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提供他莫昔芬、可待因、曲马多以及细胞色素P450 2D6代谢的其他药物的相关信息
确定确切的基因型时,其他方法不能产生这一信息,或如果基因型-表型不一致的临床遇到
在需要时识别精确的基因型(例如,药物试验,研究方案)
识别可能干扰药物代谢的新变异(当对测序进行反射时)
当需要时,测试将在2层中完成。第1层使用基于pcr的5'-核酸酶分析来确定存在的变异。所有样品也有基于pcr的5'-核酸酶测定的拷贝数。在第1层的测试允许检测所有的公共CYP2D6变异(如,*2,*3,*4,*5,*6,*7,*8,*9,*10,*17,*29,*35,*41)和更罕见的等位基因,如*11,*12,*14,*15,和*114。等位基因的重复和倍增也被确认。单一和串联CYP2D7-2D6(* 13)等位基因CYP2D6-2D7(如*4N, *36, *68)等位基因也可以检测到。二级检测涉及使用荧光染料终结者化学进行测序,只有在一级检测结果不明确时才进行。大约3%的样品需要二级测试。
仅当通过第1层测试识别了含糊不清的表型时,才会进行第2层测试。确定表型所需的测序试验的数量取决于第1层结果。
看CYP2D6综合级联检测算法在特殊的指令。
细胞色素P450(CYP)的酶系列是一组氧化/脱康化酶,其在许多组织的微粒体中局存,包括肠和肝脏。CYP酶,CYP2D6,全部或部分地对许多常见规定的药物的代谢负责。
这CYP2D6基因具有高度变化,100多个命名等位基因。可以删除,重复并乘以基因,并且可以具有多个序列变化。此外,一些人有杂种的基因CYP2D6和CYP2D7.假基因。一些人有CYP2D6导致催化活性降低或缺乏的酶的合成的变异。这些人对cyp2d6代谢药物的处理可能更慢。CYP2D6涉及活性等位基因的重复和繁殖可能导致CYP2D6代谢药物的UrtraRapID代谢。CYP2D6基因型结果用于预测代谢产物表型。(见表1)
表1.单个星等位基因的酶活性
酶活性 |
的例子CYP2D6星等位基因 |
正常(广泛)新陈代谢 |
*1, *2, * 2a, *35 |
减少活动 |
*9, *10, *14, *17, *29,和* 41. |
无活动或空活动 |
* 3,* 4,* 4N,* 5,* 6,* 7,* 8,* 11,* 12,* 13,* 15,* 36,* 68,* 114 |
CYP2D6表型是根据样本中存在的功能性、部分功能性和非功能性等位基因的数量来预测的。
表型来源于药物基因变异联盟网站(1),临床药物遗传学实施联盟网站(2),发表的指南(3-8),以及对CYP2D6文献的详尽综述(9-10)。
在有些情况下,精确的表型预测是不可能的,在这些情况下,将给出一系列可能的表型。没有可检测到的基因改变的个体将具有广泛药物代谢物的预测表型,并被指定为CYP2D6 * 1 / * 1。
通过CYP2D6代谢的药物可能需要基于个体患者的基因型进行剂量调整。代谢剂差的患者可能需要低于通常剂量,以在由CYP2D6酶灭活的药物的情况下实现最佳反应,并且在由CYP2D6酶激活的药物的情况下高于通常剂量。或者,在通过CYP2D6激活的药物中,在药物中灭活的药物中,utrarapID代谢剂的患者可能会受益于药物中的药物的增加。在没有针对各种代谢物表型的FDA上的明确指导的情况下,紫外线或代谢差的患者可以通过切换到可与CYP2D6或通过适用的治疗药物监测的可比较的交替药物来益处。
总的来说,这个测试提供了全面的CYP2D6患者的基因型结果,确保更准确的表型预测。该测定对服用或考虑由CYP2D6酶灭活(例如,曲折,曲马多毒素)或灭活(例如,抗抑郁药和抗精神病药)的药物的患者具有临床意义。
将启动与该测试相关的顺序层测试,直到确定可能的含糊不清的表型。
将提供一份全面的解释性报告。
