测试ID: APCZ
APC.基因，全基因分析，变化

确认家族性腺瘤性息肉病(FAP)诊断为临床特征的患者

当这项测试被要求时，比较基因组杂交总是需要额外的费用。

看到结肠息肉病综合征检测算法在特殊说明中。

家族性腺瘤性息肉病(FAP)是一种常染色体显性遗传病，由子宫内膜改变引起APC.位于5号染色体长臂上的基因。典型的FAP以成百上千的腺瘤性结肠息肉的进行性发展为特征。息肉可能在生命的前十年发展，大多数未经治疗的FAP患者会在40岁时发展为结肠癌。通常情况下，结肠左侧息肉居多;然而，结肠的其他区域也可能受到影响。结肠外表现是多种多样的，包括胃和十二指肠息肉、壶腹息肉、骨瘤、牙齿异常(未爆发的牙齿)、先天性视网膜色素上皮肥大(CHRPE)、良性皮肤病变、硬纤维瘤、肝母细胞瘤和结肠外癌。常见的结肠和结肠外表现排列导致了3种临床变异:Gardner综合征、Turcot综合征和遗传性硬纤维瘤病。

Gardner综合征的特征在于经典FAP的结肠息肉，具有表皮皮肤囊肿和颌骨和长骨骼的良性骨质肿瘤。

Turcot综合征以多发结肠息肉和中枢神经系统肿瘤为特征。Turcot综合征是一种罕见的FAP临床变异，也被认为是遗传性非息肉病结直肠癌(HNPCC)的临床变异。Turcot综合征患者除了有腺瘤性息肉外，还有中枢神经系统肿瘤。所观察到的中枢神经系统肿瘤类型有助于区分Turcot-FAP变异患者和Turcot-HNPCC变异患者。与Turcot-FAP变异相关的主要中枢神经系统肿瘤是髓母细胞瘤，而与Turcot-HNPCC相关的主要中枢神经系统肿瘤是胶质母细胞瘤。

遗传性硬纤维瘤(HDD)是FAP的一种变异，以多发硬纤维瘤为主要特征。许多HDD患者甚至可能没有FAP的结肠表现。APC.种系检测可以帮助临床医生区分散发的硬纤维瘤和与FAP相关的硬纤维瘤。

减毒FAP (AFAP)的特点是发病较晚，表型较轻(通常<100个腺瘤性息肉和较少的结肠外表现)。典型的AFAP患者比典型患者至少晚10到20年出现症状。AFAP患者通常缺乏结肠癌和/或多发性腺瘤性息肉的家族史。值得注意的是，在AFAP和MYH-相关息肉病(MAP)，一种常染色体隐性息肉病综合征，通常伴有少于100个息肉。虽然MAP的临床表型仍有些不明确，但结肠外表现，包括CHRPE已被描述在受影响的患者。考虑到AFAP和MAP的表型重叠，这些测试通常一起排列或以反射方式排列。

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将提供一份解释性报告。

根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)的建议，对所有检测到的变异进行评估。(1)根据已知、预测或可能的致病性对变异进行分类，并报告解释性评论，详细说明它们的潜在或已知意义。

一小部分家族性腺瘤性息肉病(FAP)携带者或被诊断为FAP的个体可能有此方法无法识别的改变(如启动子改变、深层内含子改变、双等位基因改变)MYH基因)。因此，没有改变并不排除阳性携带者状态或诊断为FAP的可能性。对于载波测试来说，首先要证明存在一个APC.受影响家庭成员的基因改变

存在可能导致假阴性或假阳性结果的罕见变化。如果获得的结果与临床结果不一致，则应考虑进行额外的检测。

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果给出的信息不准确或不完整，我们对结果的解释可能会出现错误。

强烈建议接受预测性检测的患者在检测前和检测结果出来后接受基因咨询。

技术的局限性:

在一些情况下，可以鉴定未确定意义的DNA变体。

由于下一代测序的局限性，90%的插入和缺失可以被检测到，分别高达28个碱基和38个碱基。如果该小组对其中一种综合征的诊断仍有怀疑，考虑使用传统的桑格方法进行全基因测序。通过阵列比较基因组杂交(aCGH)检测单个或多外显子缺失以及全基因缺失。

评估工具:

多种硅质评价工具被用于帮助解释这些结果。这些工具定期更新;因此，对这些算法的更改可能导致对给定更改的不同预测。此外，这些工具在确定致病性方面的可预测性目前还没有得到验证。

除非预测会引起疾病，否则在内含子深处发现的改变或不导致氨基酸取代的改变未见报道。

Variants-Policy重新分类:

目前，实验室系统地审查检测和报告的可能有害的改变或意义不确定的变体还不是标准做法。实验室鼓励卫生保健提供者随时与实验室联系，以了解某一特定变体的状态随时间的变化情况。

1.Richards S, Aziz N, Bale S，等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med. 2015 May;17(5):405-424

2.美国临床肿瘤学会。美国临床肿瘤学会政策声明更新：癌症易感性临床癌症的基因检测。2003; 21：2397-2406

3.一半E, Bercovich D, Rozen P:家族性腺瘤性息肉病。Orphanet J Rare Dis. 2009 Oct 12;4:22

4.家族性腺瘤性息肉病的年龄和表现相关症状。2005年3月2日;5:24

• 分子遗传学:遗传性癌症综合征患者信息
• 基因检测的知情同意
• 结肠息肉病综合征检测算法
• 基因检测的知情同意(西班牙语)