测试ID：CySGP
胱氨酸尿基因图谱，变化

跟进异常生化结果，暗示胱素尿

建立胱氨酸尿患者的分子诊断

识别已知与胱氨酸尿有关的基因变异，以便对有风险的家庭成员进行预测检测

该测试利用下一代测序来检测与胱素尿相关的3个基因中的单核苷酸和拷贝数变体：SLC3A1，SLC7A9，pre。看到胱氨酸基因面板的靶向基因和方法细节在特殊的说明和方法描述中获取其他详细信息。

致病变异的鉴定可能有助于胱氨酸尿的诊断、预后、临床管理、家族筛查和遗传咨询。

可以考虑/推荐额外的第一层测试。有关更多信息，请参阅订购指导。

胱氨酸尿是一种先天性代谢错误，由氨基酸胱氨酸在肠道和肾脏的吸收和再吸收不良造成。这导致难以溶解的胱氨酸和二碱性氨基酸(赖氨酸、精氨酸和鸟氨酸)在尿液中积累，并导致肾结石(尿石症)的产生。症状包括急性发作的腹部或下背部疼痛，尿中有血(血尿)，反复发作的肾结石可导致频繁的尿路感染，最终导致肾功能不全。胱氨酸尿的综合发病率估计为1 / 7000。

胱氨酸尿是一种常染色体隐性疾病，但一些杂合子携带者具有常染色体显性，不完全外显率升高，但通常非疾病导致尿胱氨酸和双碱性氨基酸排泄。与纯合子变异患者相比，一些杂合子确实倾向于有更高水平的赖氨酸和胱氨酸，精氨酸和鸟氨酸，纯合子变异患者排泄大量的半胱氨酸和所有3种双基氨基酸。

胱氨酸尿症是由基因变异引起的，SLC3A1和pre在染色体2P和SLC7A919号染色体上q。最初，根据杂合子亲本标本尿胱氨酸排泄量将该病分为I、II和III亚型(II和III亚型也称为非I型)。提出了一种新的分类系统来区分不同形式的胱氨酸尿:A型，由于变异SLC3A1基因;B型，由于变体SLC7A9基因;和AB型，因为每个变种SLC3A1和SLC7A9基因。

这是一种涉及两者的相邻基因缺失SLC3A1和pre基因与常染色体隐性低呼吸促症 - 胱氨酸综合征有关，呈现出烦赘的特征，严重的新生儿肺促症，染色体综合征，未在儿童晚期过渡到婴儿期的婴儿期失败，以及肾病患者，赖氨酸，赖氨酸，精氨酸和鸟氨酸的肾血症病毒。变体在pre基因与常染色体隐性先天性骨髓综合征22（CMS22）有关，其不存在囊性尿素。

在进行分子遗传学检测之前，建议将胱氨酸、赖氨酸、鸟氨酸和精氨酸(CYSQN /胱氨酸尿谱，定量，24小时，尿液或CYSR /胱氨酸尿谱，定量，随机，尿液)作为筛选胱氨酸尿的一级检测。

胱氨酸的治疗/管理选择包括高流体摄入，碱和膳食修饰，以及口腔施氮素的施用，以防止形成胱氨酸石。

将提供一份解释性报告。

根据美国医学遗传学和基因组学（ACMG）建议，评估所有检测到的改变。（1）变体基于已知，预测或可能的致病性，并报告了细节其潜在或已知意义的解释性评论。

临床相关性：

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果提供的信息不准确或不完整，可能会导致对结果的误解。

如果由于临床上大量的家族史进行测试，则首先测试受影响的家庭成员通常是有用的。检测受影响的家庭成员中的可报告变体将允许对危险个人进行更丰富的测试。

要讨论额外测试选项的可用性，有关一般测试选择的帮助，或在解释这些结果的援助中，可以在800-533-1710联系Mayo临床实验室遗传辅助咨询师。

技术的局限性:

下一代测序可能无法检测到所有类型的基因组变体。在极少数情况下，可能发生假阴性或假阳性结果。对于某些目标区域，覆盖的深度可能是可变的，但是将注意到低于最小可接受标准或失败区域的测定性能。鉴于这些限制，阴性结果不排除遗传症的诊断。如果怀疑特定的临床疾病，则可以考虑通过替代方法的评估。

如果患者曾接受过异基因造血干细胞移植或最近的异体输血，这些结果可能由于捐献者DNA的存在而不准确。请致电梅奥yabo208诊所实验室，了解如何对接受骨髓移植的病人进行检测。

由于检测技术的限制，可能存在基因区域无法有效扩增用于测序或缺失和重复分析，包括同源区域、高鸟嘌呤-胞嘧啶(GC)含量和重复序列。根据内部实验室标准，采用替代方法对选定的可报告变型进行确认。

该测定不会可靠地检测40或更多碱基对（BP）的插入/缺失（吲哚），包括Alu插入，长三个核心元素（线），以及短的穿插核心元素（锡）。验证生物信息学软件管道，以检测高达75 BP的95％的删除，并插入高达47 BP。另外，可能无法检测到低水平的马赛克变体。

这个测试不是为了区分体细胞变异和种系变异。如果有可能任何检测到的变异是体细胞，可能需要额外的检测来澄清结果的重要性。

Variants-Policy重新分类:

目前，实验室定期系统地审查以前分类过的变种还不是标准做法。实验室鼓励卫生保健提供者随时与实验室联系，以了解某一特定变体的状态随时间的变化情况。

变体的评估:

根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)和分子病理学协会(AMP)的建议，评估和分类变异。(1)其他基因特异性指南也可以考虑。变异是根据已知的、预测的或可能的致病性进行分类的，并以解释性注释详细说明其潜在的或已知的意义。分类为良性或可能良性的变异没有报告。

多种硅评价工具可用于帮助解释这些结果。硅评估工具预测的准确性高度依赖于给定基因的可用数据，定期更新这些工具可能会导致预测随着时间的推移而改变。从硅评估工具的结果应解释谨慎和专业的临床判断。未预测会影响剪接或导致疾病的内含子和同义序列变异尚未报道。

1. Richards S，Aziz N，Bale S等人：序列变体解释的标准和准则：美国医学遗传学和基因组学学院的联合共识建议和分子病理学协会。Genet Med。2015年5月; 17（5）：405-424

2.Palacín M, Goodyer P, Nunes V，等:胱氨酸尿。见:Valle D, Antonarakis S, Ballabio A, Beaudet A, Mitchell GA，编。遗传疾病的在线代谢和分子基础:McGraw-Hill2019.2020年1月7日生效。可以在http://ommbid.mhmedical.com/content.aspx?bookid=2709§ionid=225555540

3.Eggermann T, Spengler S, Venghaus A，等:低张力-胱氨酸尿综合征2p21缺失。Eur JMed Genet. 2012;55(10)561-563

4.pll缺乏伴或不伴半胱氨酸尿可导致一种新型肌无力综合征。神经学。2014;82 (14)1254 - 1260

• 分子遗传学:生化疾病患者信息
• 基因检测的知情同意
• 基因检测的知情同意(西班牙语)
• 胱氨酸基因面板的靶向基因和方法细节