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快速检测球孢子菌属DNA
有助于球虫真菌病的诊断
球孢子菌病是由二形真菌引起的,球孢子菌属巨细胞和球孢子菌属posadasii。这些生物是美国西南部地区、墨西哥北部以及中美洲和南美洲地区特有的。这种疾病通常表现为自限性上呼吸道感染,(1)临床发病一般发生在吸入球虫孢子(关节孢子)后10 - 16天。(2)既往健康或免疫抑制的个体,疾病进展可能迅速。
目前,球孢子菌病诊断的金标准是临床标本的培养。(3)然而,在培养过程中生长可能需要数周的时间。这往往会延误对感染者的诊断和治疗。血清学试验包括免疫扩散试验和补体固定试验被广泛应用于抗体检测球孢子菌属.血清学的球孢子菌属可能受到抗体发展延迟或与其他真菌交叉反应导致的非特异性的限制。此外,免疫扩散和补体固定试验是高劳动强度的,通常限于参考实验室。
分子方法可以识别球孢子菌属直接从临床标本中提取物种,并应与培养结合使用。对于标本类型,如福尔马林固定,石蜡包埋组织,培养是不可能的,但分子测试可以提供有用的信息。
不适用
阳性结果表明存在球孢子菌属DNA。
阴性结果表明没有检测到球孢子菌属DNA。
抑制结果表明,该方法能有效地检测球孢子菌属在这个标本中DNA被抑制。如果需要,新的样品可以在新的订单下重新提交。
这种快速PCR方法检测球孢子菌属因此,不能区分活的、与疾病相关的生物体或旧病遗留的核酸。检测结果应与患者症状和临床表现相关,然后作出明确诊断。
阴性结果也不能排除球孢子菌属或活动性疾病,因为该生物体的存在水平可能低于本试验的检测限度。
这个测试不区分球孢子菌属巨细胞和球孢子菌属posadasii.
福尔马林固定已被证实会降低PCR的敏感性。(4)因此,如果固定组织的PCR结果为阴性,应谨慎解释,如果临床表现提示球孢子菌病。
对148份福尔马林固定、石蜡包埋的组织标本进行检测,灵敏度和特异性分别为73.4%和100%。
检测限为1 ~ 10拷贝靶/微升(<50拷贝靶/反应)。通过在国家生物技术信息中心网站(http://www.ncbi.nml.nig.gov)上使用基本局部比对搜索工具(BLAST)对引物和探针序列进行搜索,确定了分析的特异性。此外,从114个可能产生交叉反应的生物体中提取的大量核酸进行了检测,这些生物体包括真菌、细菌、分枝杆菌、病毒和人类DNA。该分析没有显示与特异性面板中包含的任何生物体的交叉反应。
1.球虫聚合酶链反应检测在临床中的应用。Mycopathologia, 2010;170:345 - 351
2.肺球孢子菌病的治疗考虑。2016;10:1079 - 1091