测试Id:外向

肠病毒、分子检测、PCR、等离子体

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

艾滋病诊断肠病毒感染

方法名称
一个简短的描述方法用于执行测试

实时聚合酶链反应(PCR) /核糖核酸探针杂交

纽约的状态
表明纽约国家批准的状态,如果测试是公开为纽约州立客户定货。

是的

报告名称
列出了短或缩写为一个测试版本的发布名称

肠病毒PCR, P

别名
列表附加测试常见的名字,作为一个帮助搜索

柯萨基病毒

柯萨基病毒一

柯萨奇病毒B

艾柯病毒

肠病毒

肠病毒(柯萨基病毒和艾柯病毒)

手,脚,口病

标本类型
描述了标本类型验证测试

等离子体EDTA

标本要求
定义了执行测试所需的最佳标本和首选的体积来完成测试

提交原始临床样本为肠道病毒PCR(不是文化隔离)。这个测试将检测肠病毒,但不会区分病毒在这个家庭或提供血清学分型的信息。

收集容器/管:薰衣草(EDTA)

提交集装箱/管:螺旋帽、无菌容器

样品数量:1毫升

收集产品说明:旋转迅速下降。

形式

如果不是电子订购,完成,打印和发送微生物测试请求(T244)标本。

试样体积最小
定义样本的数量必须提供一个临床相关的结果取决于测试实验室

0.3毫升

拒绝原因
识别标本类型和条件可能会导致样品被拒绝

严重溶血 拒绝

样品稳定性信息
提供了一个描述运输所需的温度进行实验室的标本,替代还包括可接受的温度

标本类型 温度 时间 特种集装箱
等离子体EDTA 冷藏(首选) 7天
7天

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

艾滋病诊断肠病毒感染

临床信息
讨论了生理学、病理生理学和一般临床方面,与实验室测试

肠道病毒是积极意义RNA病毒引起的家庭。这些病毒最初是由血清型分类作为脊髓灰质炎病毒(3类),艾柯病毒(31日类型,包括类型22日和23日,现在分为parechoviruses),柯萨基病毒(类型)23日,柯萨奇病毒B(6类)。然而,基因组研究已经证明,有明显的重叠在不同血清型的生物学特性,最近,孤立的肠道病毒现在用连续数字命名(如EV68, EV69)。

正常的肠病毒复制的网站是胃肠道感染通常是亚临床的地方。然而,在部分情况下,病毒扩散到其他器官,引起全身表现,包括轻微的呼吸道疾病(如感冒);结膜炎;手、足、口病;无菌性脑膜炎;心肌炎;和急性弛缓性麻痹。总的来说,肠道病毒是最常见的导致儿童上呼吸道疾病。此外,肠道病毒是最常见的中枢神经系统(CNS)疾病的原因;他们几乎占所有病毒恢复脊髓液的文化分化的肠道病毒与其他病毒和细菌,引起中枢神经系统疾病是重要的适当的医疗管理这些病人。

传统的细胞培养方法需要6天,平均而言,对肠道病毒检测。相比之下,实时PCR可以当天检测。肠病毒核酸的检测PCR也最敏感的诊断方法诊断中枢神经系统感染这些病毒引起的。

参考价值
描述参考区间和附加信息的解释测试结果。可能包括在适当的时间间隔根据年龄和性别。间隔Mayo-derived,除非另有指定。如果一个提供解释报告,参考价值字段将这个状态。

解释
提供信息,协助解释测试结果

一个积极的结果表明样品中肠道病毒RNA的存在。

注意事项
讨论了条件,可能会导致诊断的混乱,包括样本收集和处理不当,不恰当的测试选择、干扰物质

消极的结果并不排除肠病毒感染的可能性。这种试验可能检测到病毒从各种各样的标本类型在无症状的个体。这个试验应该只用于患者临床病史和症状符合肠病毒感染,而且必须解释的临床图片。这个测试不应该用于屏幕无症状的患者。

支持数据

精度/诊断敏感性和特异性:

我们比较通用的肠道病毒检测脊髓液常规管细胞培养(MCR-5)和LightCycler PCR。检测的715份标本中,肠道病毒65年发现传统的细胞培养和82年(9%)由LightCycler PCR (11%)。82年22(27%)只积极通过PCR;然而,65年只有5只(8%)正由传统的细胞培养。

补充数据激增(研究):

补充上面的数据中,30或更多的负样本的每个标本类型(脑脊液/无菌体液,真皮/眼/直肠拭子,等离子体,和上、下呼吸道标本)与肠病毒文化上升控制在大约10到50目标/制程(近似检测极限)。飙升的标本被蒙蔽的方式运行以及负(nonspiked)标本的标本类型。飙升的标本,是积极的,97%至100%和100%的nonspiked标本都是负面的。总共489飙升和nonspiked标本进行测试。

分析包容性:

试验检测到的所有64个成员国肠病毒面板,包括柯萨基病毒、脊髓灰质炎病毒、艾柯病毒和其他肠道病毒。

分析特异性/检测极限(LoD):

