测试ID: GALZ
半乳糖血症,高尔特基因，全基因分析，变化

在普通变异检测为阴性、生化诊断为半乳糖血症或表明携带者状态的半乳糖-1-磷酸尿苷转移酶活性水平的个体中识别变异

该测试利用下一代测序来检测与半乳糖血症相关的1个基因的单核苷酸和拷贝数变异:高尔特．

致病变异的识别可能有助于半乳糖血症的诊断、预后、临床管理、家族筛查和遗传咨询。

可能会考虑/建议进行额外的一级测试。有关更多信息，请参见半乳糖血症检测算法．

看到半乳糖血症检测算法在特殊的指令。

经典半乳糖血症是一种常染色体隐性半乳糖代谢疾病，由半乳糖-1-磷酸尿苷转移酶(高尔特)基因。完全或几乎完全缺乏GALT酶是危及生命的。如果不及时治疗，并发症包括肝功能衰竭、败血症、智力低下和死亡。半乳糖血症的治疗是通过无半乳糖饮食，这允许迅速从急性症状和一般良好的预后。尽管在早期就进行了适当的治疗，但半乳糖血症儿童发育迟缓、语言问题和运动功能异常的风险仍在增加。患有半乳糖血症的女性患卵巢早衰的风险增加。典型半乳糖血症的患病率约为三万分之一。

Duarte变异型半乳糖血症(Duarte变异型、N314D和经典变异型的复合杂合度)通常与GALT活性水平(5%-20%)高于经典半乳糖血症(<5%);然而，这可能是难以区分的新生儿筛查试验。典型地，患有Duarte变异半乳糖血症的个体有一个较温和的表型，但通常在婴儿期用低半乳糖饮食治疗。LA变异，由N314D和第二个变化L218L组成，与单独的Duarte变异相比，与更高水平的GALT活性相关。

新生儿筛查，通过测量总半乳糖(半乳糖和半乳糖-1-磷酸)或确定GALT酶的活性来识别潜在受影响的个体，在不同的状态下有所不同。半乳糖血症的诊断是通过随访定量测定GALT活性。如果酶活性水平指示了载体或受影响的状态，分子检测为常见高尔特可能会执行变体。如果一种或两种致病变异均未通过靶向变异分析检测到，生化检测已证实诊断为半乳糖血症，则对其进行测序高尔特基因可用于识别私人变异。

的高尔特9p13的基因图谱和180多个变异已经被确认。在典型半乳糖血症患者中常见几种致病变异(G/G基因型)。最常见的是Q188R变异，占经典半乳糖血症等位基因的60% - 70%。S135L变异是非洲裔美国人群体中最常见的变异，约占该群体中变异等位基因的50%。K285N变异在东欧后裔中很常见，占该群体等位基因的25% - 40%。L195P变异见于5% - 7%的典型半乳糖血症。杜阿尔特变异(N314D)在美国一般人口的5%中发现。

上述变异，加上LA变异，包括在GCT /半乳糖反射，血液，是诊断半乳糖血症或随访阳性新生儿筛查结果的首选检测。这些变异也包括在GAL14 /半乳糖血症基因分析(14变异面板)，变异。全序列高尔特在GALT活性缺乏的个体中，当这些检测发现1个或没有变异时，基因对变异的鉴定是有用的。全序列高尔特该基因在编码区和剪接连接处识别了95%以上的序列变异。看到半乳糖血症检测算法参阅特别说明以了解更多信息。

将提供一份解释性报告。

根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)的建议，对所有检测到的变异进行评估。(1)根据已知、预测或可能的致病性对变异进行分类，并报告解释性评论，详细说明它们的潜在或已知意义。

临床相关性:

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果提供的信息不准确或不完整，可能会导致对结果的误解。

如果检查是由于有临床意义的家族史而进行的，那么首先检查受影响的家庭成员往往是有用的。在受影响的家庭成员中发现可报告的变异将有助于对危险个体进行更有信息的检测。

为了讨论进一步检测选项的可用性，为一般检测选择提供帮助，或为这些结果的解释提供帮助，可以联系梅奥诊所实验室的遗传顾问，电话800-533-1710。

技术的局限性:

下一代测序可能无法检测到所有类型的基因组变异。在极少数情况下，可能会出现假阴性或假阳性结果。对于某些靶区，覆盖深度可能是可变的，但检测性能低于最低可接受标准或失败区域将被注意到。鉴于这些局限性，阴性结果并不排除遗传疾病的诊断。如果怀疑有特定的临床疾病，可以考虑采用其他方法进行评估。

如果患者曾接受过异基因造血干细胞移植或最近的异体输血，这些结果可能由于捐献者DNA的存在而不准确。请致电梅奥yabo208诊所实验室，了解如何对接受骨髓移植的病人进行检测。

由于检测技术的限制，可能有一些基因区域不能被有效扩增用于测序或缺失和重复分析，包括同源区域、高鸟嘌呤-胞嘧啶(GC)含量和重复序列。根据内部实验室标准，采用替代方法对选定的可报告变型进行确认。

该方法不能可靠地检测40个或更多碱基对(bp)的插入/缺失(indels)，包括Alu插入、长穿插元素(LINES)和短穿插元素(SINES)。生物信息学软件管道被证实可以检测95%的75 bp以下的缺失和47 bp以下的插入。

此外，低水平的镶嵌变体可能无法检测到。

这个测试不是为了区分体细胞变异和种系变异。如果有可能任何检测到的变异是体细胞，可能需要额外的检测来澄清结果的重要性。

Variants-Policy重新分类:

目前，实验室定期系统地审查以前分类过的变种还不是标准做法。实验室鼓励卫生保健提供者随时与实验室联系，以了解某一特定变体的状态随时间的变化情况。

变体的评估:

变量的评估和分类使用已出版的American

医学遗传学和基因组学学院(ACMG)和分子病理学协会(AMP)的建议作为指南。(1)其他基因特异性指南也可以考虑。变异是根据已知的、预测的或可能的致病性进行分类的，并以解释性注释详细说明其潜在的或已知的意义。分类为良性或可能良性的变异没有报告。多种硅评价工具可用于帮助解释这些结果。硅评估工具预测的准确性高度依赖于给定基因的可用数据，定期更新这些工具可能会导致预测随着时间的推移而改变。从硅评估工具的结果应解释谨慎和专业的临床判断。未预测会影响剪接或导致疾病的内含子和同义序列变异尚未报道。

1.Richards S, Aziz N, Bale S，等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med. 2015 May;17(5):405-424

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