将提供一份综合的解释性报告,该报告将结合用于获得最终基因型的所有层检测的结果。
基因型,与相关的星型等位基因,使用标准的等位基因命名法由药物基因变异(PharmVar)联盟公布(1)。
为CYP2D6拷贝数变异分析,可报告的拷贝数范围是0到4个拷贝为每个CYP2D6地区的评估。
新的变体将基于对基因函数的已知,预测或可能的影响进行分类,并报告具有细节其潜在或已知意义的解释性评论。
有关药物替代基因及其相关药物的其他信息,请参阅药物替代组合桌子在特殊的指令。该资源还包括关于酶抑制剂和诱导剂的信息,以及潜在的替代药物选择。
罕见变异可能会导致假阴性或假阳性结果。如果获得的结果与临床结果(表型)不匹配,则应考虑进行额外的检测。
如果来自接受非白血病输血或异基因造血干细胞移植的患者,样本可能含有供体DNA。在这些情况下获得的样本结果可能不能准确反映受体的基因型。对于接受输血的个体,基因型通常在6周内恢复到受体的基因型。对于接受同种异体造血干细胞移植的个体,建议使用移植前DNA样本进行检测。
CYP2D6肝移植患者的基因检测结果可能不能准确反映患者CYP2D6的状态。
此方法可能无法检测全部CYP2D6导致CYP2D6活性改变的变异。因此,没有可检测到的变异并不排除患者由于其他原因而改变CYP2D6代谢的可能性CYP2D6此方法无法检测的变体。此外,当发现2个或更多的变异时,顺/反状态(变异是在同一染色体上还是在相反染色体上)并不总是已知的。
相关性的复杂因素CYP2D6具有表型的基因型则认为许多药物或其代谢物是CYP2D6催化活性的抑制剂。选择性5 -羟色胺再摄取抑制剂(SSRI)以及一些三环抗抑郁药(TCA)和其他药物可能会降低CYP2D6的催化活性。除代谢不良者外,所有代谢产物类别的患者CYP2D6酶活性均可能受到多种药物或其代谢物的抑制。因此,个体可能需要比单纯基因分型预测的更低的药物剂量。在其他共同给药的情况下解释试验结果是很重要的。
CYP2D6功能下降的等位基因可能以不同的速度代谢不同的药物,从正常到不良不等,但目前有关这方面的文献并不完整。
本试验的目的不是提供特定的剂量或药物选择建议,仅用于辅助临床决策。在给患者用药时,无论预测的表型如何,都应使用药物标签指南。
1. Pharmvar:药物转子变异联盟。Updated 3月3日,2021年3月3日。访问3月22日,2021年3月22日。在www.pharmvar.org/提供
2.临床药科学实施联盟(CPIC)。访问10月14日2020年10月14日。https://cpicpgx.org/
3. Brown JT,Bishop Jr,Sangkuhl K,等人。细胞色素P450(CYP)2D6基因型和奥昔乙氨酸治疗的临床药遗工实施联盟指南。Clin Pharmacol Ther。2019; 106(1):94-102。DOI:10.1002 / CPT.1409
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8.作者相关文章:Hicks JK, Sangkuhl K, Swen JJ等。CYP2D6和CYP2C19基因型与三环抗抑郁药剂量的临床药物遗传学实施联盟指南(CPIC): 2016年更新。临床药理学杂志。2017;102(1):37-44。doi: 10.1002 / cpt.597
9.Black JL 3, Walker DL, O’kane DJ, Harmandayan M.临床样本中未检测到的CYP2D6混合基因的频率:对表型预测的影响[发表修正发表在Drug Metab Dispos. 2012年6月;40(6):1238]。医药学报。2012;40(1):111-119。doi: 10.1124 / dmd.111.040832
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