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测试ID: PMS2Z
PMS2基因,全基因分析,变化

有用的建议临床疾病或测试可能有帮助的环境

确定林奇综合征/遗传性非息肉病结直肠癌的诊断

通过免疫组化方法确定肿瘤组织中PMS2蛋白的缺失是否与受影响个体的种系突变有关

家族性的识别PMS2突变允许在家庭成员中进行预测性测试

遗传学测试信息提供有助于选择正确基因检测或正确提交检测请求的信息

之前的授权可用于本分析;看到的特别指示。

测试算法描述将测试添加到初始顺序时的情况。这包括反射和其他测试。

看到林奇综合症测试算法在特殊的指令。

临床信息讨论生理学,病理生理学和一般的临床方面,因为他们涉及一个实验室测试

林奇综合征(也称为遗传性非息肉病结直肠癌或HNPCC)是一种常染色体显性遗传性癌症综合征,与错配修复基因的种系突变有关,一种MSH2 MSH6,PMS2。的3 '端内的删除EPCAM基因也与林奇综合症有关,因为这导致失活MSH2启动子。

林奇综合征的主要特征是结肠直肠癌和子宫内膜癌的风险显著增加。结直肠癌的终生风险是高度可变的,并依赖于相关的基因。结肠直肠癌的风险相关一种MSH2突变(约50%-80%)通常高于其他林奇综合征相关基因突变相关的风险,子宫内膜癌的终身风险(约25%-60%)也是高度可变的。肿瘤范围内的其他恶性肿瘤包括胃癌、卵巢癌、肝胆道和泌尿道癌以及小肠癌。这些癌症的终生风险小于15%。在4个错配修复基因中PMS2基因决定了林奇症候群中所有肿瘤的最低风险。

林奇综合征的几种临床变异已经被定义。这些包括Turcot综合征、Muir-Torre综合征和纯合错配修复突变(也称为体质错配修复缺陷综合征)。Turcot综合征和Muir-Torre综合征与所描述的肿瘤范围内的癌症风险增加有关,但也分别包括脑和中枢神经系统恶性肿瘤和皮脂腺癌。纯合子错配修复突变,以错配修复基因中双等位有害突变的存在为特征,与血液癌和脑癌、咖啡斑和儿童结肠癌或小肠癌定义的不同临床表型相关。

有几个策略来评估个人或家庭的癌症史是暗示林奇综合症的人。其中一种策略是检测疑似个体的肿瘤是否存在微卫星不稳定性,以及/或免疫组化检测是否存在缺陷DNA错配修复。PMS2表达缺失的肿瘤更有可能发生种系突变PMS2基因。

参考价值描述用于解释测试结果的参考间隔和附加信息。可能包括基于年龄和性别的间隔时间。间隔是mayo派生的,除非另有指定。如果提供了解释性报告,参考值字段将说明这一点。

将提供一份解释性报告。

解释提供有助于解释测试结果的信息

所有检测到的变异将根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)的建议进行评估。(1)变异将根据已知、预测或可能的致病性进行分类,并报告解释性评论,详细说明它们的潜在或已知意义。

注意事项讨论可能导致诊断混乱的条件,包括不适当的标本采集和处理,不适当的试验选择和干扰物质

有些人被诊断患有PMS2相关林奇综合征可能存在该方法无法识别的突变(如深部内含子突变、启动子突变)。因此,没有突变并不排除诊断林奇综合征的可能性。对于无症状个体的预测检测,首先证明a的存在是重要的PMS2受影响家庭成员的基因突变。

在某些情况下,可鉴定出意义不明的DNA改变。

我们强烈建议无症状患者接受预测性检测前和检测结果可用后接受遗传咨询。

不建议对无症状儿童进行预测性检测。

存在可能导致假阴性或假阳性结果的罕见多态性。如果获得的结果与临床结果不一致,则应考虑进行额外的检测。

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果给出的信息不准确或不完整,我们对结果的解释可能会出现错误。

除了与疾病相关的探针,多重连接依赖的探针扩增技术利用定位于染色体其他区域的探针作为内部控制。在某些情况下,这些控制探头可能会检测到本试验没有专门针对的其他疾病或条件。通常不报告控制探针的结果。然而,在临床相关信息被确定的情况下,将通知订购医生结果,并提供任何适当的后续检测建议。

临床参考临床性质的深入阅读的建议

1.Richards S, Aziz N, Bale S,等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med 2015 May;17(5):405-424

2.Vaughn CP, Hart J, Samowitz WS, Swensen JJ:避免伪基因干扰检测PMS2 3'缺失。哼Mutat 32:1063 2011; 1071年

3.Senter L, Clendenning M, Sotamaa K,等:Lynch综合征的临床表型与种系PMS2突变有关。胃肠病学杂志2008;135:419 - 428

4.Clendenning M, Hampel H, LaJeunesse J,等:远程PCR有助于pms2特异性突变的鉴定。哼Mutat 2006; 27 (5): 490 - 495

5.Vasen HFA, Moslein G, Alonso A,等:Lynch综合征(遗传性非息肉病癌)的临床治疗指南。医学杂志2007;44:353-362

6.林奇Syndrome-GeneReviews-NCBI书架。可以在www.ncbi.nlm.nih.gov /书/ NBK1211 /

特殊指令图书馆的pdf文件,包括与考试有关的相关信息和表格