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测试ID: AGXTZ
AGXT基因,全基因分析,变化

有用的建议临床疾病或测试可能有帮助的环境

确认原发性1型高草尿症的诊断

在家族中没有已知突变的情况下,对有1型原发性高草酸尿家族史的个体进行携带者检测

测试算法描述将测试添加到初始顺序时的情况。这包括反射和其他测试。

看到Hyperoxaluria诊断算法在特殊的指令。

临床信息讨论生理学,病理生理学和一般的临床方面,因为他们涉及一个实验室测试

原发性高草酸尿1型(PH1)是一种遗传性乙醛酸代谢障碍,由丙氨酸缺乏引起:乙醛酸-氨基转移酶(AGT),一种将乙醛酸转化为甘氨酸的肝酶。缺乏AGT活性导致乙醛酸盐转化为草酸盐,而草酸盐不能被降解。因此,过量的草酸会随尿液排出体外,导致肾结石(尿石症)、肾钙质沉着症和肾衰竭。随着肾功能下降,血液中草酸水平显著升高,草酸与钙结合形成草酸钙沉积在肾脏、眼睛、心脏、骨骼和其他器官,导致全身性疾病。Pyridoxine(维生素B6)是AGT的辅助因子,在一些PH1患者中可有效减少尿草酸排泄。

PH1的症状包括肾石症、肾钙质沉着症或终末期肾病伴或无尿石病史。出现症状的年龄是可变的;然而,大多数人在儿童或青少年时期就出现了肾结石相关的症状。在一些具有更严重表型的婴儿中,肾衰竭可能是最初的表现特征。较少的情况下,受影响的个体在成年后出现复发性肾结石或肾衰竭。终末期肾病最常见于生命的第三十年,但也可发生在任何年龄。

PH1的确切流行率和发病率尚不清楚,但根据人口调查估计,发病率为每百万人1至3人,发病率为每年每百万人0.1人。

生化检测提示原发性高草尿症患者。尿液草酸的测量是首选,在儿童患者中校正成人体表面积(HYOX /高草酸尿面板,尿;OXU /草酸盐,24小时,尿)。尿液草酸排泄异常强烈提示,但不能诊断该疾病,因为还有其他形式的遗传性(2型和非ph1 /PH2)高草酸尿和继发性高草酸尿可能导致类似的尿液草酸排泄率升高。高草尿时尿乙醇酸升高提示PH1。历史上,PH1的诊断是通过肝活检进行AGT酶分析确定的;然而,这已被分子检测所取代,在大多数情况下,分子检测是确认性或带菌者检测的基础。

PH1是一种常染色体隐性遗传病,由突变引起AGXT基因,它编码AGT酶。几种常见AGXT已鉴定的突变包括C . 33dupc, p.Gly170Arg (C . 508g ->A)和p.Ile244Thr (C . 731t ->C)。在大约70%的PH1患者中,这些突变占2个受影响等位基因中的至少1个。直接排序AGXT基因被预测识别出99%的个体等位基因,这些个体通过酶分析被知道会受到PH1的影响。

虽然发病年龄和疾病严重程度是可变的,不一定可以预测基因型,但pyridoxine响应性和p.Gly170Arg突变的纯合性之间的相关性已经被观察到。(注:p.g gly170arg突变检测只能通过订购AGXTG /丙氨酸:乙醛酸转氨酶[AGXT]变异分析[G170R)、血液)。吡哆醇(维生素B6)是一种已知的AGT辅助因子,在一些使用药物剂量治疗的PH1患者中可有效减少尿液草酸排泄。有2个p.Gly170Arg突变副本的个体在使用药理学剂量的吡氧嘧啶治疗时已显示其尿液草酸值正常化,而只有一个突变副本的个体尿液草酸值减少。这是很有价值的,因为并不是所有的患者都对吡哆辛有反应,而且我们需要一些策略来帮助确定最有可能从这种靶向治疗中获益的个体。

参考价值描述用于解释测试结果的参考间隔和附加信息。可能包括基于年龄和性别的间隔时间。间隔是mayo派生的,除非另有指定。如果提供了解释性报告,参考值字段将说明这一点。

将提供一份解释性报告。

解释提供有助于解释测试结果的信息

根据美国医学遗传学学会的建议,对所有检测到的变异进行评估。(1)根据已知、预测或可能的致病性对变异进行分类,并报告解释性评论,详细说明它们的潜在或已知意义。

注意事项讨论可能导致诊断混乱的条件,包括不适当的标本采集和处理,不适当的试验选择和干扰物质

一小部分携带者或被诊断为原发性高草酸尿1型(PH1)的个体可能存在该方法无法识别的突变(如启动子突变)。因此,没有突变并不排除阳性携带者状态或诊断为PH1疾病的可能性。对于携带者检测来说,首先证明受影响家庭成员中存在ph1基因突变是很重要的。

在某些情况下,可鉴定出意义不明的DNA改变。

除了与疾病相关的探针外,该测试还利用定位于染色体其他区域的探针作为内部控制。在某些情况下,这些控制探头可能会检测到本试验没有专门针对的其他疾病或条件。通常不报告控制探针的结果。然而,在临床相关信息被确定的情况下,将通知订购医生结果,并提供任何适当的后续检测建议。

存在可能导致假阴性或假阳性结果的罕见多态性。如果获得的结果与临床结果不一致,则应考虑进行额外的检测。

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果给出的信息不准确或不完整,我们对结果的解释可能会出现错误。

临床参考临床性质的深入阅读的建议

1.Richards S, Aziz N, Bale S,等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med 2015 May;17(5):405-424

2.Milliner DS:原发性高草尿症:一种诊断算法。中华医学杂志2005;25(2):154-160

3.Monico CG, Rossetti S, Olson JB, Milliner DS: I型原发性高草尿症的Pyridoxine效应与最常见的突变等位基因有关。肾脏Int 2005; 67 (5): 1704 - 1709

4.Monico CG, Rossetti S, Schwanz HA,等:对55例1型原发性高草尿症的先证者进行全面突变筛查,显示了基于基因诊断的可行性。J Am Soc Nephrol 2007;18:1905-1914

5.Rumsby G, Williams E, Coulter-Mackie M:评估突变筛查作为诊断原发性高草尿症的一线试验。肾脏Int 2004; 66 (3): 959 - 963

6.Williams EL, Acquaviva C, Amoroso, A,等:原发性高草尿症I型:更新和额外的突变分析AGXT基因。哼Mutat 30:910 2009; 917年

7.Williams E, Rumsby G:选择性外显子测序AGXT基因在50%原发性1型高草尿症患者中提供遗传诊断。中国化学2007;53 (7):1216 - 1221

8.2007年4月公报:原发性高草尿症和草病的实验室和分子诊断

特殊指令图书馆的pdf文件,包括与考试有关的相关信息和表格