艾滋病诊断肠病毒感染
这个测试不应使用屏幕无症状的病人
看到脑膜炎或脑炎面板算法在特殊的指令。
实时聚合酶链反应(PCR) /核糖核酸探针杂交
柯萨基病毒
柯萨基病毒一
柯萨奇病毒B
艾柯病毒
肠病毒
肠病毒(柯萨基病毒和艾柯病毒)
手,脚,口病
看到脑膜炎或脑炎面板算法在特殊的指令。
不同
这个测试将检测肠病毒但不会区分病毒在这个家庭或提供血清学分型的信息。
1。标本来源是必需的。
2。源信息应包括的主要解剖网站收集。
提交原始临床样本为肠道病毒PCR(不是文化隔离)。
提交以下标本:只有1
样品类型:体液
来源:心包,腹膜
容器/管:无菌容器
样品数量:0.5毫升
托收指示:不要离心机。
样品类型:脊髓液
容器/管:无菌瓶
样品数量:0.5毫升
托收指示:不要离心机。
样品类型:拭子
供应:Culturette(洗液文化棍)(T092)
来源:皮肤、眼睛、直肠、生殖器、鼻咽口咽,咽喉、鼻腔或尿道
容器/管:Multimicrobe媒体(M4-RT)或类似的病毒传输媒体(M4、M5)和Eswab
样品数量:整个标本
收集产品说明:
1。直肠拭子必须没有可见的粪便物
2。地方拭子回multimicrobe媒体(M4-RT、M4、M5)
如果不是电子订购,完成,打印和发送微生物测试请求(T244)标本。
体液,脊髓液:0.3毫升
钙alginate-tipped拭子 木头拭子 运输拭子含有凝胶 Heat-inactivated标本 |
拒绝 |
标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
---|---|---|---|
不同 | 冷藏(首选) | 7天 | |
冻 | 7天 |
艾滋病诊断肠病毒感染
这个测试不应使用屏幕无症状的病人
看到脑膜炎或脑炎面板算法在特殊的指令。
肠道病毒是积极意义RNA病毒引起的家庭。这些病毒最初是由血清型分类作为脊髓灰质炎病毒(3类),艾柯病毒(31日类型,包括类型22日和23日,现在分为parechoviruses),柯萨基病毒(类型)23日,柯萨奇病毒B(6类)。然而,基因组研究已经证明,有明显的重叠不同血清型的生物学特性和最近孤立的肠道病毒现在用连续数字命名(如EV68, EV69)。
正常的肠病毒复制的网站是胃肠道感染通常是亚临床的地方。然而,在部分情况下,病毒扩散到其他器官,引起全身表现,包括轻微的呼吸道疾病(如感冒);结膜炎;手、足、口病;无菌性脑膜炎;心肌炎;和急性弛缓性麻痹。总的来说,肠道病毒是最常见的导致儿童上呼吸道疾病。此外,肠道病毒是最常见的中枢神经系统(CNS)疾病的原因;他们几乎占所有病毒恢复脊髓液的文化。分化的肠道病毒与其他病毒和细菌,引起中枢神经系统疾病是重要的适当的医疗管理这些病人。
传统的细胞培养方法需要6天,平均而言,对肠道病毒检测。相比之下,实时polymerase连锁反应(PCR)允许当天检测。肠病毒核酸的检测PCR也最敏感的诊断方法诊断中枢神经系统感染这些病毒引起的。
负
一个积极的结果表明样品中肠道病毒RNA的存在。
消极的结果并不排除肠病毒感染的可能性。
这种试验可能检测到病毒从各种各样的标本类型在无症状的个体,包括粪便。这个试验应该只用于患者临床病史和症状符合肠病毒感染,而且必须解释的临床图片。
这是一个定性分析和结果报告为负或有针对性的肠道病毒RNA阳性。
精度/诊断敏感性和特异性:
yabo208梅奥诊所实验室相比肠道病毒的检测脊髓液通过常规管细胞培养(MCR-5)和LightCycler聚合酶链反应(PCR)。检测的715份标本中,肠道病毒65年发现传统的细胞培养和82年(9%)由LightCycler PCR (11%)。82年22(27%)只积极通过PCR;然而,65年只有5只(8%)正由传统的细胞培养。
补充数据激增(研究):
