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测试ID:SDHBZ
SDHB.基因,全基因分析,变化

对...有用建议测试可能有用的临床障碍或设置

帮助诊断遗传性遗传性囊炎 - 嗜铬细胞瘤综合征与病原相关的综合征SDHB.基因变种

临床信息讨论生理学,病理生理学和一般临床方面,因为它们与实验室测试有关

琥珀酸脱氢酶(SDH)是由4个亚基组成的线粒体膜结合酶络合物:SDHA,SDHB,SDHC和SDHD。SDH是氧化还原酶,其催化琥珀酸盐(三羧酸循环函数)的氧化和泛喹(呼吸链功能)的泛喹酮还原。

杂合的致病变异SDHB.SDHC, 要么SDHD导致具有可变寿命的常染色体显性肿瘤综合征。患者只有1个功能的受影响的SDH亚基基因的种系拷贝。当第二个,完整的拷贝有组织丢失或在靶组织中突变,肿瘤发展。据信通过缺氧诱导因子(HIF)途径介导的肿瘤发生,其因酶络合物的函数丧失而被激活。交感神经和副交感神经神经节优选影响,导致伞形增压(PGLS)或Pheochromocytomas(PCC)的发育。


PGL可能包括副交感神经神经节(颈部和头骨碱)或同情神经节(来自颈部到骨盆的Parvertebral交感链)。PCCs可以涉及1个或肾上腺。几乎所有PCCS过度产量的儿茶酚胺,导致高血压,偏好对高血压危机。大约20%的PGL,大多是腹部内,也分泌了儿茶酚胺。颈部的PGL通常不会产生儿茶酚胺。SDH相关的PGL和PCC通常不是恶性的;然而,恶性肿瘤已经在少数患者中描述(特别是致病患者SDHB.变体)。此外,由于致病变体的种系存在,在各种靶组织中可能会随着时间的推移发生新的原发性肿瘤。

SDHB.与PGL(通常是发挥作用)最强烈的相关性,但也发生肾上腺PCC,如偶然的胃肠间质瘤(GIST)和肾细胞癌(RCC)。SDHB相关PGL / PCC的寿命渗透率相对较低(25%-40%),但大约一半的临床影响患者将经历转移性疾病。

SDHD显示类似于的疾病谱SDHB.,除头部和颈部pgls比在SDHB.,而运作或恶性PGLS / PCCS和GISTS不太常见。迄今为止尚未观察到RCC。患有患者传播病原的寿命渗透SDHD变体基本上是100%,而母体传播功能障碍SDHDCopy很少导致疾病。

SDHC到目前为止,已经主要与颅底和颈部的PGL有关。腹部和功能PGL或PCC罕见,GIST非常罕见。迄今为止尚未观察到RCC。但是,关于的确定性有限SDHC基因型 - 表型相关性,因为报告的案例数量低。出于同样的原因,关于寿命的终身渗透率没有可靠的估计SDHC- 相关的pgl / pcc。

集体,杂合种种系致病变异SDHB.SDHC, 要么SDHD在明显散发性PGL病例的30%至50%中被发现,并且可以在大约90%的临床遗传病例中确认。向外散态PCC和看似遗传的PCC分别为20%至25%和20%至30%。病原的患病率SDHB.变体高于SDHD,这又超过了数字SDHCSDHB.SDHC显示古典常血型血栓倡导,而SDHD显示一种改进的常染色体显性遗传,主要具有父母传输,表明产妇印记,其确切的分子相关仍然未知;然而,最近的证据表明,组织特异性远处印记,导致远程调节SDHD表达。

少数家族性PGL的个体将在其他基因中具有致病性变异:Sdhaf2.(也称为SDH5.),TMEM127, 和最大限度


已经描述了其他基因,但需要额外的研究以确认其临床相关性和遗传检测的效用:(i)SDHA在家族性PCC / PGL中描述了变体;但是,所有人SDHA到目前为止所描述的变体已经发现了看似散发的PCC / PCL的患者,而不是家庭案例,此外,可用数据表明SDHA变体可能具有低的渗透,因此遗传测试的临床效用难以确定。(ii)egln1 / phd2.HIF2.αIDH1., 和kif1.bet还提出易于倾向于PCC或PGL,但是迄今未得到证实这样做,或者只有很少这样做。