这个分析的较低的LoD大约是10至50 RNA目标副本/制程。这是在所有标本类型确认接受这个试验。

特异性:

试验没有crossreact包含其他RNA-containing病毒特异性面板(鼻病毒;呼肠孤病毒;A型和B型流感病毒;呼吸道合胞体病毒;和副流感病毒病毒)和病毒(单纯疱疹,巴尔病毒、水痘一带状疱疹病毒和巨细胞病毒)。

可报告范围:

这是一个定性分析和报告结果的消极或积极的有针对性的肠道病毒RNA。

临床参考
对临床性质的深入阅读的建议

1。肠病毒surveillance-United州,1970 - 2005。MMWR Morb致命的工作代表2006年9月15日;55 (SS08): 1 - 20

2。尝试年代,Pailloud F, Thouvenot D, et al:评估相结合的上呼吸道拭子样本与脑脊液检查儿童enteroviral脑膜炎的诊断。J医学病毒学1999;57 (2):193 - 197

3所示。Furione M, Zavattoni M•加蒂M, et al:快速检测enteroviral RNA的无菌性脑膜炎患者脑脊液(CSF)的反向transcription-nested聚合酶链反应。新Microbiol 1998; 21 (4): 343 - 351

方法描述
描述如何执行测试并提供method-specific参考

这个实时逆转录laboratory-developed PCR检测,病毒核酸提取标本使用麦格纳纯自动化仪表(罗氏应用科学),其次是放大和检测罗氏LightCycler 2.0乐器。这个PCR试验优化多元蛋白质地区探测到目标的序列。引物扩增193 bp的产品。

肠病毒基因组RNA转录首次cDNA逆转录酶,其次是放大的cDNA产品。T他LightCycler仪器可以迅速(30 - 40分钟)通过严格检测扩增子发展空气缸温度循环在毛细管比色皿。放大产品的检测是基于荧光共振能量转移(FRET)原则。担心产品的检测,与供体荧光团杂交探针,荧光素,在3’端是由外部光源和发光兴奋所吸收的第二个杂交探针受体荧光团,LC-Red 640年在5 '端。受体荧光团然后发出不同波长的光,可以测量信号正比于特定PCR产品的数量。烦恼(后续生产检测荧光信号)仅发生在探测器特别退火到目标序列的扩增子。

融化曲线分析是进行PCR扩增和检测阶段的分析,因为它提供了更大的敏感性比放大阶段和维护高特异性。

发生融化阶段的分析如下:

从45摄氏度,探测器可以绑定到放大产品,热室然后慢慢的温度提高到80摄氏度和荧光测量来确定点失去一半的荧光探针是变性(即“融化”)的目标。这就是所谓的熔化温度(Tm)的病毒。分析PCR扩增和探针融化曲线是通过使用LightCycler软件来完成的。(Cockerill FR三世,Uhl JR:应用程序和实时PCR临床微生物实验室的挑战。快速循环实时PCR方法和应用。由U Reischl,编辑等。 德国 施普林格,2002年,页3-30)

PDF报告
表明报告包括一个额外的文档是否与图表、图像或其他丰富的信息

没有

天(s)
概述了天测试执行。这个领域反映了天,样品必须在测试实验室开始测试过程,包括任何样品制备和测试执行之前处理时间。列出了一些测试,不断进行,这意味着化验白天多次执行。

周一到周日

报告可用
时间的间隔(收到样品在梅奥诊所实验室结果可用)考虑标准设置和周末。yabo208第一天的时间通常是结果可用。最后一天的时间可能需要,占任何必要的重复测试。

一天/ 1到5天

样品保留时间
轮廓的时间在测试标本保存在实验室之前就会被丢弃

1周

执行实验室的位置
表明实验室的位置执行测试

罗彻斯特

费用
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测试的分类
提供信息关于医疗器械分类为实验室测试工具和试剂。测试可以分为清除或通过美国食品和药物管理局(FDA)和每个制造商使用说明,或产品,不接受FDA审查和批准,并贴上一个分析物特定试剂(ASR)产品。

这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。

CPT编码信息
提供指导在决定适当的当前程序的术语(CPT)代码(s)为每个测试或概要信息。梅奥诊所上市CPT编码反映实验室的解释CPT编码需求。yabo208每个实验室有责任来确定正确的CPT编码用于计费。

CPT编码由执行实验室提供。

87498年

测试设置资源

设置文件
测试设置信息包含测试文件定义支持订单细节和结果之间的接口梅奥诊所实验室和实验室信息系统。yabo208

Excel|Pdf

样品报告
正常和异常样本报告作为参考提供报告的外观。

正常的报告|异常报告

如果样品报告
国际体系(SI)的单位报告提供有限数量的测试。这些报告仅用于国际帐户,只可以通过MayoLINK账户已定义接收他们。

如果正常的报告|如果异常报告