补充上面的数据中,30或更多的负样本的每个标本类型(脊髓液(CSF) /无菌体液,真皮/眼/直肠拭子,等离子体,和上、下呼吸道标本)与肠病毒文化上升控制在大约10到50目标/制程(近似检测极限)。飙升的标本被蒙蔽的方式运行以及负(non-spiked)标本的标本类型。飙升的标本,是积极的,97%至100%和100%的non-spiked标本都是负面的。总共489飙升和non-spiked标本进行测试。
分析包容性:
试验检测到的所有64个成员国肠病毒面板,包括柯萨基病毒、脊髓灰质炎病毒、艾柯病毒和其他肠道病毒。重要的是,检测parechovirus血清型变量被发现。
分析特异性/检测极限:
降低检测极限的测定是大约10到50 RNA目标副本/制程。这是在所有标本类型确认接受这个试验。
特异性:
分析不能准确区分肠病毒、鼻病毒。然而,没有观察到当一个特异性大面板进行了测试,包括流感a / B、呼吸道合胞体病毒,副流感病毒病毒,单纯疱疹病毒,巴尔病毒、水痘带状疱疹病毒和巨细胞病毒。
可报告范围:
这是一个定性分析和结果报告为负或有针对性的肠道病毒RNA阳性。
1。Khetsuriani N:肠病毒surveillance-United州,1970 - 2005。MMWR发病率死亡率周报。2006年9月15日;55 (SS08): 1 - 20
2。阿贝迪GR,沃森JT,停止佤邦,Oberste et al女士:肠道病毒和Parechovirus监测——美国,2014 - 2016。MMWR Morb凡人周众议员67:515 2018;518年
3所示。尝试年代,Pailloud F, Thouvenot D, et al:评估相结合的上呼吸道拭子样本与脑脊液检查儿童enteroviral脑膜炎的诊断。J医学病毒学。1999;57 (2):193 - 197
4所示。Furione M, Zavattoni M•加蒂M, et al:快速检测enteroviral RNA的无菌性脑膜炎患者脑脊液(CSF)的反向transcription-nested聚合酶链反应。新的Microbiol。1998; 21 (4): 343 - 351
这个实时逆转录laboratory-developed polymerase连锁反应(PCR)检测,病毒核酸提取标本,紧随其后的是放大和检测罗氏LightCycler 2.0仪器。这个PCR试验优化多元蛋白质地区探测到目标的序列。引物扩增193 bp的产品。
肠病毒基因组RNA转录首次cDNA逆转录酶,其次是放大的cDNA产品。T他LightCycler仪器可以迅速(30 - 40分钟)通过严格检测扩增子发展空气缸温度循环在毛细管比色皿。放大产品的检测是基于荧光共振能量转移(FRET)原则。担心产品的检测,与供体荧光团杂交探针,荧光素,在3’端是由外部光源和发光兴奋所吸收的第二个杂交探针受体荧光团,LC-Red 640年在5 '端。受体荧光团然后发出不同波长的光,可以测量信号正比于特定PCR产品的数量。烦恼(后续生产检测荧光信号)仅发生在探测器特别退火到目标序列的扩增子。
熔化曲线分析是进行PCR扩增和检测阶段的分析,因为它提供了更大的敏感性比放大阶段并维护高特异性。
发生融化阶段的分析如下:
从45摄氏度,探测器可以绑定到放大产品,热室然后慢慢的温度提高到80摄氏度和荧光测量来确定点失去一半的荧光探针是变性(即“融化”)的目标。这就是所谓的熔化温度(Tm)的病毒。分析PCR扩增和探针融化曲线是通过使用LightCycler软件来完成的。(Bernard PS Reiser Pritham GH:突变的检测荧光杂交探针融化曲线。:菜单,Wittwer C, Nakagawara K, eds。快速循环实时PCR方法和应用。施普林格;2012:11-20)
周一到周日
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
87498年