影响没有被评估。测试结果可能会影响到并发抗菌疗法或水平的生物样本中检测极限以下。

大肠杆菌K1:菌株具有K1荚膜抗原检测。所有其他的大肠杆菌菌株血清型不会被检测出来。

流感嗜血杆菌:分析可能交叉反应嗜血杆菌haemolyticus。H haemolyticus在呼吸道中找到,但很少与CSF。H流感嗜血杆菌可以减少呼吸道的健康个体。在样本收集和测试时仍应小心防止污染导致假阳性结果。

脑膜炎奈瑟氏菌:只有封装的N双球菌将被检测到。未密封的N双球菌不会被检测到。

链球菌引起的肺炎:年代肺炎可以减少呼吸道的健康个体。在样本收集和测试时仍应小心防止污染导致假阳性结果(报告)。

肠病毒:试验可以发现许多人类鼻病毒的血清型密切相关。鼻病毒在呼吸道,但很少与CSF。在样本收集和测试时仍应小心防止污染导致假阳性结果。

人类疱疹病毒6型(hhv - 6)或巨细胞病毒(CMV):可以存在于一个潜在的形式重新激活期间由于其他病原体感染,包括代理不被FilmArray我面板可能引起脑膜炎或脑炎(例如,结核分枝杆菌或艾滋病毒)。染色体整合hhv - 6可能导致一个积极的结果。当FilmArray检测到的我,hhv - 6或巨细胞病毒应该视为脑膜炎或脑炎的可能原因后只有在适当的临床设置和专家咨询。

单纯疱疹病毒1(1型单纯疱疹病毒):1型单纯疱疹病毒可能与积极摆脱来自个人或复发性疱疹。在样本收集和测试时仍应小心防止污染导致假阳性结果。

水痘带状疱疹病毒(带状疱疹):病毒传染到CSF通常发生在例带状疱疹(带状疱疹)。带状疱疹的原因可能不是中枢神经系统疾病在这些情况下。

新型隐球菌/ gattii:分析可能与交叉反应隐球菌amylolentus,的近邻C neoformans这并不感染人类。(1)

的脑膜炎或脑炎多重PCR面板detects14病原体(细菌n = 6,病毒n = 7,和真菌n = 1)从脊髓液(CSF)。的性能面板使用临床评估,剩余脑脊液样本(n = 291)阳性,常规方法(如细菌培养,个人实时PCR试验)代表一种病原体的面板。值得注意的是,一个子集(n = 76)的脑脊液标本收集在prevaccine时代,并被描述为阳性细菌病原体。专家组演示了一个总体百分比积极协议(PPA)的97.5%(78/80)的细菌病原体,对病毒有90.1% (145/161),52% (26/50)新型隐球菌/ gattii。尽管低整体面板之间的协议(52%)和抗原检测检测C neoformans / gattii百分比,正面面板的协议C neoformans / gattii直接测定为92.3%(12/13)相比常规真菌涂片或培养的结果。指临床参考1额外的信息。

1。FilmArray脑膜炎或脑炎[我]面板CE试管说明书,BioFire诊断,LLC犹他州,盐湖城rfit - prt - 0276 - 03 2017年6月

2。Liesman R,斯特拉斯堡,海特曼等:商业多元化评价分子面板的诊断感染性脑膜炎和脑炎。中国Microbiol2018年2月7所示。doi: 10.1128 / JCM.01927-17

3所示。Ramanan P,布赖森,Binnicker MJ, et al:综合征在临床微生物学基于仪表盘测试。2018年1月1;(1):31日e00024-17。doi:10.1128 / CMR.00024-17

4所示。大黄酸J,巴尔数控、Hemmert AC等:诊断性能的复合PCR鉴定脑膜炎感染艾滋病病毒的人口在乌干达。2016年3月,84 (3):268 - 273。doi: 10.1016 / j.diagmicrobio.2015.11.017

5。伍SH,阿奎莱拉E,萨拉查L, et al:加强病原体识别患者的脑膜炎和消极的革兰氏染色剂使用BioFire FilmArray (R)脑膜炎或脑炎面板。安中国Microbiol Antimicrob 2016年4月21日,十五26。doi: 10.1186 / s12941 - 016 - 0137 - 1

• 脑膜炎或脑炎面板算法

是一个FilmArray脑膜炎或脑炎面板封闭系统执行所需的化学分离,放大,和定性检测核酸从多个细菌,病毒,和酵母病原体从脊髓液标本的病人怀疑有脑膜炎或脑炎。面板包含试剂在冻干形式,分为离散段所需的化学过程。患者样本和水化液由真空到面板,然后放入FilmArray乐器。检测流程操作自动化(一期PCR核酸纯化,阶段的PCR,和融化分析)和完成在大约一个小时在这个封闭的系统:

核酸酸净化:

样品溶解化学和机械的结合机制和解放核酸捕获,清洗和筛选了使用磁珠技术。

第一阶段PCR:

反向转录一步执行病毒RNA转换成互补脱氧核糖核酸扩增前。纯化核酸的解决方案是结合预热大师混合启动逆转录一步多重PCR和随后的热循环。

第二阶段PCR:

第一阶段的产品PCR被稀释,混合着新鲜PCR试剂包含插入DNA荧光染料(LCGreen + BioFire诊断),这是分布在第二阶段的PCR数组。数组的个别井包含不同的引物化验(一式三份),目标的特定核酸序列从每个病原体检测,以及控制模板材料。

- - - - - -DNA分析:融化

t温度正在慢慢增加,荧光在每个数组的监测和分析,生成一个融化曲线。

融化曲线的分析:

软件评价DNA融化曲线为每个来确定一个PCR产品出现在。如果融化概要显示PCR产物的存在,然后分析软件计算曲线的熔化温度,然后对比试验的预期范围。当软件确定融化曲线是正的范围,它被称为积极的。当它确定融化曲线的负或不是在适当的范围内,它被称为负的。

复制的分析:

融化曲线每个3为每个复制的分析评估,以确定试验的结果。分析被称为积极的,至少2相关的3融化曲线必须被称为积极的,和温度至少2的3正融化曲线必须相似(在1度),化验不符合这些标准被称为负的。(说明书:FilmArray脑膜炎/ EncephalitisPanel CE试管说明书,BioFire诊断,LLC盐湖城犹他州rfit - prt - 0276 - 03 2017年6月)

没有

周一到周日

1到2天

14天

罗彻斯特

• 授权用户可以登录测试价格费用的详细信息。
• 客户没有测试价格可以联系亚搏一天24小时,一周7天。
• 潜在客户应该联系他们的区域经理。寻求帮助,请联系亚搏。

这个测试已经清除、批准或由美国食品和药物管理局是免税的,按照制造商的说明使用。性能特征验证了梅奥诊所的方式符合CLIA需求。

87483年

样品报告

正常和异常样本报告作为参考提供报告的外观。

正常的报告|异常报告

如果样品报告

国际体系(SI)的单位报告提供有限数量的测试。这些报告仅用于国际帐户,只可以通过MayoLINK账户已定义接收他们。

如果正常的报告|如果异常报告