筛选致病变种SDH.目前对散发性PCC倡导的基因尚未倡导,但普遍存在,通常与其他易估价基因的突变的试验一起:Sdhaf2.TMEM127最大限度(多个内分泌肿瘤类型2:MEN2),vhl.(von hippel-lindau综合症),NF1(神经纤维瘤病类型1)。然而,看似家族性PCC病例没有既定的家族性肿瘤综合征的既定诊断,可能会受益SDH.基因测试,以及筛选以前列出的其他预估基因。

为了最大限度地减少遗传检测的成本,PGL和PCC患者的病变的临床模式可用于确定应测试上面列出的各种预感基因的顺序。嗜铬细胞瘤和Paraganglioma(2014)的最新内分泌社会临床实践指南提供了目前有利的目标测试方法。指数案例的遗传诊断允许有针对性的亲属假设检测。

参考值描述参考间隔和其他信息以解释测试结果。可能包括适当时基于年龄和性别的间隔。除非另有说明,否则间隔是梅奥衍生的。如果提供了解释性报告,则参考值字段将陈述这一点。

将提供解释性报告。

解释提供有助于解释测试结果的信息

可变性的评估和分类是使用最新的美国医学遗传学建议作为指南进行的。(1)基于已知,预测或可能的致病性分类,并报告具有细节其潜在或已知意义的解释性评论。

硅评估工具中的多个可用于帮助解释这些结果。在Silico评估工具中的预测准确性高度依赖于给定基因可用的数据,并且这些工具的预测可能随时间变化。来自Silico评估工具的结果应谨慎和专业的临床判断解释。

注意讨论可能导致诊断混淆的条件,包括不当的标本收集和处理,不适当的测试选择和干扰物质

一些具有SDHB基因的个体可以具有致病变体,该致病变体未被进行(例如,启动子变体,深内肾内含量)的方法。因此,没有变体,不会消除与SDHB相关疾病的可能性。为了预测对无症状的个体的测试,首先记录受影响的家庭成员中病原基因变体的存在是重要的。

测试结果应在临床调查结果,家族史和其他实验室数据的背景下解释。如果提供的信息不准确或不完整,则可能会出现对结果的误解。在一些情况下,可以鉴定未确定意义的DNA变体。很少,引物或探针结合位点中的序列变体可导致假阴性试验结果(DNA测序)或假阳性或假阴性结果(多重结扎依赖性探针扩增:MLPA;删除筛选)选择性等位基因辍学。由于DNA质量差,MLPA缺失筛选测定中可能发生假阴性或假阳性结果。如果获得的结果与临床结果不匹配,则应考虑额外的测试。

除疾病相关的探针外,MLPA技术还利用局部化为其他染色体区域的探针作为内部对照。在某些情况下,这些对照探针可能检测到该测试没有专门的疾病或条件。通常报道控制探针的结果。但是,如果确定了临床相关信息的情况下,将向订购医师通知该结果,并为任何适当的后续测试提供建议。

除非报告或预测导致疾病,否则未报告在没有导致氨基酸替代的内含子或改变中的改变。可根据要求提供所识别的这些和常见的良性变体。

支持数据

我们测序了SDHB.SDHC, 和SDHD42种试样的基因以前用于琥珀酸脱氢酶(SDH.)国家健康研究院(NIH)的变体。我们蒙蔽了原始结果,直到完成所有测序。先前识别的所有变体被证实。总体而言,27名患者有SDHB.变体,2例患者SDHC变体和8名患者SDHD变体。分析间测试显示所有测序区域的100%的一致性。来自健康个体的十五个标本也被测序。所有全部显示野生型序列SDHB.SDHC,SDHD

测试来自NIH的另外42个标本以缺失SDHB.SDHC,SDHD,采用多路复用连接依赖性探针扩增-Luminex FlexMap技术。发现十七个标本有1个删除的部分SDH.基因。这些结果由NIH确认。此外,测试了来自健康个体的50个标本进行缺失。我们检测到没有缺失SDHB.SDHC,要么SDHD在这些人中的任何一个。

临床参考深入阅读临床性质的建议

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5. Benn de,Richardson Al,Marsh DJ,罗宾逊BG:嗜铬细胞瘤和帕拉帕氏菌相关综合征的基因检测。ANN NY ACAD SCI 2006; 1073:104-111

特别说明PDF库包括与测试相关的相关信息和表格